Fluctuation of intratumor biological variables as a function of menstrual timing of surgery for breast cancer in premenopausal patients

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Contribution of 3H-thymidine labelling index and flow cytometric S-phase in predicting survival of patients with non-Hodgkin's lymphoma.

The 3H-thymidine labelling index (3H-dT LI) of cell suspensions from fresh material and the flow cytometric S-phase (FCM-S) of nuclei recovered from paraffin blocks were determined on the same pathologic lymph node specimen for 190 non-Hodgkin's lymphomas (NHLs). FCM-S was defined by a planimetric method and by an optimization procedure. Poor correlation coefficients were observed among the three cell kinetic variables. All three cell kinetic variables were significant indicators of 8-year survival and median survival time. The life-regression procedure evidenced a significant relative contribution of 3H-dT LI and FCM-S, thus suggesting a different biologic meaning of the two cell kinetic variables. This finding was further supported by evidence that simultaneous use of 3H-dT LI and FCM-S can identify groups of patients with different survival better than when either modality is used alone. Multivariate analysis indicated that the risk groups as defined by cell kinetic variables are predictors of survival even in the presence of established factors such as histology and stage

Identificação de SNPs em parte do gene de um fator de diferenciação celular localizado no BTA14.

Um fator de diferenciação celular localizado no BTA14 foi relacionado com adipogênese. O objetivo desse trabalho foi identificar SNPs no gene desse fator para subseqüente associação com espessura de gordura subcutânea em bovinos da raça Canchim. O valor genético (VG) de 113 touros foi calculado. Seis touros com maior VG e seis touros com menor VG foram escolhidos para identificação de SNPs. Todos os touros foram genotipados para todos os SNPs identificados e então foi aplicado um teste exato de Fisher. 76 SNPs foram identificados. O teste de Fisher revelou um valor de P= 0.0167 para um SNP localizado no íntron 13. Esse SNP pode ser um bom candidato para associação com deposição de gordura na população estudada

Investigação de regiões cromossômicas candidatas para associação com a deposição de gordura em bovinos da raça Canchim.

Este trabalho teve o objetivo de investigar a associação entre os marcadores BMS490, ETH10 do cromossomo 5; INRA133, ILSTS090 do cromossomo 6 e RM222, BMS2142 do cromossomo 19 de bovinos e a característica espessura de gordura subcutânea (EGS) na raça Canchim. Foi estudada uma amostra de 392 animais, composto por dois grupos genéticos: Canchim (5/8 Charolês + 3/8 Zebu) e MA, criados em regime de pasto na Embrapa Pecuária Sudeste, em São Carlos -SP, e na Fazenda Ipameri, em Jussara -GO. O DNA foi extraído de amostras de sangue pelo método de precipitação das proteínas com sal como descrito por Regitano (2001). Os microssatélites foram amplificados por reação em cadeia da polimerase (PCR) e analisados no equipamento ABI 3100 Avant (Applied Biosystems). As análises de variância foram realizadas usando o método de quadrados mínimos, com modelo estatístico que incluiu os efeitos de sexo, grupos genéticos; fazenda, mês e ano de nascimento, manejo adotado e genótipo do marcador. Apesar dos marcadores terem sido escolhidos para delimitar regiões associadas à deposição de gordura em outras populações de bovinos de corte, não foram encontrados efeitos significativos dos marcadores em relação à EGS, na população da raça Canchim estudada

SNP do gene da tireoglobulina não afeta a espessura de gordura em bovinos da raça Canchim.

A raça Canchim é uma raça composta que vem crescendo no mercado de gado de corte. Apesar da elevada capacidade de produção de carne a raça possui pouca gordura de cobertura, justificando pesquisas com o objetivo de aumentar a deposição de gordura nessa raça. Essas pesquisas incluem a procura por marcadores moleculares que podem auxiliar a identificação de animais com maior potencial genético para a característica. Em várias populações bovinas, inclusive na população em estudo, a região centromérica do cromossomo 14 (BTA14) foi associada com deposição de gordura. O gene da tireoglobulina está localizado à 4,46 Mb nesse cromossomo e relatos descrevem a influência de um polimorfismo na seqüência 5´ líder desse gene sobre o marmoreio e a espessura de gordura. O objetivo deste trabalho foi analisar o efeito desse polimorfismo no gene da tireoglobulina sobre a espessura de gordura, em bovinos da raça Canchim. Foram avaliados 813 animais, de dois grupos genéticos (MA e CA), criados em 7 fazendas e pertencentes a famílias de meio-irmãos. Associação entre os genótipos do marcador e a medida fenotípica (espessura de gordura) foi analisada por um modelo misto. A característica não foi influenciada pelo polimorfismo do gene da tireoglobulina, o que sugere que outro gene situado na região centromérica do cromossomo 14 de bovinos deva ser responsável pela variação da característica nessa população

Identificação de SNPs no gene DDEF1 bovino.

A raça Canchim foi criada objetivando a produção de carne de melhor qualidade nas condições brasileiras e, tem sido muito utilizada em cruzamentos. Padrões específicos de algumas características da carcaça como, por exemplo, de espessura de gordura, contribuem para a manutenção da qualidade da carne. A raça Canchim produz carcaças com espessura de gordura inferior ao desejável pelo mercado, necessitando assim de estudos que visem auxiliar o melhoramento dessa característica. Os marcadores moleculares surgem nesse contexto como uma possibilidade de auxiliar o melhoramento tradicional. O BTA14 possui relatos de QTLs para espessura de gordura, motivando o estudo de genes candidatos a influenciar a deposição de gordura nessa região do genoma dos bovinos. Um dos genes encontrados nessa região e que foi relacionado à adipogênese é o DDEF1. Este trabalho teve por objetivos a identificação de polimorfismos em parte do domínio P H centaurina do gene DDEF1. Foram calculados os valorers genéticos de 113 touros, pais de uma população de meio-irmãos constituída de 1193 animais. Procedeu-se a escolhida de 6 touros com maior valor genético e maior acurácia e 6 touros com menor valor genético e maior acurácia. O DNA desses 12 touros foi utilizado em reações de sequenciamento do domínio P H centaurina do gene DDEF1, que foi dividido em 5 amplicons devido ao grande distanciamento dos exons codificadores desse domínio. No entanto, até o momento apenas as análises de 3 desses amplicons foram finalizadas. Os sequenciamentos foram realizados em um seqüenciador ABI Prism 3100 Avant (Applied Biosystems). Os eletroferogramas gerados pelo seqüenciador foram submetidos ao programa de base calling Phred. Em seguida tais seqüências foram submetidas ao programa de montagem Phrap. A visualização das seqüências geradas foi realizada através do programa Consed, onde foi possível a observação dos SNPs. Esta metodologia permitiu identificação de polimorfismos somente em indivíduos heterozigotos para o SNP. Para identificação de polimorfismos entre indivíduos homozigotos submeteu-se as seqüências consenso ao programa CLUSTAL W. Foram identificados 10 polimorfismos no amplicon RP1, 8 no RP2 e 9 no RP3. As seqüências consenso obtidas foram comparadas as depositadas no banco de SNPs do NCBI (http://www.ncbi.nlm.nih.gov/SNP/snp_blastByOrg.cgi). Tendo-se verificado que os polimorfismos identificados nesse trabalho não estão depositados naquele banco de dados

A espessura de gordura subcutânea independe do genótipo de leptina em bovinos da raça Canchim criados a pasto.

A criação de bovinos da raça Canchim para a produção de carne tem crescido no Brasil, porém, a carcaça de animais desta raça não apresenta boa cobertura de gordura, fator importante para a palatabilidade e para a conservação da carne após o abate. Por esse motivo, pesquisas que visam ao melhoramento dessa característica têm sido conduzidas. Uma abordagem muito utilizada para encontrar marcadores para uma característica desejada é a busca por associação com polimorfismos em genes candidatos. Entre os genes candidatos relacionados à deposição de gordura, o gene da leptina tem se destacado. Nos bovinos, o gene da leptina foi mapeado no cromossomo 4. Um polimorfismo existente no íntron 2 desse gene foi associado à deposição de gordura. O presente trabalho analisou a associação desse polimorfismo com a espessura de gordura subcutânea em bovinos da raça Canchim. Para a realização deste trabalho foram utilizados 800 animais da raça Canchim, nascidos nos anos de 2003 a 2006, criados em regime de pastagem em sete fazendas dos estados de São Paulo e Goiás. Amostras de sangue e sêmen foram coletadas para extração de DNA. A genotipagem foi realizada por digestão dos produtos de reação em cadeia da polimerase (PCR) com a enzima de restrição Sau3AI. Foi realizada uma análise de máxima verossimilhança restrita, a qual demonstrou não haver associação significativa do polimorfismo do gene da leptina com espessura de gordura em bovinos da raça Canchim