Papel de la enzima PNPasa en el transporte de ARNmt en cáncer linfático: Revisión bibliográfica

Lymphoma is the most common type of blood cancer today and, as its name suggests, it begins in the lymphatic system. The origin of this disease is related to mitochondrial defects, generated by mutations in the PNPase enzyme or polynucleotide phosphorylase, whose main functions are import and degradation mitochondrial RNA. For this reason, the main objective of the present work was to carry out a bibliographic review of scientific publications that described the important role of this enzyme in relation to mitochondria as the cause of lymphatic cancer. The methodology used consisted of a bibliometric analysis based on the use of different databases, in which search equations formed from keywords were introduced. Then, the selection of articles related to the study topic and published in the last 20 years was carried out. Subsequently, the journals were analyzed, based on the h-index, in order to determine which supported the hypothesis of the role of PNPase in lymphoma and which stated the opposite. The results showed that a total of 441,288 scientific publications were obtained, of which 133 were selected to carry out this work. As for the journals, those with the highest h-index were Nature and Cell . It can be concluded that PNPase plays a very important role in the transport of mitochondrial RNA and that the nuclear transcription factor (NF-Y) is involved in the control of cell growth, therefore, both have a crucial role in the development of this disease. Therefore, research on both PNPase and NF-Y is essential to establish the specific genetic characteristics that define the early lesions of lymphatic cancer and the consequent determination of their treatment.El linfoma es el tipo de cáncer de sangre más común en la actualidad y, como su nombre indica, comienza en el sistema linfático. El origen de esta enfermedad está relacionado con defectos mitocondriales, generados por mutaciones en la enzima PNPasa o polinucleótido fosforilasa, cuyas principales funciones son las de importación y degradación del ARN mitocondrial. Por este motivo, el objetivo principal del presente trabajo fue la realización de una revisión bibliográfica acerca de publicaciones científicas, que hicieran relevancia al papel de esta enzima, en relación con la mitocondria como causante del cáncer linfático. La metodología empleada consistió en un análisis bibliométrico basado en la utilización de diferentes bases de datos, en las que se introdujeron ecuaciones de búsqueda formadas a partir de palabras clave. Después, se llevó a cabo la selección de los artículos relacionados con el tema de estudio y publicados en los últimos 20 años. Posteriormente, se analizaron las revistas, en función del índice H, para poder observar cuáles apoyaban la hipótesis del papel de PNPasa en linfoma y cuáles decían lo contrario. Los resultados mostraron que se obtuvo un total de 441.288 publicaciones científicas, de las que fueron seleccionadas 147 para poder llevar a cabo este trabajo. En cuanto a las revistas, las que presentaron un índice H mayor fueron Natura y Cell. Se puede concluir que la PNPasa desempeña un papel muy importante en el transporte del ARN mitocondrial, y que el factor NF-Y está involucrado en el control del crecimiento de las células, por lo que, ambos presentan una función crucial en el desarrollo de esta enfermedad. Por ello, la investigación, tanto de PNPasa como de NF- Y, es fundamental para establecer las características genéticas concretas, que definan las lesiones tempranas del cáncer linfático y la consiguiente determinación de su tratamiento.Ciencias Experimentale

La biología celular de GPBP (Goodpasture antigen binding protein)

La enfermedad de Goodpasture (GP) es un proceso autoinmune exclusivamente humano caracterizado por una glomerulonefritis rápidamente progresiva y hemorragia pulmonar, causado por los autoanticuerpos que se depositan a lo largo de la membrana basal del glomérulo renal y el alveolo pulmonar. Los anticuerpos patógenos están dirigidos contra la región no-colagenosa del dominio C-terminal (NC1) de la cadena ¿3 del colágeno IV [a3 (IV)NC1 ] también llamado antígeno GP. Con el propósito de identificar proteínas que interaccionan con la región divergente N terminal del antígeno Goodpasture humano, se utilizaron de forma combinada un péptido sintético de 21 residuos que representa esta región y anticuerpos monoclonales contra el mismo para rastrear bibliotecas de expresión de cDNA humanas. Mediante esta estrategia se llevó a cabo el clonado molecular de una proteína de 624 residuos que in vitro, y en su versión recombinante, une y fosforila específicamente tanto el péptido sintético como el antígeno Goodpasture humano y que hemos denominado GPBP, ¿Goodpasture-antigen binding protein¿. GPBP presenta un alto número de aminoácidos fosforilables (17.9%) y acídicos (16%), siendo la serina el residuo más abundante (9.3%). En la región N terminal la proteína presenta un dominio homólogo a pleckstrina (dominio PH) y en la región C terminal un dominio START. Los dominios PH han sido implicados en la localización de proteínas en la membrana plasmática en respuesta a señales mientras los dominios START se han relacionado con el transporte de lípidos incluyendo el colesterol. Finalmente como elemento estructural reseñable también cabe mencionar la presencia de una señal bipartita de localización nuclear como parte integral de una región que predice la formación de estructuras súper helicoidales (coiled-coil). La contrapartida recombinante de GPBP (rGPBP) presenta un tamaño estimado de 89 kDa, frente a los 71 kDa que se esperan a partir de su estructura primaria principalmente por la presencia de fosforesiduos (PSer, PThr y PTyr). GPBP tiene capacidad para transferir fosfatos a residuos serina y/o treonina presentes en su molécula (autofosforilación) o en proteínas sustrato (transfosforilación) a pesar de que no posee los requerimientos estructurales que definen el dominio catalítico de una proteína quinasa convencional. Varios estudios han cuestionado el papel de GPBP en la organización del colágeno IV y su relevancia en las patologías autoinmunes, describiéndola como un transportador de ceramida desde el retículo endoplasmático hasta el aparato de Golgi, (CERT). Dichos estudios proponen que el motivo FFAT de GPBP se une a la proteína VAP del retículo endoplasmático y el dominio de homología a pleckstrina, interacciona con fosfatidil-inositol-4-fosfato (PI4P) en la cara externa de la membrana del aparato de Golgi. Estas interacciones permitirían al dominio START, en posición carboxiterminal, unir ceramida en el retículo endoplasmático y posteriormente liberarla en el aparato de Golgi (Hanada et al., 2003; Kumagai et al., 2007). Los resultados fueron publicados sin tener en cuenta un estudio exhaustivo de la distribución celular de las formas nativas. Tampoco se tuvieron en cuenta estudios previos basados en inmunofluorescencias donde se mostraba la existencia de las isoformas de GPBP en la MBG (Raya et al. 2000; Revert, F., 2007). Pruebas de inmunohistoquímica sugieren que GPBP es principalmente extracelular, aunque con la posibilidad de localizar en varios sitios intracelulares (Raya, A., 2000). La distribución de las proteínas ofrece mucha información con respecto a la función, por tanto, se necesitan estudios adicionales para entender la función biológica de GPBP. El objetivo general de la tesis doctoral consiste en profundizar en la biología de GPBP ahondando en los mecanismos de diversificación estructural de los diferentes productos del gen COL4A3BP, estudiando la expresión y la distribución de las diferentes isoformas de GPBP. Para concretar el estudio se fijan unos objetivos específicos: 1. Identificar isoformas de GPBP en líneas celulares. Estudiar su expresión y distribución. 2. Estudiar mediante líneas celulares la exportación de GPBP al medio extracelular, analizando la participación de las isoformas de GPBP en este proceso. 3. Estudiar el potencial biológico de nuevos motivos identificados en la estructura primaria de GPBP.Goodpasture-antigen binding protein (GPBP) is a nonconventional Ser/Thr kinase for basement membrane type IV collagen. Various studies have questioned these findings and proposed that GPBP serves as transporter of ceramide between the endoplasmic reticulum and the Golgi apparatus. Here we show that cells expressed at leasttwoGPBPisoforms resultingfromcanonical (77- kDa) and noncanonical (91-kDa)mRNAtranslation initiation.The 77-kDa polypeptide interacted with type IV collagen and localized as a soluble form in the extracellular compartment. The 91-kDa polypeptide and its derived 120-kDa polypeptide associated with cellular membranes and regulated the extracellular levels of the 77-kDa polypeptide. A short motif containing two phenylalanines in an acidic tract and the 26-residue Ser-rich region were required for efficient 77-kDa polypeptide secretion. Removal of the 26-residue Ser-rich region by alternative exon splicing rendered the protein cytosolic and sensitive to the reduction of sphingomyelin cellular levels. Theseandprevious data implicateGPBPsin a multicompartmental program for protein secretion (i.e. type IV collagen) that includes: 1) phosphorylation and regulation of protein molecular/supramolecular organization and 2) interorganelle ceramide trafficking and regulation of protein cargo transport to the plasma membrane

Ambiente inflamatorio en pacientes con COVID-19: Revisión sistemática

The SARS-CoV-2 virus is the main cause of the pandemic viral pneumonia known as COVID-19. Some studies suggest that, in this disease, lymphopenia is the most common sign of infection, as well as increased CRP and IL-6 caused by a cytokine storm directed at the lungs. Therefore, the hypothesis of the study is to make a systematic revision of scientific studies linked to the immunological phenomenon known as COVID-19. Objectives: The main aim is to study the cytokine storm of COVID-19, as well as to determine the role of IL-6 and T-lymphocytes. Methods: A search strategy was made through the PICOS questions, based on the PRISMA method. The MeSH terms were looked up on PubMed, Google Scholar and SciELO (2019-2021). The level of quality was sought according to the ranking of Scimago institutions, and the H index of the journals was assessed. Results: 43 articles were included, and clinic, diagnosis, treatment, and pathogenesis were compared. A decrease in TCD4 / CD8 lymphocytes was shown in patients with severe disease, as well as an increase in IL-6 and CRP. Conclusions: The immunological phenomenon known as COVID-19 is characterized by lymphopenia and an increase in IL-6 amongst critically ill patients. Monitoring those parameters could help to understand the progression of the COVID-19 disease.El virus SARS-CoV-2 es el responsable de la neumonía viral pandémica conocida como COVID-19. Algunos estudios sugieren que, en esta enfermedad, la linfopenia sea el signo más común de infección, así como el aumento de PCR e IL-6 provocado por una tormenta de citocinas dirigida a los pulmones. Por ello, la hipótesis del trabajo es realizar una revisión sistemática de los estudios científicos relativos al fenómeno inmunológico de la COVID-19. Objetivos: El objetivo principal es estudiar la tormenta de citocinas de la COVID-19, así como determinar el rol de la IL-6 y los linfocitos T. Métodos: Se elaboró la estrategia de búsqueda a través de la pregunta PICOS en base al método PRISMA. Los términos MeSH se buscaron en PubMed, Google Scholar y SciELO (2019-2021). Se buscó el nivel de calidad según la clasificación de instituciones de Scimago, y se valoró el índice H de las revistas. Resultados: Se incluyeron 43 artículos y se compararon clínica, diagnóstico, tratamiento y patogenia. Se mostró una disminución de los linfocitos TCD4/CD8 en pacientes con enfermedad grave y un aumento de IL-6 y PCR. Conclusiones: El fenómeno inmunológico de la COVID-19 se caracteriza por linfopenia y aumento de IL-6 en pacientes críticamente enfermos. La monitorización de estos parámetros podría ayudar a entender la progresión de la enfermedad COVID-19.Ciencias Experimentale

La fisión mediada por DRP1 tiene un papel importante en las enfermedades de Alzheimer y Parkinson

Our objectives were to perform a bibliometric analysis with which to highlight the role of Drp1 in the pathogenesis of AD and PD as a fundamental regulator of mitochondrial fusion and fission homeostasis, in addition to highlighting Drp1 as a possible therapeutic target in AD and PD.Nuestros objetivos son realizar un análisis bibliométrico con el que destacar la relevancia de Drp1 en la patogénesis de la EA y la EP como regulador fundamental de la homeostasis de la fusión y fisión mitocondrial, además de destacar a Drp1 como posible diana terapéutica en la EA y la EP.Ciencias Experimentale

Atezolizumab and Bevacizumab Combination Therapy in the Treatment of Advanced Hepatocellular Cancer

Liver cancer, particularly hepatocellular carcinoma, is a global concern. This study focuses on the evaluation of Atezolizumab and Bevacizumab combination therapy as a promising alternative in the treatment of advanced hepatocellular carcinoma. The objectives of this systematic review include evaluating the efficacy of Atezolizumab and Bevacizumab combination therapy compared to conventional therapies with Sorafenib and other conventional therapies, analyzing the associated adverse effects, and exploring prognostic factors in the setting of advanced hepatocellular carcinoma. A systematic literature review was carried out using the PubMed and Web of Science databases. Fifteen related articles were included and evaluated according to their level of evidence and recommendation. Results: The combination therapy of Atezolizumab and Bevacizumab, along with Sorafenib, showed positive results in the treatment of patients with advanced hepatocellular carcinoma. Significant adverse effects were identified, such as gastrointestinal bleeding, arterial hypertension, and proteinuria, which require careful attention. In addition, prognostic factors, such as transforming growth factor beta (TGF-β), alpha-fetoprotein (AFP), and vascular invasion, were highlighted as key indicators of hepatocellular carcinoma progression. Conclusions: The combination of Atezolizumab and Bevacizumab is shown to be effective in the treatment of advanced hepatocellular carcinoma, although it is essential to take into consideration the associated adverse effects. The prognostic factors identified may provide valuable information for the clinical management of this disease. This study provides a comprehensive overview of a promising emerging therapy for liver cancer.Medicin

Analysis of the Psychosocial Sphere of Older Adults in Extreme Poverty in the Peruvian Amazon

The situation of social exclusion in which older adults live in extreme poverty is a problem that leads to psychological alterations such as depression or cognitive deterioration. Our objective was to analyze the living conditions and the psychosocial sphere of older adult people living in extreme poverty in Requena del Tapiche in Peru. This was an observational, descriptive, cross-sectional study. Sixty participants between 60 and 100 years of age of both sexes were included who gave their informed consent. Sociodemographic variables were analyzed, and the Gijón, family Apgar, Yesavage, and Pfeiffer scales were used. The sample was composed of 55% women and 45% men, with a mean age of 79.2 years (SD 6.67). More than half live alone or with their spouse. Fifty-seven percent sleep on the floor or on wood, and about 82% do not have safe water. Family dysfunction is found in 40%, and 98% are at social risk or with an established social problem and a precarious economic situation. More than 60% suffer from depressive symptoms, which are more frequent in women. We conclude that older adults perceive deficient family support, observing a deteriorated social situation. Most of them are at risk of social exclusion and loneliness, making them more vulnerable. They show sadness, with a high rate of depression. People with more cognitive impairment live alone, and those in social exclusion suffer a higher degree of depression. More cooperative projects and health promotion interventions developed in the peripheral neighborhoods of Requena del Tapiche are needed to improve the impact on the health of older adult people in extreme poverty.The publication costs of this work have been financed by the Catholic University of Valencia under grant 2023-275-001.Medicin

Goodpasture Antigen-binding Protein Is a Soluble Exportable Protein That Interacts with Type IV Collagen

Goodpasture-antigen binding protein (GPBP) is a nonconventional Ser/Thr kinase for basement membrane type IV collagen. Various studies have questioned these findings and proposed that GPBP serves as transporter of ceramide between the endoplasmic reticulum and the Golgi apparatus. Here we show that cells expressed at leasttwoGPBPisoforms resultingfromcanonical (77- kDa) and noncanonical (91-kDa)mRNAtranslation initiation.The 77-kDa polypeptide interacted with type IV collagen and localized as a soluble form in the extracellular compartment. The 91-kDa polypeptide and its derived 120-kDa polypeptide associated with cellular membranes and regulated the extracellular levels of the 77-kDa polypeptide. A short motif containing two phenylalanines in an acidic tract and the 26-residue Ser-rich region were required for efficient 77-kDa polypeptide secretion. Removal of the 26-residue Ser-rich region by alternative exon splicing rendered the protein cytosolic and sensitive to the reduction of sphingomyelin cellular levels. Theseandprevious data implicateGPBPsin a multicompartmental program for protein secretion (i.e. type IV collagen) that includes: 1) phosphorylation and regulation of protein molecular/supramolecular organization and 2) interorganelle ceramide trafficking and regulation of protein cargo transport to the plasma membrane.This work was supported by Grants SAF97/0065, SAF2000/0047, SAF2001/0453, SAF2003-09772-C03-01, and SAF2006-12520-C02-01 from Ministerio de Educacio´ n y Ciencia, Grant 98/102-00 from Fundacio ´ n “La Caixa,” and Grants GV04B-285 and BM-001/2002 from Generalitat Valenciana (Spain) (to J. S.).Medicin

Experimentos de anoxia/inanición en C. elegans y preacondicionamiento anestésico. Una actividad práctica de laboratorio para la formación integrada en las competencias del diseño de experimentos, análisis e interpretación de datos en la experimentación

[EN] Competence in the design of experiments and the interpretation of their results is closely linked to the ability to understand and analyze information in the scientific-technical literature. In the present work, we present a project of integral activity that links the research, reading and interpretation of scientific articles together with the design and interpretation of experimental results, through a system of "step by step guide" very appropriate for an introduction to these competences To the students of the first courses of the university education[ES] La competencia en el diseño de experimentos y la interpretación de sus resultados está íntimamente unida a la capacidad para entender y analizar la información en la bibliografía científico-técnica. En el presente trabajo, presentamos un proyecto de actividad integral que enlaza la búsqueda, lectura e interpretación de artículos científicos conjuntamente con el diseño e interpretación de resultados experimentales, mediante un sistema de "guía paso a paso" muy apropiado para una introducción a estas competencias a los alumnos de los primeros cursos de la educación universitaria.Sanmartín Santos, I.; Lloret Alcañiz, A.; Ventura González, I.; Prieto Ruiz, J. (2017). Experimentos de anoxia/inanición en C. elegans y preacondicionamiento anestésico. Una actividad práctica de laboratorio para la formación integrada en las competencias del diseño de experimentos, análisis e interpretación de datos en la experimentación. En In-Red 2017. III Congreso Nacional de innovación educativa y de docencia en red. Editorial Universitat Politècnica de València. 733-743. https://doi.org/10.4995/INRED2017.2017.6754OCS73374

SP1 and NFY Regulate the Expression of PNPT1, a Gene Encoding a Mitochondrial Protein Involved in Cancer

The Polyribonucleotide nucleotidyltransferase 1 gene (PNPT1) encodes polynucleotide phosphorylase (PNPase), a 30-50 exoribonuclease involved in mitochondrial RNA degradation and surveillance and RNA import into the mitochondrion. Here, we have characterized the PNPT1 promoter by in silico analysis, luciferase reporter assays, electrophoretic mobility shift assays (EMSA), chromatin immunoprecipitation (ChIP), siRNA-based mRNA silencing and RT-qPCR.We show that the Specificity protein 1 (SP1) transcription factor and Nuclear transcription factor Y (NFY) bind the PNPT1 promoter, and have a relevant role regulating the promoter activity, PNPT1 expression, and mitochondrial activity. We also found in Kaplan–Meier survival curves that a high expression of either PNPase, SP1 or NFY subunit A (NFYA) is associated with a poor prognosis in liver cancer. In summary, our results show the relevance of SP1 and NFY in PNPT1 expression, and point to SP1/NFY and PNPase as possible targets in anti-cancer therapy.Medicin

Desarrollo de competencias profesionales en biomedicina utilizando el aprendizaje basado en proyectos

[EN] Professional competences in the field of experimental sciences are acquired through the practice of professional practice. In the university environment, the knowledge, skills and abilities in the different undergraduate subjects are taught in a parceled manner. Our 45 students biotechnology studies in Catholic University of Valencia, during the internship repeat protolocos and follow a recipe to perform an experiment that exemplifies the fundamental contents of the subject being taught. The aboradaje of this work is based on project-based learning. The student has to elaborate a biotechnological project from beginning to end. The project is based on the construction of a non-viral vector for immunotherapy, which ranges from the timing of the experiments to the preparation of the article that should represent the result of their learning. The student has to elaborate his protocols, calculate the times, synchronize the crops and use different techniques learned in previous courses. This experience, close to the future reality, forces him to work on the competences of diverse asignturas of the degree, not only immunology. The advantages offered by this type of work is to increase the autonomy in the laboratory and put into practice what was learned during the degree so that their learning is meaningful.[ES] Las competencias profesionales en el ámbito de las ciencias experimentales se adquieren con la práctica del ejercicio profesional. En el ámbito universitario, se imparten de forma parcelada los conocimientos, destrezas y habilidades en las diferentes asignaturas de grado. Nuestros 45 alumnos del grado de Biotecnología de la Universidad Católica de Valencia, durante los periodos de prácticas repiten protocolos y siguen una receta para realizar un experimento que ejemplarice los contenidos fundamentales de la asignatura que se está impartiendo. El abordaje de este trabajo se basa en el aprendizaje basado en proyectos. El alumno ha de elaborar un proyecto biotecnológico de principio a fin. El proyecto se basa en la construcción de un vector no vírico para inmunoterapia, que va desde la temporalización de los experimentos hasta la elaboración del artículo que debería representar el resultado de su aprendizaje. El alumno, ha de elaborar sus protocolos, calcular los tiempos, sincronizar los cultivos y usar diferentes técnicas aprendidas en cursos anteriores. Esta experiencia próxima a la realidad futura le obliga a trabajar las competencias de diversas asignaturas del grado, no solo inmunología. Las ventajas que ofrece este tipo de trabajo es aumentar la autonomía en el laboratorio y poner en práctica lo aprendido durante el grado para que le sea significativo su aprendizaje.Sanmartín Santos, I.; Lloret Alcañiz, A.; Prieto Ruiz, JÁ.; Ventura González, I. (2019). Desarrollo de competencias profesionales en biomedicina utilizando el aprendizaje basado en proyectos. En IN-RED 2019. V Congreso de Innovación Educativa y Docencia en Red. Editorial Universitat Politècnica de València. 824-832. https://doi.org/10.4995/INRED2019.2019.10451OCS82483