Etude des polymorphismes HLA-DQA1 et HLA-DQB1 dans des populations africaines du Sahel

Abstract

Cette étude est la première analyse étendue de la diversité génétique et moléculaire aux loci HLA- DQA1 et HLA-DQB1 en Afrique. Menée sur un set de données composé de plus de 1600 individus de 26 populations nouvellement typées et originaires de 8 pays, elle a pour ambition de parfaire nos connaissances sur l'histoire du peuplement de ce continent et de la région du Sahel en particulier, ainsi que de nous éclairer sur l'histoire évolutive de ces deux loci HLA peu étudiés, en rapport avec des éléments géographiques, culturels et environnementaux (tels que leur lien avec la prévalence de P.falciparum, parasite responsable de la malaria).De nombreux moyens statistiques (telles que des analyses de variance, le calcul d'indices de diversité, l'estimation des fréquences des séquences, des analyses de corrélation entre la génétique et la géographie, des tests de neutralité et des analyses haplotypiques) ont été utilisés pour caractériser la diversité inter- et intra-populationnelle, aussi bien au niveau moléculaire qu'au niveau des fréquences ainsi que pour étudier l'évolution des deux loci et leur éventuel lien