Overlevingsplan bos en natuur : achtergronddocument bij natuurbalans 2001

OBN onderzoek in het kader van de natuurbalan

Role of IgM testing in the diagnosis and post-treatment follow-up of syphilis: a prospective cohort study

Objectives The diagnosis of repeat syphilis and its followup remains challenging. We aimed to investigate if IgM testing may assist in the diagnosis of syphilis reinfection/ relapse and its treatment follow-up. Methods This substudy was conducted in the context of a syphilis biomarker discovery study (ClinicalTrials. gov Nr: NCT02059525). Sera were collected from 120 individuals with a new diagnosis of syphilis (72 with repeat infections) and 30 syphilis negative controls during a cohort study investigating syphilis biomarkers conducted at a sexually transmitted infection/HIV clinic in Antwerp, Belgium. Syphilis was diagnosed based on a simultaneous positive treponemal and non-treponemal assay result and/ or positive serum PCR targeting polA. Specimens collected at visit of diagnosis, and 3 and 6 months post-treatment were tested by two enzyme immunoassays (EIAs), recomWell (Mikrogen; MI) and Euroimmun (EU), to detect anti-treponemal IgM. Baseline specimens were also tested for anti-treponemal IgM using a line immunoassay (LIA) recomLine (MI). Quantitative kinetic decay curves were constructed from the longitudinal quantitative EIA results. Results An overall sensitivity for the diagnosis of syphilis of 59.8% (95% CI: 50.3%–68.7%), 75.0% (95% CI: 66.1%–82.3%) and 63.3% (95% CI: 54.8%–72.6%) was obtained for the EU, MI EIAs and MI LIA, respectively. When only considering repeat syphilis, the diagnostic sensitivity decreased to 45.7% (95% CI: 33.9%–58.0%), 63.9% (95% CI: 51.7%–74.6%) and 47.2% (95% CI: 35.5%–59.3%), respectively. IgM seroreverted in most cases 6 months after treatment. Post-treatment IgM concentrations decreased almost 30% faster for initial syphilis compared with repeat infection. The IgM EIAs and IgM LIA agreed from fairly to moderately (Cohen’s kappa (κ): 0.36 (EU EIA); κ: 0.53 (MI EIA); κ: 0.40 (MI LIA)) with the diagnosis of syphilis. Conclusions IgM detection was not a sensitive method to diagnose syphilis and was even poorer in the diagnosis of syphilis repeat infections

Development of a method for a bioassay with nematodes in natural soil

Abstract niet beschikbaarThis report describes the experiments that were carried out, to develop a bioassay with nematodes in a polluted natural soil. The nematode Plectus acuminatus, was cultured in 0.5% sloppy-agar with Acinetobacter spec. as a food source. For the experiments small plastic pots were used with 10 g soil polluted with heavy metals, from the Budel-area. One hundred nematodes were inoculated, and exposed for 7 days in a climate-chamber by 20 degrees C in the dark. In the first experiment with three levels of heavy metal contamination and pH-adjustment, the recovery of nematodes was very low (maximum 22%). The results showed that nematodes can survive in experiments with natural soil. Also a weak trend was found: more nematodes were caught back in the clean soil. Liming (to adjust pH) did not seem to have an effect on survival. To optimize the survival a second experiment was carried out. Several methodical items were investigated (Liming, Extraction method, Food, Injection of nematodes). The results show that the survival percentage can be optimized to an average of 79%. Additionally, the possibilities to preserve Plectus acuminatus in a frozen state were investigated, in order to use identical genetical material in future experiments. It appeared to be possible to revive nematodes after freezing at -70 C degrees. The highest survival (19%), after 7 days at -70 degrees C, was found for nematodes in pure tap water.DGM/B

Ecological effect calculations for the national Nature Outlook 2: terrestrial ecosystems

In de 2e Nationale Natuurverkenning gaat het Milieu- en NatuurPlanbureau (MNP) na hoe trends in maatschappelijke ontwikkelingen natuur en landschap rond 2030 kunnen gaan beinvloeden. De achterliggende analyse van vier contrasterende integrale omgevingsscenario's kwantificeert de ecologische effecten van het totale samenspel van trends. Dit rapport beschrijft de methode van de ecologische effectberekening voor de terrestrische natuur oftewel natuur op het land, waarin de stappen 1) van scenariobeschrijving tot modelinvoer 2) van modelinvoer tot modeluitvoer 3) van modeluitvoer tot graadmeter, aan bod komen. Daarnaast behandelt het rapport de resultaten met enkele illustrerende analyses en enige discussiepunten bij de methode en resultaten. De terrestrische natuurkwaliteit als geheel herstelt zich in de komende dertig jaar met gemiddeld circa 10 a 15% van de waarde van optimaal ontwikkelde natuur. De kwaliteitsverbetering verschilt echter sterk per natuurtype (tot maximaal 60%) en tussen soortgroepen. De natuurkwaliteit op het land neemt duidelijk toe. De natuurkwaliteit van het agrarisch deel verandert daarentegen niet.In the Dutch national Nature Outlook 2 the Environmental Assessment Office analyses effects of social trends on biodiversity. The possible future changes in biodiversity have been quantified in four integrated scenarios. This report describes how changes in terrestrial ecosystems were calculated with ecological models. It includes the descriptions of: 1) the definition of model input from the scenarios, 2) the ecological modelling itself and, 3) the visualisation of the calculated biodiversity changes in the Natural Capital Index. In each of the four scenarios, environmental quality improves and more space becomes available for nature areas. The improvement of environmental quality causes an increase in the quality of nature. Flora in particular benefits from lowering the deposition of acid and nitrogen components and improving the hydrology in natural areas. Integrated nature and environmental policy measures can enable the quality of nature to restore in the coming 30 years with an average of 10-15% to approximately 60% of the value of an optimally developed ecosystem. Not all types of ecosystem and group of species profit in a similar way. The increase in biodiversity is large in natural areas, whereas in urban areas the quality of nature does not improve.Directie Milieu- en Natuuurplanburea

MOVE, national model for the vegetation, version 3. The incidence of about 900 plant species as a function of 7 environmental variables

Dit rapport verschijnt in een serie van rapporten over het model MOVE<br>Als onderdeel van het decision support system De Natuurplanner wordt het vegetatiemodel MOVE primair ingezet voor nationale verkenningen. MOVE gebruikt multipele logistische regressie om de kans op voorkomen van plantensoorten te voorspellen als functie van omgevingsvariabelen. MOVE bevat ruim 900 plantensoorten. De responsfuncties van MOVE 2 gebruiken vermesting, verzuring en verdroging als verklarende factoren. Deze studie breidt het model uit met variabelen op het gebied van vegetatiestructuur, zware metalen, saliniteit en regio-verschillen. Bovendien is de empirische basis van de responsfuncties vergroot tot ruim 100.000 vegetatieopnamen. De modellen zijn statistisch getoetst.As a part of the decision support system 'De Natuurplanner' the vegetation model MOVE is primarily applied to national environmental outlooks. MOVE uses multiple logistic regression to predict the incidence of plant species as a function of environmental conditions. Over 900 plant species are included in MOVE. The response functions of MOVE 2 used eutrofication, acidification and moisture as explanatory variables. This study extends the model with variables in the areas of vegetation structure, heavy metals, salinity and regional differences. The empirical basis for the response curves was also enlarged to over 100,000 records and the models statistically tested.RIV

Ecological effect calculations for the national Nature Outlook 2: terrestrial ecosystems

In the Dutch national Nature Outlook 2 the Environmental Assessment Office analyses effects of social trends on biodiversity. The possible future changes in biodiversity have been quantified in four integrated scenarios. This report describes how changes in terrestrial ecosystems were calculated with ecological models. It includes the descriptions of: 1) the definition of model input from the scenarios, 2) the ecological modelling itself and, 3) the visualisation of the calculated biodiversity changes in the Natural Capital Index. In each of the four scenarios, environmental quality improves and more space becomes available for nature areas. The improvement of environmental quality causes an increase in the quality of nature. Flora in particular benefits from lowering the deposition of acid and nitrogen components and improving the hydrology in natural areas. Integrated nature and environmental policy measures can enable the quality of nature to restore in the coming 30 years with an average of 10-15% to approximately 60% of the value of an optimally developed ecosystem. Not all types of ecosystem and group of species profit in a similar way. The increase in biodiversity is large in natural areas, whereas in urban areas the quality of nature does not improve.In de 2e Nationale Natuurverkenning gaat het Milieu- en NatuurPlanbureau (MNP) na hoe trends in maatschappelijke ontwikkelingen natuur en landschap rond 2030 kunnen gaan beinvloeden. De achterliggende analyse van vier contrasterende integrale omgevingsscenario's kwantificeert de ecologische effecten van het totale samenspel van trends. Dit rapport beschrijft de methode van de ecologische effectberekening voor de terrestrische natuur oftewel natuur op het land, waarin de stappen 1) van scenariobeschrijving tot modelinvoer 2) van modelinvoer tot modeluitvoer 3) van modeluitvoer tot graadmeter, aan bod komen. Daarnaast behandelt het rapport de resultaten met enkele illustrerende analyses en enige discussiepunten bij de methode en resultaten. De terrestrische natuurkwaliteit als geheel herstelt zich in de komende dertig jaar met gemiddeld circa 10 a 15% van de waarde van optimaal ontwikkelde natuur. De kwaliteitsverbetering verschilt echter sterk per natuurtype (tot maximaal 60%) en tussen soortgroepen. De natuurkwaliteit op het land neemt duidelijk toe. De natuurkwaliteit van het agrarisch deel verandert daarentegen niet

Overlevingsplan bos en natuur : achtergronddocument bij natuurbalans 2001

OBN onderzoek in het kader van de natuurbalan

MOVE, national model for the vegetation, version 3. The incidence of about 900 plant species as a function of 7 environmental variables

As a part of the decision support system 'De Natuurplanner' the vegetation model MOVE is primarily applied to national environmental outlooks. MOVE uses multiple logistic regression to predict the incidence of plant species as a function of environmental conditions. Over 900 plant species are included in MOVE. The response functions of MOVE 2 used eutrofication, acidification and moisture as explanatory variables. This study extends the model with variables in the areas of vegetation structure, heavy metals, salinity and regional differences. The empirical basis for the response curves was also enlarged to over 100,000 records and the models statistically tested.Als onderdeel van het decision support system De Natuurplanner wordt het vegetatiemodel MOVE primair ingezet voor nationale verkenningen. MOVE gebruikt multipele logistische regressie om de kans op voorkomen van plantensoorten te voorspellen als functie van omgevingsvariabelen. MOVE bevat ruim 900 plantensoorten. De responsfuncties van MOVE 2 gebruiken vermesting, verzuring en verdroging als verklarende factoren. Deze studie breidt het model uit met variabelen op het gebied van vegetatiestructuur, zware metalen, saliniteit en regio-verschillen. Bovendien is de empirische basis van de responsfuncties vergroot tot ruim 100.000 vegetatieopnamen. De modellen zijn statistisch getoetst

Doelrealisatiegraadmeter voor de ecologische hoofdstructuur

Het Planbureau voor de Leefomgeving (PBL) geeft jaarlijkse trendcijfers van de natuurkwaliteit met de Natuurwaardegraadmeter 2.0. Om daarnaast te kunnen rapporteren waar binnen de Ecologische Hoofdstructuur (EHS) de beoogde kwaliteit wordt gerealiseerd is de ‘EHS Doelrealisatiegraadmeter’ (EDG) ontwikkeld. Voor de EDG worden vier stappen doorlopen: vervaardigen van een kaartbeeld van de natuurdoelen die nagestreefd worden, voor elke locatie beoordelen of een natuurdoel reeds voorkomt, vaststellen hoeveel planten, vlinders en vogels actueel voorkomen, en vergelijken van deze hoeveelheid met een specifieke norm voor het betreffende natuurdoel. Het eindresultaat laat zien dat 24% van het areaal de gewenste kwaliteit heeft en 20% bijna. ‘Moeras’, ‘Open duinen’, en de verschillende typen bos scoren het hoogst. De huidige versie van de EDG maakt nog gebruik van het natuurdoeltypensysteem, omdat de nieuwe SNLtypologie (SNL = Subsidiestelsel Natuur- en Landschapsbeheer) nog niet helemaal was uitgewerkt. Bij de ontwikkeling van de EDG is wel rekening gehouden dat hij ook toepasbaar gemaakt kan worden voor andere systemen, zoals Index-NL

Evaluation of the Acidification targets: the emission alternatives

This report supports the evaluation of the Dutch targets for acidification which was announced in the 3th National Environmental Policy Plan (NMP3). The relation between emissions, environmental quality and health risks was studied using a number of emissions variants. The calculations show that the environmental quality in 2010 improves compared to the current situation. Despite this major bottlenecks remain. The deposition target for 2010 from the NMP3 will not be realized. During the next decade the percentage of hectares of ecosystems unprotected for deposition of potential acid and nitrogen is expected to be larger than 75%. Only realization of the NMP3 emission targets, with proportional reductions in other countries, provides achievement of the NMP3 targets for deposition. The long-term ozone target value for the protection of human health and vegetation will not be met in 2010. However, the 2010 limit values will possibly be met. The number of hospital admissions associated with ozone is expected to grow if one includes the increase of the ageing population. The policy on reduction of acidifying compounds will not sufficiently reduce the ambient concentration of particulate matter to comply with the 2010 indicative limit values for PM. Some exceedances of the NO2 annual limit value are calculated for 2010.Dit rapport levert bouwstenen voor de 'evaluatie van de verzuringsdoelstellingen' welke in het NMP3 is aangekondigd. Er is een aantal emissievarianten doorgerekend om inzicht te krijgen in de samenhang tussen emissies, milieukwaliteit en gezondheidsrisico's. Het verschil tussen de huidige situatie en de emissievarianten in 2010 is aanzienlijk, desondanks blijven er grote knelpunten bestaan. De 2010 depositiedoelstellingen uit het NMP3 worden de komende 10 jaar niet gehaald. Het percentage hectaren ecosysteem dat onbeschermd is voor de depositie van potentieel zuur en stikstof blijft de komende 10 jaar in alle varianten boven de 75%. Pas bij uitvoering van de emissiedoelen uit het NMP3, met soortgelijke inspanningen in het buitenland, komt realisatie van de depositiedoelstellingen voor 2010 in beeld. De langetermijn luchtkwaliteitsdoelstelling voor ozon ter bescherming van de gezondheid en vegetatie wordt in geen van de varianten gehaald. Wel worden de voorgestelde tussendoelstellingen voor 2010 mogelijk gehaald. Rekening houdend met vergrijzing, zal er tussen de huidige situatie en 2010 een toename zijn van het aantal extra ziekenhuisopnamen door ozon. Het verzuringsbeleid dringt de jaargemiddelde concentratie fijn stof in 2010 niet voldoende terug om de indicatieve doelstellingen voor dat jaar te realiseren. Ook voor NO2 worden in 2010 op enkele plaatsen overschrijdingen berekend