Quantitative assessment of polymetallic pollution of the dnieper river by a method of heavy metals background concentration calculation in mussel Anodonta anatina

Як критерій забруднення окремих районів русла р. Дніпро використано показник перевищення фонового рівня вмісту важких металів у м’яких тканинах молюсків Anodonta anatina (Linnaeus, 1758). Для оцінки параметрів фонового вмісту та величини граничного фонового рівня використовували метод розрахунку абсолютного відхилення медіани (MAD). Порівняння вмісту металів у молюсках із 23 досліджених районів із розрахованою величиною граничного фонового рівня для української ділянки р. Дніпро дозволило визначити ступінь забруднення окремих районів ріки.Как критерий загрязнения отдельных районов русла р. Днепр использовано показатель превышения фонового уровня содержания тяжелых металлов в мягких тканях моллюсков Anodonta anatina (Linnaeus, 1758). Для оценки параметров фонового содержания и величины предельного фонового уровня использовали метод расчета абсолютного отклонения медианы (MAD). Сравнение содержания металлов в моллюсках из 23 исследованных районов с рассчитанной величиной предельного фонового уровня для украинского участка р. Днепр позволило определить степень загрязнения отдельных районов реки.Statistically significant exceeding of a background level of the heavy metal content in Anodonta anatina (Linnaeus, 1758) soft tissues was applied for pollution measure. The method of the median absolute deviation (MAD) was used for the heavy metals’ background and threshold levels assessment. The comparison of metal contents in mussels from 23 studied area of Ukrainian part of the Dnieper with the calculated background level allowed to determine the pollution degree of some river’s sites

Different rates of (non-)synonymous mutations in astrovirus genes; correlation with gene function

BACKGROUND: Complete genome sequences of the Astroviridae include human, non-human mammalian and avian species. A consensus topology of astroviruses has been derived from nucleotide substitutions in the full-length genomes and from non-synonymous nucleotide substitutions in each of the three ORFs. Analyses of synonymous substitutions displayed a loss of tree structure, suggesting either saturation of the substitution model or a deviant pattern of synonymous substitutions in certain virus species. RESULTS: We analyzed the complete Astroviridae family for the inference of adaptive molecular evolution at sites and in branches. High rates of synonymous mutations are observed among the non-human virus species. Deviant patterns of synonymous substitutions are found in the capsid structural genes. Purifying selection is a dominant force among all astrovirus genes and only few codon sites showed values for the dN/dS ratio that may indicate site-specific molecular adaptation during virus evolution. One of these sites is the glycine residue of a RGD motif in ORF2 of human astrovirus serotype 1. RGD or similar integrin recognition motifs are present in nearly all astrovirus species. CONCLUSION: Phylogenetic analysis directed by maximum likelihood approximation allows the inclusion of significantly more evolutionary history and thereby, improves the estimation of dN and dS. Sites with enhanced values for dN/dS are prominent at domains in charge of environmental communication (f.i. VP27 and domain 4 in ORF1a) more than at domains dedicated to intrinsic virus functions (f.i. VP34 and ORF1b (the virus polymerase)). Integrin recognition may play a key role in astrovirus to target cell attachment

SPATIAL-TEMPORAL DYNAMICS OF LITTORAL ZOOPLANKTON COMMUNITY OF THE OLEKSANDRIVKA RESERVOIR

The analysis results of spatio-temporal dynamics of zooplankton communities from littoral of the Oleksandrivka reservoir are presented. The features of the seasonal changes in species composition, faunal and ecological spectrums, quantitative indicators (density and biomass) and the dominant species complexes of littoral zooplankton was revealed. The analysis of seasonal dynamics of qualitative and quantitative development of zooplankton in the littoral zone within the upper, middle and lower parts of the Oleksandrivka reservoir was conducted

Occult hepatitis B infection: an evolutionary scenario

This is an Open Access article distributed under the terms of the Creative Commons Attribution Licens

Cellular Levels of HIV Unspliced RNA from Patients on Combination Antiretroviral Therapy with Undetectable Plasma Viremia Predict the Therapy Outcome

BACKGROUND:Combination antiretroviral therapy (cART), the standard of care for HIV-1 infection, is considered to be successful when plasma viremia remains below the detection limit of commercial assays. Yet, cART fails in a substantial proportion of patients after the apparent success. No laboratory markers are known that are predictive of cART outcome in initial responders during the period of undetectable plasma viremia. METHODOLOGY/PRINCIPAL FINDINGS:Here, we report the results of a retrospective longitudinal study of twenty-six HIV-infected individuals who initially responded to cART by having plasma viremia suppressed to <50 copies/ml. Eleven of these patients remained virologically suppressed, whereas fifteen experienced subsequent cART failure. Using sensitive methods based on seminested real-time PCR, we measured the levels of HIV-1 proviral (pr) DNA, unspliced (us) RNA, and multiply spliced RNA in the peripheral blood mononuclear cells (PBMC) of these patients at multiple time points during the period of undetectable plasma viremia on cART. Median under-therapy level of usRNA was significantly higher (0.43 log(10) difference, P = 0.0015) in patients who experienced subsequent cART failure than in successfully treated patients. In multivariate analysis, adjusted for baseline CD4(+) counts, prior ART experience, and particular cART regimens, the maximal usRNA level under therapy was the best independent predictor of subsequent therapy failure (adjusted odds ratio [95% CI], 24.4 [1.5-389.5], P = 0.024). The only other factor significantly associated with cART failure was prior ART experience (adjusted odds ratio [95% CI], 12.3 [1.1-138.4], P = 0.042). Levels of usRNA under cART inversely correlated with baseline CD4(+) counts (P = 0.0003), but did not correlate with either baseline usRNA levels or levels of prDNA under therapy. CONCLUSION:Our data demonstrate that the level of HIV-1 usRNA in PBMC, measured in cART-treated patients with undetectable plasma viremia, is a strong predictive marker for the outcome of therapy

INFLUENCE OF ELECTRON EMISSION ON SPECTROSCOPIC PROPERTIES OF SOME PHOSPHATES WITH Pr3+ IMPURITY

This paper reports the spectroscopic properties of praseodymium-doped phosphates, KLuP2O7, Sr9Sc(PO4)7, K3Lu(PO4)2 doped with Pr3+ ions. Spectra of photoluminescence (PL) upon UV-VUV excitation, PL excitation, thermally stimulated luminescence was measured.The work was partially supported by the Ministry of Science and Higher Education of the Russian Federation (through the basic part of the government mandate, project No. FEUZ-2020-0060)

Macro- and microelemental composition of the Antarctic fish blood serum

The research materials were selected during the 9-th Ukrainian Antarctic expedition in Academic Vernadsky station region. For analysis the fish samples that related to Nototheniidae, Bathydraconidae and Chaenichthyidae were used. The elemental composition of fish blood serum was estimated by flame atomic absorption spectroscopy and X-ray fluorescence spectroscopy. The elemental analysis of blood serum of the Antarctic fish revealed the species- dependent distribution. The expedience of the fish blood serum use for environmental biotesting is proposed

Дія амітриптиліну на біоелектричну активність гіпокампу на фоні розвитку довготривалого стресу

Dynamics of changes of capacities of gypocampus bioelectric activity in control rats, in animals under immobilization stress and in the long-term stressed rats, which was administrated by amitriptilinum, was analyzed. The dynamics of changes of the gypocampus bioelectric activity reflects features of reorganization of the brain adaptive mechanisms with the constant change of its functioning mode under conditions of the long-term stress development. Проаналізовано динаміку змін потужностей біоелектричної активності гіпокампу у тварин контрольної групи та за умов імобілізаційного стресу паралельно зі щурами, які на фоні розвитку стрес-реакції приймали амітриптилін. Динаміка змін біоелектричної активності гіпокампу відображає особливості перебудови пристосувальних механізмів мозку при стійкій зміні режиму його функціонування за умов розвитку довготривалого стресу.Проаналізовано динаміку змін потужностей біоелектричної активності гіпокампу у тварин контрольної групи та за умов імобілізаційного стресу паралельно зі щурами, які на фоні розвитку стрес-реакції приймали амітриптилін. Динаміка змін біоелектричної активності гіпокампу відображає особливості перебудови пристосувальних механізмів мозку при стійкій зміні режиму його функціонування за умов розвитку довготривалого стресу

Вплив карбамазепіну на біоелектричну активність гіпоталамуса щурів за умов розвитку стрес-реакції

The influence of carbamazepine medication on bioelectric activity of the posterior and anterior hypothalamus in rats under stress conditions was studied. It is shown, that carbamazepine changes amplitude of the basic rhythms of electric activity of the hypothalamus posterior zone, which value were less compared with the capacities amplitude of the hypothalamic anterior zone.Досліджено вплив фармакологічного препарату карбамазепіну на біоелектричну активність заднього та переднього гіпоталамуса щурів за умов стресу. Показано, що карбамазепін змінює амплітуду основних ритмів електричної активності задньої зони гіпоталамуса, значення якої були меншими порівняно з амплітудою потужності передньої зони. Досліджено вплив фармакологічного препарату карбамазепіну на біоелектричну активність заднього та переднього гіпоталамуса щурів за умов стресу. Показано, що карбамазепін змінює амплітуду основних ритмів електричної активності задньої зони гіпоталамуса, значення якої були меншими порівняно з амплітудою потужності передньої зони