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    Bases moleculares de la interacci贸n de la E3 ubiquitina ligasa TRIM7 con glucogenina-1 y su potencial relevancia en el contexto de la glucogenosis tipo XV

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    Tesis (Doctor en Ciencias Qu铆micas) - - Universidad Nacional de C贸rdoba. Facultad de Ciencias Qu铆micas, 2021Resumen: La ubiquitinaci贸n es un tipo de modificaci贸n postraduccional caracter铆stico de organismos eucariotas, que requiere de la acci贸n conjunta de las enzimas E1 activadora, E2 conjugadora y E3 ligasa para mediar la transferencia de ubiquitina a una prote铆na sustrato. TRIM7 es una E3 ligasa que recientemente ha adquirido inter茅s por su rol en diversas patolog铆as, y pertenece a la familia de prote铆nas TRIM, caracterizadas por un motivo conservado tripartito (TRIM) N-terminal y una regi贸n C-terminal variable que puede mediar el reconocimiento de sustratos. Inicialmente, fue identificada como una prote铆na que interacciona a trav茅s de su dominio C-terminal B30.2 (TRIM7B30.2) con glucogenina-1 (GN1). Dicha prote铆na es responsable de la iniciaci贸n de la bios铆ntesis del gluc贸geno, por lo que las mutaciones que afectan al gen que la codifica se traducen en un trastorno extremadamente raro denominado glucogenosis tipo XV. El presente trabajo se centr贸 en caracterizar a TRIM7B30.2 por cristalograf铆a de rayos X, y describir detalles sobre las regiones relevantes para la interacci贸n con GN1. La estructura de TRIM7B30.2 revel贸 un plegamiento de tipo s谩ndwich-尾 formado por dos l谩minas 尾 antiparalelas caracter铆stico de este tipo de dominios, adem谩s de presentar una cavidad con carga positiva en la cara c贸ncava de dicho plegamiento. Adicionalmente, se logr贸 identificar a residuos clave que delimitan la zona involucrada en la interacci贸n con GN1, adem谩s de obtener indicios de que el extremo C-terminal de esta 煤ltima es necesario para su reconocimiento por TRIM7B30.2 y la prote铆na TRIM7 entera. Otra parte de este estudio se dedic贸 a conocer el impacto de la mutaci贸n patol贸gica Ala16Pro sobre GN1 de conejo, que presenta una alta homolog铆a con la prote铆na humana, mediante el uso de un amplio conjunto de t茅cnicas bioqu铆micas y biof铆sicas. El an谩lisis revel贸 un cambio estructural significativo que ocasion贸 una disminuci贸n de la afinidad por su sustrato y, en consecuencia, de la actividad de la prote铆na; adem谩s de una marcada p茅rdida de estabilidad. Por 煤ltimo, se busc贸 conocer si GN1 y sus mutantes patol贸gicas Ala16Pro y Thr83Met, son sustrato de su actividad E3 ligasa; y si esto podr铆a tener un rol relevante en la glucogenosis tipo XV. Los resultados de la reacci贸n in vitro mostraron que la transferencia de ubiquitina no ocurre bajo las condiciones empleadas, sin embargo, se encontr贸 que TRIM7 interacciona con la mutante patol贸gica GN1 Ala16Pro pese al cambio estructural de la prote铆na, lo que podr铆a implicar a TRIM7 en la v铆a de degradaci贸n de esta mutante, y por ello el estudio ser谩 continuado en cultivos celulares.Abstract : Ubiquitination is a common post translational modification in eukaryotes, which involves an E1 activating enzyme, an E2 conjugating enzyme, and an E3 ligase enzyme; in a process that mediates the transfer of ubiquitin to a substrate protein. TRIM7 is an E3 ligase member of the TRIM protein family, characterized by an N-terminal tripartite motif (TRIM) and a variable C-terminal region that can mediate substrate recognition, that has been recently linked to diverse pathological processes. TRIM7 was initially identified as a glycogenin-1 (GN1) interacting protein, and this interaction involves the C-terminal B30.2 domain of TRIM7 (TRIM7B30.2). GN1 is the protein that initiates glycogen biosynthesis, and mutations in the gene that encodes for this enzyme are involved in the onset of an extremely rare disease known as type XV glycogen storage disease. This work was mainly focused on the characterization of TRIM7B30.2, through the use of X-ray crystallography, and the details of the region involved in the interaction with GN1. The structure of TRIM7B30.2 revealed the characteristic B30.2 domain fold consisting of two 尾-sheets arranged as a distorted 尾-sandwich, and a positively charged cavity in the hypervariable region of this domain. Besides, key residues that define the zone of interaction with GN1 were identified, and evidence for the requirement of the latter鈥檚 C-terminal region in the binding was found. This study was also focused on the effect of the pathogenic Ala16Pro mutation on rabbit GN1, which displays a high sequence homology with the human protein; and to this end, a wide range of biophysical and biochemical techniques were applied. The analysis revealed a significant structural change which resulted in a decrease in substrate affinity and protein activity, besides a considerable loss of stability. Finally, the thesis was oriented towards analyzing the potential E3 ligase activity of TRIM7 on GN1 and the pathological mutants Ala16Pro and Thr83Met, and its possible functional role on type XV glycogen storage disease. The results have shown that in vitro, TRIM7 does not transfer ubiquitin to GN1 or the mutants in this experimental setup. However, it was found that despite the structural change caused by the mutation, TRIM7 still interacts with the Ala16Pro mutant of human GN1, which might implicate the intervention of TRIM7 in the degradation pathway of this mutant, and for this reason, this study will be continued in cell cultures.2023-08-30Fil: Mu帽oz Sosa, Christian Javier. Universidad Nacional de C贸rdoba. Facultad de Ciencias Qu铆micas; Argentina.Fil: Carrizo Garcia, Mar铆a Elena. Universidad Nacional de C贸rdoba. Facultad de Ciencias Qu铆micas. Departamento de Qu铆mica Biol贸gica; Argentina.Fil: Carrizo Garcia, Mar铆a Elena. Consejo Nacional de Investigaciones Cient铆ficas y T茅cnicas. Centro de Investigaciones en Qu铆mica Biol贸gica de C贸rdoba; Argentina.Fil: Genti de Raimondi, Susana Del Valle. Universidad Nacional de C贸rdoba. Facultad de Ciencias Qu铆micas. Departamento de Bioqu铆mica Cl铆nica; Argentina.Fil: Genti de Raimondi, Susana del Valle. Consejo Nacional de Investigaciones Cient铆ficas y T茅cnicas. Centro de Investigaciones en Bioqu铆mica Cl铆nica e Inmunolog铆a; Argentina.Fil: Carbonio, Raul Ernesto. Universidad Nacional de C贸rdoba. Facultad de Ciencias Qu铆micas. Departamento de Fisicoqu铆mica; Argentina.Fil: Carbonio, Raul Ernesto. Consejo Nacional de Investigaciones Cient铆ficas y T茅cnicas. Instituto de Investigaciones en Fisicoqu铆mica de C贸rdoba; Argentina.Fil: Romero, Jorge Miguel. Universidad Nacional de C贸rdoba. Facultad de Ciencias Qu铆micas; Argentina.Fil: Erm谩cora, Mario Roberto. Consejo Nacional de Investigaciones Cient铆ficas y T茅cnicas. Instituto Multidisciplinario de Biolog铆a Celular; Argentina

    Pol铆ticas y estrategias de comunicaci贸n. Caso FCEFyN

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    Trabajo Final para optar al grado acad茅mico de Licenciatura en Comunicaci贸n Social, Universidad Nacional de C贸rdoba (in茅dita) Calificaci贸n: 10 (diez) Orientaci贸n InstitucionalLa comunicaci贸n es el soporte fundamental para la construcci贸n colectiva de los imaginarios en cada 茅poca y sociedad y, adem谩s, es una herramienta sumamente importante a la hora de comprender y analizar las relaciones y v铆nculos humanos. La tarea que tienen hoy las organizaciones, referentes sociales y profesionales independientes, es entender la manera en que las personas se relacionan: reconocer esos v铆nculos y diagnosticarlos, sistematizar sus caracter铆sticas para establecer fortalezas y debilidades. Con esa informaci贸n podr谩n planificar acciones comunicacionales que se dirijan a la concreci贸n de los objetivos y las necesidades de la organizaci贸n. A trav茅s de la optimizaci贸n de los procesos de comunicaci贸n, su sistematizaci贸n, planificaci贸n e implementaci贸n, se podr谩n garantizar resultados en todos sus niveles institucionales, potenciando los v铆nculos tanto internos como externos. As铆, la comunicaci贸n se vuelve un veh铆culo y un elemento fundamental y estrat茅gico a la hora de gestionar de las organizaciones.Fil: Rasano, Valentina. Universidad Nacional de C贸rdoba. Facultad de Ciencias de la Comunicaci贸n; Argentina.Fil: Vankeirsbilck, Debora Florencia. Universidad Nacional de C贸rdoba. Facultad de Ciencias de la Comunicaci贸n; Argentina

    Origen y evoluci贸n de las audiencias en la Corona de Castilla

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    21 p谩ginasAl hablar de la Corona de Castilla nos situamos, en el tiempo, en la 茅poca bajomedieval y en la Edad Moderna. En el espacio, en los territorios que le pertenecen y que 鈥攃omo se sabe鈥 se ampl铆an de manera espectacular, durante ese per铆odo, en la Pen铆nsula y, sobre todo, en las Indias. No se considera aqu铆 a los territorios de la Corona de Arag贸n, hasta que deja de ser independiente de Castilla, aunque el nombre de Audiencia se conoci贸 y se emple贸 en la Corona de Arag贸n desde la Baja Edad Media para designar tambi茅n a un tribunal de justicia real. Pero se trata de una iniciativa diferente, presentaba unas caracter铆sticas y una organizaci贸n muy distintas de las Audiencias castellanas, y finalmente y sobre todo, el 芦sistema禄 castellano 鈥攕i se puede hablar de tal sistema鈥 acab贸 sustituyendo al aragon茅s. La definici贸n de la instituci贸n de la Audiencia en Castilla y en las Indias no es simple; en primer lugar, por una raz贸n pr谩ctica, pues es designada a menudo con nombres diferentes, lo que refleja su caracter铆stica esencial: no es una instituci贸n cristalizada, creada de una vez por todas. Y hablar de la instituci贸n de la Audiencia equivale, en gran medida, a hablar de su evoluci贸n. En efecto, en un principio se trata de un tribunal 煤nico, pr贸ximo al rey, pero, con el tiempo, se van multiplicando las Audiencias en la Pen铆nsula y en las Indias. Adem谩s, este tribunal, aun siendo 煤nico, no tuvo siempre la misma composici贸n, ni las mismas atribuciones, ni las mismas competencias judiciales como, en general, tampoco las tuvieron las distintas Audiencias creadas a lo largo del tiempo respecto de la originaria ni cada una respecto de las dem谩s.S

    El Tratado de Niza: entre la consolidaci贸n de la Uni贸n Europea de Maastricht y el debate sobre el futuro de Europa

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    30 p谩ginasLas principales reformas introducidas en el Tratado de Niza incluyen las cooperaciones reforzadas, cuestiones institucionales y la ampliaci贸n del uso de mayor铆as calificadas. El sistema de cooperaciones reforzadas, introducido en el Tratado de Amsterdam, fue fortalecido en Niza y permitir谩 una integraci贸n m谩s r谩pida y profunda. La reforma institucional toc贸 el n煤mero de votos asignados en el Consejo Europeo, y la distribuci贸n de asientos en el Parlamento Europeo y en la comisi贸n. En cuanto a la Corte de Justicia, varias de sus caracter铆sticas podr谩n ser reformadas con el voto un谩nime del consejo en lugar de requerirse una Conferencia Intergubernamental. Ha habido cambios en la distribuci贸n de las competencias entre el Tribunal de Primera Instancia y la Corte de Justicia. Esta 煤ltima ser谩 integrada por un juez por cada Estado miembro, y trabajar谩 preferentemente en salas, y no en pleno como en el pasado.S

    El estatus jur铆dico del lobo ib茅rico en el punto de mira : un cambio de paradigma en Castilla y Le贸n = The legal status of the iberian wolf in point of view : a change of paradigm in Castilla y Le贸n

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    40 p谩ginasLa situaci贸n jur铆dica del lobo ib茅rico en Castilla y Le贸n en los 煤ltimos tiempos ha sufrido una profunda modificaci贸n normativa. Son muchos los cambios producidos en su r茅gimen jur铆dico, principalmente en su catalogaci贸n al norte del r铆o Duero en Castilla y Le贸n, donde es especie cineg茅tica. Si bien la suspensi贸n cautelar de su caza al norte del precitado r铆o, decretada por Auto de 26 de abril de 2018, a lo que sigui贸 la urgente aprobaci贸n de la Ley 9/2019, de 28 de marzo, de modificaci贸n de la Ley 4/1996, de 12 de julio, de Caza de la comunidad aut贸noma de Castilla y Le贸n, as铆 como los 煤ltimos pronunciamientos jurisprudenciales en la materia, han motivado un cambio de paradigma en la consideraci贸n jur铆dica del lobo ib茅rico en Castilla y Le贸n. El estudio aborda la actual situaci贸n jur铆dica de la especie en nuestra Comunidad Aut贸noma a partir del an谩lisis jurisprudencial de la responsabilidad patrimonial por los da帽os que causa, rese帽ando las diferencias m谩s notables al respecto en funci贸n de la ubicaci贸n de sus ejemplares al norte o sur del r铆o Duero en Castilla y Le贸nS

    Absurdos digitales: una serie de podcast sobre redes sociales y cultura pol铆tica contempor谩nea

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    Trabajo Final para optar al grado acad茅mico de Licenciatura en Comunicaci贸n Social, Universidad Nacional de C贸rdoba (in茅dita). Calificaci贸n: 10 (diez) Orientaci贸n radiof贸nica鈥淎bsurdos Digitales: Un podcast sobre redes sociales y cultura pol铆tica contempor谩nea鈥 es un producto sonoro presentado en formato podcast como propuesta de trabajo final para la Licenciatura en Comunicaci贸n Social. Este trabajo tiene como objetivo generar una reflexi贸n en torno a los nuevos repertorios de acci贸n pol铆tica en redes sociales y a las modalidades que adopta el debate p煤blico en el espacio digital. Para ello, nos centramos en el an谩lisis de dos fen贸menos de la cultura digital que canalizan discursos pol铆ticos en redes sociales: los memes y las fake news. La producci贸n cuenta con dos piezas sonoras que corresponden a los primeros episodios de la serie y abordan respectivamente el uso pol铆tico de los memes y el empleo estrat茅gico de las fake news como elementos constitutivos de la comunicaci贸n pol铆tica. El an谩lisis toma como referencia los principales discursos y eventos que conciernen a la pol铆tica nacional e internacional de la 煤ltima d茅cada (2010-2020), a los fines de ejemplificar lo expuesto con una realidad actual. Esta propuesta parte de una premisa en torno a la consolidaci贸n de las redes sociales como espacio p煤blico de encuentro y debate ciudadano y de la inquietud por abordar los desaf铆os que transitamos como sujetos pol铆ticos frente al desarrollo de las tecnolog铆as de comunicaci贸n e informaci贸n. El producto es el resultado de una instancia de relevamiento te贸rico, un trabajo de recolecci贸n de informaci贸n mediante entrevistas y un proceso de producci贸n y dise帽o sonoro. Es una iniciativa que propone aportar a la comprensi贸n de nuestras pr谩cticas digitales cotidianas como actos pol铆ticos transformadores, a los fines de construir herramientas para mejorar nuestra experiencia como usuarios de redes sociales y enriquecer nuestra participaci贸n en espacio p煤blico digital. Por 煤ltimo, nos proponemos utilizar la diversidad de recursos sonoros y radiales existentes y atender a la potencialidad expresiva de lo sonoro para generar un producto atractivo y entretenido a la escucha, capaz de interpelar a una audiencia usuaria de redes sociales.Fil: Hern谩ndez Mazzola, Diego Ernesto. Universidad Nacional de C贸rdoba. Facultad de Ciencias de la Comunicaci贸n; Argentina.Fil: Stejman, Debora. Universidad Nacional de C贸rdoba. Facultad de Ciencias de la Comunicaci贸n; Argentina

    Study on the concordance between different SNP鈥恎enotyping platforms in sheep

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    .Different SNP genotyping technologies are commonly used in multiple studies to perform QTL detection, genotype imputation, and genomic predictions. Therefore, genotyping errors cannot be ignored, as they can reduce the accuracy of different procedures applied in genomic selection, such as genomic imputation, genomic predictions, and false-positive results in genome-wide association studies. Currently, whole-genome resequencing (WGR) also offers the potential for variant calling analysis and high-throughput genotyping. WGR might overshadow array-based genotyping technologies due to the larger amount and precision of the genomic information provided; however, its comparatively higher price per individual still limits its use in larger populations. Thus, the objective of this work was to evaluate the accuracy of the two most popular SNP-chip technologies, namely, Affymetrix and Illumina, for high-throughput genotyping in sheep considering high-coverage WGR datasets as references. Analyses were performed using two reference sheep genome assemblies, the popular Oar_v3.1 reference genome and the latest available version Oar_rambouillet_v1.0. Our results demonstrate that the genotypes from both platforms are suggested to have high concordance rates with the genotypes determined from reference WGR datasets (96.59% and 99.51% for Affymetrix and Illumina technologies, respectively). The concordance results provided in the current study can pinpoint low reproducible markers across multiple platforms used for sheep genotyping data. Comparing results using two reference genome assemblies also informs how genome assembly quality can influence genotype concordance rates among different genotyping platforms. Moreover, we describe an efficient pipeline to test the reliability of markers included in sheep SNP-chip panels against WGR datasets available on public databases. This pipeline may be helpful for discarding low-reliability markers before exploiting genomic information for gene mapping analyses or genomic predictionS

    What is the importance of sperm subpopulations?

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    .The study of sperm subpopulations spans three decades. The origin, meaning, and practical significance, however, are less clear. Current technology for assessing sperm morphology (CASA-Morph) and motility (CASA-Mot) has enabled the accurate evaluation of these features, and there are many options for data classification. Subpopulations could occur as a result of the stage of development of each spermatozoon in the subpopulation. Spermatogenesis might contribute to the production of these subpopulations. Insights from evolutionary biology and recent molecular research are indicative of the diversity among male gametes that could occur from unequal sharing of transcripts and other elements through cytoplasmic bridges between spermatids. Sperm cohorts exiting the gonads would contain different RNA and protein contents, affecting the spermatozoon physiology and associations with the surrounding environmental milieu. Subsequently, these differences could affect how spermatozoa interact with the environmental milieu (maturation, mixing with seminal plasma, and interacting with the environmental milieu, or female genital tract and female gamete). The emergence of sperm subpopulations as an outcome of evolution, related to the reproductive strategies of the species, genital tract structures, and copulatory and fertilization processes. This kind of approach in determining the importance of sperm subpopulations in fertilization capacity should have a practical impact for conducting reproductive technologies, inspiring and enabling new ways for the more efficient use of spermatozoa in the medical, animal breeding, and conservation fields. This manuscript is a contribution to the Special Issue in memory of Dr. Duane GarnerS

    A new index of resilience applicable to external pulse-disturbances that considers the recovery of communities in the short term

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    .Resilience is a key concept in the study of the recovery of ecosystems affected by disturbances. Currently, there are numerous indices to measure resilience, but many of them do not show the accuracy of the resilience value or the behaviour of ecological parameters in the face of disturbances. New approaches and technologies enable large amounts of information to be obtained, facilitating the proposal of new resilience indices that work consistently and intuitively for a wide variety of ecological response variables under different scenarios after pulse-disturbances. In this study, we propose and verify a new resilience index, comparing its performance with others previously published. We validated the performance of the new index using real data based on field measurements of changes in soil bacterial OTUs diversity and abundance after a wildfire. The new resilience index provided an automatic and robust functional classification of the behaviour of ecosystems after disturbances, supported by a bootstrap analysis. We identified 5 scenarios of ecosystem resilience performance according to their behaviour after a pulse-disturbance: resilient, non-resilient, recovering, rebound, and continuing.S

    Identification of Hindbrain Neural Substrates for Motor Initiation in the hatchling Xenopus laevis Tadpole

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    Animal survival profoundly depends on the ability to detect stimuli in the environment, process them and respond accordingly. In this respect, motor responses to a sensory stimulation evolved into a variety of coordinated movements, which involve the control of brain centres over spinal locomotor circuits. The hatchling Xenopus tadpole, even in its embryonic stage, is able to detect external sensory information and to swim away if the stimulus is considered noxious. To do so, the tadpole relies on well-known ascending sensory pathway, which carries the sensory information to the brain. When the stimulus is strong enough, descending interneurons are activated, leading to the excitation of spinal CPG neurons, which causes the undulatory movement of swimming. However, the activation of descending interneurons that marks the initiation of motor response appears after a long delay from the sensory stimulation. Furthermore, the long-latency response is variable in time, as observed in the slow-summating excitation measured in descending interneurons. These two features, i.e. long-latency and variability, cannot be explained by the firing time and pattern of the ascending sensory pathway of the Xenopus tadpole. Therefore, a novel neuronal population has been proposed to lie in the hindbrain of the tadpole, and being able to 'hold' the sensory information, thus accounting for the long and variable delay of swim initiation. In this work, the role of the hindbrain in the maintenance of the long and variable response to trunk skin stimulation is investigated in the Xenopustadpole at developmental stage 37/38. A multifaceted approach has been used to unravel the neuronal mechanisms underlying the delayed motor response, including behavioural experiments, electrophysiology analysis of fictive swimming, hindbrain extracellular recordings and imaging experiments. Two novel neuronal populations have been identified in the tadpole's hindbrain, which exhibit activation patterns compatible with the role of delaying the excitation of the spinal locomotor circuit. Future work on cellular properties and synaptic connections of these newly discovered populations might shed light on the mechanism of descending control active at embryonic stage. Identifying supraspinal neuronal populations in an embryonic organism could aid in understanding mechanisms of descending motor control in more complex vertebrates
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