Characterization of stem cell factors NANOG1 and NANOG2 on gene and protein level in embryonic carcinoma cells and t(4;11) cell population

Abstract

Das NANOG2-Gen ist ein Genduplikat des nur in embryonalen Stammzellen exprimierten Stammzellfaktors NANOG1, der eine Schlüsselrolle bei der Pluripotenz und der Selbsterneuerung der Stammzellen und möglicherweise der Krebsstammzellen hat. Zur Analyse, ob NANOG2 die beschriebenen Funktionen von NANOG1 in Gewebestammzellen und Krebsstammzellen übernimmt und ursächlich für die Leukämieentstehung verantwortlich ist, wurden embryonale Zellen und primäre Leukämiezellen auf NANOG2-Expression durch RT-PCR-Experimente, Western Blot Analysen und ChIP Assays untersucht. Dabei konnte eine Methode zur Unterscheidung der NANOG1 und NANOG2-Transkripte etabliert, neue Genstrukturen dieser Gene charakterisiert und NANOG2-Transkripte in hämatopoetischen Stammzellen und in allen primären Leukämiezellen detektiert werden. Außerdem konnte mit Hilfe von Genexpressionsanalysen eine äquivalente Funktion von NANOG2 zu NANOG1 festgestellt werden.The gene NANOG2 is a duplicate of NANOG1, which is only expressed in embryonic stem cells and has a key role in pluripotency and self renewal of stem cells and possibly cancer stem cells. To analyze if NANOG2 has the same function like NANOG1 in adult stem cells and cancer stem cells and if it is responsible for initiation of leukemia, embryonic cells and primary leukemia cells were analyzed on NANOG2 expression by RT-PCR, immunological and ChIP assays. It was possible to establish a new method to distinguish between NANOG1 and NANOG2 transcripts, to detect NANOG2 transripts in hematopoetic stem cells and primary leukemia cells and to characterize new NANOG1 and NANOG2 gene structures. Furthermore it was possible to show that NANOG2 has an equivalent function to NANOG1