Presence-only for marked point process under preferential sampling

Preferential sampling models have garnered significant attention in recent years. Although the original model was developed for geostatistics, it founds applications in other types of data, such as point processes in the form of presence-only data. While this has been recognized in the Statistics literature, there is value in incorporating ideas from both presence-only and preferential sampling literature. In this paper, we propose a novel model that extends existing ideas to handle a continuous variable collected through opportunistic sampling. To demonstrate the potential of our approach, we apply it to sardine biomass data collected during commercial fishing trips. While the data is intuitively understood, it poses challenges due to two types of preferential sampling: fishing events (presence data) are non-random samples of the region, and fishermen tend to set their nets in areas with a high quality and value of catch (i.e., bigger schools of the target species). We discuss theoretical and practical aspects of the problem, and propose a well-defined probabilistic approach. Our approach employs a data augmentation scheme that predicts the number of unobserved fishing locations and corresponding biomass (in kg). This allows for evaluation of the Poisson Process likelihood without the need for numerical approximations. The results of our case study may serve as an incentive to use data collected during commercial fishing trips for decision-making aimed at benefiting both ecological and economic aspects. The proposed methodology has potential applications in a variety of fields, including ecology and epidemiology, where marked point process model are commonly used.FCT -Fundação para a Ciência e a Tecnologia(PTDC/MAT-STA/28243/2017

Fatty acid and retinol-binding protein: Unusual protein conformational and cavity changes dictated by ligand fluctuations

Lipid-binding proteins (LBPs) are soluble proteins responsible for the uptake, transport, and storage of a large variety of hydrophobic lipophilic molecules including fatty acids, steroids, and other lipids in the cellular environment. Among the LBPs, fatty acid binding proteins (FABPs) present preferential binding affinities for long-chain fatty acids. While most of FABPs in vertebrates and invertebrates present similar β-barrel structures with ligands accommodated in their central cavity, parasitic nematode worms exhibit additional unusual α-helix rich fatty acid- and retinol-binding proteins (FAR). Herein, we report the comparison of extended molecular dynamics (MD) simulations performed on the ligand-free and palmitic acid-bond states of the Necator americanus FAR-1 (Na-FAR-1) with respect to other classical β-barrel FABPs. Principal component analysis (PCA) has been used to identify the different conformations adopted by each system during MD simulations. The α-helix fold encompasses a complex internal ligand-binding cavity with a remarkable conformational plasticity that allows reversible switching between distinct states in the holo-Na-FAR-1. The cavity can change up to one-third of its size affected by conformational changes of the protein-ligand complex. Besides, the ligand inside the cavity is not fixed but experiences large conformational changes between bent and stretched conformations. These changes in the ligand conformation follow changes in the cavity size dictated by the transient protein conformation. On the contrary, protein-ligand complex in β-barrel FABPs fluctuates around a unique conformation. The significantly more flexible holo-Na-FAR-1 ligand-cavity explains its larger ligand multiplicity respect to β-barrel FABPs.Fil: Barletta Roldan, Patricio German. Universidad Nacional de Quilmes. Departamento de Ciencia y Tecnología; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: Franchini, Gisela Raquel. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - La Plata. Instituto de Investigaciones Bioquímicas de La Plata "Prof. Dr. Rodolfo R. Brenner". Universidad Nacional de la Plata. Facultad de Ciencias Médicas. Instituto de Investigaciones Bioquímicas de La Plata "Prof. Dr. Rodolfo R. Brenner"; ArgentinaFil: Córsico, Betina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - La Plata. Instituto de Investigaciones Bioquímicas de La Plata "Prof. Dr. Rodolfo R. Brenner". Universidad Nacional de la Plata. Facultad de Ciencias Médicas. Instituto de Investigaciones Bioquímicas de La Plata "Prof. Dr. Rodolfo R. Brenner"; ArgentinaFil: Fernández Alberti, Sebastián. Universidad Nacional de Quilmes. Departamento de Ciencia y Tecnología; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentin

EVALUACIÓN DEL USO Y MANEJO DE LAS BASES DE DATOS DISPONIBLES PARA EL PERFIL DE MEDICINA TRANSFUSIONAL

Con el objetivo de evaluar las habilidades en el uso y manejo de las bases de datos disponibles en la Red del Sistema Nacional de Salud y establecer estrategias a partir de los resultados alcanzados, se aplicó una encuesta de competencias informacionales a 7 profesores y 11 estudiantes de la carrera Licenciatura en Tecnología de la Salud, en el perfil Medicina Transfusional, en la Facultad de Ciencias Médicas “Enrique Cabrera”. La encuesta identificó el estado del conocimiento sobre búsquedas bibliográficas, la utilización de las fuentes de información y el acceso a las tecnologías de la información. Se tuvieron en cuenta los aspectos éticos, y se protegió en todo momento la identidad de los entrevistados. Los resultados de la experiencia demuestran que la mayoría de los profesores conocen y usan las bases de datos PUBMED e HINARI, de ellos 16,7% requiere del apoyo de un especialista; los alumnos tienen un total desconocimiento de las bases de datos cuya consulta facilita Infomed. Los docentes y los alumnos desconocen la existencia de la base de datos DYNAMED, mientras que el buscador más conocido y visitado por estos es Google. Se concluye que existe una deficiente competencia informacional. A partir de los resultados alcanzados se recomienda desarrollar habilidades mediante talleres y otras actividades curriculares de alfabetización informacional.PALABRAS CLAVE:Bases de datos, Red de Salud, Tecnologías de la información y las comunicaciones, Búsqueda bibliográficas, Fuentes de información, Competencias informacionales

Desenvolvimento rural sustentável na região do município de Ibirubá- RS

Trabalho apresentado no 31º SEURS - Seminário de Extensão Universitária da Região Sul, realizado em Florianópolis, SC, no período de 04 a 07 de agosto de 2013 - Universidade Federal de Santa Catarina.O referido programa busca através de diferentes ações integradas na relação ensino-pesquisa-extensão, desenvolver ações voltadas aos sistemas familiares de produção e comercialização, através dos princípios da interdisciplinaridade. Fazem parte dos parceiros deste programa organizações públicas e privadas do município de Ibirubá-RS. Este programa faz parte de uma iniciativa do Banco Brasil, em conjunto com diversas entidades do setor público e privado (IFRS, COOPEAGRI,Prefeitura Municipal, EMATER, entre outros) que visa qualificar a produção leiteira realizada por pequenos produtores através da prestação de serviços de assistência técnica e extensão rural. Com o foco na sustentabilidade o programa também prevê incrementar a diversificação produtiva nas propriedades rurais, facilitando o contato e a aprendizagem de novas tecnologias adaptadas as condições da agricultura familiar. Uma primeira etapa já fora realizada, em ação conjunta com professores e alunos do IFRS e entidades participantes do programa, efetuaram-se reuniões com as famílias convidadas, da Localidade Linha Pulador Sul, Ibirubá, RS. Esta localidade foi escolhida por motivos de melhor acessibilidade e boa aceitabilidade dos produtores para novas técnicas. Na primeira reunião, realizada na comunidade, foram apresentados os objetivos do programa para as famílias convidadas. Na segunda reunião houve participação das famílias rurais que aderiram ao programa, em um total de oito, na qual as entidades idealizadoras apresentaram aos presentes o modelo de questionário que será aplicado com intenção de fazer um diagnóstico da propriedade, e também foram determinadas as equipes responsáveis pela aplicação deste junto as famílias participantes. A partir de então foram determinadas as datas das visitas, as quais estão em andamento. A próxima etapa prevista será sistematizar os diagnósticos e realizar novos encontros com os produtores, a fim de validar os dados obtidos e criar as estratégias de ação que serão aplicadas nas propriedades rurais no decorrer do Programa

Evaluation of recombinant antigens of Trypanosoma cruzi to diagnose infection in naturally infected dogs from Chaco region, Argentina

Dogs are considered the main mammal reservoir of Trypanosoma cruzi in domiciliary environments. Consequently, accurate detection of T. cruzi infection in canine populations is epidemiologically relevant. Here we analyzed the utility of the T. cruzi recombinant antigens FRA, SAPA, CP1, Ag1 and a SAPA/TSSA VI mixture, in an ELISA format. We used a positive control group of sera obtained from 38 dogs from the Chaco region in Argentina with positive Homogenate-ELISA reaction, all of them also positive by xenodiagnosis and/or PCR. The negative group included 19 dogs from a non-endemic area. Sensitivity, specificity, Area Under the Curve (AUC) of the Receiver-Operating Charactheristic (ROC) curve and Kappa index were obtained in order to compare the diagnostic efficiency of the tests. The SAPA/TSSA VI had the highest performance, with a sensitivity of 94.7% and an AUC ROC of 0.99 that indicates high accuracy. Among individual antigens, SAPA-ELISA yielded the highest sensitivity (86.8%) and AUC ROC (0.96), whereas FRA-ELISA was the least efficient test (sensitivity=36.8%; AUC ROC=0.53). Our results showed that the use of SAPA/TSSA VI in ELISA assays could be a useful tool to study dogs naturally infected with T. cruzi in endemic areas.Fil: Floridia Yapur, Noelia Aldana del Rosario. Universidad Nacional de Salta. Sede Regional Orán. Instituto de Investigación de Enfermedades Tropicales; Argentina. Universidad Nacional de Salta. Facultad de Ciencias Naturales. Escuela de Biología. Cátedra de Química Biológica; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Salta; ArgentinaFil: Vega Benedetti, Ana Florencia. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Salta. Instituto de Patología Experimental. Universidad Nacional de Salta. Facultad de Ciencias de la Salud. Instituto de Patología Experimental; ArgentinaFil: Monje Rumi, Maria Mercedes. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Salta. Instituto de Patología Experimental. Universidad Nacional de Salta. Facultad de Ciencias de la Salud. Instituto de Patología Experimental; ArgentinaFil: Ragone, Paula Gabriela. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Salta. Instituto de Patología Experimental. Universidad Nacional de Salta. Facultad de Ciencias de la Salud. Instituto de Patología Experimental; ArgentinaFil: Lauthier, Juan José. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Salta. Instituto de Patología Experimental. Universidad Nacional de Salta. Facultad de Ciencias de la Salud. Instituto de Patología Experimental; ArgentinaFil: Tomasini, Nicolás. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Salta. Instituto de Patología Experimental. Universidad Nacional de Salta. Facultad de Ciencias de la Salud. Instituto de Patología Experimental; ArgentinaFil: Alberti D'amato, Anahí Maitén. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Salta. Instituto de Patología Experimental. Universidad Nacional de Salta. Facultad de Ciencias de la Salud. Instituto de Patología Experimental; ArgentinaFil: López Quiroga, Inés Raquel. Universidad Nacional de Salta. Facultad de Ciencias Naturales. Escuela de Biología. Cátedra de Química Biológica; Argentina. Universidad Nacional de Salta. Sede Regional Orán. Instituto de Investigación de Enfermedades Tropicales; ArgentinaFil: Diosque, Patricio. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Salta. Instituto de Patología Experimental. Universidad Nacional de Salta. Facultad de Ciencias de la Salud. Instituto de Patología Experimental; ArgentinaFil: Marcipar, Iván Sergio. Universidad Nacional del Litoral. Facultad de Bioquímica y Ciencias Biológicas. Laboratorio de Tecnología Inmunológica; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Salta; ArgentinaFil: Nasser, Julio Rubén. Universidad Nacional de Salta. Sede Regional Orán. Instituto de Investigación de Enfermedades Tropicales; Argentina. Universidad Nacional de Salta. Facultad de Ciencias Naturales. Escuela de Biología. Cátedra de Química Biológica; ArgentinaFil: Cimino, Rubén Oscar. Universidad Nacional de Salta. Sede Regional Orán. Instituto de Investigación de Enfermedades Tropicales; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Salta; Argentina. Universidad Nacional de Salta. Facultad de Ciencias Naturales. Escuela de Biología. Cátedra de Química Biológica; Argentin

Trabajo rural, género y salud : El caso de la producción hortícola en el Cinturón Verde de La Plata

Los trabajadores hortícolas, nivel colectivo e individual producen complejos de representaciones y prácticas relacionadas con el conjunto de necesidades sentidas como tales, entre ellas nos interesa en particular la indagación de aquellas relacionadas con la prevención de enfermedades y el cuidado de la salud. Se trata de prácticas que son fundamentales para la reproducción de cualquier conjunto social por lo que han de ser entendidas entonces como saberes y prácticas estructurales a todas las sociedades. (Menéndez, E.: 1994; 1998). Esta presentación que se produce a partir de los lineamientos principales de un estudio mayor que se encuentra en su fase inicial, intentará en una primera aproximación a la temática, señalar brevemente la situación planteada como problemática y una serie de consideraciones teóricas y metodológicas que señalan el punto de partida de la investigación mencionada. Partimos de la visión general de los considerandos conceptual-metodológicos de los ejes básicos que estructuran el trabajo analítico y nos planteamos una serie de interrogantes e hipótesis que nos permitirán indagar en las articulaciones entre trabajo y salud desde el eje de las relaciones de género.Jornadas realizadas junto con el I Encuentro Latinoamericano de Metodología de las Ciencias Sociales.Facultad de Humanidades y Ciencias de la Educació