Uncertain Trees: Dealing with Uncertain Inputs in Regression Trees

Tree-based ensemble methods, as Random Forests and Gradient Boosted Trees, have been successfully used for regression in many applications and research studies. Furthermore, these methods have been extended in order to deal with uncertainty in the output variable, using for example a quantile loss in Random Forests (Meinshausen, 2006). To the best of our knowledge, no extension has been provided yet for dealing with uncertainties in the input variables, even though such uncertainties are common in practical situations. We propose here such an extension by showing how standard regression trees optimizing a quadratic loss can be adapted and learned while taking into account the uncertainties in the inputs. By doing so, one no longer assumes that an observation lies into a single region of the regression tree, but rather that it belongs to each region with a certain probability. Experiments conducted on several data sets illustrate the good behavior of the proposed extension.Comment: 9 page

Hemorheological Failure in the Pathology of Cardio-vascular Complications in Patients with Diabetic Foot Syndrome

The literature that includes the study of cardiovascular complications in patients with diabetic foot syndrome was analyzed. The topicality of this problem is caused by the steady growth of diabetes mellitus morbidity among people. For today there are more than 170 mln people throughout the world with diabetes mellitus, among them 65–80 % have cardiovascular complications (myocardium infarction, acute disorder of brain blood circulation and so on).It is established for today, that pathogenesis of diabetic foot syndrome is multi-factor one and the development of purulent-necrotic stages of DFS is connected with the combination of different factors, especially microcirculation disorder. In this article we\u27ll consider the mechanisms of diabetic angiopathy development, the state of platelet-vascular hemostasis link in this category of patients

Pasta consumption and connected dietary habits: Associations with glucose control, adiposity measures, and cardiovascular risk factors in people with type 2 diabetes—TOSCA.IT study

Background: Pasta is a refined carbohydrate with a low glycemic index. Whether pasta shares the metabolic advantages of other low glycemic index foods has not really been investigated. The aim of this study is to document, in people with type-2 diabetes, the consumption of pasta, the connected dietary habits, and the association with glucose control, measures of adiposity, and major cardiovascular risk factors. Methods: We studied 2562 participants. The dietary habits were assessed with the European Prospective Investigation into Cancer and Nutrition (EPIC) questionnaire. Sex-specific quartiles of pasta consumption were created in order to explore the study aims. Results: A higher pasta consumption was associated with a lower intake of proteins, total and saturated fat, cholesterol, added sugar, and fiber. Glucose control, body mass index, prevalence of obesity, and visceral obesity were not significantly different across the quartiles of pasta intake. No relation was found with LDL cholesterol and triglycerides, but there was an inverse relation with HDL-cholesterol. Systolic blood pressure increased with pasta consumption; but this relation was not confirmed after correction for confounders. Conclusions: In people with type-2 diabetes, the consumption of pasta, within the limits recommended for total carbohydrates intake, is not associated with worsening of glucose control, measures of adiposity, and major cardiovascular risk factors

Polimorfismi dell'inibitore 1 dell'attivatore del plasminogeno e dell'enzima di conversione dell'angiotensina e rischio di complicanze nel diabete di tipo 1 e di tipo 2

Background. Il sistema dell'attivatore del plasminogeno è ampiamente sotto il controllo del sistema renina-angiotensina: l'angiotensina II, sintetizzata dall’enzima di conversione dell’angiotensina (ACE), aumenta l'espressione e l'attività dell’inibitore dell’attivatore del plasminogeno (PAI-1). Entrambi i sistemi promuovono meccanismi coinvolti nella proliferazione delle cellule muscolari lisce e delle cellule mesangiali nonché nell'accumulo di matrice extracellulare. Le attività dell’ACE e del PAI-1 sono regolate rispettivamente dal polimorfismo inserzione/delezione (I/D) localizzato sull'introne 16 del gene dell'ACE e dal polimorfismo 4G/5G localizzato sul promotore del gene del PAI-1. Obiettivo. Studiare la plausibile interazione dei polimorfismi di ACE e PAI-1 nel modulare la suscettibilità alle complicanze micro- e macrovascolari nel diabete mellito in 732 soggetti con diabete tipo 1 e 605 con diabete tipo 2. Metodi. PCR (e PCR specifica per la sequenza di inserzione) o dHPLC e PCR + RFLP (Restriction Fragment Length Polymorphism) sono state utilizzate rispettivamente per lo screening dei genotipi di ACE e PAI-1, su campioni di DNA ottenuto con estrazione salina. L’associazione con la presenza di microangiopatia è stata anche indagata raggruppando i soggetti in base all’assenza di ogni complicanza, alla presenza di almeno una complicanza da uno stadio iniziale (microalbuminuria e/o retinopatia background), o alla presenza di almeno una complicanza in stadio avanzato (nefropatia conclamata e/o retinopatia proliferante). Risultati. In tutti i pazienti diabetici il polimorfismo 4G/5G era associato alla presenza di complicanze microvascolari. Nel diabete tipo 1 il genotipo 4G4G risultava più frequente nei soggetti con aumentata AER (34 vs 24%, p=0.01), retinopatia proliferante (35 vs 25%, p=0.03) e microangiopatia renale e/o retinica avanzata o incipiente (37% e 25% vs 18%, X2=33.7, 4df p<0.001). Le relazioni fra il genotipo 4G4G e gli stadi di nefropatia, la retinopatia proliferante e le complicanze microvascolari avanzate risultavano indipendenti da durata del diabete, pressione arteriosa e HbA1c. Nelle femmine con diabete tipo 2 il genotipo 4G4G era associato a nefropatia conclamata (p=0.02) indipendentemente da pressione sistolica, HbA1c e BMI. Nel diabete tipo 1, ma non nel tipo 2, la frequenza del genotipo 4G4G era più elevata in presenza di CVD (47 vs 30%, p=0.003). Il polimorfismo I/D si associava significativamente con ipertensione e CVD nel diabete tipo 2: infatti, il genotipo II risultava più frequente in soggetti normotesi (19 vs 10%, p=0.01) ed in soggetti senza CVD (14 vs 7%, p=0.03). Nessuna interazione nè effetti sinergici tra i due polimorfismi sono stati osservati nel modulare il rischio di complicanze micro- e macrovascolari. Conclusioni. In risultati suggeriscono che il polimorfismo 4G/5G del PAI-1, ma non quello I/D dell’ACE, contribuisce in maniera indipendente nell'aumentato rischio di complicanze microvascolari, particolarmente nel diabete tipo 1. L’interazione biologicamente plausibile tra polimorfismi ACE ID e PAI-1 4G5G in relazione al rischio di complicanze non emerge in una ampia coorte di soggetti con diabete tipo 1 e tipo 2

Serum resistin is causally related to mortality risk in patients with type 2 diabetes: Preliminary evidences from genetic data

Resistin has been firmly associated with all-cause mortality. We investigated, whether, in patients with type 2 diabetes (T2D), this association is sustained by a cause-effect relationship. A genotype risk score (GRS), created by summing the number of resistin increasing alleles of two genome-wide association studies (GWAS)-derived single nucleotide polymorphisms (SNPs), serum resistin measurements and allcause death records were obtained in 1,479 (403 events/12,454 person-years), patients with T2D from three cohorts, Gargano Heart Study-prospective design (n = 350), Gargano Mortality Study (n = 698) and Foggia Mortality Study (n = 431), from Italy. GRS was strongly associated with serum resistin in a non-linear fashion (overall p = 3.5 ∗ 10-7) with effect size modest for GRS = 1 and 2 and much higher for GRS &gt;3, with respect to GRS = 0. A significant non-linear association was observed also between GRS and all-cause mortality (overall p = 3.3 ∗ 10-2), with a low effect size for GRS = 1 and 2, and nearly doubled for GRS ≥ 3, with respect to GRS = 0. Based on the above-reported associations, each genetic equivalent SD increase in log-resistin levels showed a causal hazard ratio of all-cause mortality equal to 2.17 (95%CI: 1.22-3.87), thus providing evidence for a causal role of resistin in shaping the risk of mortality in diabetic patients

Ruolo del sistema ubiquitina-proteasoma (UPS) nella disfunzione beta cellulare del diabete di tipo 2 e possibili opzioni terapeutiche.

Ruolo del sistema ubiquitina-proteasoma (UPS) nella disfunzione beta cellulare del diabete di tipo 2 e possibili opzioni terapeutiche. Sebbene la disfunzione beta cellulare rivesta un ruolo di primaria importanza nel diabete di tipo 2, le informazioni ad oggi disponibili riguardanti il loro fenotipo molecolare in tale tipo di diabete, sono ancora piuttosto limitate. In questo lavoro, dapprima sono state valutate le differenze di espressione tra il trascrittoma di isole purificate da donatori affetti da diabete di tipo 2 (T2D) e quello di isole di donatori non diabetici (ND) mentre in seguito l’attenzione è stata focalizzata sul sistema ubiquitina-proteasoma (UPS), il principale pathway intracellulare deputato alla degradazione delle proteine. L’analisi microarray mostrava che 1230 geni risultavano differenzialmente espressi nelle isole diabetiche e che questi influenzavano sia la struttura che la funzione di tale tessuto. In seguito a questa ed ad altre analisi emergeva decisamente una riduzione dell’UPS nel T2D. Gli esperimenti di RT-PCR quantitativa mostravano una riduzione dell’espressione di UBE2K, PSMB7 e UCHL1 (geni dell’UPS). Studi di immunoistochimica rivelavano un maggior accumulo di ubiquitina accompagnato ad una riduzione dell’attività del proteasoma in T2D. L’inibizione diretta del proteasoma e l’esposizione ad acido palmitico riducevano l’ attività del proteasoma e a questo si accompagnava una riduzione della secrezione insulinica indotta da glucosio. La metformina e il GLP-1, due molecole comunemente utilizzate nel trattamento del diabete di tipo 2 in grado di ripristinare un corretto rilascio insulinico in risposta a glucosio associato ad un aumento dell’attività del proteasoma. In questo studio si mostra la presenza di numerose alterazioni nel trascrittoma delle isole diabetiche e si sottolinea l’importanza delle alterazioni a carico del sistema UPS come meccanismo associato alla disfunzione beta cellulare nel diabete di tipo 2

IL RENE COME NUOVO TARGET DI DI FARMACI ANTIDIABETICI:INIBITORI DI SGLT2

IL DIABETE DI TIPO 2 RAPPRESENTA UNA DELLE PATOLOGIE A PIù AMPIO E PROGRESSIVO INCREMENTO NELLA POPOLAZIONE MONDIALE. LA RICERCA DI NUOVI FARMACI E' PERTANTO UN'IMPELLENTE NECESSITA'. ACCANTO ALLE TRADIZIONALI STRATEGIE FARMACOLOGICHE COMUNEMENTE UTILIZZATE PER LA TERAPIA DI QUESTA MALATTIA METABOLICA STANNO EMERGENDO NUOVI E INTERESSANTI APPROCCI BASATI SU TARGET DI RECENTE ACQUISIZIONE. IL CO-TRASPORTATORE SODIO-GLUCOSIO DI TIPO 2 E' RESPONSABILE DEL PRESSOCHE' TOTALE RIASSORBIMENTO DEL GLUCOSIO A LIVELLO DEI TUBULI RENALI. L'INIBIZIONE DELLA FUNZIONE DI QUESTA PROTEINA DI MEMBRANA E' DUNQUE ASSOCIATA AD UNA PERDITA DI GLUCOSIO CON LE URINE E DUNQUE AD UN ABBASSAMENTO DELLA GLICEMIA. QUESTO HA RAPPRESENTATO UNA SOLIDA BASE RAZIONALE PER LO SVILUPPO DI FARMACI ORIGINALI DA UTIIZZARE NEL TRATTAMENTO DEL DIABETE DI TIPO 2. MOLECOLE COME DAPAGLIFLOZIN E ANALOGHI HANNO FORNITO ECCELLENTI RISULTATI NEGLI STUDI FARMACOLOGICI PRECLINICI, ED HANNO MOSTRATO EFFICACIA E SICUREZZA NEI SUCCESSIVI TRIAL CLINICI, RICEVENDO L'APPROVAZIONE DA PARTE DELLE PIù IMPORTANTI AGENZIE REGOLATORIE