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Utilisation de la vidéo Haute Définition pour étudier la distribution spatiale de la biodiversité lagonaire de Pouebo, Nouvelle Calédonie
Coral reefs are among the most diversified ecosystems; structured by comlexe processese. Yet, spatial organization of the diversity of reef fish communities is not well known. The present study, covering the Marine Protected Area of Pouebo (North-East of New Caledonia), takes part of the AMBIO project from IFREMER, which studies spatio-temporal variations of biodiversity by means of High-definition rotatif underwater video systems. In total 1717 individuals from 25 taxonomic families, 56 genus and 145 species were observed. The derived habitat typology of stations distinguishes five habitat classes, which seem to be highly significant for fish species richness and fish density. Results show that biodiversity increases close to the intermediate and the barrier reef and that biodiversity is high in comlexe coral habitats. Nevertheless, the protection status does not seem to be a determining factor, neither for fish communities, nor for exploited fish species. We state the presence of rare species in some stations as well as high species richness for Chaetodonitidae, which are habitat indicators. Globally, the present study shows that coral reefs and their associated biodiversity seem to be in good conservation status in the studied area.Les récifs coralliens sont parmi les écosystèmes les plus diversifiés ; structurés par des processus complexes. Cependant, l’organisation spatiale de la diversité des communautés ichtyologiques de ces écosystèmes reste mal connue. Cette étude, englobant l’Aire Marine Protégée de Pouebo (Nord-est, Nouvelle Calédonie), s’intègre dans le projet AMBIO de l’IFREMER étudiant les variations spatio-temporelles de la biodiversité à l’aide de systèmes vidéo rotatif en Haute Définition. Au total, 1717 individus appartenant à 25 familles, 56 genres et 145 espèces ont été observés sur les 85 stations vidéo échantillonnées. Une typologie d’habitat a permis de distinguer cinq classes d’habitat, hautement significatives pour la richesse spécifique et la densité d’abondance des espèces observées. Les résultats indiquent que la biodiversité augmente en s’éloignant de la côte et la biodiversité est maximale dans les habitats complexes dominés par du corail vivant. En revanche le statut de protection ne semble pas être un facteur discriminant ni pour les peuplements en général, ni pour les espèces exploitées. On note la présence d’espèces rares dans ceratines stations, ainsi qu’une richesse spécifique élevée pour les Chaetodontidae, espèce indicatrice de la qualité de l’habitat. Globalement l’étude indique que les récifs coralliens et la biodiversité associée seraient en bon état général dans la zone étudiée
Temporal partitioning of diurnal behavioural patterns of Coris julis and Diplodus vulgaris (Actinopterygii: Perciformes) in Mediterranean coralligenous habitats.
Background. There is need for more information on behavioural rhythms of fishes in relation to their habitat use in few or not previously monitored areas, such as coralligenous habitats. Some studies have compiled inventories of observable fish species in this habitat, but no studies have been performed on the temporal patterning of fish behaviour, especially at the scale of the day. The presently reported study aims at providing knowledge on finescale fluctuations of abundances and behaviour of two fish species in coralligenous habitats throughout the diurnal period. Materials and methods. Fish fauna was filmed hourly, for several days, from dusk to dawn, with autonomous, programmable, and rotating video systems. Diurnal variations in abundances per count, considering size classes and behaviour, were studied for two diurnal fish species-the Mediterranean rainbow wrasse, Coris julis (Linnaeus, 1758) (Labridae), and the common two-banded seabream, Diplodus vulgaris (Geoffroy Saint-Hilaire, 1817) (Sparidae) in two study areas of coralligenous habitats on the French Riviera. Results. Significant temporal variability at the scale of the hour was revealed for abundances of C. julis in one of the two study areas, with few individuals in crepuscular periods and highest abundances in the morning and in the afternoon. These differences were mainly due to significant diurnal variations in abundances of small and medium C. julis, which were low in crepuscular periods, whereas large-sized individuals were equally abundant during the day. On the other hand, no discernible diurnal rhythmicity of mean abundances of D. vulgaris was observed, regardless of the study area. Crepuscular periods were associated with sudden changes of abundances and behaviour for both species, with a greater percentage of mobile and solitary individuals, and few feeding individuals compared to the rest of the day. Feeding occurred mainly in the morning for C. julis. In contrast, no dial-time preference for feeding was revealed for D. vulgaris. Conclusions. The study provided preliminary insights into fine-scale diurnal variations of abundances of different life stages and of fish behaviour. Variability in abundances of life stages and of fish behaviours at different times of day should be taken into account for population assessments and spatial comparisons. Moreover, our study confirmed the use of video-imaging as an efficient non-destructive tool for the study of fish fauna in structurally complex, highly valuable habitats
Campagne RINBIO 2015. Surveillance des niveaux de contamination chimique pour biomonitoring actif
Cette étude présente les résultats de la campagne RINBIO 2015, qui évalue les niveaux de contamination chimique en s’appuyant sur l’utilisation de moules en cages.
Les résultats de 2015 sont équivalents à ceux obtenus lors des 7 précédentes campagnes en identifiant un certain nombre de stations présentant des pics significatifs de contamination :
Pour les métaux lourds, les secteurs impactés sont :
- Plomb, essentiellement l’étang de Peyrade, mais aussi la petite et grande rade de Toulon ;
- Cadmium, la lagune de Bages ;
- Mercure, essentiellement l’étang de Palo, mais également l’étang de la Palme et la rade de Toulon en mer ;
- Cuivre, les étangs de Vic, de Méjean et du Grec ;
- Nickel, essentiellement les stations mer Bandol, Port-la-Nouvelle et Santa Giulia, ainsi que l’étang de Leucate ;
- Chrome, les stations mer Port-la-Nouvelle, Bandol, Fréjus ouest et Santa Giulia, ainsi que l’étang de Leucate ;
- Arsenic, l’étang de Gruissan.
Pour les molécules organiques, on retrouve une contamination plus diffuse, avec plusieurs secteurs impactés, qui concernent principalement les lagunes :
- PCBs, les étangs de Thau, Prévost, Vic, La Peyrade, Berre et du complexe palavasien, et la rade de Toulon ;
- Composés du DDT, les étangs de Bages, Gruissan, Thau sud, Lapeyrade et du complexe palavasien ;
- HAP les étangs de Thau nord, Lapeyrade, du Grec, de Méjean et la petite rade de Toulon.
L’amélioration du modèle de « capteur moule » a permis d’indentifier une tendance temporelle pour 39 stations suivies de façon triannuelle de 2000 à 2015. La majorité des stations présentent des concentrations proches du bruit de fond observé lors de chaque campagne.
Plusieurs stations se caractérisent cependant par une surcontamination chronique (notamment les eaux de transition languedociennes) ou par des événements de surcontamination unique pour certains contaminants (PCB, HAP, Ni, Cr, Cd, pp’DDE) dans certaines eaux côtières
Campagne de surveillance DCE 2015 en Méditerranée française. Districts « RHONE ET COTIERS MEDITERRANEENS » ET « CORSE »
Sur la façade méditerranéenne, l'Ifremer a assuré en 2015 une partie logistique de la quatrième campagne du contrôle de surveillance DCE et la coordination de la caractérisation de plusieurs éléments de qualité. Les résultats de la quatrième campagne de contrôles de surveillance DCE permettent de caractériser la qualité de 45 masses d’eau littorales suivies en 2015. Dans le district « Rhône et côtiers méditerranéens » (volet 1), 3 des 18 masses d’eau côtières (MEC) sont déclassées pour la chimie au regard des résultats acquis dans la matière vivante, tandis que l'ensemble des MEC suivies pour le phytoplancton affichent un bon état. Dans les masses d’eau de transition (MET), la chimie matière vivante déclasse 7 MET, le suivi dans l'eau (échantillonneurs passifs) n'a déclassé aucune MET. Pour l’état biologique, 6 MET sont déclassées pour les macrophytes et 10 MET pour le phytoplancton. Dans le district « Corse » (volet 2), les MEC présentent un très bon état pour le phytoplancton et la chimie matière vivante. 2 MET sont déclassées pour les macrophytes et pour le phytoplancton. Pour l’état chimique, les MET suivies affichent un bon état pour la chimie eau alors qu'une MET est déclassée pour la chimie matière vivante. Tous les dépassements de la NQE chimie dans la matière vivante sont dus à des niveaux élevés de 4-ter-octylphénol, et cela dans les deux districts
Pweevo 2012. Bilan de l’état de santé du récif par stations vidéo rotatives STAVIRO
• Conducted within the AMBIO project, this work deals with coral reef fish communities and associated habitats, in the New Caledonian lagoons. It relies on remote unbaited underwater video observations, using the STAVIRO rotating technique.
• The study takes place in the Pouebo area, part of the New Caledonian World Heritage site, and encompassing three no-take marine reserves enclosed within a Locally Managed Area (LMA).
• The sampling design covers the entire area, and was stratified according to reef geomorphology and protection status. 86 stations were validated within 4 days. They were analyzed to characterize the habitat surrounding each station, and fish communities, based on a species list that includes fished species, emblematic species and functionally important species.
• 32 indicators were computed and mapped (Sextant server). 24 indicators were analysed using the PAMPA computing tool. Outcomes were organized in a dashboard per management objective (biodiversity conservation and fisheries management).
• 131 fish and turtle species, belonging to 18 families were observed. Surgeonfish and parrotfish were most frequently observed (86% and 67% of stations), and then parrotfish (63%).
• Twenty-two species of butterflyfish were observed, as well as several sharks, indicating an overall good ecological status of the reef, but turtles, humphead wrasses and rays were rarely seen.
• There was no significant effect of protection upon the overall species assemblage, nor on the barrier reef. But on intermediate reefs, it differed between the Pewhane reserve and unprotected areas.
• In Pewhane, coral cover and butterfly fish abundance were higher in reserve, and fished species, carnivore and herbivore species, surgeon fish and grouperswere more abundant in the living coral habitat. Target species were also abundant on the inner slope of the barrier reef, but with higher abundances outside reserves for surgeon fish, parrotfish and groupers. On the fringing reef, coral cover and fish-related indicatorswerehigher outside the LMA.
• Finally, the ecological status in the area appears satisfactory with abundant key coral reef species and coral cover. Yet, the protection effects differ between the barrier reef, the intermediate reef and the fringing reef.
Biodiversity ; Fish ; Habitat ; Underwater video; STAVIRO ; Monitoring and assessment; Marine Protected Area ; MPA; World Heritage; Coral reefs; New Caledonia ; Indicator; Dashboard ; Map server ; Sextant ; PAMPACette étude conduite dans le cadre du projet AMBIO concerne les communautés de poissons et les habitats associés aux récifs coralliens des lagons de Nouvelle-Calédonie. Elle s’appuie sur des données collectées par STAVIRO, une technique vidéo rotative. Cette campagne a été réalisée en 2012 dans la zone de Pouébo, comprise dans la Zone Côtière Nord Est, elle-même située dans le bien inscrit au Patrimoine Mondial de l’Humanité. La zone d’étude comprend également les Aires Marines Protégées (AMP) de Pewhane, Whan-DenecePouarape et WhangaLedane, incluses dans une Aire de Gestion Durable des Ressources (AGDR). Le plan d'échantillonnage couvre l’ensemble de la zone et a été stratifié en fonction des trois structures récifales (récif frangeant, récif d’îlot/intermédiaire et récif barrière) et en tenant compte du statut de protection des AMP. 86 stations vidéo rotatives ont été validées. Leur analyse a permis de caractériser l’habitat environnant chaque station, ainsi que les communautés de poissons sur la base d’une liste d’espèces d’intérêt écologique, halieutique et emblématique. 32 indicateurs ont été calculés et représentés sous forme de carte disponible sur un serveur Sextant. 24 indicateurs ont été analysés grâce à l’outil de calcul PAMPA et fait l’objet d’une fiche détaillée de résultats en annexe du rapport. Ces résultats sont repris et synthétisés sous forme de tableau de bord par objectif de gestion relatif à la conservation de la biodiversité et la gestion des ressources de la pêche.
Les principaux habitats observés correspondent à des fonds durs : habitat riche en corail vivant (48.5% des stations), et habitat détritique
(23.5% des stations), et seulement 28% de stations sur fonds meubles.
131 espèces de poissons et de tortue, appartenant à 18 familles ont été observées.
Chirurgiens et papillons sont les familles les plus fréquentes (86% et 67% des stations), suivis par les perroquets (63%). Dix familles sont observées sur plus de 20% des stations.
Vingt-deux espèces de poissons-papillons ont été observées ainsi que plusieurs requins, signes d’un bon état de santé d’ensemble des récifs observés. En revanche, peu de tortues, de napoléons et de raies ont été vues.
A l’échelle de la zone, l’assemblage spécifique est nettement structuré par l’habitat mais ne diffère pas significativement entre les statuts de protection. Par contre, sur les récifs intermédiaires dans l’habitat Corail vivant, l’assemblage diffère significativement entre la réserve Pewhane et les zones hors réserve, tandis que la situation n’est pas tranchée sur le récif barrière.Dans la Réserve Pewhane, le recouvrement corallien et la richesse spécifique des poissons-papillons sont plus élevés en réserve, et les indicateurs relatifs aux espèces commerciales, consommables, aux cibles de la chasse, aux carnivores et aux herbivores, ainsi qu’aux chirurgiens et loches présentent des valeurs significativement plus élevées dans la réserve sur l’habitat Corail vivant.Les espèces-cibles sont également abondantes sur le tombant interne du récif barrière, mais avec des abondances plus élevées en dehors des réserves pour les chirurgiens, les perroquets et les loches. Sur le récif frangeant, la situation est plus favorable hors AGDR en terme de recouvrement corallien et d’indicateurs relatifs aux poissons, et ce du fait d’une fréquentation et accessibilité moindres.
Au final, l’effet de la protection se révèle différent entre les réserves du récif barrière et la réserve Pewhane sur le récif intermédiaire
Branched pegylated linker-auristatin to control hydrophobicity for the production of homogeneous minibody-drug conjugate against HER2-positive breast cancer
International audienceTrastuzumab emtansine (Kadcyla®) was the first antibody-drug conjugate (ADC) approved by the Food and DrugAdministration in 2013 against a solid tumor, and the first ADC to treat human epidermal growth factor receptor2 positive (HER2+) breast cancer. However, this second generation ADC is burden by several limitationsincluded heterogeneity, limited activity against heterogeneous tumor (regarding antigen expression) and suboptimaltumor penetration. To address this, different development strategies are oriented towards homogeneousconjugation, new drugs, optimized linkers and/or smaller antibody formats. To reach better developed nextgeneration ADCs, a key parameter to consider is the management of the hydrophobicity associated with thelinker-drug, increasing with and limiting the drug-to-antibody ratio (DAR) of the ADC. Here, an innovativebranched pegylated linker was developed, to control the hydrophobicity of the monomethyl auristatin E (MMAE)and its cathepsin B-sensitive trigger. This branched pegylated linker-MMAE was then used for the efficientgeneration of internalizing homogeneous ADC of DAR 8 and minibody-drug conjugate of DAR 4, targeting HER2.Both immunoconjugates were then evaluated in vitro and in vivo on breast cancer models. Interestingly, this studyhighlighted that the minibody-MMAE conjugate of DAR 4 was the best immunoconjugate regarding in vitrocellular internalization and cytotoxicity, gamma imaging, ex vivo biodistribution profile in mice and efficientreduction of tumor size in vivo. These results are very promising and encourage us to explore further fragmentdrugconjugate development
Clinical pattern of checkpoint inhibitor-induced liver injury in a multicentre cohort
Immune checkpoint inhibitors (ICIs) have changed the landscape of cancer therapy. Liver toxicity occurs in up to 25% of patients treated with ICIs. The aim of our study was to describe the different clinical patterns of ICI-induced hepatitis and to assess their outcome. Methods: We conducted a retrospective observational study of patients with checkpoint inhibitor-induced liver injury (CHILI) discussed in multidisciplinary meetings between December 2018 and March 2022 in three French centres specialised in ICI toxicity management (Montpellier, Toulouse, Lyon). The hepatitis clinical pattern was analysed by the ratio of serum alanine aminotransferase (ALT) and alkaline phosphatase (ALP) (R value = (ALT/ULN)/(ALP/ULN)) for characterisation as cholestatic (R − 5), or mixed (2 − 3 according to the Common Terminology Criteria for Adverse Events system) was significantly associated with the hepatocellular hepatitis (p <0.05). No cases of severe acute hepatitis were reported. Liver biopsy was performed in 41.9% of patients: granulomatous lesions, endothelitis, or lymphocytic cholangitis were described. Biliary stenosis occurred in eight patients (6.8%) and was significantly more frequent in the cholestatic clinical pattern (p < 0.001). Steroids alone were mainly administered to patients with a hepatocellular clinical pattern (26.5%), and ursodeoxycholic acid was more frequently used in the cholestatic pattern (19.7%) than in the hepatocellular or mixed clinical pattern (p <0.001). Seventeen patients improved without any treatment. Among the 51 patients (43.6%) rechallenged with ICIs, 12 (23.5%) developed CHILI recurrence. Conclusions: This large cohort indicates the different clinical patterns of ICI-induced liver injury and highlights that the cholestatic and hepatocellular patterns are the most frequent with different outcomes. Impact and Implications: ICIs can induce hepatitis. In this retrospective series, we report 117 cases of ICI-induced hepatitis, mostly grades 3 and 4. We find a similar distribution of the different patterns of hepatitis. ICI could be resumed without systematic recurrence of hepatitis