El presente trabajo de investigación tiene como objetivo determinar cómo la aplicación de la metodología 5S mejora la productividad del área de producción en la empresa Bokadex S.A.C., Ate – 2017. Para lo cual se necesitó recopilar información desde el mes de Julio hasta setiembre del 2017 para los datos del Pre test y desde finales de setiembre hasta noviembre del 2017 para el post test, los datos fueron recopilados mediante el método de observación y la elaboración de la lista de chequeo, asimismo se elaboró un Manual de Buenas Prácticas de Manufactura con la finalidad de mejorar la calidad e inocuidad de los productos que son elaborados en la empresa. Los datos fueron procesados mediante Excel y el programa IBM SPSS STATISTICS 24, logrando un mejoramiento del 11.38% de la productividad de la empresa, quedando demostrado que la aplicación de la metodología 5S y el manual de Buenas Prácticas de Manufactura generan un aumento de la productividad