Особенности микробиоты у пациентов с воспалительными заболеваниями кишечника (проспективное исследование)

Background. The intestinal microbiota, on the one hand, protects a person from pathogens, on the other hand, it itself may be one of the triggers and/or mediators of progression in inflammatory bowel diseases. Inflammatory bowel disease (IBD) predominantly affects young people of working age. It noted a steady increase in the incidence of IBD in recent decades throughout the world and in Russia. Inflammatory bowel diseases significantly affect quality of life and lead to complications of having to perform surgery, which significantly reduces the quality of life. Aims of the study was to investigate the composition of the microbiota of the colon, the search features of the microbial spectrum of patients with inflammatory bowel disease patients compared with control patients. Materials and methods. A prospective study was carried out between patients with inflammatory bowel disease and patients without inflammatory bowel disease for the period 20182019. The study included 157 IBD patients and 150 patients without IBD. All patients studied stool, which have been subjected to microbiological and metagenomic study. Results. Most often, facultative anaerobic microorganisms were present in the stool of patients with IBD (in 60%, 103109 CFU/g) and in patients without IBD (69%, 103109 CFU/g), the share of gram-negative bacteria accounted for 52%, in mostly represented by bacilli belonging to the order Enterobacteriales, only 7% of isolated gram-negative facultative aerobic microorganisms were gram-negative non-fermenting bacteria represented by 5 genera: Acinetobacter, Burkholderia, Pseudomonas, Stenotrophomonas, Ralstonia. Gram-positive facultative anaerobic microorganisms in 89% were represented by cocci of the genus Enterococcus, Streptococcus, Staphylococcus, Micrococcus, Gemella, Globicatella, Granulicatella. Conclusions. According to the results of our study, special attention should be paid to the presence of rare microaerophilic and obligate anaerobic microorganisms in the fecal microbiota of patients with IBD (Arcobacter butzleri, Gardnerella vaginalis, Aromatoleum aromaticum, Terrisporobacter glycolicus (Clostridium glycolicum), Solobacterium moorei, Alloscardovia omnicolens, Fusobacterium nucleatum, Fusobacterium ulcerans, Dialister micraerophilus), that have not been isolated from patients without IBD. A timely adequate assessment of the composition and functional characteristics of the microbiota in terms of key biomarkers will make it possible to carry out targeted diagnostics and prevention of the immediate and long-term consequences of inflammatory bowel diseases.Обоснование. Микробиота кишечника, с одной стороны, защищает человека от патогенов, а с другой сама может являться одним из триггеров и/или медиаторов прогрессирования при воспалительных заболеваниях кишечника (ВЗК). ВЗК поражают преимущественно лиц молодого трудоспособного возраста. Отмечается неуклонный рост заболеваемости ВЗК в последние десятилетия во всем мире и в России. ВЗК существенно влияют на качество жизни, а осложнения приводят к необходимости выполнения хирургических вмешательств, что значительно снижает качество жизни. Цель исследования изучение состава микробиоты толстой кишки, поиск особенностей микробного спектра у пациентов с воспалительными заболеваниями кишечника по сравнению с пациентами контрольной группы. Методы. Выполнено проспективное исследование пациентов с ВЗК и пациентов, находящихся на лечении в колопроктологическом стационаре, без воспалительных заболеваний кишечника за 20182019 гг. В исследование были включены 157 пациентов ВЗК и 150 пациентов без ВЗК. У всех пациентов исследовались биообразцы стула, которые были подвергнуты микробиологическому и метагеномному исследованию. Результаты. Наиболее часто в просветных фекалиях пациентов с ВЗК (в 60% случаев в титре 103109 КОЕ/г) и пациентов без ВЗК (69% случаев в титре 103109 КОЕ/г) присутствовали факультативно анаэробные микроорганизмы, среди которых на долю грамнегативных бактерий приходилось 52% случаев, в большей части представленных бациллами, относящимися к порядку Enterobacteriales, только 7% изолированных грамнегативных факультативно аэробных микроорганизмов являлись грамнегативными неферментирующими бактериями (ГОНФБ), представленными пятью родами: Acinetobacter, Burkholderia, Pseudomonas, Stenotrophomonas, Ralstonia. Грампозитивные факультативно анаэробные микроорганизмы в 89% случаев были представлены кокками родов Enterococcus, Streptococcus, Staphylococcus, Micrococcus, Gemella, Globicatella, Granulicatella. По результатам нашего исследования следует обратить особое внимание на присутствие в фекальной микробиоте пациентов с ВЗК редких микроаэрофильных и облигатно анаэробных микроорганизмов Arcobacter butzleri, Gardnerella vaginalis, Aromatoleum aromaticum, Terrisporobacter glycolicus (Clostridium glycolicum), Solobacterium moorei, Alloscardovia omnicolens, Fusobacterium nucleatum, Fusobacterium ulcerans и Dialister micraerophilus, которые не были изолированы от пациентов без ВЗК. Заключение. Своевременная адекватная оценка состава и функциональных характеристик микробиоты по показателям ключевых биомаркеров позволит проводить направленную диагностику и профилактику ближайших и отдаленных последствий воспалительных заболеваний кишечника

The creation of a virtual museum contributes to the providing the most effective diagnosis of parasitosis

Conduction. The recognition diagnosis of helminths and protozoa invasion is one of the current and almost unresolved problems in modern parasitology. For the present, the lack of a standardized museum of parasitic pathogens in Russia and abroad complicates a parasitologist's already hard work. The population urbanization, increased anthropogenic pressure, climate change, and natural disasters lead to the occurrence of favorable conditions for the development, long-Term survival, and spread of pathogens of parasitic diseases in various environmental objects. The deterioration of the population socio-economic conditions, the emergence of interethnic conflicts in the world led to large-scale migration flows from countries near and far abroad to Russia, which led to an increase in pathogens circulating in the territory of the Russian Federation. The aim of our research was to improve the methodological support and create virtual slides with the image of larvae and eggs of helminths, as well as cysts and oocysts of pathogenic protozoa recorded on the territory of the Russian Federation based on digital scanner microscopes. Material and methods. The authors used scanner microscopes with the software module "Parasitology." Results. An up-To-date register of photo images of more than 40 species of parasitic pathogens of medical significance and 53 species of pathogens of parasitic diseases of animals that pose a danger to human life has been delivered. Discussion. The authors are always working on improving the technical characteristics of digital analyzers. Conclusion. Updating the atlas, creating a new advanced gallery of helminth eggs, larvae, cysts, and oocysts of pathogenic protozoa will significantly increase parasitological studies' effectiveness in sanitation and the analysis of intestinal microbiota. © 2021 Izdatel'stvo Meditsina. All rights reserved