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    3D-QSAR/CoMFA Models as a Tool for Biocatalysis and Protein Engineering

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    The x-ray structure of an enzyme is taken into account, when available, as the reference model to explain catalytic activity and selectivity. Unfortunately, in most of the cases the structure is available only as apostructure, i.e. without the substrate bound to the active site, and it is strange to find many different enzyme-substrate complexes of a specific enzyme as crystals. Moreover this structure is not the "real" structure of the protein during catalysis as the crystal is stationary. In this paper we propose the use of CoMFA models to evaluate the differences betweenthe crystal and the real structure of the enzyme under reaction conditions. In addition to the stationary nature of a crystal, the experimental limitations of crystallographic techniques to obtain crystals in a fast and reliable manner, give a chance to the creation of CoMFA models by evaluating the easy to obtain catalytic properties of enzyme variants to provide information about the structural changes produced by the mutations. By means of the evaluation of different structures as substrates CoMFA models will not only provide information about the structure of the enzyme, but also about the flexibility and potential conformational changes of the substrate binding site

    Translocação e redistribuição de enxofre em plantas de milho e de soja.

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    O objetivo deste trabalho foi estudar a transloca√ß√£o e a redistribui√ß√£o de S pelo transporte acr√≥peto e bas√≠peto em plantas de milho e de soja. Plantas das duas esp√©cies foram cultivadas em solu√ß√£o nutritiva contendo 35 S em casa de vegeta√ß√£o. O 35S aplicado em uma √ļnica raiz foi prontamente absorvido e translocado para a parte a√©rea, assim como para as demais ra√≠zes cultivadas na aus√™ncia de enxofre. O radiois√≥topo aplicado em uma √ļnica folha foi transportado tanto na dire√ß√£o acr√≥peta quanto na bas√≠peta. Entretanto, o milho e a soja mostraram comportaments diferentes na absor√ß√£o e na distribui√ß√£o do enxofre. O milho, apesar de ter apresentado maior absor√ß√£o radicular, reteve grande parte desse elemento na raiz, enquanto a soja absorveu consideravelmente menos, por√©m apresentou maior efici√™ncia de transloca√ß√£o. Nas plantas de soja, as folhas superiores, principalmente as mais novas, mostraram ser os principais drenos fisiol√≥gicos do enxofre

    Relativistic Runge-Lenz vector: from N=4{\cal N}=4 SYM to SO(4) scalar field theory

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    Starting from N=4{\cal N}=4 SYM and using an appropriate Higgs mechanism we reconsider the construction of a scalar field theory non-minimally coupled to a Coulomb potential with a relativistic SO(4) symmetry and check for scalar field consistency conditions. This scalar field theory can also be obtained from a relativistic particle Lagrangian with a proper implementation of the non-minimal coupling. We provide the generalization of the non-relativistic construction of the Runge-Lenz vector to the relativistic case and show explicitly that this new vector generates the SO(4) algebra. Using the power of the SO(4) symmetry, we calculate the relativistic hydrogen atom spectrum. We provide a generalization of the Kustaanheimo-Stiefel transformation to the relativistic case and relate our results with the corresponding relativistic oscillator. Finally, in the light of these results, we reconsider the calculation of the hydrogen atom spectrum from the cusp anomalous dimension given in [2].Comment: 17 pages. Enhaced version matching the published JHEP version. Typos corrected. The argument of concistence at the end of section 2 was correcte

    Plasma‚Äďwall interaction in laser inertial fusion reactors: novel proposals for radiation tests of first wall materials

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    Dry-wall laser inertial fusion (LIF) chambers will have to withstand strong bursts of fast charged particles which will deposit tens of kJ m‚ąí2 and implant more than 1018 particles m‚ąí2 in a few microseconds at a repetition rate of some Hz. Large chamber dimensions and resistant plasma-facing materials must be combined to guarantee the chamber performance as long as possible under the expected threats: heating, fatigue, cracking, formation of defects, retention of light species, swelling and erosion. Current and novel radiation resistant materials for the first wall need to be validated under realistic conditions. However, at present there is a lack of facilities which can reproduce such ion environments. This contribution proposes the use of ultra-intense lasers and high-intense pulsed ion beams (HIPIB) to recreate the plasma conditions in LIF reactors. By target normal sheath acceleration, ultra-intense lasers can generate very short and energetic ion pulses with a spectral distribution similar to that of the inertial fusion ion bursts, suitable to validate fusion materials and to investigate the barely known propagation of those bursts through background plasmas/gases present in the reactor chamber. HIPIB technologies, initially developed for inertial fusion driver systems, provide huge intensity pulses which meet the irradiation conditions expected in the first wall of LIF chambers and thus can be used for the validation of materials too

    Critical Behavior of Three-Dimensional Disordered Potts Models with Many States

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    We study the 3D Disordered Potts Model with p=5 and p=6. Our numerical simulations (that severely slow down for increasing p) detect a very clear spin glass phase transition. We evaluate the critical exponents and the critical value of the temperature, and we use known results at lower pp values to discuss how they evolve for increasing p. We do not find any sign of the presence of a transition to a ferromagnetic regime.Comment: 9 pages and 9 Postscript figures. Final version published in J. Stat. Mec

    Eluição de magnésio, cálcio e potássio de acordo com o tempo de difusão em colunas com agregados de um Latossolo vermelho distrófico típico.

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    O transporte de nutrientes at√© √†s ra√≠zes √© essencialmente efetuado por fluxo de massa e difus√£o. √Ä medida que os nutrientes presentes na solu√ß√£o m√≥vel ou de interagregados v√£o-se exaurindo, eles se movimentam por difus√£o do interior para a superf√≠cie dos agregados. Com o objetivo de determinar a quantidade de Mg, Ca e K no efluente de colunas com agregados de um Latossolo Vermelho distr√≥fico t√≠pico, em resposta ao tempo de difus√£o, realizou-se um experimento utilizando √°gua destilada como eluente. Os tratamentos corresponderam a um arranjo fatorial 4 x 5, sendo quatro classes de agregados (2,0-1,0; 1,0-0,5; 0,5-0,25; e 0,25-0,105 mm) e cinco tempos de difus√£o (O, 1, 2, 4 e 6 dias). As colunas receberam um volume de √°gua destilada igual a 10 vezes o seu volume de poros, recolhendo-se cinco fra√ß√Ķes de dois volumes de poros de efluente nos intervalos indicados para cada tempo de difus√£o. Os agregados menores liberaram mais Mg, Ca e K para a solu√ß√£o nos espa√ßos interagregados que os maiores. A quantidade de Mg, Ca e K elu√≠da aumentou com o tempo de difus√£o, a partir da segunda fra√ß√£o analisada

    Colaboración internacional y buenas prácticas en la gestión de enfermedades crónicas complejas a través de herramientas web 2.0: Observatorio de prácticas innovadoras en el manejo de enfermedades crónicas complejas OPIMEC

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    Ponencias de la Segunda Conferencia internacional sobre brecha digital e inclusi√≥n social, celebrada del 28 al 30 de octubre de 2009 en la Universidad Carlos III de MadridLas enfermedades cr√≥nicas (EC) constituyen un reto de salud mundial en el siglo XXI. La OMS las define como enfermedades de larga duraci√≥n por lo general de progresi√≥n lenta y prev√© que en 2020 ser√°n responsables del 73% de las muertes y del 60% de la carga global de enfermedad (World Health Organization, 2002). Es primordial que la comunidad internacional de salud p√ļblica y de gesti√≥n sanitaria conozca y comparta informaci√≥n sobre los avances en las pr√°cticas tecnol√≥gicas y organizativas m√°s innovadoras en gesti√≥n de EC, con √©nfasis en las EC Complejas (ECC) asociadas a una mayor p√©rdida de autonom√≠a y grado de dependencia y discapacidad. Con este prop√≥sito, a mediados de 2006, la Direcci√≥n General de Innovaci√≥n Sanitaria, Sistemas y Tecnolog√≠a de la Consejer√≠a de Salud de la Junta de Andaluc√≠a crea el ¬ęObservatorio de Pr√°cticas Innovadoras para el Manejo de Enfermedades Cr√≥nicas Complejas¬Ľ (OPIMEC) que impulsa la participaci√≥n y generaci√≥n de conocimiento en informaci√≥n sanitaria para profesionales y una Plataforma de Red en el √°mbito de la gesti√≥n de ECC para el fomento de alianzas y colaboraciones desde Andaluc√≠a basadas en dar y recibir conocimiento abierto entre personas, equipos y organizaciones (Jadad AR, 1999, p. 761-764; Jadad AR, 2000, p.362-365). La Web del Observatorio de Pr√°cticas Innovadoras en el Manejo de Enfermedades Cr√≥nicas Complejas (OPIMEC), http://www.opimec.org, va centrada en la creaci√≥n de una plataforma basada en la Web 2.0. que permite el acceso y la edici√≥n colaborativa de contenidos para profesionales. El objetivo fundamental de esta plataforma es compartir y colaborar en la generaci√≥n y difusi√≥n de conocimiento, todo ello facilitado con herramientas innovadoras de la Web 2.0. como son la publicaci√≥n de contenidos, la votaci√≥n, comentarios sobre los contenidos, la sindicaci√≥n de contenidos y la creaci√≥n de comunidades abiertas de trabajo colaborativo. El proyecto OPIMEC cuenta con una cadena de procesos de gesti√≥n de la informaci√≥n de los que podemos destacar su forma colaborativa de crear conocimiento por todas las personas usuarias de la plataforma, un equipo editorial encargado de asegurar la calidad de los contenidos y una evaluaci√≥n por pares de las pr√°cticas y organizaciones propuestas en la Web. Desde la edici√≥n, hasta la publicaci√≥n y su distribuci√≥n final el conocimiento es examinado met√≥dicamente. Este proceso es automatizado a trav√©s de herramientas de software libre creadas para OPIMEC y asesorado por su Consejo Asesor Internacional. As√≠ pues, la plataforma Web 2.0 que da soporte al observatorio OPIMEC est√° construida sobre tecnolog√≠as libres como: Framework Web Django (impulsado por Google Inc. entre otros), MySQL y GNU/Linux. La elecci√≥n de esta combinaci√≥n tecnol√≥gica se ha realizado tras un an√°lisis exhaustivo sobre las tecnolog√≠as abiertas disponibles, en base a criterios de eficiencia, productividad y adaptabilidad a las necesidades actuales y futuras de OPIMEC. La Web OPIMEC tiene intenci√≥n y vocaci√≥n de convertirse en un destacado proyecto a nivel mundial con clara vertiente de cooperaci√≥n internacional e innovaci√≥n, mejorando la calidad de vida de la ciudadan√≠a, aprovechando las herramientas que ofrece la difundida red global de Internet y promocionando la participaci√≥n e iniciativa de los y las profesionales. Nuestra Web OPIMEC est√° estructurada en espacios que facilitan y propician la participaci√≥n y consecuci√≥n de los objetivos del proyecto, con el fin de que la asimilaci√≥n de sus contenidos por parte de las personas usuarias sea eficiente y efectiva. Podemos encontrar en ella, herramientas existentes en las redes sociales as√≠ como algunas nuevas desarrolladas espec√≠ficamente para OPIMEC, como son los ‚Äúdocumentos colaborativos‚ÄĚ, que facilitar√°n el trabajo, la conexi√≥n y la participaci√≥n de profesionales desde cualquier parte del mundo, pudiendo as√≠ aprovechar los recursos al m√°ximo, Se dispone por tanto de destacadas herramientas como una base de datos actualizada de eventos, noticias, recursos y documentos, directorios y mapas de organizaciones, pr√°cticas y personas innovadoras, espacios de comunidad en las que los equipos de trabajo pueden desarrollarse, comunicarse y complementarse con otras personas usuarias, compartiendo buenas pr√°cticas, innovaci√≥n y contenidos novedosos en el manejo de enfermedades cr√≥nicas complejas. El aspecto importante de la plataforma es que las personas usuarias son de forma democr√°tica, creadores, evaluadores y consumidores de los contenidos publicados, siendo as√≠ una herramienta de trabajo construida, ampliada, valorada y seguida por toda la comunidad de profesionales; facilitando la difusi√≥n del conocimiento construido por y para todos y todas los profesionales sanitarios, personal investigador, ciudadanos y ciudadanas en general en el manejo de enfermedades cr√≥nicas complejas. Un conocimiento ampliamente compartido es la clave para aumentar y mejorar el bienestar social y la calidad de vida

    Translocac√£o de enxofre em plantas de milho e de soja.

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    Este trabalho teve por objetivo estudar a translocação de enxofre em plantas de milho e de soja

    Thermodynamic glass transition in a spin glass without time-reversal symmetry

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    Spin glasses are a longstanding model for the sluggish dynamics that appears at the glass transition. However, spin glasses differ from structural glasses for a crucial feature: they enjoy a time reversal symmetry. This symmetry can be broken by applying an external magnetic field, but embarrassingly little is known about the critical behaviour of a spin glass in a field. In this context, the space dimension is crucial. Simulations are easier to interpret in a large number of dimensions, but one must work below the upper critical dimension (i.e., in d<6) in order for results to have relevance for experiments. Here we show conclusive evidence for the presence of a phase transition in a four-dimensional spin glass in a field. Two ingredients were crucial for this achievement: massive numerical simulations were carried out on the Janus special-purpose computer, and a new and powerful finite-size scaling method.Comment: 10 pages, 6 figure

    Physically meaningful and not so meaningful symmetries in Chern-Simons theory

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    We explicitly show that the Landau gauge supersymmetry of Chern-Simons theory does not have any physical significance. In fact, the difference between an effective action both BRS invariant and Landau supersymmetric and an effective action only BRS invariant is a finite field redefinition. Having established this, we use a BRS invariant regulator that defines CS theory as the large mass limit of topologically massive Yang-Mills theory to discuss the shift k \to k+\cv of the bare Chern-Simons parameter kk in conncection with the Landau supersymmetry. Finally, to convince ourselves that the shift above is not an accident of our regularization method, we comment on the fact that all BRS invariant regulators used as yet yield the same value for the shift.Comment: phyzzx, 21 pages, 2 figures in one PS fil
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