Evaluation de l’état de santé des habitats et peuplements de poissons de la zone de Voh-Koné-Pouembout, Campagnes de stations vidéo rotatives STAVIRO 2007-2013

• Conducted within the AMBIO project, this work deals with coral reef fish communities and associated habitats, in the New Caledonian lagoons. It aims at assessing the status and trends of habitats and mobile macrofauna in the Voh-Kone-Pouembout lagoon, in the light of demographic and industrial developments and accounting for the existing customary reserve of Oundjo. • It relies on 280 stations collected in 2007 and 2013 using the remote unbaited underwater video STAVIRO rotating technique, which were analysed to characterize habitat, fish assemblages, turtles and sea snakes, from a list of 490 species (AMBIO/A/1). • 143 species (including one turtle species and one sea snake species), belonging to 23 families were observed. The most frequent and abundant families were surgeonfish and parrotfish, then goatfish, butterflyfish and emperors. Groupers and rabbitfish were rarely observed. • 27 indicators were computed, mapped (maps available on a Sextant server), and analysed using the PAMPA computing tool. Outcomes were organized in a dashboard for each management objective (biodiversity conservation and fisheries management). • Coral status is rather good and stable, and shows no impact from anthropogenic pressures, even close to the plant and shipping channel. • Frequency of sharks, rays and humphead wrasses clearly dropped between 2007 and 2013. Turtles were rarely observed in both years. • Fish community is moderately diversified, particularly in the Living Coral habitat. Herviores dominate species assemblage and piscivores are not abundant. • The abundance of several fished species distinctly declined between 2007 and 2013, but trends differed according to areas.• Cette étude conduite dans le cadre du projet AMBIO concerne les communautés de poissons et habitats associés aux récifs coralliens des lagons de Nouvelle-Calédonie. L’objectif est d’évaluer l’état de santé des habitats et de la macrofaune mobile de la zone de Voh-Koné-Pouembout, au regard du développement démographique et industriel et en tenant compte de l’existence de la Réserve coutumière d’Oundjo. • L’étude s’appuie sur 280 stations video STAVIRO collectées lors de deux campagnes réalisées en 2007 et 2013. Leur analyse a permis de caractériser l’habitat environnant chaque station, ainsi que les communautés de poissons, tortues et serpents, sur la base d’une liste de 490 espèces (cf. AMBIO/A/1). • 143 espèces de poissons, tortue et serpent, appartenant à 23 familles ont été observées. Les familles les plus fréquentes et les plus abondantes sont les chirurgiens et perroquets, suivis par les rougets-barbets, les poissons-papillons et les becs et bossus. Loches et picots sont assez peu observés. • 27 indicateurs ont été calculés, représentés sous forme de carte disponible sur un serveur Sextant, et analysés grâce à l’outil de calcul PAMPA. Les résultats sont synthétisés sous forme de tableau de bord par objectif de gestion relatif à la conservation de la biodiversité et la gestion des ressources de la pêche et sous forme de cartes avec des tendances pour les principaux indicateurs relatifs à la pêche. • L’état de santé du corail est satisfaisant et stable ; il ne semble pas avoir souffert du développement démographique et économique de la zone, même à proximité de l’usine et du chenal. • La fréquence d’observation des requins, raies et poissons-napoléons a nettement diminué entre 2007 et 2013. Les tortues ont été peu observées les deux années. • Le peuplement de poisson est moyennement diversifié et abondant, notamment sur l’habitat Corail vivant. Les herbivores dominent l’assemblage, mais sont en diminution. Les piscivores sont peu abondants. • L’abondance de plusieurs espèces pêchées a nettement diminué entre 2007 et 2013, mais la tendance diffère en fonction des zones

Influence of settings management and protection status on recreational uses and pressures in marine protected areas

International audienceCoastal populations and tourism are growing worldwide. Consequently outdoor recreational activity is increasing and diversifying. While Marine Protected Areas (MPAs) are valuable for mitigating anthropogenic impacts, recreational uses are rarely monitored and studied, resulting in a lack of knowledge on users' practices, motivation and impacts. Based on boat counts and interview data collected in New Caledonia, we i) explored factors affecting user practices and motivations, ii) constructed fine-scale pressure indices covering activities and associated behaviors, and iii) assessed the relationships between user practices and site selection. User practices were found to depend on protection status, boat type and user characteristics. Pressure indices were higher within no-take MPAs, except for fishing. We found significant relationships between user practices and settings characteristics. In the context of increasing recreational uses, these results highlight options for managing such uses through settings management without jeopardizing the social acceptance of MPAs or the attainment of conservation goals

Avantages et inconvénients de la stéréo vidéo : applicabilité au protocole pour STAVIRO

La stéréo vidéo repose sur l’utilisation synchronisée de 2 caméras permettant de produire une image en 3 dimensions. Elle permet par triangulation d’obtenir une estimation précise de la taille de chaque individu et de mesurer les distances. En 2007 en Nouvelle Calédonie l’ IFREMER a développé des systèmes mono-vidéo autonomes et rotatifs (STAVIRO et MICADO). La caméra est déployée 12 minutes depuis un bateau sans immersion de plongeurs, le temps d’effectuer 3 rotations complètes. L’objectif de l’étude est de réaliser un bilan comparatif entre l’utilisation d’un système STAVIRO classique et l’utilisation d’un système équipé en stéréo vidéo. 59 stations ont été réalisées entre le 2 et le 13 juin 2014 dans le lagon sud ouest de la Nouvelle Calédonie

Hyehen 2012. Bilan de l’état de santé du récif par stations vidéo rotatives STAVIRO

This work deals with fish communities and associated habitats, in the context of New Caledonian coral reef ecosystems. It was conducted within the AMBIO project. The study relies on remote underwater video observations, using the STAVIRO rotating technique. The study takes place in the Hienghene area, an area (Eastern Coastal Area) part of the World Heritage site “New Caledonian lagoons”. It encompasses two Marine Protected Areas, Do Himenand Yeega. The sampling design covers the entire area, and was stratified according to reef geomorphology and protection status. 105 stations were validated within 4,5 days. They were analyzed to characterize the habitat surrounding each station, and fish communities, based on a species list that includes fished species, emblematic species and functionally important species. 23 indicators were computed and corresponding maps were constructed (available on a Sextant server). Each indicator was plotted and analyzed using the PAMPA computing tool. Outcomes were organized in a dashboard for each management objective (biodiversity conservation and fisheries management). Most stations were conducted on rocky substrate: 32% of stations in the living coral habitat and 47% on detritic substrate, and only 21% in soft bottoms habitats. 109 fish species, and one turtle species, belonging to 19families were observed. Surgeonfishes and parrotfishes are the most frequently observed families (90% and 75% of stations) followed by butterflyfishes (54%), mullids (48%) and wrasses (45%). Nine families were observed in morethann20% of stations. Seventeen species of butterflyfish were observed, several turtles, humphead wrasses and sharks, indicating an overall goodhealth of the reef ecosystem. Herbivores and carnivores dominate the fish assemblage and are quite abundant in coral-rich habitats; carnivores are significantly more abundant in the both reserves, whereas this is only at Do-Himen(reserve on the barrier reef) for herbivores. Species assemblage significantly differs between habitats and to a lesser extent on protection status. Most indicators display higher values inside reserves, these differences are significant for species richness (SR) in living coral habitat, and for the SR of surgeon fish and parrotfish. Indicator values are generally higher in the DO-Himen reserve than in Yeega which is closer to the shore.Cette étude conduite dans le cadre du projet AMBIO concerne les communautés de poissons et les habitats associés aux récifs coralliens des lagons de Nouvelle-Calédonie. Elle s’appuie sur des données collectées par STAVIRO, une technique vidéo rotative. Cette campagne a été réalisée en 2012 dans la zone de Hienghène, comprise dans la Zone Côtière Est, elle-même située dans le bien inscrit au Patrimoine Mondial de l’Humanité. La zone d’étude comprend également les Aires Marines Protégées (AMP) de Do Himen et de Yeega. Le plan d'échantillonnage couvre l’ensemble de la zone et a été stratifié en fonction des trois structures récifales (récif frangeant, récif d’îlot/intermédiaire et récif barrière) et en tenant compte du statut de protection des AMP. En 4,5 jours 105stations vidéo rotatives ont été validées. Leur analyse a permis de caractériser l’habitat environnant chaque station, ainsi que les communautés de poissons sur la base d’une liste d’espèces d’intérêt écologique, halieutique et emblématique. 31 indicateurs ont été calculés et représentés sous forme de cartes disponibles sur un serveur Sextant. 23 indicateurs ont été analysés grâce à l’outil de calcul PAMPA et ont fait l’objet d’une fiche détaillée de résultats en annexe du rapport. Ces résultats sont repris et synthétisés sous forme de tableau de bord par objectif de gestion relatif à la conservation de la biodiversité et la gestion des ressources de la pêche. Les principaux habitats observés correspondent à des fonds durs : habitat riche en corail vivant (32% des stations), et habitat détritique (47% des stations), et seulement 21% de stations sur fonds meubles. 109 espèces de poissons et de tortue, appartenant à 19 familles ont été observées. Les familles les plus fréquentes sont les chirurgiens et les perroquets (90% et 75% des stations), suivis par les poissons-papillons (54%), les rougets-barbets (48%) et les labres (45%). Neuf familles sont observées sur plus de 20% des stations. Dix-sept espèces de poissons-papillons, plusieurs tortues, napoléons et requins ont été observées, signes d’un bon état de santé d’ensemble des récifs observés. Les herbivores et carnivores sont assez abondants sur les habitats coralliens ; les carnivores sont significativement plus abondants dans les deux réserves, tandis que les herbivores le sont seulement à Do-Himen, réserve située sur le récif barrière. L’assemblage spécifique diffère significativement entre les habitats et marginalement en fonction du statut de protection. La plupart des indicateurs ont des valeurs plus élevées en réserve, ces différences sont significatives pour la richesse spécifique (RS) sur l’habitat Corail Vivant, la RS des chirurgiens et celle des perroquets. Les indicateurs présentent en général des valeurs plus favorables dans la réserve de Do-Himen que dans celle de Yeega plus proche de la côte

Pweevo 2012. Bilan de l’état de santé du récif par stations vidéo rotatives STAVIRO

• Conducted within the AMBIO project, this work deals with coral reef fish communities and associated habitats, in the New Caledonian lagoons. It relies on remote unbaited underwater video observations, using the STAVIRO rotating technique. • The study takes place in the Pouebo area, part of the New Caledonian World Heritage site, and encompassing three no-take marine reserves enclosed within a Locally Managed Area (LMA). • The sampling design covers the entire area, and was stratified according to reef geomorphology and protection status. 86 stations were validated within 4 days. They were analyzed to characterize the habitat surrounding each station, and fish communities, based on a species list that includes fished species, emblematic species and functionally important species. • 32 indicators were computed and mapped (Sextant server). 24 indicators were analysed using the PAMPA computing tool. Outcomes were organized in a dashboard per management objective (biodiversity conservation and fisheries management). • 131 fish and turtle species, belonging to 18 families were observed. Surgeonfish and parrotfish were most frequently observed (86% and 67% of stations), and then parrotfish (63%). • Twenty-two species of butterflyfish were observed, as well as several sharks, indicating an overall good ecological status of the reef, but turtles, humphead wrasses and rays were rarely seen. • There was no significant effect of protection upon the overall species assemblage, nor on the barrier reef. But on intermediate reefs, it differed between the Pewhane reserve and unprotected areas. • In Pewhane, coral cover and butterfly fish abundance were higher in reserve, and fished species, carnivore and herbivore species, surgeon fish and grouperswere more abundant in the living coral habitat. Target species were also abundant on the inner slope of the barrier reef, but with higher abundances outside reserves for surgeon fish, parrotfish and groupers. On the fringing reef, coral cover and fish-related indicatorswerehigher outside the LMA. • Finally, the ecological status in the area appears satisfactory with abundant key coral reef species and coral cover. Yet, the protection effects differ between the barrier reef, the intermediate reef and the fringing reef. Biodiversity ; Fish ; Habitat ; Underwater video; STAVIRO ; Monitoring and assessment; Marine Protected Area ; MPA; World Heritage; Coral reefs; New Caledonia ; Indicator; Dashboard ; Map server ; Sextant ; PAMPACette étude conduite dans le cadre du projet AMBIO concerne les communautés de poissons et les habitats associés aux récifs coralliens des lagons de Nouvelle-Calédonie. Elle s’appuie sur des données collectées par STAVIRO, une technique vidéo rotative. Cette campagne a été réalisée en 2012 dans la zone de Pouébo, comprise dans la Zone Côtière Nord Est, elle-même située dans le bien inscrit au Patrimoine Mondial de l’Humanité. La zone d’étude comprend également les Aires Marines Protégées (AMP) de Pewhane, Whan-DenecePouarape et WhangaLedane, incluses dans une Aire de Gestion Durable des Ressources (AGDR). Le plan d'échantillonnage couvre l’ensemble de la zone et a été stratifié en fonction des trois structures récifales (récif frangeant, récif d’îlot/intermédiaire et récif barrière) et en tenant compte du statut de protection des AMP. 86 stations vidéo rotatives ont été validées. Leur analyse a permis de caractériser l’habitat environnant chaque station, ainsi que les communautés de poissons sur la base d’une liste d’espèces d’intérêt écologique, halieutique et emblématique. 32 indicateurs ont été calculés et représentés sous forme de carte disponible sur un serveur Sextant. 24 indicateurs ont été analysés grâce à l’outil de calcul PAMPA et fait l’objet d’une fiche détaillée de résultats en annexe du rapport. Ces résultats sont repris et synthétisés sous forme de tableau de bord par objectif de gestion relatif à la conservation de la biodiversité et la gestion des ressources de la pêche. Les principaux habitats observés correspondent à des fonds durs : habitat riche en corail vivant (48.5% des stations), et habitat détritique (23.5% des stations), et seulement 28% de stations sur fonds meubles. 131 espèces de poissons et de tortue, appartenant à 18 familles ont été observées. Chirurgiens et papillons sont les familles les plus fréquentes (86% et 67% des stations), suivis par les perroquets (63%). Dix familles sont observées sur plus de 20% des stations. Vingt-deux espèces de poissons-papillons ont été observées ainsi que plusieurs requins, signes d’un bon état de santé d’ensemble des récifs observés. En revanche, peu de tortues, de napoléons et de raies ont été vues. A l’échelle de la zone, l’assemblage spécifique est nettement structuré par l’habitat mais ne diffère pas significativement entre les statuts de protection. Par contre, sur les récifs intermédiaires dans l’habitat Corail vivant, l’assemblage diffère significativement entre la réserve Pewhane et les zones hors réserve, tandis que la situation n’est pas tranchée sur le récif barrière.Dans la Réserve Pewhane, le recouvrement corallien et la richesse spécifique des poissons-papillons sont plus élevés en réserve, et les indicateurs relatifs aux espèces commerciales, consommables, aux cibles de la chasse, aux carnivores et aux herbivores, ainsi qu’aux chirurgiens et loches présentent des valeurs significativement plus élevées dans la réserve sur l’habitat Corail vivant.Les espèces-cibles sont également abondantes sur le tombant interne du récif barrière, mais avec des abondances plus élevées en dehors des réserves pour les chirurgiens, les perroquets et les loches. Sur le récif frangeant, la situation est plus favorable hors AGDR en terme de recouvrement corallien et d’indicateurs relatifs aux poissons, et ce du fait d’une fréquentation et accessibilité moindres. Au final, l’effet de la protection se révèle différent entre les réserves du récif barrière et la réserve Pewhane sur le récif intermédiaire

Local and landscape effects on the functional biodiversity in mango orchards on reunion island

International audienceMango production, which is an important part of tropical areas' economy, is at a phytosanitary and technical dead-end on Reunion Island. The use of chemical insecticides doesn't limit the losses in economy, caused by harmful insects (Diptera, Heteroptera, Homoptera and Thysanoptera). The inefficiency of these energizing and chemical inputs, dictate plant protection evolution towards agro-ecological practices. One of them is to create habitats in crops, in order to promote diversity and abundance of pests' natural enemies. Management of functional biodiversity requires the understanding of the ecological processes involved and the capacity to identify the factors governing predatory arthropod communities in agro-ecosystems. The integrative approach of this study is to characterize the richness and diversity of arthropod predators in mango orchards, depending on various factors: plant species richness in the crop, farming practices and landscape context. The study focuses on epigeal arthropod predators, which are involved in the cycle of several pest species, such as Cecidomyiidae and Tephritidae whose last instar is characterized by a fall to the ground, so as to achieve their pupal stage in the soil. Twenty-four plots were considered, divided into the mango production basins of Reunion Island. Characterization of the composition and properties (richness and diversity) of predatory arthropod communities was conducted by sampling, using pitfall traps. Vegetation adventitious inventory within the orchards permitted to quantify plant species richness. Plots were pooled (fuzzy partitioning) according to their agricultural practices and landscape context. The measures of 17 parameters, corresponding to the nature and frequency of the plant treatment, as well as the weed vegetation management, have identified four practices intensity regimes. The landscape has been mapped to a circle of 400 m radius around each plot; the 11 measured parameters, characterizing the landscape structure and heterogeneity, have distinguished three types of landscape contexts. Richness and evenness of predatory arthropod communities were correlated and compared to these three scales of factors. Trappings revealed that predator communities consisted mainly of ants (Hymenoptera: Formicinae) and of 11 spider families (Araneae). Analysis highlighted the fact that these communities had: (1) a diversity positively correlated with the richness of the vegetation, (2) a greater richness in more moderate cultural practices, (3) a species richness higher when landscape context is heterogeneous, with fragmented mango orchards. To our knowledge, this is the first simultaneous detection of local and landscape factors effects on terrestrial arthropod predators' diversity in a tropical agro-ecosystem. (Texte intégral

Field evaluation of the effectiveness of thermotherapy against cassava mosaic disease in Central African Republic

International audienceAim: The effectiveness of thermotherapy in managing cassava mosaic disease (CMD) was studied on a susceptible local cultivar in the field in the epidemiological conditions. Study Design: The field was laid out in randomized complete block design Place and Duration: Field experiment was conducted in forest zone at Kapou located in south west of Central African Republic according to University of Bangui during August 2010 and July 2011. Methodology: Diseased cassava cuttings were treated in a heated water bath at temperatures ranging from 43ºC to 51ºC for 30 min before being grown for 12 months in the field. Results: Temperatures from 43ºC to 49ºC were found to have no deleterious effect on either the survival of cuttings or on plant regeneration. One month after planting (MAP), up to 40% of the cuttings treated at 47ºC to 49ºC had regenerated a plant with no CMD symptoms compared to 7% of untreated cuttings. Between two and five MAP, cassava cuttings treated at 49ºC produced plants with a significantly lower incidence of CMD than plants produced from untreated cuttings. All plants grown from treated cuttings developed significantly less severe CMD symptoms than untreated cuttings between 8 and 12 months after planting. The highest tuberous root yield was obtained with diseased cuttings treated at 49ºC (4.7kg/plant), equivalent to the yield from untreated symptomless cuttings (4.6kg/plant). Conclusion: Our data clearly demonstrate the value of thermotherapy to maintain a high level of production using local cultivars under severe CMD epidemic conditions.(Résumé d'auteur

Molecular epidemiology of cassava mosaic disease in Madagascar

International audienceCassava is the staple food for hundreds of millions of people in Africa but its cultivation is seriously constrained by cassava mosaic disease (CMD) in Madagascar, and in Africa in general. This study identified the cassava mosaic geminiviruses (CMGs) involved in CMD in Madagascar and their associated epidemiological characteristics from countrywide surveys. Molecular characterization of CMGs in Madagascar revealed an unprecedented diversity and co-occurrence of six viruses: African cassava mosaic virus (ACMV), East African cassava mosaic Cameroon virus (EACMCV), East African cassava mosaic Kenya virus (EACMKV), East African cassava mosaic virus (EACMV), South African cassava mosaic virus (SACMV) and the recently described Cassava mosaic Madagascar virus (CMMGV). Distinct geographical distributions were observed for the six viruses. While ACMV was more prevalent in the central highlands, EACMV and EACMKV were prevalent in lowlands and coastal regions. Both EACMCV and SACMV occurred in almost all the localities visited. PCR diagnosis revealed that mixed infection (up to four co-infected viruses) occurred in 21% of the samples and were associated with higher symptom severity scores. Pairwise comparisons of virus associations showed that EACMCV was found in mixed infections more often than expected while ACMV and SACMV were mostly found in single infections. A greater abundance of whiteflies was observed in lowland and coastal areas. Nevertheless, infected cuttings remain the primary source of CMD propagation (95%) in Madagascar. (Résumé d'auteur