Sec24-Dependent Secretion Drives Cell-Autonomous Expansion of Tracheal Tubes in Drosophila

Epithelial tubes in developing organs, such as mammalian lungs and insect tracheae, need to expand their initially narrow lumina to attain their final, functional dimensions [1]. Despite its critical role for organ function, the cellular mechanism of tube expansion remains unclear. Tracheal tube expansion in Drosophila involves apical secretion and deposition of a luminal matrix [2,3,4,5], but the mechanistic role of secretion and the nature of forces involved in the process were not previously clear. Here we address the roles of cell-intrinsic and extrinsic processes in tracheal tube expansion. We identify mutations in the sec24 gene stenosis, encoding a cargo-binding subunit of the COPII complex [6,7,8]. Via genetic-mosaic analyses, we show that stenosis-dependent secretion drives tube expansion in a cell-autonomous fashion. Strikingly, single cells autonomously adjust both tube diameter and length by implementing a sequence of events including apical membrane growth, cell flattening, and taenidial cuticle formation. Known luminal components are not required for this process. Thus, a cell-intrinsic program, rather than nonautonomous extrinsic cues, controls the dimensions of tracheal tubes. These results indicate a critical role of membrane-associated proteins in the process and imply a mechanism that coordinates autonomous behaviors of individual cells within epithelial structures

Pho-view of auxin: Reversible protein phosphorylation in auxin biosynthesis, transport and signaling

The phytohormone auxin plays a central role in shaping plant growth and development. With decades of genetic and biochemical studies, numerous core molecular components and their networks, underlying auxin biosynthesis, transport, and signaling, have been identified. Notably, protein phosphorylation, catalyzed by kinases and oppositely hydrolyzed by phosphatases, has been emerging to be a crucial type of post-translational modification, regulating physiological and developmental auxin output at all levels. In this review, we comprehensively discuss earlier and recent advances in our understanding of genetics, biochemistry, and cell biology of the kinases and phosphatases participating in auxin action. We provide insights into the mechanisms by which reversible protein phosphorylation defines developmental auxin responses, discuss current challenges, and provide our perspectives on future directions involving the integration of the control of protein phosphorylation into the molecular auxin network

Pumilio binds para mRNA and requires nanos and brat to regulate sodium current in drosophila motoneurons

Homeostatic regulation of ionic currents is of paramount importance during periods of synaptic growth or remodeling. Our previous work has identified the translational repressor Pumilio (Pum) as a regulator of sodium current (INa) and excitability in Drosophila motoneurons. In this current study, we show that Pum is able to bind directly the mRNA encoding the Drosophila voltage-gated sodium channel paralytic (para). We identify a putative binding site for Pum in the 3' end of the para open reading frame (ORF). Characterization of the mechanism of action of Pum, using whole-cell patch clamp and real-time reverse transcription-PCR, reveals that the full-length protein is required for translational repression of para mRNA. Additionally, the cofactor Nanos is essential for Pum-dependent para repression, whereas the requirement for Brain Tumor (Brat) is cell type specific. Thus, Pum-dependent regulation of INa in motoneurons requires both Nanos and Brat, whereas regulation in other neuronal types seemingly requires only Nanos but not Brat. We also show that Pum is able to reduce the level of nanos mRNA and as such identify a potential negative-feedback mechanism to protect neurons from overactivity of Pum. Finally, we show coupling between INa (para) and IK (Shal) such that Pum-mediated change in para results in a compensatory change in Shal. The identification of para as a direct target of Pum represents the first ion channel to be translationally regulated by this repressor and the location of the binding motif is the first example in an ORF rather than in the canonical 3'-untranslated region of target transcripts

Die Betrachtung der Wertanalyse aus ethischer Sicht

In der vorliegenden Arbeit wird im ersten Schritt zunächst über die inhaltliche Ausrichtung der Betriebswirtschaftslehre diskutiert. Dabei wird die Problematik einer „wertfreien und nicht normativen Betriebswirtschaftslehre“ angesprochen und festgehalten, dass für die zugrunde liegende Problemstellung von einer wertgebundenen (normativen) Betriebswirtschaftslehre auszugehen ist. Danach wird die Bedeutung des „Wertbegriffs“ in der Betriebswirtschaftslehre behandelt, in welchem Zusammenhang dieser Begriff mit dem betriebswirtschaftlichen Instrument der Wertanalyse zu sehen ist. Dabei wird zuerst das Verfahren der Wertanalyse aus rein betriebswirtschaftlicher Sicht definiert und die für die zugrundeliegende Problemstellung besonders relevanten Teile des Optimierungsprozesses näher erläutert. Im nächsten Schritt wird bei der Betrachtung dieses Verfahrens auch der subjektive Wert eines Gutes als Einflussgröße miteinbezogen, dem ein Konsument einem Gut oder einer bestimmten Eigenschaft eines Gutes aufgrund seiner Nutzenstiftung beimisst. In diesem Zusammenhang wird auch der Begriff Nutzen näher definiert um in weiterer Folge in der Arbeit eine Einteilung und Definition nach Güterarten aufgrund ihrer Nutzenstiftung (positive-, neutrale-, negative-, und stark negative Nutzenstiftung) vorzunehmen, was den Ausgangspunkt für die weiteren Untersuchungen bildet. Im Hauptteil der Arbeit wird auf das wertanalytische Problem eingegangen. Dazu wird die wertanalytische Problematik in zwei Teilprobleme zerlegt, einerseits die Optimierung der Produktionskosten durch Produktdiversifikation, andererseits die optimale Kundenorientierung, wobei sich die weiteren Untersuchungen ausschließlich auf das zweite Teilproblem konzentrieren. Dabei ergibt sich die Problematik, dass die völlige Erfüllung bestimmter Kundenwünsche vielfach nicht nur unsichere, sondern sogar gefährliche Produkte hervorbringt, welche mittels Fallstudienmethode anhand konkreter Beispiele aufgegriffen und für jede der vier definierten Güterarten in Bezug auf Ihre Nutzenstiftung ausführlich untersucht werden. Dabei wird das Hauptaugenmerk insbesondere darauf gelegt, inwieweit ethisch antagonistische Kundenwünsche für das untersuchte Produkt vorliegen, welcher Zusammenhang zwischen den ethisch bedenklichen Faktoren und den daraus auftretenden negativen Folgeerscheinungen besteht und welche ethische Problematik dies für einen klassischen, nicht normativen Wertanalyseprozess aufwirft. Dabei wird in den Ausführungen keine Bewertung der Wertanalyse durch Werturteile vorgenommen, sondern vielmehr eine eventuell bestehende ethische Dilemmasituation aufgezeigt, um zu veranschaulichen, dass ethische Faktoren auf der Kunden- und Produzentenseite einen Einfluss auf einen Wertanalyseprozess haben und dieser nicht völlig wertfrei betrachtet werden kann. Als Ergebnis der Untersuchung kann festgehalten werden, dass die wertfreie Betrachtung der Wertanalyse für die einzelnen Güterkategorien stets zu einer Entscheidung für die Produktion des Gutes führt, sofern das Produkt einen Nutzen für den Konsumenten stiftet und für den Unternehmer einen entsprechenden Gewinn abwirft. Dabei repräsentiert die Wertanalyse ein klassisches Verfahren, welches ökonomisch effizient ist, jedoch stillschweigend Nebenbedingungen unterstellt, welche in der Literatur über die Wertanalyse bisher keine Berücksichtigung finden. Somit ist die Wertanalyse ein Verfahren, welches eine klar definierte Anwendungssystematik verfolgt, jedoch ethische Nebenbedingungen unterstellt, welche nie explizit erwähnt werden, was wissenschaftlich problematisch ist. Die Untersuchung zeigt weiters, dass je mehr die Produktauswahl bzw. die gewünschte Produktqualität von emotionalen und ethischen Werten abhängt, umso problematischer wird auch die Produktgestaltung mittels Wertanalyse. So kann das Produkt trotz einer durchgeführten Wertanalyse eine Fehlentwicklung sein, wenn sich z. B. gewisse Produkteigenschaften für die Mehrzahl der Kunden nicht mit ihrem moralischen Normensystem bzw. ethischen Empfindungen vereinbaren lassen und deshalb das Produkt nicht gekauft wird. Dies lässt den Schluss zu, dass die Wertanalyse als Gewinnmaximierungsverfahren unter bewusster Berücksichtigung ethischer Einflussfaktoren bessere Ergebnisse liefern würde. Weiters stützt die vorliegende Untersuchung der wertanalytischen Problematik den Ansatz, dass eine Einbeziehung normativer Faktoren in die Betriebswirtschaftslehre nicht völlig abgelehnt werden kann

Complete Genome Sequence of a New Firmicutes Species Isolated from Anaerobic Biomass Hydrolysis

A new Firmicutes isolate, strain HV4-6-A5C, was obtained from the hydrolysis stage of a mesophilic and anaerobic two-stage lab-scale leach-bed system for biomethanation of fresh grass. It is assumed that the bacterial isolate contributes to plant biomass degradation. Here, we report a draft annotated genome sequence of this organism. © 2017 Abendroth et al

Brassinosteroid signaling delimits root gravitropism via sorting of the Arabidopsis PIN2 auxin transporter

Arabidopsis PIN2 protein directs transport of the phytohormone auxin from the root tip into the root elongation zone. Variation in hormone transport, which depends on a delicate interplay between PIN2 sorting to and from polar plasma membrane domains, determines root growth. By employing a constitutively degraded version of PIN2, we identify brassinolides as antagonists of PIN2 endocytosis. This response does not require de novo protein synthesis, but involves early events in canonical brassinolide signaling. Brassinolide-controlled adjustments in PIN2 sorting and intracellular distribution governs formation of a lateral PIN2 gradient in gravistimulated roots, coinciding with adjustments in auxin signaling and directional root growth. Strikingly, simulations indicate that PIN2 gradient formation is no prerequisite for root bending but rather dampens asymmetric auxin flow and signaling. Crosstalk between brassinolide signaling and endocytic PIN2 sorting, thus, appears essential for determining the rate of gravity-induced root curvature via attenuation of differential cell elongation

Draft Genome Sequence of a New Oscillospiraceae Bacterium Isolated from Anaerobic Digestion of Biomass

Here, we present the genome sequence and annotation of the novel bacterial strain HV4-5-C5C, which may represent a new genus within the family Oscillospiraceae (order Eubacteriales). This strain is a potential keystone species in the hydrolysis of complex polymers during anaerobic digestion of biomass. © 2020 Pascual et al

Complete genome sequence of a new clostridium sp. isolated from anaerobic digestion and biomethanation

Here, we present the genome sequence and annotation of the bacterial strain HV4-5-A1G, a potentially new Clostridium species. Based on its genomic data, this strain may act as a keystone microorganism in the hydrolysis of complex polymers, as well as in the different acidogenesis and acetogenesis steps during anaerobic digestion. © 2020 Hahnke et al

Complete Genome Sequence of a New Ruminococcaceae Bacterium Isolated from Anaerobic Biomass Hydrolysis

A new Ruminococcaceae bacterium, strain HV4-5-B5C, participating in the anaerobic digestion of grass, was isolated from a mesophilic two-stage laboratoryscale leach bed biogas system. The draft annotated genome sequence presented in this study and 16S rRNA gene sequence analysis indicated the affiliation of HV4-5- B5C with the family Ruminococcaceae outside recently described genera. © 2018 Hahnke et al