Immunostaing of p53 associated with absence of mutations in TP53 gene in dogs with lymphoma

Sabendo-se da influência das mutações no gene TP53 no desenvolvimento das neoplasias e da discrepância entre os resultados obtidos pelas técnicas de sequenciamento e imunoistoquímica, esta pesquisa teve como objetivo relacionar a sequência do TP53 com a imunorreatividade da p53. Foram obtidas amostras de linfoma de 12 cães. O diagnóstico histopatológico foi determinado pela classificação de Kiel. O imunofenótipo e a imunomarcação da p53 foram determinados por imunoistoquímica. Para reação com a p53, utilizou-se anticorpo policlonal anti-p53 (CM1) na diluição de 1:500. A região do gene TP53 compreendida entre os exons quatro e nove foi amplificada por PCR e submetida ao sequenciamento. Apesar dos resultados obtidos pela imunoistoquímica, nenhuma mutação foi encontrada nas sequências analisadas. Conclui-se que a imunorreatividade da p53 pela imunoistoquímica não pode ser atribuída à presença de mutações no domínio central do gene TP53.TP53 mutations are usually involved in cancer, but sequencing and immunohistochemistry results are often controversial. Thus, the aim of this study was to associate TP53 sequence with p53 immunostaining in dogs with lymphoma. Tumor samples were collected from 12 dogs with lymphoma and were included in this study. Histopathological diagnosis was performed according to Kiel classification. Immunohistochemistry was performed to identify immunophenotype as well as p53 expression. Polyclonal antibody anti-p53 (CM1) was used at a 1:500 dilution. The region that encompasses exons 4-9 was amplified by f PCR reactions and sequencing was then performed. Nevertheless, gene mutations were not observed in any sequence. In conclusion, immunoreactivity of p53 by means of immunohistochemistry should not be indicator of presence of mutations in the core domain of TP53 gene

MORPHOLOGIC AND MOLECULAR CHARACTERIZATION OF SPECIES OF Myrciaria spp

A Jabuticabeira é considerada como uma das fruteiras mais típicas do Brasil, contudo há poucos estudos desta planta na literatura e mesmo na literatura especializada, existem muitas controvérsias sobre sua classificação. Este trabalho faz comparações entre as espécies de Jabuticabeiras, usando as técnicas de marcadores morfológicos (Organografia) e moleculares (RAPD). As características morfológicas das plantas, usadas como marcadores morfológicos, foram comparadas com espécimes presentes nos herbários dos Estados de São Paulo e Minas Gerais e através da revisão de literatura especializada. As diferenças moleculares entre as espécies foi determinada através do uso de marcadores moleculares (RAPD). O experimento foi realizado nas cidades de Piracicaba, Jaboticabal e Ituverava, São Paulo, Brasil. Diferenças morfológicas e moleculares entre as plantas estudadas foram identificadas e as mesmas foram agrupadas em quatro grupos distintos, as espécies identificadas foram: Myrciaria cauliflora (Mart.) O. Berg, Myrciaria coronata Mattos, Myrciaria jaboticaba (Vell.) O. Berg., Myrciaria phytrantha (Kiaersk.) Mattos. A técnica de marcadores moleculares aliada à técnica de marcadores morfológicos (organografia), mostrou ser uma ferramenta importante na identificação de espécies de jabuticabeiras. Palavras-chave: Myrciaria, jabuticabeiras, marcadores morfológicos, marcadores moleculares (RAPD)The jabuticaba tree is considered one of the most tipical brasilian fruit tree, however, there are a little of studies of this plant in the literature and even in the specilized literature, there are controversies about its classification many. The present work makes some comparisons between jabuticaba species, using morphologic markers (organography) and molecular markers (RAPD) technique. The morphologic characteristics of the plants, used as morphologic markers, were compared with specimens present on herbaria from São Paulo and Minas Gerais states and through the revision of specialized literature. Molecular differences between the species were identified by molecular in Piracicaba, Jaboticabal and Ituverava cities, São Paulo, Brasil. Morphologic and molecular differences between the studied plants were identified and arranged in four groups, the identified species were: Myrciaria cauliflora (Mart.) O. Berg, Myrciaria coronata Mattos, Myrciaria jaboticaba (Vell.) O. Berg., Myrciaria phytrantha (Kiaersk.) Mattos. The technique of molecular markers with the technique of morphologic markers (organography) showed to be an important tool in the identification of jabuticaba tree species. Keywords: Myrciaria, biological identification, morphologic markers, molecular markers (RAPD

Genetic divergence in Eucalyptus spp. clones by molecular RAPD markers

The genetic divergence in 20 Eucalyptus spp. clones was evaluated by multivariate techniques based on 167 RAPD markers, of which 155 were polymorphic and 12 monomorphic. The measures of genetic distances were obtained by the arithmetic complement of the coefficients of Jaccard and of Sorenso-Nei and Li and evaluated by the hierarchical methods of Single Linkage clustering and Unweighted Pair Group Method with Arithmetic Mean (UPGMA). Independent of the dissimilarity coefficient, the greatest divergence was found between clones 7 and 17 and the smallest between the clones 11 and 14. Clone clustering was little influenced by the applied procedure so that, adopting the same percentage of divergence, the UPGMA identified two groups less for the coefficient of Sorenso-Nei and Li. The clones evidenced considerable genetic divergence, which is partly associated to the origin of the study material. The clusters formed by the UPGMA clustering algorithm associated to the arithmetic complement of Jaccard were most consistent

Molecular characterization of accessions of crabgrass (Digitaria nuda) and response to ametryn

Digitaria species are sugar cane crop weeds in Brazil and are being controlled with herbicides, although there are some reports of control failure, notably to the triazine group. Molecular techniques are recommended to analyze the genetic variability in weeds. RAPD (Random Amplified Polymorphic DNA), PCR-RFLP (Polymerase Chain Reaction - Restriction Fragment Length Polymorphism) and, in combination with sequencing, allow the localization of resistance genes, as well as possible mutations related to the onset of resistant individuals in some species. Thus, the objective of this work was to characterize ten accessions of Digitaria spp. by RAPD and PCR-RFLP markers, to sequence a conserved region of the psbA gene and evaluate the accessions response to ametryn. As showed by molecular analysis there was high genetic similarity among the accessions, all of them presented similar genetics profiles and were susceptible to ametryn.As espécies de Digitaria são plantas daninhas nas lavouras de cana-de-açúcar no Brasil e estão sendo controladas com herbicidas, porém há alguns relatos de falha no controle, notavelmente ao grupo das triazinas. Técnicas moleculares são recomendadas para análise da variabilidade genética em plantas daninhas, como o RAPD (DNA Polimórfico Amplificado ao Acaso) e PCR-RFLP (Reação da Polimerase em Cadeia - Polimorfismo no Comprimento de Fragmentos de Restrição) e, aliadas ao sequenciamento, permitem a localização de genes de resistência, bem como possíveis mutações relacionadas ao surgimento de indivíduos resistentes em algumas espécies. Com isso, o objetivo deste trabalho foi caracterizar dez acessos de Digitaria spp. por meio de marcadores RAPD e PCR-RFLP, sequenciar uma região conservada do gene psbA e analisar a resposta destes à ametrina. Pela análise molecular houve elevada similaridade genética entre os acessos, pois todos apresentaram perfis genéticos semelhantes e foram suscetíveis à ametrina

Morphologic and molecular characterization of species of myrciaria spp

A Jabuticabeira é considerada como uma das fruteiras mais típicas do Brasil, contudo há poucos estudos desta planta na literatura e mesmo na literatura especializada, existem muitas controvérsias sobre sua classificação. Este trabalho faz comparações entre as espécies de Jabuticabeiras, usando as técnicas de marcadores morfológicos (Organografia) e moleculares (RAPD). As características morfológicas das plantas, usadas como marcadores morfológicos, foram comparadas com espécimes presentes nos herbários dos Estados de São Paulo e Minas Gerais e através da revisão de literatura especializada. As diferenças moleculares entre as espécies foi determinada através do uso de marcadores moleculares (RAPD). O experimento foi realizado nas cidades de Piracicaba, Jaboticabal e Ituverava, São Paulo, Brasil. Diferenças morfológicas e moleculares entre as plantas estudadas foram identificadas e as mesmas foram agrupadas em quatro grupos distintos, as espécies identificadas foram: Myrciaria cauliflora (Mart.) O. Berg, Myrciaria coronata Mattos, Myrciaria jaboticaba (Vell.) O. Berg., Myrciaria phytrantha (Kiaersk.) Mattos. A técnica de marcadores moleculares aliada à técnica de marcadores morfológicos (organografia), mostrou ser uma ferramenta importante na identificação de espécies de jabuticabeiras

Morphologic and molecular characterization of Myrciaria spp species

A jabuticabeira é considerada uma das fruteiras mais típicas do Brasil. Entretanto, há poucos estudos sobre esta planta na literatura, e mesmo sua classificação botânica é muito controvertida. Este trabalho faz comparações entre as espécies de jabuticabeiras, usando as técnicas de marcadores morfológicos (organografia) e moleculares RAPD. As características morfológicas das plantas, usadas como marcadores morfológicos, foram comparadas com espécimes presentes nos herbários dos Estados de São Paulo e Minas Gerais e com as descrições obtidas em revisão de literatura especializada. As diferenças moleculares entre as espécies foram determinadas por meio do uso de marcadores RAPD. O experimento foi realizado nas cidades de Piracicaba, Jaboticabal e Ituverava do Estado de São Paulo, Brasil. Diferenças morfológicas e moleculares entre as plantas estudadas foram identificadas, e quatro grupos distintos de espécies foram definidos: Myrciaria cauliflora (Mart.) O. Berg, M. coronata Mattos, M. jaboticaba (Vell.) O. Berg. e M. phytrantha (Kiaersk.) Mattos. A técnica de marcadores moleculares, aliada à técnica de marcadores morfológicos, mostrou ser uma ferramenta importante na identificação de espécies de jabuticabeiras.The jabuticaba tree is considered one of the most typical Brazilian fruit trees. However, few studies of this plant are found in the literature and even its botanical classification is very controversial. The present research reports some comparisons between jabuticaba species, using morphologic (organography) and molecular markers techniques. The morphologic characteristics of the plant used as markers were compared with specimens of the herbaria from São Paulo and Minas Gerais States and with the descriptions reported in the literature. Molecular differences between the species were identified by the use of RAPD markers. The experiment was made in Piracicaba, Jaboticabal and Ituverava municipal districts in São Paulo State, Brazil. Morphologic and molecular differences between the studied plants were identified and four groups of species were defined: Myrciaria cauliflora (Mart.) O. Berg, M. coronata Mattos, M. jaboticaba (Vell.) O. Berg. and Myrciaria phytrantha (Kiaersk.) Mattos. Both molecular and morphologic markers techniques showed to be important tools for the identification of jabuticaba tree species