Systematic characterization of small proteins with a domain of unknown function DUF 1127 in $\textit {Agrobacterium tumefaciens}$

Abstract

Die Arbeit befasst sich mit der Charakterisierung von Proteinen mit einer Domäne unbekannter Funktion DUF1127 in dem Pflanzenpathogen $\textit {Agrobacterium tumefaciens}$. Unter DUF1127-Proteinen finden sich zahlreiche Proteine, weniger als 50 Aminosäuren umfassen, was sie per Definition zu so genannte "kleinen Proteinen" macht. Bioinformatisch konnten zu den vier bekannten DUF1127-Proteinen drei weitere in $\textit {A. tumefaciens}$ identifiziert werden. Phylogenetische Unterschiede legten eine Unterteilung der DUF1127-Proteine unter Untergruppen nahe, was durch die differentielle Regulation der DUF1127-Genexpression bestätigt wurde. DUF1127-Proteine werden in Sucrose-haltigem Medium differentiell synthetisiert. Die Deletion von drei DUF1127-Genen mit hoher Sequenzähnlichkeit führte zu verschiedenen Phänotypen, zu denen auch ein Sucrose- und Osmolaritäts-abhängiger Wuchsdefekt zählt. Insgesamt weißen die Ergebnisse auf eine Funktion der DUF1127-Proteine bei der Verwertung oder der Aufnahme von Zucker hin