Estimation and prediction of parameters and breeding values in soybean using REML/BLUP and Least Squares

The aim of this study was to compare REML/BLUP and Least Square procedures in the prediction andestimation of genetic parameters and breeding values in soybean progenies. F2:3 and F4:5 progenies were evaluated in the2005/06 growing season and the F2:4 and F4:6 generations derived thereof were evaluated in 2006/07. These progenies wereoriginated from two semi-early experimental lines that differ in grain yield. The experiments were conducted in a lattice designand plots consisted of a 2 m row, spaced 0.5 m apart. The trait grain yield per plot was evaluated. It was observed that earlyselection is more efficient for the discrimination of the best lines from the F4 generation onwards. No practical differences wereobserved between the least square and REML/BLUP procedures in the case of the models and simplifications for REML/BLUPused here

Índices de seleção no incremento simultâneo de componentes de produção dos híbridos topcross de milho verde

The objective of this work was to define the most suitable selective strategy for the simultaneous increment of yield components of green maize, by comparing three selection indexes weighted by economic weights and by the REML/BLUP method, in the assessment of predicted genetic gains for traits of interest. An experiment with 75 topcross hybrids from partially inbred S1 lines of green maize was carried out in Jataí, in the state of Goiás, Brazil, using a randomized complete block design, with four replicates. The following yield traits were evaluated: straw ears and commercial ears, grain mass, ear length, ear diameter, and number of ear rows. The selection indexes of Smith and Hazel, Williams, and Mulamba & Mock were applied and weighted for four economic weights (1, CVg, CVg/CVe, and h²). Among the tested selection indexes, those of Williams and Mulamba & Mock are the best-fit ones for the selection of topcross hybrids of green maize, as they provide positive and more balanced selection gains for all evaluated traits. The REML/BLUP method shows better predicted genetic gains than those achieved by the three selection indexes, besides being efficient for the selection of topcross hybrids of green maize.O objetivo deste trabalho foi determinar a estratégia seletiva mais adequada para o incremento simultâneo de componentes da produção de milho verde, pela comparação de três índices de seleção, ponderados por pesos econômicos, e pelo método REML/BLUP, na avaliação de ganhos genéticos previstos para os caracteres de interesse. Um ensaio com 75 híbridos topcross, de linhagens S1 parcialmente endogâmicas de milho-verde foi implementado em Jataí, GO, Brasil, tendo-se utilizado um delineamento de blocos ao acaso, com quatro repetições. As seguintes características de produtividade foram avaliadas: espigas empalhadas e espigas comerciais, massa de grãos, comprimento de espiga, diâmetro de espiga e número de fileiras da espiga. Os índices de seleção de Smith e Hazel, Williams e de Mulamba & Mock foram aplicados e ponderados por quatro pesos econômicos (1, CVg, CVg/CVe e h²). Entre os índices de seleção testados, o de Williams e os de Mulamba & Mock são os melhores para a seleção de híbridos de milho verde, pois proporcionam ganhos de seleção positivos e mais equilibrados em todos os caracteres avaliados. O método REML/BLUP apresenta melhores ganhos genéticos preditos do que os obtidos pelos três índices de seleção estudados, além de ser eficiente para a seleção de híbridos topcross de milho verde

Uso da metodologia REML/BLUP para seleção de genótipos de laranjeira-doce

The objective of this work was to select superior sweet orange (Citrus sinensis) genotypes with higher yield potential based on data from eight harvests, using the residual or restricted maximum likelihood/best linear unbiased prediction (REML/BLUP) methodology. The experiment was carried out from 2002 to 2008 and in 2010 in the municipality of Rio Branco, in the state of Acre, Brazil. Analyzes of deviance were performed to test the significance of the components of variance according to the random effects of the used model, and parameters were estimated from individual genotypic and phenotypic variances. A selection intensity of 20% was adopted regarding genotypic selection, i.e., only the best 11 of the 55 genotypes tested were selected. The estimates of the genetic parameters show the existence of genetic variability and the selection potential of the studied sweet orange genotypes. The genotypic correlation between harvests is of low magnitude, except for the variable average fruit mass, and, as a reflex, there is a change in the ordering of the genotypes. Genotypes 5, 48, 19, 14, and 47 stand out as being the most productive, and, therefore, are the most suitable for selection purposes. Genotypes 14 and 47 show superior performance for the character set evaluated.O objetivo deste trabalho foi selecionar genótipos superiores de laranjeira-doce (Citrus sinensis) com maior potencial produtivo com base em dados de oito safras, com uso da metodologia “residual or restricted maximum likelihood/best linear unbiased prediction” (REML/BLUP). O experimento foi realizado de 2002 a 2008 e em 2010, no município de Rio Branco, no estado do Acre, Brasil. Análises de deviance foram realizadas para testar a significância dos componentes da variância de acordo com os efeitos aleatórios do modelo utilizado, e os parâmetros foram estimados a partir das variâncias genotípicas e fenotípicas individuais. Foi adotada uma intensidade de seleção de 20% em relação à seleção genotípica, ou seja, apenas os melhores 11 dos 55 genótipos testados foram selecionados. As estimativas dos parâmetros genéticos mostram a existência de variabilidade genética e o potencial de seleção dos genótipos de laranjeira-doce estudados. A correlação genotípica entre as safras é de baixa magnitude, exceto para a variável massa média dos frutos, e, como reflexo, há uma mudança na ordenação dos genótipos. Os genótipos 5, 48, 19, 14 e 47 se destacam como os mais produtivos e, portanto, são os mais adequados para fins de seleção. Os genótipos 14 e 47 apresentam desempenho superior para o conjunto de caracteres avaliados

Variabilidade genética de procedências e progênies de umbuzeiro via metodologia de modelos lineares mistos (REML/BLUP).

O umbuzeiro (Spondias tuberosa Arruda), espécie nativa do semi-árido brasileiro, é um dos recursos genéticos mais importantes para a produção de frutos destinados ao consumo in natura e à industrialização. No melhoramento de espécies perenes, o uso de técnicas de avaliação genética com base em modelos mistos do tipo REML/BLUP (máxima verossimilhança restrita /melhor predição linear não viciada) é fundamental para a predição de valores genéticos aditivos e genotípicos de indivíduos com potencial para seleção, tanto em nível intrapopulacional como interpopulacional. Este procedimento vem sendo aplicado com sucesso no Brasil, no melhoramento de várias espécies frutíferas e florestais. O presente trabalho teve como objetivos estudar a variabilidade genética, estimar parâmetros genéticos e realizar a predição de valores genéticos dos indivíduos, utilizando a metodologia REML/BLUP a partir da avaliação de procedências e progênies de umbuzeiro. O ensaio foi instalado em delineamento de blocos ao acaso, com arranjo hierárquico desbalanceado, constituído de três procedências e 42 progênies. Foram avaliados os caracteres altura de plantas (ALP), maior diâmetro de copa (MAC), menor diâmetro de copa (MEC), diâmetro do colo (DIC) e número de ramos primários (NRP), os quais são correlacionados à produção de frutos. Os resultados obtidos permitem afirmar que, no umbuzeiro, aos nove anos de idade, a maior parte da variabilidade genética encontrada concentra-se dentro de populações. Os caracteres MEC e MAC apresentaram, respectivamente, valores de herdabilidade individual no sentido restrito de 0,08 e 0,14 e ganhos de 6% e 9%, respectivamente, com a seleção dos dez melhores genitores. Termos para indexação: Spondias tuberosa Arruda, análise genética, predição de ganhos, Anacardiaceae

Estimativas de parâmetros genéticos e ganhos de seleção em progênies de polinização aberta do açaizeiro.

O presente trabalho teve como objetivos estudar a variabilidade genética, estimar parâmetros genéticos e fenotípicos, e realizar a predição de valores genéticos dos indivíduos de açaizeiro irrigado no Estado do Pará, utilizando a metodologia BLUP/REML a partir da avaliação de progênies com base nos caracteres altura do primeiro cacho (APC), peso total do cacho (PTC), peso total de frutos (PTF), número de cachos (NC), peso médio do cacho (PMC), comprimento médio da ráquis (CMR), número médio de ráquilas (NMR), número de perfilhos (NP) e peso médio de cem frutos (P100). Cinqüenta progênies foram avaliadas em dois látices 5 x 5 com duas repetições e parcelas lineares de cinco plantas cada, no espaçamento de 5 m x 5 m. O programa computacional Selegen- Reml/Blup foi utilizado para as análises genéticas e a identificação dos melhores indivíduos para compor a população de produção de sementes para um programa a curto prazo e a de melhoramento para um programa a longo prazo. As correlações genotípicas de maiores magnitudes foram aquelas envolvendo o peso total de frutos e peso total do cacho, peso total do cacho e número de cacho e peso total de fruto e número de cacho, indicando que a seleção para peso total de frutos pode ser realizada por meio da seleção daquela de mais fácil seleção. As estimativas dos parâmetros genéticos obtidos revelam excelente potencial seletivo da população e variabilidade genética suficiente para o melhoramento genético da população a curto e longo prazos. Ganho genético considerável de 45,33% em relação à média do experimento pode ser obtido com a seleção dos 20 melhores indivíduos para o caráter produção total de fruto

Avaliação genética em teste de progênie de erva-mate por meio do software SELEGEN - REML/BLUP.

Em plantas perenes, a seleção propriamente dita deve basear-se nos valores genéticos aditivos (quando o interesse é a propagação sexuada dos indivíduos selecionados) e genotípicos (quando o interesse é a propagação assexuada dos indivíduos selecionados) preditos de todos os indivíduos avaliados em campo. As técnicas ótimas de avaliação genética envolvem simultaneamente a predição de valores genéticos e a estimação de componentes de variância, sob modelos estatísticos no âmbito de indivíduos. O presente trabalho têm por objetivo efetuar a avaliação genética de indivíduos, por meio do ?Software SELEGEN-REML/BLUP?, em um teste combinado de procedência e progênie integrante do programa de melhoramento da erva-mate (Ilex paraguariensis St. Hil.) coordenado pela Embrapa Florestas, com o propósito de identificar as melhores árvores para a instalação de pomares de sementes por mudas ou clonal. O material genético consiste de sete procedências e 140 progênies de meios-irmãos, instalado em Ivai ? PR. O delineamento foi de blocos ao acaso, com 10 repetições de parcelas lineares com seis plantas, no espaçamento de 3 x 2m. Ganhos genéticos de alta magnitude podem ser obtidos, para peso foliar, com a seleção de indivíduos com base em valores genéticos, tanto pelo desbaste do teste combinado de procedência e progênie, com vistas a transformá-lo em pomar de sementes por mudas, como por meio da propagação vegetativa dos melhores indivíduos para um pomar clonal. Contudo, essa ultima alternativa, além de propiciar maiores ganhos genéticos, permite uma melhor distibuição espacial das árvores no campo, favorecendo a polinizaçãoSecão: Conservação, Melhoramento e Multiplicação. Feira do Agronegócio da Erva-mate, 1., 2003, Chapecó. Integrar para promover o agronegócio da erva-mate

Estimativas de parâmetros genéticos e ganhos de seleção em progênies de polinização aberta de açaizeiro.

O presente trabalho teve como objetivos estudar a variabilidade genética, estimar parâmetros genéticos e fenotípicos, e realizar a predição de valores genéticos dos indivíduos de açaizeiro irrigado no Estado do Pará, utilizando a metodologia BLUP/REML a partir da avaliação de progênies com base nos caracteres altura do primeiro cacho (APC), peso total do cacho (PTC), peso total de frutos (PTF), número de cachos (NC), peso médio do cacho (PMC), comprimento médio da ráquis (CMR), número médio de ráquilas (NMR), número de perfilhos (NP) e peso médio de cem frutos (P100). Cinqüenta progênies foram avaliadas em dois látices 5 x 5 com duas repetições e parcelas lineares de cinco plantas cada, no espaçamento de 5 m x 5 m. O programa computacional Selegen- Reml/ Blup foi utilizado para as análises genéticas e a identificação dos melhores indivíduos para compor a população de produção de sementes para um programa a curto prazo e a de melhoramento para um programa a longo prazo. As correlações genotípicas de maiores magnitudes foram aquelas envolvendo o peso total de frutos e peso total do cacho, peso total do cacho e número de cacho e peso total de fruto e número de cacho, indicando que a seleção para peso total de frutos pode ser realizada por meio da seleção daquela de mais fácil seleção. As estimativas dos parâmetros genéticos obtidos revelam excelente potencial seletivo da população e variabilidade genética suficiente para o melhoramento genético da população a curto e longo prazos. Ganho genético considerável de 45,33% em relação à média do experimento pode ser obtido com a seleção dos 20 melhores indivíduos para o caráter produção total de frutos

Genetic gain evaluated with selection indices and with REML/Blup in popcorn

O objetivo deste trabalho foi comparar quatro índices de seleção e o método REML/Blup na avaliação de ganhos genéticos preditos das características de interesse ao programa de melhoramento do milho‑pipoca UENF 14. Foram avaliadas 200 progênies de irmãos‑completos, em uma safra, em dois ambientes (regiões Norte e Noroeste do Estado do Rio de Janeiro), com duas repetições, o que totalizou 800 observações. Avaliaram-se as características altura média de plantas, altura média de inserção da primeira espiga, estande final, tombamento, diâmetro de colmo, prolificidade, rendimento e capacidade de expansão dos grãos. Entre os índices de seleção testados, o de Mulamba & Mock proporcionou os melhores resultados para a seleção das progênies de irmãos‑completos. O método REML/Blup mostrou-se muito eficiente, tendo selecionado progênies com desempenhos relativos elevados e com ganhos genéticos preditos melhores que os dos índices de seleção testados. As progênies selecionadas com uso do método REML/Blup, para maior rendimento de grãos, não são as mesmas selecionadas para maior capacidade de expansão. O índice de Mulamba & Mock e o método REML/Blup proporcionam os melhores ganhos preditos para a população UENF 14.The objective of this work was to compare four selection indices and the REML/Blup method in the evaluation of the predicted genetic gains for the characteristics of interest to the breeding program of the UENF 14 popcorn. Two hundred full‑sib progenies were evaluated in one season, in two locations (North and Northwest Regions of the state of Rio de Janeiro, Brazil), with two replicates, totaling 800 observations. The characteristics evaluated were average plant height, average height of first ear insertion, final stand, tipping, stem diameter, prolificacy, grain yield and popping expansion. Among the selection indices tested, Mulamba & Mock’s provided the best results for selection of full‑sib progenies. The REML/Blup method proved to be very efficient, selecting progenies with high relative performance and better predicted genetic gains than those of the selection indices tested. The progenies selected using the REML/Blup method, for highest grain yield, are not the same as those selected for higher popping expansion. The Mulamba & Mock index and the REML/Blup method provide the best predicted gains for the UENF 14 population