CRISPR interference-based gene repression in the plant growth promoter Paenibacillus sonchi genomovar Riograndensis SBR5

Fernandes de Brito L, Schultenkämper K, Passaglia L, Wendisch VF. CRISPR interference-based gene repression in the plant growth promoter Paenibacillus sonchi genomovar Riograndensis SBR5. Applied Microbiology and Biotechnology . 2020;104:5095-5106.Gene repression using the endonucleolytically deactivated dCas9 protein and sgRNAs (CRISPR interference or CRISPRi) is a useful approach to study gene functions. Here, we established CRISPRi in Paenibacillus sonchi genomovar Riograndensis SBR5, a plant growth promoting bacterium. CRISPRi system with sgRNAs targeting SBR5 endogenous genes spo0A, yaaT and ydjJ and plasmid-borne gfpUV was constructed and analyzed. Flow cytometry analysis revealed a significant decrease of reporter protein GFPUV signal in P. sonchi strains expressing gfpUV sgRNA in comparison with non-targeting controls. CRISPRi-based repression of chromosomal genes for regulation of sporulation spo0A and yaaT decreased sporulation and increased biofilm formation in SBR5. Repression of the sorbitol catabolic gene ydjJ revealed decreased specific activity of YdjJ in crude cell extracts and reduced biomass formation from sorbitol in growth experiments. Our work on CRISPRi-based gene repression serves as basis for gene function studies of the plant growth promoter P. sonchi SBR5. To our knowledge, the present study presents the first tool for gene repression established in Paenibacillus species

PERFIL EPIDEMIOLÓGICO DA MORTALIDADE MATERNA NO MUNICÍPIO DE SÃO LUÍS-MA

Com o propósito de estudar e atualizar em São Luís-Maranhão, entre os anos de 1987 e 1993, os dados sobre a mortalidade materna - indicador indireto da qualidade de assistência prestada à mulher, durante a gravidez, parto e puerpério - oram investigadas todas as declarações de óbito de mulheres em idade reprodutiva (10 a 49 anos), registradas junto ao Setor de Mortalidade da Secretaria Estadual de Saúde nesta cidade no período de interesse, donde foram selecionados os casos de “morte materna”, num total de 172. Considerou-se a distribuição dos óbitos por “causa mortis” e faixa etária. O coeficiente de mortalidade materna (CMM) para o período foi de 113,63/100.000 nascidos vivos (NV). A avaliação anual revelou 172, 141, 126, 117, 64, 89,4 e 78,15/100.000 NV para cada ano entre 1987 e 1993. Na determinação dos óbitos, prevaleceram as causas maternas diretas (92,8%), distribuídas sobretudo entre infecção (37,2%), toxemia (29,4%) e hemorragia (22,8%). Mais da metade dos decessos ocorreu em mulheres jovens de até 24 anos, valendo destacar a faixa de adolescentes que contribuiu com 21,2% desses casos fatais. Conclui-se portanto, que, apesar do declínio gradual do CMM a cada ano e da melhora considerável em relação ao último estudo (519/100.000 NV em 1983), tais resultados deixam muito a desejar quando comparados aos de outros centros, bem como se considerarmos que estes devam estar subnotificados e que a maioria das mortes poderia ter sido evitada

Complete genome sequence of Paenibacillus riograndensis SBR5T, a Gram-positive diazotrophic rhizobacterium

AbstractPaenibacillus riograndensis is a Gram-positive rhizobacterium which exhibits plant growth promoting activities. It was isolated from the rhizosphere of wheat grown in the state of Rio Grande do Sul, Brazil. Here we announce the complete genome sequence of P. riograndensis strain SBR5T. The genome of P. riograndensis SBR5T consists of a circular chromosome of 7,893,056bps. The genome was finished and fully annotated, containing 6705 protein coding genes, 87 tRNAs and 27 rRNAs. The knowledge of the complete genome helped to explain why P. riograndensis SBR5T can grow with the carbon sources arabinose and mannitol, but not myo-inositol, and to explain physiological features such as biotin auxotrophy and antibiotic resistances. The genome sequence will be valuable for functional genomics and ecological studies as well as for application of P. riograndensis SBR5T as plant growth-promoting rhizobacterium

Eficácia de um Programa de Intervenção para o Desenvolvimento de Habilidades Linguísticas

The importance of language and its formal instruction during the initial school phase has stimulated studies that seek options to implement them successfully. From this perspective, this study aimed to verify the effects of an intervention program on the language skills assessed. The participants were sixth-grade elementary school students evaluated in reading comprehension, spelling, word recognition and metatextual awareness. The intervention program was performed with 103 students, divided into experimental (EG) and control groups (CG). The experimental group attended 10 sessions, which included the use of gradual Cloze technique in texts of various textual genres, which were intended to develop the reading comprehension and the development of metatextual awareness. Analyses indicated the superiority of EG over the CG in the post-test. New studies are needed to permit the generalization of the results.La importancia del lenguaje y de su enseñanza formal durante la fase escolar inicial ha motivado estudios que buscan alternativas para implementarlas con éxito. Bajo esa perspectiva, este estudio tuvo como objetivo verificar los efectos de un programa de intervención en las habilidades lingüísticas evaluadas. Participaron estudiantes del sexto grado de la escuela primaria, evaluados respecto a la comprensión de lectura, la grafía, el reconocimiento de palabras y la consciencia metatextual. Se llevó a cabo un programa de intervención con 103 de ellos, divididos en grupos experimentales y de control. Los grupos experimentales participaron de 10 sesiones, que incluyeron el uso de la técnica de Cloze gradual en textos de géneros textuales diversos, con los que se pretendió, además del desarrollo de la comprensión lectora, también el desarrollo de la consciencia metatextual. Los análisis indicaron la superioridad del GE en comparación con el GC en el post-test. Se sugiere llevar a cabo nuevos estudios para permitir la generalización de los resultados.A importância da linguagem e de seu ensino formal durante a fase escolar inicial tem motivado estudos que procuram alternativas para implementá-las com sucesso. Sob essa perspectiva, o presente estudo objetivou verificar os efeitos de um programa de intervenção sobre as habilidades linguísticas avaliadas. Os participantes foram alunos do 6o ano do ensino fundamental, avaliados quanto à compreensão de leitura, à grafia, ao reconhecimento de palavras e à consciência metatextual. Foi realizado um programa de intervenção com 103 deles, separados em grupo experimental (GE) e de controle (GC). O grupo experimental participou de 10 sessões, usando a técnica de Cloze gradual em textos de gêneros textuais diversos, por meio dos quais pretendeu-se, além do desenvolvimento da compreensão de leitura, também o desenvolvimento da consciência metatextual. As análises indicaram superioridade do GE sobre o GC no pós-teste. Sugere-se a realização de novos estudos para permitir a generalização dos resultados

Preservar para lembrar: vestígios da cultura material da escola no Museu Histórico Visconde de São Leopoldo (1905-1940)

Objetos, mobiliários e fotografias, enquanto documentos, contam-nos histórias e nos permitem refletir sobre o que se passou, reverberando um tempo por vezes distante e respondendo a questionamentos a eles feitos. Partindo desse pressuposto, buscamos, neste estudo, analisar os processos educativos que se passaram na cidade de São Leopoldo/RS, no início do século XX, particularmente entre os anos de 1905 e 1940. Para isso, tomamos como documento os mobiliários escolares, especialmente no que tange a fotografias e objetos escolares em exposição salvaguardados no Museu Histórico Visconde São Leopoldo. Os objetos foram registrados por meio fotográfico, catalogados e analisados a partir de sua materialidade. A análise realizada tem como temática a cultura material da escola à luz dos estudos realizados por Antonio Viñao Frago (1995, 2006), Rosa Fátima de Souza (2007) e Hernández Díaz (2002). Entendemos que o conjunto de objetos aqui analisados apresenta uma cultura escolar de práticas locais, em consonância com uma cultura nacional e, até mesmo, internacional. Dessa forma, as considerações finais apresentam contribuições para a História da Educação local e geral.Palavras-chave: Objetos escolares. História da Educação. São Leopoldo/RS.Preserving to remember: vestiges of the school material culture in the Visconde de São Leopoldo Historical Museum (1905-1940)ABSTRACTObjects, furniture, and photographs, as documents, tell stories and allow us to reflect on what happened, reverberating a distant time, and answering the questions we ask them. Under this assumption, we seek, in this study, to analyze the educational processes that occurred in the city of São Leopoldo/RS, at the beginning of the 20th century, particularly between the years 1905 and 1940. In this regard, we consider as documents the school furnishings, especially concerning exposed photographs and school objects safeguarded in the Visconde de São Leopoldo Historical Museum. The objects were photographed, catalogued, and analyzed from their materiality. The conducted analysis approaches the material culture of schools considering the studies undertaken by Antonio Viñao Frago (1995, 2006), Rosa Fátima de Souza (2007), and Hernández Díaz (2002). We understand that the set of objects analyzed here presents a school culture of local practices, in accord with a national culture, and even with an international one. Therefore, the final remarks present contributions to the local and general History of Education.Keywords: School objects. History of Education. São Leopoldo/RS.Preservar para recordar: vestigios de la cultura material de la escuela en el Museo Histórico Visconde de São Leopoldo (1905-1940)RESUMENObjetos, muebles y fotografías, mientras que documentos, nos cuentan historias y nos permiten reflexionar sobre lo que pasó, reverberando un tiempo distante y contestando a preguntas hechas a ellos. Sobre esta base, buscamos, en esta investigación, analizar los procesos educativos que se han pasado en la ciudad de São Leopoldo/RS, en el siglo XX, particularmente entre los años de 1905 y 1940. Para esto, tomamos como documento los muebles escolares, especialmente en lo que refiere a fotografías y a objetos escolares expuestos y preservados en el Museo Histórico Visconde de São Leopoldo. Los objetos fueron fotografiados, catalogados y analizados en su materialidad. El análisis tiene como temática la cultura material de la escuela desde el punto de vista de las investigaciones realizadas por Antonio Viñao Frago (1995, 2006), Rosa Fátima de Souza (2007) y Hernández Díaz (2002). Entendemos que el conjunto de objetos analizados presenta una cultura escolar de prácticas locales, de acuerdo con una cultura nacional, e incluso de una cultura internacional. De esta forma, las consideraciones finales presentan las contribuciones para la Historia de la Educación local y general.Palabras clave: Objetos escolares. Historia de la Educación. São Leopoldo/RS

Deriving water quality parameters using sentinel-2 imagery: A case study in the Sado Estuary, Portugal

Monitoring water quality parameters and their ecological effects in transitional waters is usually performed through in situ sampling programs. These are expensive and time-consuming, and often do not represent the total area of interest. Remote sensing techniques offer enormous advantages by providing cost-effective systematic observations of a large water system. This study evaluates the potential of water quality monitoring using Sentinel-2 observations for the period 2018-2020 for the Sado estuary (Portugal), through an algorithm intercomparison exercise and time-series analysis of different water quality parameters (i.e., colored dissolved organic matter (CDOM), chlorophyll-a (Chl-a), suspended particulate matter (SPM), and turbidity). Results suggest that Sentinel-2 is useful for monitoring these parameters in a highly dynamic system, however, with challenges in retrieving accurate data for some of the variables, such as Chl-a. Spatio-temporal variability results were consistent with historical data, presenting the highest values of CDOM, Chl-a, SPM and turbidity during Spring and Summer. This work is the first study providing annual and seasonal coverage with high spatial resolution (10 m) for the Sado estuary, being a key contribution for the definition of effective monitoring programs. Moreover, the potential of remote sensing methodologies for continuous water quality monitoring in transitional systems under the scope of the European Water Framework Directive is briefly discussed.Fil: Sent, Giulia. Universidade Nova de Lisboa; PortugalFil: Biguino, Beatriz. Universidade Nova de Lisboa; PortugalFil: Favareto, Luciane. Universidade Nova de Lisboa; PortugalFil: Cruz, Joana. Universidade Nova de Lisboa; PortugalFil: Sá, Carolina. Universidade Nova de Lisboa; PortugalFil: Dogliotti, Ana Inés. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Ciudad Universitaria. Instituto de Astronomía y Física del Espacio. - Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Instituto de Astronomía y Física del Espacio; ArgentinaFil: Palma, Carla. Instituto Hidrográfico; PortugalFil: Brotas, Vanda. Universidade Nova de Lisboa; PortugalFil: Brito, Ana C.. Universidade Nova de Lisboa; Portuga

SEXUALIDADE EM MULHERES COM LESÃO NA MEDULA ESPINHAL / SEXUALITY IN WOMEN WITH SPINAL CORD INJURY

Introdução: A lesão medular traz consequências trágicas na vida das pessoas. A sexualidade se constitui em um dos aspectos relevantes das perdas sofridas e se torna importante no processo de ajustamento à nova condição. Objetivo: Compreender a sexualidade de mulheres portadoras de lesão medular. Métodos: Estudo qualitativo com aplicação de questionário semiestruturado em 10 mulheres com paraplegia e tetraplegia, com no mínimo um ano de acometimento da lesão e com experiência sexual antes e após a lesão. Resultados: As mulheres entrevistadas demonstraram dificuldades de reconstrução da vida afetivo-sexual, após a lesão a necessidade de reconstrução da imagem corporal e de si mesmas, bem como a incorporação de novos sentidos à sexualidade e suas práticas eróticas. Conclusão: Em mulheres com lesão medular evidenciou-se a sexualidade como importância ímpar no processo de aceitação da deficiência, passando por todo um processo de superação com o intuito de assimilar a deficiência física até chegar a uma fase de adaptação às incapacidades impostas pela lesão medular, as quais implicaram em conseqüências no âmbito cultural, afetivo e sexual.Palavras-chave: Mulheres. Paraplegia. Quadriplegia. Sexualidade.AbstractIntroduction: Spinal cord injury brings tragic consequences in people's lives. The sexuality is one of the important aspects of losses and becomes important in the process of adjustment to the new conditions Objective: Understanding the sexuality of women with spinal cord injury. Methods: Qualitative study with application of semi-structured questionnaire in 10 women with paraplegia and quadriplegia, with at least one year of onset of injury and with sexual experience before and after injury. Results: The women interviewed showed the difficulties of rebuilding the emotional-sexual after de lesion, the need for reconstruction of body image and of themselves, and the incorporation of new meanings of sexuality and their erotic practices. Conclusions: In women with spinal cord injury became evident sexuality as unique importance in the process of acceptance of disability, through a process of overcoming in order to assimilate the disability until you reach a stage adaptation to disability imposed by spinal cord injury, which entail consequences under cultural, emotional and sexual.Keywords: Women. Paraplegia. Quadriplegia. Sexuality

Contribuições da CONSOCIAL em projetos de cidade digital estratégica

This study aims to identify social priorities in the National Conference on Transparency and Social Control (CONSOCIAL), relating to the control of public accounts, for purposes of supporting the planning of the digital city strategic. Under the method of content analysis, proposals were evaluated, with the support of Atlas ti software. The results show that the code "disclosure" is mentioned in 34.54% of the proposals and "control" in 30.53%. The "transparency" is invoked in 27.11%, while "accounts", "reports" and "financial" appearing in 35% of the proposals. Other expressions were "advice", "education", "health" and "corruption". Participants of CONSOCIAL indicate how priority the disclosure and transparency, besides solutions that provide access to tools of systematic social control directed at the content of public accounts, allowing adequate monitoring by the citizen. Therefore, emerges the search for solutions that keep the guidelines consistent in benefit of population.Este estudo objetiva identificar prioridades sociais nas propostas da Conferência Nacional sobre Transparência e Controle Social (CONSOCIAL), relacionadas ao controle das contas públicas, para fins de subsidiar o planejamento da cidade digital estratégica. Sob o método de análise de conteúdo, foram avaliadas as propostas, com apoio do software Atlas ti. Os resultados demonstram que o código “divulgação” é mencionado em 34,54% das propostas e “controle” em 30,53 %. A “transparência” é invocada em 27,11%, enquanto que “contas”, “relatórios” e “financeiros” figuram em 35% das propostas. Outros códigos propostos foram “conselho”, “educação”, “saúde” e “corrupção”. Os participantes da CONSOCIAL indicaram como prioritárias a divulgação e a transparência, além de soluções que viabilizem o acesso a ferramentas, além de sistemáticas de controle social voltadas aos conteúdos das contas públicas, permitindo o acompanhamento adequado por parte do cidadão. Neste sentido, desponta a busca por soluções que guardem consonância com as diretrizes populacionais

Food consumption and cardiovascular risk in disease-free women with polycystic ovary syndrome:: a cross-sectional study in Northeast Brazil

Objective: To investigate the association between dietary intake, nutritional status and cardiovascular risk markers in women with polycystic ovary syndrome (PCOS) without other chronic diseases.Methods: This cross-sectional study included 59 women diagnosed with PCOS and 126 age-matched healthy controls. Data collected consisted of socio-demographic and behavioral variables, weight, height, body mass index (BMI), waist circumference (WC), waist-to-height ratio (WHTR), lipid accumulation products (LAP), serum triglycerides (TG) level, body fat percentage (BFP), and food consumption. Quantitative and qualitative food intake were verified by applying a food frequency questionnaire.Results: BMI, WC, WHTR and LAP index values as well as TG levels, but not BFP values, were significantly increased in the PCOS group as compared to controls (p<0.05). In the control group, eutrophic women had slightly higher TG levels, whereas obese women were younger in the PCOS group (p<0.05). In both groups, the consumption of carbohydrates and proteins was adequate, but fiber intake was insufficient. In the PCOS group, energy consumption was excessive, while carbohydrate intake was higher than in controls, but adequate.Conclusion: Although diseasefree PCOS women showed enhanced inadequacy in dietary intake and nutritional status and increased cardiovascular impairment, no correlation between dietary intake, nutritional status and cardiovascular risk markers was found.Key words: Polycystic ovary syndrome; Eating; Cardiovascular diseases; Nutritional status

Fungistase a fusarium graminearum de um solo submetido a diferentes sistemas de manejo

Soil management, in terms of tillage and cropping systems, strongly influences the biological properties of soil involved in the suppression of plant diseases. Fungistasis mediated by soil microbiota is an important component of disease-suppressive soils. We evaluated the influence of different management systems on fungistasis against Fusarium graminearum, the relationship of fungistasis to the bacterial profile of the soil, and the possible mechanisms involved in this process. Samples were taken from a long-term experiment set up in a Paleudult soil under conventional tillage or no-tillage management and three cropping systems: black oat (Avena strigose L.) + vetch (Vicia sativa L.)/maize (Zea mays L.) + cowpea (Vigna sinensis L.), black oat/maize, and vetch/maize. Soil fungistasis was evaluated in terms of reduction of radial growth of F. graminearum, and bacterial diversity was assessed using ribosomal intergenic spacer analysis (RISA). A total of 120 bacterial isolates were obtained and evaluated for antibiosis, and production of volatile compounds and siderophores. No-tillage soil samples showed the highest level of F. graminearum fungistasis by sharply reducing the development of this pathogen. Of the cropping systems tested, the vetch + black oat/maize + cowpea system showed the highest fungistasis and the oat/maize system showed the lowest. The management system also affected the genetic profile of the bacteria isolated, with the systems from fungistatic soils showing greater similarity. Although there was no clear relationship between soil management and the characteristics of the bacterial isolates, we may conclude that antibiosis and the production of siderophores were the main mechanisms accounting for fungistasis.O manejo, em termos de preparo e sistemas de culturas, exerce forte influência sobre as propriedades do solo; e essas, por sua vez, condicionam o seu potencial supressivo a doenças de plantas. Nesse contexto, a fungistase é um dos componentes da supressividade, sendo um processo mediado pela microbiota do solo. Este trabalho teve como objetivo avaliar a influência de diferentes sistemas de manejo sobre a fungistase ao fungo fitopatogênico Fusarium graminearum, a sua relação com o perfil bacteriano do solo e os possíveis mecanismos de ação envolvidos no processo. As avaliações foram realizadas a partir de amostras de um Argissolo Vermelho distrófico, coletadas em um experimento de manejo de longa duração, conduzido sob plantio direto e preparo convencional e cultivado com os sistemas de culturas aveia + vica/milho + caupi, vica/milho e aveia/milho. A fungistase do solo foi avaliada em termos de redução do crescimento radial do fungo testado. O perfil bacteriano foi avaliado pelo polimorfismo do espaço intergênico do 16S rRNA (RISA). Foram obtidos 120 isolados bacterianos, que foram avaliados quanto à antibiose e à produção de compostos voláteis e de sideróforos. As amostras provenientes de plantio direto apresentaram maior fungistase a F. graminearum, reduzindo acentuadamente o desenvolvimento do patógeno. Também foi observada maior inibição do patógeno nas amostras de solo cultivadas sob o sistema aveia + vica/milho + caupi, enquanto o sistema aveia/milho foi o menos antagonista. O perfil genético bacteriano do solo também foi influenciado pelos sistemas de manejo, havendo semelhança entre os sistemas mais antagonistas. Embora não tenha sido identificada uma relação entre os sistemas de manejo e as características dos isolados, pode-se concluir que a antibiose e a produção de sideróforos foram os mecanismos que mais contribuíram para a fungistase