Evaluación del bacterioma de distintos sustratos para establecer huertos urbanos

Abstract

Urban gardens offer an alternative way to obtain food; they also promote environmental stewardship and social cohesion; however, it is essential to use substrates that are suitable for plant growth and to increase production. The bacteria present in a crop’s growing medium largely determine the success of the harvest; therefore, the objective of this study was to characterize the bacterial community of different growing media used in urban gardens. Four substrates were analyzed: peat moss, due to its widespread use in gardens and orchards; black soil (from a nursery); agricultural soil (from northern Tamaulipas, Mexico); and a mixture of agricultural soil with worm castings and mycorrhizae. Genomic DNA was extracted from all substrates and the 16S region was amplified; the sequences were analyzed using the 16S Metagenomics application.  The most prevalent phyla were found to be Actinobacteria, Proteobacteria, and Firmicutes; and among the genera, Bacillus, Solirubrobacter, Rubrobacter, and Streptomyces stood out. All these microorganisms have been linked to benefits for crops, so their presence could promote the growth of various plant species cultivated in urban gardens.Los huertos urbanos son una alternativa para la obtención de alimentos; además, promueven el cuidado del ambiente y la cohesión social. Sin embargo, es fundamental contar con sustratos adecuados para el crecimiento de las plantas y aumentar la producción. Las bacterias presentes en el suelo de un cultivo determinan en gran parte el éxito de la cosecha. El objetivo del trabajo fue caracterizar el bacterioma de distintos sustratos que se utilizan en huertos urbanos. Se analizaron cuatro sustratos: turba, por su uso extendido en huertos y jardines; tierra negra (de vivero); tierra agrícola (de la zona norte de Tamaulipas, México) y una mezcla de tierra agrícola con humus de lombriz y micorrizas. Se obtuvo ADN genómico de todos los sustratos y se amplificó la región 16S; las secuencias se analizaron con la aplicación 16S Metagenomics. Se determinó que los filos con mayor prevalencia fueron las actinobacterias, proteobacterias y firmicutes y, en cuanto a los géneros, destacan Bacillus, Solirubrobacter, Rubrobactery Streptomyces. Todos estos microrganismos han sido relacionados con beneficios para los cultivos, por lo que su presencia podría favorecer el crecimiento de diversas especies vegetales cultivadas en huertos urbanos