Visualization of ontology evolution using OntoDiffGraph

Dissertação de mestrado em Ciências da ComputaçãoOntologies evolve with the passing of time due to improvements, corrections or changes in requirements that need to be made. It is hard to keep track of these changes made in an ontology without a tool built specifically for that purpose. The goal of this master’s work is the creation of a visualization technique with the objective of allowing the viewer to easily identify changes made in an ontology by comparing two versions of it. The proposed approach adapts the already existing VOWL (Visual Notation for OWL On tologies) specification so that it can also display the differences between two versions of an ontology through the use of a graph. This was implemented in an application, called On toDiffGraph, however this feature is not all that this application has implemented. In fact, to be able to detect the changes that were made, an algorithm was developed that allows the application to find the axioms that were added or removed in an ontology and display them in a graph. OntoDiffGraph also contains several other features that help with the identification of the changes that were made, such as displaying all axioms of the ontology in a list or filtering nodes and edges of the graph that are not relevant to the visualization of changes made in the ontology. OntoDiffGraph was used in an experiment to obtain user feedback and discover how it performed when compared to a similar application (OWLDiff). The participants gave a lot of important constructive feedback and they also displayed a preference of OntoDiffGraph over the other alternative.As ontologias evoluem com o passar do tempo devido a melhoramentos, correções ou mu danças nos requisitos que necessitam de ser feitas. É difícil observar estas mudanças feitas numa ontologia sem utilizar ferramentas especializadas para este fim. O objetivo deste trabalho de mestrado é a criação de uma técnica de visualização com a intenção de oferecer ao observador a capacidade de fácil identificação das mudanças feitas numa ontologia ao comparar duas versões distintas. A abordagem tomada adapta a especificação VOWL (Visual Notation for OWL Ontologies) de forma a que também seja possível visualizar as diferenças entre duas versões de uma ontologia através do uso de um grafo. Esta abordagem foi implementada numa aplicação, com o nome de OntoDiffGraph, no entanto esta funcionalidade não é tudo o que foi im plementado. Para que seja possível detetar as mudanças que foram feitas, um algoritmo foi desenvolvido que permite que a aplicação, além de identificar os conceitos/relações e propriedades que sofreram mudanças, encontre os axiomas que foram adicionados ou re movidos da ontologia e os apresente num grafo. OntoDiffGraph também tem diversas outras funcionalidades que ajudam na identificação de mudanças, tal como a apresentação de todos os axiomas da ontologia numa lista ou a filtração de nodos e arestas que não são relevantes para a visualização das mudanças feitas na ontologia. OntoDiffGraph foi também utilizado num experimento com o objetivo de obter críticas e comparar o seu desempenho com uma aplicação similar (OWLDiff). Os participantes no experimento ofereceram bastantes críticas construtivas e demonstraram uma preferência por OntoDiffGraph em vez de OWLDiff

Optimization of deep learning algorithms for an autonomous RC vehicle

Dissertação de mestrado em Engenharia InformáticaThis dissertation aims to evaluate and improve the performance of deep learning (DL) algorithms to autonomously drive a vehicle, using a Remo Car (an RC vehicle) as testbed. The RC vehicle was built with a 1:10 scaled remote controlled car and fitted with an embedded system and a video camera to capture and process real-time image data. Two different embedded systems were comparatively evaluated: an homogeneous system, a Raspberry Pi 4, and an heterogeneous system, a NVidia Jetson Nano. The Raspberry Pi 4 with an advanced 4-core ARM device supports multiprocessing, while the Jetson Nano, also with a 4-core ARM device, has an integrated accelerator, a 128 CUDA-core NVidia GPU. The captured video is processed with convolutional neural networks (CNNs), which interpret image data of the vehicle’s surroundings and predict critical data, such as lane view and steering angle, to provide mechanisms to drive on its own, following a predefined path. To improve the driving performance of the RC vehicle, this work analysed the programmed DL algorithms, namely different computer vision approaches for object detection and image classification, aiming to explore DL techniques and improve their performance at the inference phase. The work also analysed the computational efficiency of the control software, while running intense and complex deep learning tasks in the embedded devices, and fully explored the advanced characteristics and instructions provided by the two embedded systems in the vehicle. Different machine learning (ML) libraries and frameworks were analysed and evaluated: TensorFlow, TensorFlow Lite, Arm NN, PyArmNN and TensorRT. They play a key role to deploy the relevant algorithms and to fully engage the hardware capabilities. The original algorithm was successfully optimized and both embedded systems could perfectly handle this workload. To understand the computational limits of both devices, an additional and heavy DL algorithm was developed that aimed to detect traffic signs. The homogeneous system, the Raspberry Pi 4, could not deliver feasible low-latency values, hence the detection of traffic signs was not possible in real-time. However, a great performance improvement was achieved using the heterogeneous system, Jetson Nano, enabling their CUDA-cores to process the additional workload.Esta dissertação tem como objetivo avaliar e melhorar o desempenho de algoritmos de deep learning (DL) orientados à condução autónoma de veículos, usando um carro controlado remotamente como ambiente de teste. O carro foi construído usando um modelo de um veículo de controlo remoto de escala 1:10, onde foi colocado um sistema embebido e uma câmera de vídeo para capturar e processar imagem em tempo real. Dois sistemas embebidos foram comparativamente avaliados: um sistema homogéneo, um Raspberry Pi 4, e um sistema heterogéneo, uma NVidia Jetson Nano. O Raspberry Pi 4 possui um processador ARM com 4 núcleos, suportando multiprocessamento. A Jetson Nano, também com um processador ARM de 4 núcleos, possui uma unidade adicional de processamento com 128 núcleos do tipo CUDA-core. O vídeo capturado e processado usando redes neuronais convolucionais (CNN), interpretando o meio envolvente do veículo e prevendo dados cruciais, como a visibilidade da linha da estrada e o angulo de direção, de forma a que o veículo consiga conduzir de forma autónoma num determinado ambiente. De forma a melhorar o desempenho da condução autónoma do veículo, diferentes algoritmos de deep learning foram analisados, nomeadamente diferentes abordagens de visão por computador para detecção e classificação de imagens, com o objetivo de explorar técnicas de CNN e melhorar o seu desempenho na fase de inferência. A dissertação também analisou a eficiência computacional do software usado para a execução de tarefas de aprendizagem profunda intensas e complexas nos dispositivos embebidos, e explorou completamente as características avançadas e as instruções fornecidas pelos dois sistemas embebidos no veículo. Diferentes bibliotecas e frameworks de machine learning foram analisadas e avaliadas: TensorFlow, TensorFlow Lite, Arm NN, PyArmNN e TensorRT. Estes desempenham um papel fulcral no provisionamento dos algoritmos de deep learning para tirar máximo partido das capacidades do hardware usado. O algoritmo original foi otimizado com sucesso e ambos os sistemas embebidos conseguiram executar os algoritmos com pouco esforço. Assim, para entender os limites computacionais de ambos os dispositivos, um algoritmo adicional mais complexo de deep learning foi desenvolvido com o objetivo de detectar sinais de transito. O sistema homogéneo, o Raspberry Pi 4, não conseguiu entregar valores viáveis de baixa latência, portanto, a detecção de sinais de trânsito não foi possível em tempo real, usando este sistema. No entanto, foi alcançada uma grande melhoria de desempenho usando o sistema heterogeneo, Jetson Nano, que usaram os seus núcleos CUDA adicionais para processar a carga computacional mais intensa

Influência do operão nir na adaptação de Staphylococcus aureus às condições do hospedeiro

Staphylococcus aureus is an opportunistic human pathogen, that commensally colonizes the human host and can cause a great number of severe diseases, that can be life-threatening. It is capable of infecting a wide range of tissues, from superficial skin to deeper tissues such as the gastrointestinal track, heart and bones. This variety of tissues show different oxygen concentrations, from highly oxygenated, like blood, to almost anaerobic environments, like the intestines. Little is known of the role played by genes involved in nitrite reduction (NirBD) and siroheme biosynthesis (sirABC) in the adaptation of S. aureus to less oxygenated environments and so it is important to study these genes and the response of this bacteria to the diverse environments found during the host infection. In this work, through qRT-PCR, we observed that oxygen rich environments inhibited the expression of nirR, nirB, sirA and sirC. Hypoxia leads to the onset expression, culminating in higher levels of expression under anaerobic conditions. In anaerobic conditions, nitrates showed to decrease the expression of the nir operon genes and sirC, but their presence also presence improved growth. The mutations ΔnirB, ΔnirD and ΔnirR weaken S. aureus growth, preventing the reduction of nitrites. The deletion of sirC also demonstrated effects, but since the process that is catabolized by this enzyme can occur naturally, but at a lower rate, the effects observed by the deletion of this gene resulted in slightly slower growth and consumption of nitrites, when compared to the wild-type. In summary, S. aureus shows resilience, adapting and surviving, different oxygen environments. It was also showed that the presence of nitrates and oxygen are inhibitors of the expression of the nir and sirC operon genes, in which sirC has been shown to be an enzyme-encoding gene, that when deleted did not impair nitrite reduction by S. aureus.Staphylococcus aureus é patógeno oportunista do ser humano, que coloniza o seu hospedeiro comensalmente, tendo a capacidade de causar diversas doenças, que podem tornar-se mortais. É capaz de infetar uma grande panóplia de tecidos, desde altamente oxigenados, como o sangue, a quase anaeróbicos, como o intestino. Pouco se sabe relativamente ao papel de genes envolvidos na redução de nitritos (NirBD) e síntese de sirohemo (sirABC) na adaptação de S. aureus a ambientes menos oxigenados, sendo por isso importante estudar estes genes e a resposta da bactéria aos diversos ambientes encontrados aquando a infeção do hospedeiro. Neste trabalho, observou-se através de qRT-PCR que ambientes ricos em oxigénio inibem a expressão de nirR, nirB, sirA e sirC. A hipóxia leva ao inicio de expressão destes genes, culminando em superiores níveis de expressão em condições de anaerobiose. Em condições de anaerobiose, nitratos inibem a transcrição de genes do operão nir e sirC, mas a sua presença levou a um maior crescimentos. As mutações ΔnirB, ΔnirD e ΔnirR são debilitadores do crescimento de S. aureus, impedindo a redução de nitritos de uma forma completa. A deleção de sirC, o que resultou num crescimento e redução de nitritos semelhante ao do WT. Em suma, S.aureus, demonstra uma incrível resiliência, adaptandose e sobrevivendo a variadas concentrações de oxigênio. A presença de nitratos e oxigénio são inibidores da expressão dos genes do operão nir e sirC, no qual sirC demonstrou ser um gene que codifica uma enzima que quando deletado não impede a redução de nitritos por parte de S. aureus.Mestrado em Biotecnologi

Estudo comparativo das características físico-químicas e sensoriais de carne de capão, galo, "frango comercial" e "frango do campo"

O presente estudo teve como objetivo a avaliação das qualidades físico-química e sensorial da carne de galo e capão (de duas linhagens comerciais, pedrês e castanha, criadas juntas sob as mesmas condições até ao dia de abate), “frango do campo” e “frango comercial”. A castração é uma técnica cirúrgica adotada para alterar a maturação sexual dos galos machos com o objetivo de melhorar as características de qualidade da carcaça e da carne. As aves foram castradas com nove semanas de idade e criadas até às quinze semanas de idade. Na realização do estudo usaram-se vinte e cinco animais, treze da linhagem pedrês (sete galos e seis capões) e doze da linhagem castanha (cinco galos e sete capões). A partir dos músculos das partes anatómicas da asa, peito e perna foram analisados parâmetros físico-químicos como pH, atividade da água (aw), cor física, índice de oxidação, pigmentos hemínicos, proteína, cinzas, humidade, colagénio, composição lipídica, capacidade de retenção de água (CRA) e textura. A castração não resultou em melhorias de peso em comparação com aves não castradas. Também não houve diferenças nas medidas de pH, CRA, valor de luminosidade (L*), teor de amarelo (b*), textura, proteína, cinzas, índice de oxidação, colagénio e PUFA. Os resultados obtidos mostram diferenças pouco significativas (p≤0,05) entre sexos, para o teor de humidade, pigmentos e gordura. Os capões apresentaram maior (p≤0,001) valor de vermelho (a*) e croma (C*), bem como os valores mais baixos de tom (H*) (p≤0,001) em comparação com galos. Estas variações na cor da carne foram relacionadas a uma maior concentração de pigmentos em capões. A castração aumentou (p≤0,001) o teor de monoinsaturados, diminuindo (p≤0,001) o conteúdo de saturados. Relativamente aos ácidos gordos, verificou-se que os ácidos gordos maioritários foram o ácido oleico (C18:1), o ácido palmítico (C16:0) e o ácido linoleico (C18:2). Foi observado um maior (p≤0,001) valor de ácido oleico no capão, sendo que os valores de ácido palmítico e linoleico não diferiram entre sexos. Os capões da linhagem castanha apresentaram menor valor de força de corte em comparação com os galos da mesma linhagem. Assim como maior teor de vermelho, apresentando menor teor de amarelo e tom. Quanto à composição química, verificou-se que castração na linhagem castanha aumentou o conteúdo em cinzas. Os capões da linhagem pedrês apresentaram um teor de gordura mais elevado comparativamente aos galos, o que proporcionou menor teor de humidade (p≤0,05). No painel de provadores, a carne dos capões (castanho e pedrês), foi classificada como sendo mais suculenta, mais tenra e menos fibrosa, do que a carne dos galos. O “frango comercial” foi caracterizado no geral por apresentar a maior suculência, menor dureza e fibrosidade comparativamente aos restantes grupos de animais.The aim of the present study was to evaluate the physical, chemical and sensory characteristics of cocks and capon´s meat (two commercial lines: pedrês and castanha, raised together under the same conditions until the day of slaughter), a pasture-raised chicken and a broiler as “commercial chicken”. Castration is a surgical technique, adopted to change the sexual maturation of the cocks to improve the meat and carcass quality. The birds were castrated at nine weeks of age and bred until the fifteen weeks of age. During the work performed, were used twenty five animals, thirteen of pedrês lineage (seven cocks and six capons) and twelve of castanha lineage (five cocks and seven capons) From the muscles of the anatomical parts of the wing, breast and leg were analyzed physico-chemical parameters such as pH, water activity (aw), physical color, oxidation index, pigments, protein, ash, moisture, collagen, lipid composition, capacity water retention (CRA) and texture. Castration didn’t result in improvements in weight compared with uncastrated birds. There were also no significant (p>0,05) differences in pH measurements, CRA, lightness value (L*), content yellowness (b*), texture, protein, ash, oxidation index, collagen and PUFA. The results show some small differences (p≤0,05) between sexes, for moisture content, pigments and fat. The capons showed higher (p≤0,001) red value (a*) and Chroma (C*), and lower values of Hue (H*) (p≤0,001) compared with roosters. These variations in flesh color were related to a higher pigment concentration in capons. The castration increased (p≤0,001) the monounsaturated and decreased (p≤0,001) the saturated contents. The main fatty acids found were the oleic acid (C18:1), the palmitic acid (C16:0), and the linoleic acid (C18:2). A higher value of C18:1 in the capon was observed and the values of C16:0 and C18:2 weren’t different between sexes. The castanha capon lineage showed lower cutting force than the roosters of the same lineage. As well as higher red content, presenting lower content of yellow and Hue. The chemical composition of the castanha lineage showed that the content in ashes increased. The pedrês capon lineage, showed a higher fat content than the cocks, which provided lower moisture content. The panel of tasters, classified the capon’s meat (castanho and pedrês) as juicier, more tender and less fibrous than cocks’s meat, raised under the same conditions. The broiler was in general characterized as higher juiciness, lower hardness and fibrousness than the other birds

Study of the influence of a DC electric field on the development of the embryo of the nematode Caenorhabditis elegans

Tese de mestrado em Engenharia Biomédica e Biofísica, apresentada à Universidade de Lisboa, através da Faculdade de Ciências, 2012A bioelectricidade pode influenciar a polarização de uma célula, responsável pela divisão assimétrica, pelo que tem um impacto significativo no desenvolvimento de tecidos ao contribuir para controlar a migração e orientação de células e também a proliferação, diferenciação e apoptose celulares. Estas propriedades da bioelectricidade em tecidos biológicos tornam-na numa ferramenta importante em engenharia de tecidos e medicina regenerativa, pois permite controlar várias respostas fisiológicas a estímulos eléctricos e usá-las para fins benéficos. O nematóide Caenorhabditis elegans é um organismo primitivo, mas cuja fisiologia partilha várias características da biologia humana. Estas características, juntamente com a sua simplicidade de cultivar em grandes populações e de ser conveniente para análise e manipulação genética, tornam-no num dos organismosmodelo mais vastamente utilizados em investigação científica, existindo actualmente uma enorme quantidade de informação disponível sobre este nematóide. O embrião do C. elegans representa um modelo ideal para o estudo da divisão celular e da embriogénese, visto que o seu desenvolvimento é altamente reprodutível e facilmente observável. Além disso, o padrão de desenvolvimento do embrião é praticamente invariável, tornando possível construir um diagrama que representa toda a sua linhagem celular, o que facilita imensamente a análise da embriogénese. A motivação deste projecto surge do conhecimento de que vários seres vivos, como a hidra ou a salamandra, possuem uma grande capacidade de regeneração que está grandemente relacionada com a bioelectricidade. Compreender e controlar os seus mecanismos será certamente um grande avanço na área de engenharia de tecidos e terá como consequência o surgimento de diversas potenciais aplicações. Este projecto tem como objectivo aplicar a aplicação de um campo eléctrico DC num organismo vivo, de forma a induzir uma resposta por parte dele. Devido às suas características, o embrião do nematóide C. elegans foi escolhido como organismo modelo para a aplicação deste estímulo eléctrico. A principal assumpção é que o campo eléctrico aplicado ao longo do eixo antero-posterior do embrião do nematóide C. elegans, induza uma acumulação de carga oposta nas suas extremidades anterior e posterior com o intuito de alterar o potencial de membrana, onde se levantou a hipótese de poderem induzir respostas celulares diferentes em cada extremidade, causando alterações na embriogénese. A ideia surge de uma analogia à aplicação de um gradiente de temperatura ao longo desse mesmo eixo, sabendo-se actualmente que induz uma resposta relativamente à duração de ciclos celulares, visto que é fortemente dependente da temperatura. Através dos resultados, pretende-se também avaliar a utilidade deste embrião como um organismo-modelo para o estudo do impacto de campos eléctricos DC em tecido vivo, visto que outros embriões, como de anfíbios ou pintos, apresentam grandes distúrbios no seu desenvolvimento quando estimulados com campos eléctricos contínuos, com consequências catastróficas no organismo final. A tecnologia dos micro-sistemas permite controlar eficazmente o ambiente celular de uma forma bastante precisa. Assim, um sistema microfluídico é usado como plataforma para estudar o impacto da aplicação do campo eléctrico ao embrião. Este é colocado no interior de um microcanal contendo PBS (tampão fosfato-salino), um bom electrólito e ao mesmo tempo biocompatível para o seu desenvolvimento. Recorrendo a eléctrodos de platina, é aplicada uma diferença de potencial nas extremidades do canal, o que torna possível a existência de uma corrente eléctrica que deverá resultar numa acumulação de carga oposta nas extremidades do embrião, visto que a sua resistividade deverá ser superior à do PBS. A largura e altura do canal são semelhantes à espessura do embrião, o que garante que o campo eléctrico passa através do embrião ou que seja desviado por ele, no caso de este ser isolante. Tendo em conta que o campo eléctrico propaga-se através do canal em direcção ao embrião, é necessário saber qual a sua magnitude à volta dele. Além disso, interacções físicas como o efeito de Joule e reacções redox entre os eléctrodos e o electrólito podem alterar a temperatura e o pH no interior do canal e comprometer o desenvolvimento do embrião de forma indesejada. Assim é também efectuada uma caracterização física detalhada do sistema microfluídico, com o intuíto de saber quais os principais fenómenos físicos que podem ocorrer no interior do canal durante a aplicação do campo eléctrico. Esta caracterização permite tomar as medidas necessárias para minimizar estes efeitos secundários que possam perturbar o normal desenvolvimento do embrião. A caracterização física do sistema consiste essencialmente numa análise das interacções dos eléctrodos de platina com uma solução de cloreto de sódio, o principal constituinte do PBS e em determinar a relação entre a corrente eléctrica no canal e a diferença de potencial aplicada. Para isso são efectuadas medições experimentais e simulações recorrendo ao software de elementos finitos COMSOL Multiphysics. O procedimento experimental para a análise do impacto do campo eléctrico no embrião começa com a recolha de um embrião de um nematóide hermafrodita adulto, proveniente de uma cultura em pratos de agarose semeados com Escherichia coli como fonte de alimento. O embrião escolhido deve estar no início do desenvolvimento, de preferência após a meiose, de forma a poder ser estimulado o mais cedo possível. Sabese que perturbar os eventos iniciais da embriogénese pode ter consequências em todo o restante desenvolvimento, visto que este depende grandemente das primeiras divisões celulares. Recolhido o embrião, este é inserido no microcanal, onde é fixado e permanece durante todo o ensaio experimental. De seguida, o campo eléctrico é aplicado através da aplicação de uma diferença de potencial nos eléctrodos em contacto com as extremidades do canal. Pontes salinas de agarose são utilizadas em algumas experiencias para evitar a contaminação do electrólito com produtos das reacções químicas que ocorrem na superfície dos eléctrodos. O desenvolvimento do embrião é observado através de microscópios invertidos equipados com contraste de fase. Imagens de time-lapse são capturadas e posteriormente analisadas recorrendo ao software ImageJ. Eventos da embriogénese seleccionados para análise são comparados para embriões em experiencias de controlo e embriões estimulados com o campo eléctrico. Métodos de análise estatística são efectuados para auxiliar a comparação. Parâmetros a observar e comparar são os tempos de ocorrência dos eventos seleccionados e orientação e posição de células no embrião. O comportamento da minhoca juvenil após o nascimento também pode fornecer informação relativamente à embriogénese, pelo que também é analisado. A caracterização do chip revelou que uma tensão de 5V é apropriada para criar um campo eléctrico com dimensões fisiológicas (cerca de 0.3mV/μm), não aumentando a temperatura para valores fora dos limites de desenvolvimento normal do embrião. Alterações do pH foram minimizadas através da utilização das pontes salinas inseridas nas entradas do canal. A comparação entre embriões de controlo e embriões estimulados revela que não existem grandes diferenças entre os eventos da embriogénese de embriões de controlo e embriões estimulados pelo campo eléctrico, o que sugere que o embrião resiste ao campo eléctrico, talvez devido à barreira de permeabilidade presente na sua carapaça. Pequenas diferenças nos tempos embriológicos entre embriões de controlo e estimulados sugerem que o campo eléctrico possa ter efeitos a longo prazo na embriogénese, retardando os seus eventos mais tardios. As diferenças são demasiado pequenas para se poder tirar alguma conclusão, contudo, os resultados sugerem que deveria ser feita uma análise mais detalhada ao ciclo celular de certas células do início da embriogénese, o que não foi possível com o equipamento disponível. Comparando estes resultados com os de outros estudos com embriões, como por exemplo em anfíbios ou pintos, conclui-se que o impacto do um campo eléctrico DC no desenvolvimento do embrião do nematóide C. elegans não é tão significativo como nesses modelos, o que os torna preferíveis para estudos com embriões intactos. No entanto, existe ainda a possibilidade de estudos a nível de células isoladas extraídas do embrião e também não é de descartar a hipótese de aplicar um campo eléctrico AC ou de tentar remover a carapaça do embrião em futuras investigações.Bioelectricity has an impact on the development of tissues because it can influence cell polarization, essential for asymmetric cell division. This feature may be an important tool for tissue engineering and regenerative medicine applications. The nematode Caenorhabditis elegans is a primitive organism, but whose physiology shares several characteristics of human biology. Its embryo is an ideal model for the study of cell division and embryogenesis, since its development is almost invariant and highly reproducible and readily observable. This project has the objective of studying the impact of a DC electric field in the C. elegans embryo development and to assert if this organism is a good model for further research in this field. To accomplish it, a DC electric field is applied in a microchannel filled with PBS, where to the embryo is confined. Embryogenesis is studied by analysing selected development stages, which are compared for control and electric field experiments. To optimize the application of the electric field to the embryo and minimize other physical phenomena which can disturb embryogenesis, a detailed physical characterization of the microfluidic system is also performed. The results show that there are no big differences in the events of embryogenesis, suggesting that the embryo resists to the electrode field, perhaps due its eggshell. Nevertheless, small differences in embryological times suggest that the electric field can have long term effects on embryogenesis, and that a more detailed analysis should be performed. In summary, the embryo nematode C. elegans is not as suited to study the impact of DC electric fields in embryogenesis as other embryo models, such as amphibians. However, there is still the possibility of studies of single isolated embryo cells. Besides, it is not discarded the possibility of applying an AC electric field or attempting to remove the eggshell in future studies

Physicochemical composition and sensory quality evaluation of capon and rooster meat

The aim of the present study was to evaluate the effect of caponization on the physicochemical and sensory characteristics of rooster and capon meat (2 Portuguese autochthonous chicken breeds of roosters: Amarela and Pedrês), raised under the same production. The birds were castrated at 9 wk of age and bred until 140 d of age. Forty Amarela (20 roosters and 20 capons - castrated male) and 40 Pedrês Portuguesa (20 roosters and 20 capons) breed chickens, 5 free-range chickens, and 5 broilers were used. From the breast, leg, and wing muscles, physicochemical parameters such as pH, water activity (a w ), physical color, moisture content, ash, CP, pigments, collagen, and total fat and fatty acids profile, were analyzed according to standard procedures. Caponization did not affect pH, a w , lightness (L*), yellowness (b*), ash, protein, collagen, saturated fatty acids (SFA), polyunsaturated fatty acids (PUFA), and the ratio of unsaturated fatty acids (UFA)/SFA. Results show that caponization decreased (P = 0.05) moisture content and increased (P = 0.05) pigments and intramuscular fat content. Capons showed higher (P = 0.001) redness (a*) and chroma (C*), and lower (P = 0.001) hue (H*) compared to roosters. Caponization increased (P = 0.05) monounsaturated fatty acids content and PUFA/SFA. The main fatty acids found were oleic (C18:1), palmitic (C16:0), and linoleic (C18:2). Capons had greater (P = 0.05) C18:1 content but lower (P = 0.01) butyric acid (C4:0), caprylic acid (C8:0), stearic acid (C18:0), and (P = 0.05) arachidonic acid (C20.4) content than roosters. The objective of sensory analysis was making the comparison of the Amarela and Pedrês meat with a free-range chicken and a broiler. Panelists classified the capon meat (Amarela and Pedrês) as juicier and less tough and fibrous than rooster meat. Broilers were in general juicier, tenderer, and less fibrous than the other chickens in this study. The results of sensory evaluation complement those obtained in physicochemical analysis, suggesting that caponization promotes an overall improvement in meat quality.The authors are grateful to Laboratory of Carcass and Meat Quality of Agriculture School of Polytechnic Institute of Bragança ‘Cantinho do Alfredo’.info:eu-repo/semantics/publishedVersio

Imagery ability in Boccia: Comparison among federate athletes from different medical sport groups

The aim of this study was to analyse and compare movement visualization ability in federate and non-federate Boccia athletes, and among federate Boccia medical sport groups. Forty-two Boccia athletes (Federate N = 24; Non-federate N = 18) at an average age of 35.8 (SD = 11.19) participated in this study. The Portuguese version of Movement Imagery Questionnaire - 3 (MIQ-3), was used for this study. The participants were evaluated on the internal and external visual imagery. Statistics was carried out following the method of interference based on the magnitude of the effects. Results showed a great effect of expertise in imagery ability. The comparison between federate and non-federate Boccia athletes showed a great effect in the Internal Visual subscale and a moderate effect in the External Visual subscale. It was also observed differences between athletes from different medical-sports groups, revealing that the requirements of the sport linked to their action abilities provides them with different Imagery abilities. These results clearly influence the prescription of imagery training programs for different groups taking into account different medical-practice groups.info:eu-repo/semantics/publishedVersio

Sistema de pesos para avaliação da sustentabilidade económica da construção

Mestrado em Engenharia Civil e do Ambiente : Especialização em Construções Civis na Escola Superior de Tecnologia e Gestão do Instituto Politécnico de Viana do CasteloA sustentabilidade económica em edifícios é um tema bastante atual e sobre o qual esta dissertação se debruça. Existem já vários sistemas que avaliam e certificam a sustentabilidade em edifícios, tendo em conta as três vertentes da sustentabilidade, ambiental, social e económica, baseando-se em hierarquias de atributos devidamente ponderadas. Contudo, a vertente económica é em geral apenas considerada de forma muito simplificada. A metodologia MAEP-RB (Methodology of Assessment of Economic Performance - Residential Buildings) avalia de forma sistemática o desempenho económico de um edifício dentro do conceito sustentabilidade, com base na análise do ciclo de vida na fase anterior à utilização. O principal objetivo desta dissertação consistiu no desenvolvimento de um sistema de pesos adaptada à estrutura hierárquica da metodologia MAEP-RB. O sistema de pesos, numa hierarquia de atributos associada a uma metodologia, é um dos pontos mais importantes, pois define a importância que cada atributo tem perante a análise da sustentabilidade económica de um determinado edifício. A complexidade da criação de um sistema de pesos está na procura dos valores que melhor conseguem definir a importância de determinados atributos perante a hierarquia. Nesta dissertação recorreu-se à realização de inquéritos a profissionais de engenharia como forma angariar pareceres técnicos e posteriormente, com base no processo de analise hierárquico (AHP), definir o sistema de pesos da hierarquia de atributos da metodologia MAEP-RB.Economic sustainability in buildings is a very current theme that has an increasing importance. There are already some systems that assess and certify the sustainability in buildings, taking into account the three aspects of sustainability, environmental, social and economic, based on weighted hierarchies. However, the economic aspect is often only marginally considered. The MAEP-RB methodology (Methodology of Assessment of Economic Performance - Residential Buildings) systematically assesses the economic performance of a building within the sustainability concept, based on life cycle analysis in the before use phase. The main objective of this dissertation was the definition of the system of weights for the attributes of the MAEP-RB methodology. The system of weights, in a hierarchy associated with this type of methodology, is one of the most important points, because it defines the importance of each attribute before the analysis of the economic sustainability of a particular building. The complexity of creating a system of weights is in the search for values that best represent the importance of certain attributes within the hierarchy. In this dissertation, we carried out a seires of questionnaires to engineering professionals as a way to obtain a technical advice and subsequently, on the basis the analyses hierarchy process (AHP), define the system of weights of the methodology MAEP-RB

A macrodinâmica do crescimento com desemprego estrutural : determinando a distribuição da renda na trajetória do equilíbrio

Dissertação (mestrado)- Universidade de Brasília, Programa de Pós-Graduação em Economia, 2008.O presente esforço consiste fundamentalmente numa tentativa de determinar a trajetória do equilíbrio com crescimento, por meio de um arcabouço teórico que não seja restrito ao cenário de pleno emprego da força de trabalho. Para esta tarefa partimos do modelo de crescimento de FePDman, que pressupõe desemprego da mão-de-obra disponível e a existência de dois setores, e seguimos incorporando condições de mercado nesta abordagem. Estas condições foram estabelecidas através da função de poupança diferencial por classe social do chamado Processo Kaldor-Pasinetti. Com essa estratégia conseguimos estabelecer como o mercado equilibrado determinaria a alocação do investimento entre os setores de bens de consumo e bens de investimento, variável que é chave no modelo de Fel’Dman. A partir deste resultado determinamos a taxa de lucro de equilíbrio e a taxa de crescimento da economia numa trajetória com desemprego. Estas proposições foram generalizadas ao longo da dissertação com a incorporação de pressupostos mais abrangentes de poupança, bem como com a introdução do governo. Por fim, estabelecemos quais as condições necessárias para que uma economia com desemprego atinja o pleno emprego da força de trabalho e vice-versa.The present effort consists fundamentally in an attempt of determining the growth equilibrium path in a context of unemployment in labor-force. For this task we start with FePDman’s growth model, which presupposes unemployment of the labor force and the existence of two sections, and following by the incorporation of market conditions in this approach. These conditions were established through a differential saving function by social class, of the called Kaldor-Pasinetti Process. With that strategy we showed how the allocation of the investment among the consumption section and investment section (Fel'Dman's main variable) is established in a market equilibrium. From this result we determined the equilibrium profit tax and the economic growth tax in an unemployment path. Following along the dissertation we generalized those results by introducing less restricted save functions and government. Finally, we established the necessary conditions for an economy with unemployment reaches the full employment and vice versa