Los ARNs no codificantes largos y su vinculación con las patologías testiculares

Si bien la porción del genoma destinada a la síntesis de proteínas es muy pequeña, actualmente se sabe que casi todo el genoma se expresa bajo forma de ARNs no codificantes. Entre dichos ARNs se encuentran los ARNs no codificantes largos (lncRNAs). Aunque los lncRNAs han sido muy poco estudiados, recientemente han comenzado a centrar la atención de los investigadores, al descubrirse que los mismos pueden desempeñar diversas funciones en la regulación de la expresión génica. Además, su vinculación con patologías ha comenzado a ser puesta de manifiesto. Curiosamente, la cantidad de lncRNAs presentes en el testículo es abrumadoramente mayor que en cualquier otro órgano o tejido estudiado. Los perfiles de expresión de estos lncRNAs varían significativamente a lo largo de la espermatogénesis, y algunas evidencias sugieren que al menos algunos de ellos podrían participar en el proceso de formación de células germinales masculinas. No obstante, el conocimiento sobre el tema es aún muy escaso. En este trabajo revisamos la información disponible sobre la expresión de lncRNAs en el testículo y sus posibles funciones. Asimismo, analizamos algunos ejemplos que ilustran la participación de lncRNAs en el desarrollo de patologías como la infertilidad y el cáncer testicular

Revealing stage-specific expression patterns of long noncoding RNAs along mouse spermatogenesis

The discovery of a large number of long noncoding RNAs (lncRNAs), and the finding that they may play key roles in different biological processes, have started to provide a new perspective in the understanding of gene regulation. It has been shown that the testes express the highest amount of lncRNAs among different vertebrate tissues. However, although some studies have addressed the characterization of lncRNAs along spermatogenesis, an exhaustive analysis of the differential expression of lncRNAs at its different stages is still lacking. Here, we present the results for lncRNA transcriptome profiling along mouse spermatogenesis, employing highly pure flow sorted spermatogenic stage-specific cell populations, strand-specific RNAseq, and a combination of up-to-date bioinformatic pipelines for analysis. We found that the vast majority of testicular lncRNA genes are expressed at post-meiotic stages (i.e. spermiogenesis), which are characterized by extensive post-transcriptional regulation. LncRNAs at different spermatogenic stages shared common traits in terms of transcript length, exon number, and biotypes. Most lncRNAs were lincRNAs, followed by a high representation of antisense (AS) lncRNAs. Co-expression analyses showed a high correlation along the different spermatogenic stage transitions between the expression patterns of AS lncRNAs and their overlapping protein-coding genes, raising possible clues about lncRNA-related regulatory mechanisms. Interestingly, we observed the colocalization of an AS lncRNA and its host sense mRNA in the chromatoid body, a round spermatidsspecific organelle that has been proposed as a reservoir of RNA-related regulatory machinery. An additional, intriguing observation is the almost complete lack of detectable expression for Y-linked testicular lncRNAs, despite that a high number of lncRNA genes are annotated for this chromosom