Pretransplant HLA typing revealed loss of heterozygosity in the major histocompatibility complex in a patient with acute myeloid leukemia

Introduction Chromosomal abnormalities are frequent events in hematological malignancies. The degree of HLA compatibility between donor and recipient in hematopoietic stem cell transplantation is critical. Purpose of the study In this report, we describe an acute myeloid leukemia case with loss of heterozygosity (LOH) encompassing the entire HLA. Materials and methods HLA molecular typing was performed on peripheral blood (PB) and buccal swabs (BS). Chromosomal microarray analysis (CMA) was performed using a whole genome platform. Results Typing results on PB sample collected during blast crisis demonstrated homozygosity at the -A, -B, -C, -DR, and -DQ loci. A BS sample demonstrated heterozygosity at all loci. A subsequent PB sample drawn after count recovery confirmed heterozygosity. The CMA performed on PB samples collected during and after blast crisis revealed a large terminal region of copy-neutral LOH involving chromosome region 6p25.3p21.31, spanning approximately 35.9 Mb. The results of the CMA assay on sample collected after count recovery did not demonstrate LOH. Conclusions LOH at the HLA gene locus may significantly influence the donor search resulting in mistakenly choosing homozygous donors. We recommend confirming the HLA typing of recipients with hematological malignancies when homozygosity is detected at any locus by using BS samples, or alternatively from PB when remission is achieved

HLA Associations in Classical Hodgkin Lymphoma:EBV Status Matters

The pathogenesis of classical Hodgkin lymphoma (cHL) involves environmental and genetic factors. To explore the role of the human leukocyte antigen (HLA) genes, we performed a case-control genotyping study in 338 Dutch cHL patients using a PCR-based sequence-specific oligonucleotide probe (SSOP) hybridization approach. The allele frequencies were compared to HLA typings of more than 6,000 controls. The age of the cHL patients varied between 13 and 81 years with a median of 35 years. Nodular sclerosis subtype was the most common subtype (87%) and EBV was detected in 25% of the cHL patients. HLA-B5 was significantly increased and HLA-DR7 significantly decreased in the total cHL patient population as compared to controls. Two class II associations were observed to be specific for the EBV- cHL population with an increase of HLA-DR2 and HLA-DR5. Allele frequencies of HLA-A1, HLA-B37 and HLA-DR10 were significantly increased in the EBV+ cHL population; these alleles are in strong linkage disequilibrium and form a common haplotype in Caucasians. The allele frequency of HLA-A2 was significantly decreased in the EBV+ cHL population. Analysis of haplotypes with a frequency of >1% revealed a significant increase of HLA-A2-B7-DR2 in EBV- cHL as compared to controls. SSOP association analysis revealed significant differences between EBV+ and EBV- cHL patients for 19 probes that discriminate between HLA-A*01 and HLA-A*02. In conclusion, the HLA-A1 and HLA-A2 antigens and not specific single nucleotide variants shared by multiple alleles are responsible for the association with EBV+ cHL. Furthermore several new protective and predisposing HLA class I and II associations for the EBV+, the EBV- and the entire cHL population were identified

16(th) IHIW: population global distribution of killer immunoglobulin-like receptor (KIR) and ligands.

In the last fifteen years, published reports have described KIR gene-content frequency distributions in more than 120 populations worldwide. However, there have been limited studies examining these data in aggregate to detect overall patterns of variation at regional and global levels. Here, we present a summary of the collection of KIR gene-content data for 105 worldwide populations collected as part of the 15th and 16th International Histocompatibility and Immunogenetics Workshops, and preliminary results for data analysis

HLA-DR genotyping and mitochondrial DNA analysis reveal the presence of family burials in a fourth century Romano-British Christian cemetery

In Colchester, Britain's oldest recorded town, during the Roman period there were areas which were clearly used solely as cemeteries. One o f the most significant is at Butt Road, which includes a late Roman probable Christian cemetery with an associated building, apparently a church, that overlies and developed from a pagan inhumation cemetery. DNA was extracted from the long bones (femurs) of 29 individuals, mostly from a large complex of burials centered on two timber vaults. These were thought to comprise a number of family groupings, deduced from osteological analysis, stratigraphical and other considerations. The use of a modified version of the silica-based purification method recovered nanogram quantities of DNA/gram of bone. Two-stage amplification, incorporating primer-extension preamplification-polymerase chain reaction, permitted simultaneous amplification of both mitochondrial and nuclear DNA. Sequence-specific oligonucleotide probes yielded human leukocyte antigen (HLA)-DR typing of seven samples, with four revealing the infrequent HLA-DR10 genotype. Examination of the control region of mitochondrial DNA (mtDNA) by direct sequencing revealed polymorphisms yet to be reported in the modern population. HLA-DRB typing and mtDNA analysis affirmatively supported kinship among some, if not all, individuals in the "vault complex" and demonstrate a continental European origin of the individuals investigated

Biología del Sistema Antígeno Leucocitario Humano y su importancia en la Hematología

Esta investigación tuvo como objetivo principal describir la biología del sistema antígeno leucocitario humano y su importancia en la hematología, además de determinar la importancia de este sistema característicamente polimórfico e importante en la terapia transfusional, también se estudiaron otros aspectos, tales como: el rol que desempeña el HLA en la hematología, los haplotipos del sistema y la utilidad de las pruebas que se utilizan para la investigación del mismo. El diseño de la investigación se basó en un estudio documental descriptivo donde se abordaron los aspectos señalados en los objetivos propuestos. Para obtener la información que sustenta este trabajo se utilizaron técnicas para la recolección de datos como, análisis de literatura y documentos encontrados vía internet para lograr el propósito de la investigación. El antígeno leucocitario humano es un conjunto de moléculas implicadas en el reconocimiento inmunológico y en la señalización entre células del sistema inmunitario. Las formas en que son transmitidas de padres a hijos constituyen un sistema también denominado de complejo principal de histocompatibilidad o de la individualidad para diferenciar lo propio de lo ajeno. En el reconocimiento de aloantígenos, las células del donante reconocerían los antígenos HLA extraños del receptor, que podrían activarse, proliferarse y atacar al huésped. Las pruebas celulares, serológicas y moleculares se utilizan en la tipificación HLA para determinar el grado de compatibilidad que exhibe el receptor-donador, detectar en el receptor anticuerpos anti–HLA clínicamente relevantes dirigidos en contra de las especificidades antigénicas de su potencial donador, conocer el grado de aloinmunización humoral del paciente (sensibilización) y conocer la especificidad del anticuerpo anti HLA presente para evaluar el estatus inmunológico del paciente y la selección del donador. Finalmente se concluye que el sistema antígeno leucocitario humano tiene relación entre la hematología y la inmunología, en donde la inmunología le sirve a la hematología para salvar la vida de un paciente y mejorar la sobrevida libre de eventos después de la aplicación farmacoterapeutica. La aplicación de la biología molecular en esta área ha hecho posible la identificación más precisa y de nuevas variantes antigénicas anteriormente no conocidas, que han contribuido a ampliar las posibilidades del trasplante hematopoyético a donantes no familiares y con células del cordón umbilical, lo que incrementa las opciones de curación de diversas enfermedade

Exámenes de Antígeno de Histocompatibilidad

Esta investigación tuvo como objetivo principal abordar la importancia del sistema HLA haciendo énfasis en los exámenes de antígeno de histocompatibilidad. Se estudiaron aspectos, tales como: Describir la función que desempeña el sistema mayor de histocompatibilidad (HLA) en los trasplantes, exponer los tipos de antígenos de histocompatibilidad del sistema HLA. explicar los métodos de detección en la investigación del sistema HLA, así como también valorar la importancia del sistema HLA en la actualidad. El diseño de la investigación se basó en un estudio documental descriptivo, donde se abordaron los aspectos señalados en los objetivos propuestos. Para obtener la información que sustenta este trabajo se utilizaron técnicas para la recolección de datos como fichas bibliográficas, análisis de literatura y documentos encontrados en internet para lograr el propósito de la investigación. Así como también programas de Microsoft Word 2010 para la realización y entrega del trabajo y PowerPoint 2010 para la presentación y defensa del trabajo. Finalmente se concluye que: El Sistema HLA y los exámenes de antígeno de histocompatibilidad, desempeña una función importante en los trasplantes de órganos con el reconocimiento de antígenos y anticuerpos que pueden producir una reacción adversa en los trasplantes. La dinámica de los holotipos del Sistema HLA consiste en diferenciar lo propio de lo ajeno. En el reconocimiento de aloantígenos, las células del donante reconocerían los antígenos HLA extraños del receptor, que podrían activarse, proliferarse y atacar al huésped. Las pruebas celulares, serológicas y moleculares se utilizan en la tipificación HLA para determinar el grado de compatibilidad que exhibe el receptor donador, detectar en el receptor anticuerpos anti–HLA clínicamente relevantes dirigidos en contra de las especificidades antigénicas de su potencial donador, conocer el grado de aloinmunización humoral del paciente (sensibilización) y conocer la especificidad del anticuerpo anti HLA presente para evaluar el estatus inmunológico del paciente y la selección del donador

A new DR7-DQ8 haplotype resulting from a recombination between the DQA1 and DQB1 loci in a leukemic patient of Caucasoid origin

Meiotic recombinations within the HLA-DR/DQ subregion are seldomly observed. However the high number of unusual DRB1-DQB1 allelic combinations underline the importance of crossover in shaping the classII haplotypic diversity. We present here the first report of a DQA1-DQB1 recombination event in a leukemic patient as detected by complete classII molecular typing of the family, including analysis of the DQCAR microsatellite. The recombination that occurred on the maternal chromosomes led to the unusual DR7-DQ8 haplotype characterized by the DRB1*0701-DRB4*01030102N-DQA1*0201-DQB1*0302 alleles. Because the patient had no HLA-identical sibling donor, a search for an unrelated hematopoietic stem cell donor was initiated. Out of three potential donors, only one HLA-A/-B/-C/DRB1-compatible but DQB1-mismatched donor could be identifie

Altered distribution of mucosal NK cells during HIV infection.

The human gut mucosa is a major site of human immunodeficiency virus (HIV) infection and infection-associated pathogenesis. Increasing evidence shows that natural killer (NK) cells have an important role in control of HIV infection, but the mechanism(s) by which they mediate antiviral activity in the gut is unclear. Here, we show that two distinct subsets of NK cells exist in the gut, one localized to intraepithelial spaces (intraepithelial lymphocytes, IELs) and the other to the lamina propria (LP). The frequency of both subsets of NK cells was reduced in chronic infection, whereas IEL NK cells remained stable in spontaneous controllers with protective killer immunoglobulin-like receptor/human leukocyte antigen genotypes. Both IEL and LP NK cells were significantly expanded in immunological non-responsive patients, who incompletely recovered CD4+ T cells on highly active antiretroviral therapy (HAART). These data suggest that both IEL and LP NK cells may expand in the gut in an effort to compensate for compromised CD4+ T-cell recovery, but that only IEL NK cells may be involved in providing durable control of HIV in the gut

Pengelompokan Genotip, Serologi Dan Supertipe Gene HLA Kelas I Pada Suku Jawa, Indonesia

Gen Human Leukocyte Antigen (HLA) berperan penting dalam sistim pertahanan tubuh manusia. Gen ini juga terkenal sebagai gen yang paling polimorfik dalam struktur genom manusia. Oleh karena itu identifikasi gen HLA sangat penting dilakukan pada tiap populasi termasuk populasi suku Jawa. Pada penelitian ini, telah dilakukan identifikasi genotipe HLA pada 237 subyek. Namun demikian, selain genotip, perlu juga dilakukan pengelompokan berdasarkan jenis serologi dan supertipe HLA. Makalah ini menyajikan pengelompokan gen HLA kelas I berdasarkan database yang umum dirujuk oleh peneliti-peneliti lainnya