Análise do perfil epidemiológico e laboratorial de pacientes com hepatite B crônica naive e em tratamento antiviral em um hospital de referência de Salvador - Bahia

Introdução: a hepatite B é uma doença provocada pela infecção do vírus da hepatite B (VHB). A infecção pelo HBV pode causar hepatite aguda ou crônica, sendo as duas situações geralmente oligossintomáticas. Fatores comportamentais e genéticos, características demográficas ou concomitância de algumas substâncias tóxicas, aumentam o risco de cirrose e neoplasia primária do fígado, nos portadores crônicos do HBV. O tratamento na hepatite crônica visa reduzir o risco de progressão da doença hepática e de seus desfechos primários, especificamente cirrose, hepatocarcinoma e, conseqüentemente, o óbito Objetivo: descrever as características epidemiológicas, marcadores sorológicos da infecção pelo HBV e marcadores bioquímicos de pacientes com HB crônica tratados e naives em um hospital público de referência na Bahia. Metodologia: estudo descritivo analítico, com amostra de conveniência. Foram analisados soros de 57 indivíduos monoinfectados com diagnóstico de hepatite B crônica e categorizados em grupo 1: pacientes em tratamento antiviral (n=24) e  grupo 2: pacientes infectados  naive (n=33). Resultados: o número de mulheres infectadas foi maior que o de homens. A terceira e quinta décadas de vida apresentaram maior prevalência de casos, somando 37% do total. O maior percentual de infectados se declararam viúvos(as), proveniente da zona urbana e de etnia parda ou negra. A maioria dos pacientes apresentaram níveis normais de marcadores bioquímicos. Conclusão: a avaliação da resposta terapêutica contra a hepatite B crônica continua sendo um desafio para medicos e pesquisadores e o conhecimento do perfil epidemiológico e dos marcadores bioquímicos são dados relevantes para o acompanhamento da eficácia do tratamento

SARS-CoV-2 introductions and early dynamics of the epidemic in Portugal

Genomic surveillance of SARS-CoV-2 in Portugal was rapidly implemented by the National Institute of Health in the early stages of the COVID-19 epidemic, in collaboration with more than 50 laboratories distributed nationwide. Methods By applying recent phylodynamic models that allow integration of individual-based travel history, we reconstructed and characterized the spatio-temporal dynamics of SARSCoV-2 introductions and early dissemination in Portugal. Results We detected at least 277 independent SARS-CoV-2 introductions, mostly from European countries (namely the United Kingdom, Spain, France, Italy, and Switzerland), which were consistent with the countries with the highest connectivity with Portugal. Although most introductions were estimated to have occurred during early March 2020, it is likely that SARS-CoV-2 was silently circulating in Portugal throughout February, before the first cases were confirmed. Conclusions Here we conclude that the earlier implementation of measures could have minimized the number of introductions and subsequent virus expansion in Portugal. This study lays the foundation for genomic epidemiology of SARS-CoV-2 in Portugal, and highlights the need for systematic and geographically-representative genomic surveillance.We gratefully acknowledge to Sara Hill and Nuno Faria (University of Oxford) and Joshua Quick and Nick Loman (University of Birmingham) for kindly providing us with the initial sets of Artic Network primers for NGS; Rafael Mamede (MRamirez team, IMM, Lisbon) for developing and sharing a bioinformatics script for sequence curation (https://github.com/rfm-targa/BioinfUtils); Philippe Lemey (KU Leuven) for providing guidance on the implementation of the phylodynamic models; Joshua L. Cherry (National Center for Biotechnology Information, National Library of Medicine, National Institutes of Health) for providing guidance with the subsampling strategies; and all authors, originating and submitting laboratories who have contributed genome data on GISAID (https://www.gisaid.org/) on which part of this research is based. The opinions expressed in this article are those of the authors and do not reflect the view of the National Institutes of Health, the Department of Health and Human Services, or the United States government. This study is co-funded by Fundação para a Ciência e Tecnologia and Agência de Investigação Clínica e Inovação Biomédica (234_596874175) on behalf of the Research 4 COVID-19 call. Some infrastructural resources used in this study come from the GenomePT project (POCI-01-0145-FEDER-022184), supported by COMPETE 2020 - Operational Programme for Competitiveness and Internationalisation (POCI), Lisboa Portugal Regional Operational Programme (Lisboa2020), Algarve Portugal Regional Operational Programme (CRESC Algarve2020), under the PORTUGAL 2020 Partnership Agreement, through the European Regional Development Fund (ERDF), and by Fundação para a Ciência e a Tecnologia (FCT).info:eu-repo/semantics/publishedVersio

A farmacopsiquiatria dos antidepressivos: The pharmacopsychiatry of antidepressants

Os fármacos antidepressivos compõem o manejo terapêutico da depressão e inúmeros outros transtornos de origem neuropsiquiátrica. Logo, a ocorrências destes distúrbios tornam viável a aplicação destes, ressaltando ser essencial individualizar o tratamento e compreender a respeito das diversas classes, mecanismo de ação, interação medicamentosa, indicação clinica, grupo de risco e a intoxicação por superdosagem. O seguinte artigo objetivou descrever a respeito das particularidades dos antidepressivos, de modo a compreender sobre seu efeito farmacopsiquiatríco. Trata-se de uma revisão narrativa de literatura fundamentada nas renomadas plataformas de artigos indexados a respeito do tema. Foram selecionados os estudos que apresentavam relevância clinica para a compreensão do artigo, descartando-se os demais que não respondiam ao objetivo proposto. Na literatura científica estão disponíveis muitas informações pertinentes ao tema, ressaltando a importância deste. Atualmente, se encontram em aplicabilidade diversas classes que são os Inibidores Seletivos da Recaptação de Serotonina (ISRSs), Antidepressivos Tricíclicos (ADTs), Tetracíclicos e os Inibidores da Monoamina Oxidase (IMAO). Cada um destes possui um mecanismo de ação diferente, mas basicamente estes interferem no impulso nervoso de neurotransmissores beneficiando o portador de distúrbios neurocognitivos. Destacando que mesmo com o efeito terapêutico retrógrado, estes já manifestam os efeitos adversos. Logo, é imprescindível analisar qual o tipo e a dose do fármaco para se conduzir o melhor prognóstico do paciente.&nbsp

Perfil das mutações de resistência do vírus da Hepatite B aos análogos de nucleos(t)ídeos entre pacientes com hepatite B crônica

Submitted by Ana Maria Fiscina Sampaio ([email protected]) on 2014-10-29T13:42:36Z No. of bitstreams: 1 Maria Isabel Magalhães Santos Perfil das....pdf: 1133942 bytes, checksum: bcc264f7cc24ec022846c05825fd31cf (MD5)Made available in DSpace on 2014-10-29T13:42:36Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Maria Isabel Magalhães Santos Perfil das....pdf: 1133942 bytes, checksum: bcc264f7cc24ec022846c05825fd31cf (MD5) Previous issue date: 2014Fundação Oswaldo Cruz. Centro de Pesquisa Gonçalo Moniz. Salvador, BA, BrasilIntrodução: A doença causada pelo vírus da hepatite B (HBV) é um problema de saúde pública mundial. No Brasil, o sistema único de saúde (SUS) tem disponibilizado drogas antivirais para o tratamento de hepatite B crônica há mais de 10 anos, mas um sistema para o monitoramento e avaliação de resistência a estas drogas ainda não está disponível. Objetivo: Este estudo teve como objetivo determinar o perfil de mutações do HBV associadas com a resistência aos análogos de nucleos(t)ídeos entre 81 pacientes com infecção crônica pelo HBV: virgens de tratamento para hepatite B e tratados com diferentes análogos de nucleosídeos e nucleotídeos, no Hospital Professor Edgar Santos (HUPES-UFBA)- Salvador-BA. Metodologia: O HBV-DNA foi isolado de amostras de soro, amplificado por nested-PCR, utilizando-se primers deduzidos da região flaqueadora da domínio rt do gene P e sequenciados (ABI Prism 3730, Applied Biosystems, EUA). Duas a seis sequências de cada isolado foram alinhados e os sítios conflitantes foram resolvidos usando o software CLC Main Workbench v. 5.0 por inspeção visual dos eletroferogramas. As sequências consenso tinham um tamanho de 1032 pb (compreendendo os aminoácido 1-344 da rt). Estas sequências foram submetidas ao banco de dados HBVrt DB (Stanford University, EUA) para a análise de cada mutação de acordo com o genótipo e tratamento. Resultado: O genótipo A1 foi o mais prevalente (85,2%) seguido pelo genótipo A2 (4,9%) F (6,2%) e C1, D2 e D4 (1,2% cada). Seis pacientes (7 %) apresentaram mutações de resistência para LAM, ETV, TDF: dois com o padrão L180M + M204V e quatro com padrões diversos (L80I + L180M + M204I ;L80V + L180M + M204V; M204I; A194T). Todas estas mutações foram associadas ao genótipo A (quatro A1 e dois A2). Além disso, foi encontrado um paciente com HBV genótipo C típico do leste da Ásia. Destes pacientes, dois foram virgens de tratamento e quatro tinham histórico de tratamento para HIV ou HBV. Foram detectadas quatro mutações no gene S (três casos com a mutação sI195M e um a mutação sW196L) associadas às mutações do domínio rt do gene P, correspondendo à uma taxa de 6% de mutações de escape vacinal. A prevalência das mutações de resistência às drogas antivirais variou de acordo com a duração do tratamento e com o nível da barreira genética da droga utilizada. Neste estudo, foi encontrada uma forte associação entre a ocorrência de mutações de resistência do HBV e positividade para o AgHBe, co-infecção com o HIV e histórico de tratamento para HBV e/ou HIV. Conclusão: Antes da terapia ser iniciada é extremamente importante o monitoramento da carga viral e a identificação destas mutações para suportar decisões clinicas sobre o manejo dos pacientes e prevenir a emergência de vírus multi- resistentes.Introduction: Hepatitis B virus (HBV) infection is a public health issue. The Brazilian public health system (SUS) has provided antiviral drugs for chronic hepatitis B treatment for over 10 years, but a system for monitoring for drug-related resistance mutations is not available. Objective: This study aims to determine the presence of HBV mutations associated with resistance to nucleos(t)ide analogs among 81 patients with chronic HBV infection-naïve and treated from University Hospital Professor Edgard Santos, Salvador-BA (HUPES-UFBA). Methods: Briefly, HBV-DNA was PCR amplified with primers deduced from the flanking of the rt domain at the HBV P gene and sequenced using ABI Prism 3730 (Applied Biosystems, USA). From two to six forward and reverse sequences of each isolate were assembled and conflicting sites were resolved using software CLC Main Workbench v. 5.0 by visual inspection of the electropherograms. Consensus sequence extended 1032 bp and encompassed the entire rt domain (from amino acid 1 to 344). Those sequences were submitted to the HBV drug resistance database (HBVrt DB, Stanford University, USA) to retrieve each mutation according to genotype and treatment. Results: HBV genotype A1 (85.2%) was the most prevalent followed by genotype A2 (4.9%), F (6.2%), and C1, D2 and D4 (1.2% each). Six patients (7%) exhibited resistance mutations to LAM, ETV and TDF: two with patterns L180M + M204V and four with other different patterns: L80I + L180M + M204I; L80V + L180M + M204V; M204I; A194T. All of these mutations were present in patients with genotype A (four A1 and two A2). Furthermore, this study found one patient with genotype C, common in East Asian. Of these patients, two were naïve and four had a history of treatment for HIV or HBV. In addition, four mutations in gene S (sI195M three cases with the mutation and one with the mutations W196L) associated with mutations in the rt domain of the P gene were detected, corresponding to a rate of 6% of vaccine escape mutations. Prevalence of drug-related resistance mutations varied according to treatment duration and the level of genetic barrier for the drugs used. Conclusion: In this study a strong association was found between the occurrence of HBV resistance mutations and HBeAg positivity, co-infection with HIV and a history of treatment for HBV and / or HIV. Once the drug therapy is initiated it is extremely important to monitor viral load and identify those mutations in order to support clinical decisions about patient management and also to prevent the emergence of multidrug-resistant viruses

Analysis of clinical protocol and guidelines therapeutic for treatment for chronic hepatitis B in northeast Brazil and regions north

Submitted by Ana Maria Fiscina Sampaio ([email protected]) on 2018-03-26T17:48:36Z No. of bitstreams: 1 Pacheco SR Avaliação do protocolo clínico e diretrizes....pdf: 103187 bytes, checksum: c62829d485518196cf255ceafd7b356d (MD5)Approved for entry into archive by Ana Maria Fiscina Sampaio ([email protected]) on 2018-03-26T17:56:29Z (GMT) No. of bitstreams: 1 Pacheco SR Avaliação do protocolo clínico e diretrizes....pdf: 103187 bytes, checksum: c62829d485518196cf255ceafd7b356d (MD5)Made available in DSpace on 2018-03-26T17:56:29Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Pacheco SR Avaliação do protocolo clínico e diretrizes....pdf: 103187 bytes, checksum: c62829d485518196cf255ceafd7b356d (MD5) Previous issue date: 2016A Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) e ao Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq) pelo apoio financeiro através do processo 478322/2012-7.Fundação Oswaldo Cruz. Centro de Pesquisas Gonçalo Moniz. Salvador, BA, BrasilFundação Oswaldo Cruz. Centro de Pesquisas Gonçalo Moniz. Salvador, BA, BrasilUniversidade Federal da Bahia. Salvador, BA, BrasilUniversidade Federal da Bahia. Salvador, BA, BrasilFundação Oswaldo Cruz. Centro de Pesquisas Gonçalo Moniz. Salvador, BA, BrasilFundação Oswaldo Cruz. Centro de Pesquisas Gonçalo Moniz. Salvador, BA, BrasilNo Brasil o tratamento para Hepatite B cônica, tem sido disponibilizado pelo Sistema Único de Saúde há mais de 10 anos. O objetivo foi analisar o tratamento dos pacientes com hepatite B crônica, em dois Centros de Referência em Hepatites Virais na Região Nordeste e Norte do Brasil, comparando com o Protocolo Clínico e Diretrizes Terapêuticas da Hepatite B do Ministério da Saúde. Foram incluídos no estudo 527 pacientes em atendimento ambulatorial. No algoritmo 4.1 foi observado que existe uma dificuldade em seguir a recomendação do Ministério da Saúde, nos dois serviços de referência, 78,9% e 72% Região Nordeste e Norte respectivamente. O algoritmo 4.2, foi o algoritmo que apresentou no geral mais de 90% de seguimento na recomendação do Protocolo Clínico, devido que os pacientes são na sua grande maioria AgHBe negativo. O algoritmo 4.3 aproximadamente 85% dos pacientes da Região Nordeste estava dentro da recomendação do Protocolo Clínico para Hepatite B crônica, entretanto, nenhum paciente da Região Norte. O Protocolo Clínico de Diretrizes Terapêuticas para Hepatite B foi um grande passo e avanço. Uma ferramenta importantíssima dentro da realidade do tratamento para Hepatite B e foi possível incorporar novas drogas e indicadores de tratamento embasados na Medicina Baseada em Evidencias e nos Consensos Internacionais pelo Ministério da Saúde.In Brazil the treatment for Hepatitis B conical, has been provided by the National Health System for over 10 years. The aim was to analyze the treatment of patients with chronic hepatitis B in two reference centers in Viral Hepatitis in the Northeast and North of Brazil, compared to the Clinical Protocol and Therapeutic Guidelines Hepatitis B of the Ministry of Health. The study included 527 patients in outpatient care. In algorithm 4.1 it was observed that there is a difficulty in following the recommendation of the Ministry of Health in two reference centers, 78.9% and 72% northeast and north respectively. The 4.2 algorithm, the algorithm was presented in general more than 90% follow-up on the recommendation of the Clinical Protocol because patients are mostly negative HBeAg. The algorithm 4.3 approximately 85% of patients in the Northeast was in the recommendation of the Clinical Protocol for chronic hepatitis B, however, no patients in the Northern Region. The Clinical Protocol Therapeutic Guidelines for Hepatitis B was a big step and advance. An important tool within the reality of treatment for hepatitis B and it was possible to incorporate new drugs and treatment indicators grounded in Evidence-Based Medicine and the International Consensus by the Ministry of Health

Analysis of epidemiological and laboratoial profile of patients with chronic hepatitis B naive and treated with antiviral medicine at a referral Hospital in Salvador – Bahia

Submitted by Ana Maria Fiscina Sampaio ([email protected]) on 2018-06-07T13:00:22Z No. of bitstreams: 1 Campos MS Analise do perfil....pdf: 888794 bytes, checksum: 4086bd3d790fbe7c837c4bb351f4a110 (MD5)Approved for entry into archive by Ana Maria Fiscina Sampaio ([email protected]) on 2018-06-07T13:12:18Z (GMT) No. of bitstreams: 1 Campos MS Analise do perfil....pdf: 888794 bytes, checksum: 4086bd3d790fbe7c837c4bb351f4a110 (MD5)Made available in DSpace on 2018-06-07T13:12:18Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Campos MS Analise do perfil....pdf: 888794 bytes, checksum: 4086bd3d790fbe7c837c4bb351f4a110 (MD5) Previous issue date: 2015Universidade Federal da Bahia. Salvador, BA, BrasilUniversidade Federal da Bahia. Pós-graduação em Processos Interativos dos Órgãos e Sistemas. Salvador, BA, BrasilFundação Oswaldo Cruz. Centro de Pesquisas Gonçalo Moniz. Salvador, BA, Brasil / Universidade Federal da Bahia. Salvador, BA, BrasilFundação Oswaldo Cruz. Centro de Pesquisas Gonçalo Moniz. Salvador, BA, Brasil / Universidade Federal da Bahia. Hospitalar Universitário Prof. Edgard Santos. Salvador, BA, BrasilFundação Oswaldo Cruz. Centro de Pesquisas Gonçalo Moniz. Salvador, BA, Brasil / Universidade Federal da Bahia. Hospitalar Universitário Prof. Edgard Santos. Salvador, BA, BrasilIntrodução: a hepatite B é uma doença provocada pela infecção do vírus da hepatite B (VHB). A infecção pelo HBV pode causar hepatite aguda ou crônica, sendo as duas situações geralmente oligossintomáticas. Fatores comportamentais e genéticos, características demográficas ou concomitância de algumas substâncias tóxicas, aumentam o risco de cirrose e neoplasia primária do fígado, nos portadores crônicos do HBV. O tratamento na hepatite crônica visa reduzir o risco de progressão da doença hepática e de seus desfechos primários, especificamente cirrose, hepatocarcinoma e, conseqüentemente, o óbito Objetivo: descrever as características epidemiológicas, marcadores sorológicos da infecção pelo HBV e marcadores bioquímicos de pacientes com HB crônica tratados e naives em um hospital público de referência na Bahia. Metodologia: estudo descritivo analítico, com amostra de conveniência. Foram analisados soros de 57 indivíduos monoinfectados com diagnóstico de hepatite B crônica e categorizados em grupo 1: pacientes em tratamento antiviral (n=24) e grupo 2: pacientes infectados naive (n=33). Resultados: o número de mulheres infectadas foi maior que o de homens. A terceira e quinta décadas de vida apresentaram maior prevalência de casos, somando 37% do total. O maior percentual de infectados se declararam viúvos(as), proveniente da zona urbana e de etnia parda ou negra. A maioria dos pacientes apresentaram níveis normais de marcadores bioquímicos. Conclusão: a avaliação da resposta terapêutica contra a hepatite B crônica continua sendo um desafio para medicos e pesquisadores e o conhecimento do perfil epidemiológico e dos marcadores bioquímicos são dados relevantes para o acompanhamento da eficácia do tratamento.Introduction: hepatitis B is a disease caused by infection of hepatitis B virus (HBV). HBV infection can cause acute or chronic hepatitis, both situations generally oligosymptomatic. Behavioral and genetic factors, demographic characteristics or coexistence of some toxic substances increas the risk of cirrhosis and primary cancer of the liver in chronic HBV carriers. Treatment of chronic hepatitis aims to reduce the risk of progression of liver disease and its primary endpoints, specifically cirrhosis, hepatocellular carcinoma and consequently death. Aim: to describe the epidemiological characteristics, serological markers of HBV infection and biochemical markers of patients with HB chronic, treated and naïve, in a public referral hospital in Bahia. Methodology: analytical descriptive study with a convenience sample. 57 individuals mono infected with chronic hepatitis B and categorized in group 1 patients on antiviral treatment (n = 24) and group 2 were analyzed: patients infected naive (n = 33). Results: the number of infected women was higher than that of men. The third and fifth decades of life had a higher prevalence of cases, totaling 37%. The highest percentage of infected individuals was declared widowed, from the urban area and black or mixed race. Most patients had normal levels of biochemical markers. Conclusion: the evaluation of therapeutic response against chronic hepatitis B remains a challenge for physicians. Researchers and knowledge of the epidemiological profile and biochemical markers are relevant data for monitoring the effectiveness of treatment

Mutations associated with drug resistance and prevalence of vaccine escape mutations in patients with chronic hepatitis B infection

Submitted by Ana Maria Fiscina Sampaio ([email protected]) on 2018-04-03T18:16:16Z No. of bitstreams: 1 Santos MI Mutations Associated With Drug Resistance....pdf: 221088 bytes, checksum: d625417727c6a24993cbef09721bb9a4 (MD5)Approved for entry into archive by Ana Maria Fiscina Sampaio ([email protected]) on 2018-04-03T18:24:48Z (GMT) No. of bitstreams: 1 Santos MI Mutations Associated With Drug Resistance....pdf: 221088 bytes, checksum: d625417727c6a24993cbef09721bb9a4 (MD5)Made available in DSpace on 2018-04-03T18:24:48Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Santos MI Mutations Associated With Drug Resistance....pdf: 221088 bytes, checksum: d625417727c6a24993cbef09721bb9a4 (MD5) Previous issue date: 2017Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Universal-MCTI/ CNPq, Grant number: process: 478322/2012-7; Instituto Gonçalo Moniz - FIOCRUZ– BA/BRAZIL, Grant number: 14/2012Fundação Oswaldo Cruz. Centro de Pesquisas Gonçalo Moniz. Salvador, BA, BrasilFundação Oswaldo Cruz. Centro de Pesquisas Gonçalo Moniz. Salvador, BA, BrasilUniversidade Federal da Bahia. Laboratório do Serviço de Gastro-Hepatologia de Pesquisa em Infectologia. Salvador, BA,BrasilUniversidade Federal da Bahia. Hospitalar Universitário Professor Edgard Santos. Ambulatório Magalhães Neto. Salvador, BA, BrasilUniversidade Federal da Bahia. Hospitalar Universitário Professor Edgard Santos. Ambulatório Magalhães Neto. Salvador, BA, BrasilFundação Oswaldo Cruz. Centro de Pesquisas Gonçalo Moniz. Salvador, BA, BrasilFundação Oswaldo Cruz. Centro de Pesquisas Gonçalo Moniz. Salvador, BA, BrasilThe Brazilian public health system (SUS) has provided antiviral drugs for chronic hepatitis B treatment for over 10 years, but a system for monitoring for drug-related resistance mutations is not available. Determine the presence of HBV mutations associated with resistance to nucleos(t)ide analogs among 81 patients with chronic HBV infection in Salvador-BA-Brazil. HBV-DNA was PCR amplified with primers deduced from the rt domain at the HBV P gene, the sequence extended 1032 bp (from amino acid 1 to 344-rt domain). Those sequences were submitted to the HBV drug resistance database to retrieve each mutation according to the genotype. HBV genotype A1 (85.2%) was the most prevalent, followed by genotype A2 (4.9%), F (6.2%), and C1, D2, and D4 (1.2% each). Six patients (7%) exhibited resistance mutations to LAM, ETV, and TDF: two with patterns L180M + M204V and four with other different patterns: L80I + L180M + M204I; L80V + L180M + M204V; M204I; A194T. All of these mutations were present in patients with genotype A (four A1 and two A2). In addition, four mutations in gene S (three cases with the sI195M mutation and one with the W196L mutation), were detected, corresponding to a rate of 6% of vaccine escape mutations. Althougth the small sample size, an association was found between the occurrence of HBV resistance mutations and HBeAg positivity, co-infection with HIV and a history of treatment for HBV and/or HIV

Genotyping of HBV and tracking of resistance mutations in treatment-naïve patients with chronic hepatitis B

Submitted by Ana Maria Fiscina Sampaio ([email protected]) on 2017-08-16T16:27:14Z No. of bitstreams: 1 Pacheco SR Genotyping of HBV....pdf: 166259 bytes, checksum: 49e84a643126b53a8e977241bffd0c86 (MD5)Approved for entry into archive by Ana Maria Fiscina Sampaio ([email protected]) on 2017-08-16T16:39:09Z (GMT) No. of bitstreams: 1 Pacheco SR Genotyping of HBV....pdf: 166259 bytes, checksum: 49e84a643126b53a8e977241bffd0c86 (MD5)Made available in DSpace on 2017-08-16T16:39:09Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Pacheco SR Genotyping of HBV....pdf: 166259 bytes, checksum: 49e84a643126b53a8e977241bffd0c86 (MD5) Previous issue date: 2017Program for Technological Development in Tools for Health (PDTIS), Fiocruz, the workers from LACENBA, LACEN-AC, and Fundação Hospitalar do Acre (Fundhacre). Funding support was provided by the National Counsel of Technological and Scientific Development (CNPq) process 478322/2012-7 and the Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) “Brasil sem Miséria” (BSM, Brazil without Misery)Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Gonçalo Moniz. Laboratório de Patologia e Biologia Molecular. Salvador, BA, BrasilFundação Oswaldo Cruz. Instituto Gonçalo Moniz. Laboratório de Patologia e Biologia Molecular. Salvador, BA, BrasilUniversidade Federal da Bahia. Salvador, BA, BrasilCentral Laboratory of Public Health of Bahia. Salvador, BA, BrazilUniversidade Federal da Bahia. Salvador, BA, BrasilUniversidade Federal da Bahia. Salvador, BA, BrasilFundação Oswaldo Cruz. Instituto Gonçalo Moniz. Laboratório de Patologia e Biologia Molecular. Salvador, BA, BrasilFundação Oswaldo Cruz. Instituto Gonçalo Moniz. Laboratório de Patologia e Biologia Molecular. Salvador, BA, BrasilResistance mutation analogs to nucleos(t)ides have been described in treatment-naïve patients with chronic hepatitis B (CHB), with clinical implications. The aim of this study was to investigate primary resistance mutations and genotypes circulating in patients naïve to chronic hepatitis B, in the Northern and Northeastern regions of Brazil. Methods: We conducted a study of resistance mutations and genotypic characterization of hepatitis B virus (HBV) in 189 treatment-naïve patients chronically infected with HBV. Results: Drug resistance-associated mutations located in the RT domain of the P gene (rtHBV) were found in 6% of the treatment-naïve patients from the Northeastern Region. The mutations were rtA194T, rtL180M + rtM204V, rtS202I, rtM204I, and rtA181S. No patient in the Northern Region had the resistance mutation. In the gene S region, the frequency of vaccine escape mutations was 2.4% in the Northeastern Region and 8.6% in the Northern Region. Conclusion: This information before the start of treatment may contribute to clinical decision making, reducing treatment failure and the risk of progression to cirrhosis and hepatocellular carcinoma for CHB

Rock n' Seeds: A database of seed functional traits and germination experiments from Brazilian rock outcrop vegetation

Advancing functional ecology depends fundamentally on the availability of data on reproductive traits, including those from tropical plants, which have been historically underrepresented in global trait databases. Although some valuable databases have been created recently, they are mainly restricted to temperate areas and vegetative traits such as leaf and wood traits. Here, we present Rock n' Seeds, a database of seed functional traits and germination experiments from Brazilian rock outcrop vegetation, recognized as outstanding centers of diversity and endemism. Data were compiled through a systematic literature search, resulting in 103 publications from which seed functional traits were extracted. The database includes information on 16 functional traits for 383 taxa from 148 genera, 50 families, and 25 orders. These 16 traits include two dispersal, six production, four morphological, two biophysical, and two germination traits-the major axes of the seed ecological spectrum. The database also provides raw data for 48 germination experiments, for a total of 10,187 records for 281 taxa. Germination experiments in the database assessed the effect of a wide range of abiotic and biotic factors on germination and different dormancy-breaking treatments. Notably, 8255 of these records include daily germination counts. This input will facilitate synthesizing germination data and using this database for a myriad of ecological questions. Given the variety of seed traits and the extensive germination information made available by this database, we expect it to be a valuable resource advancing comparative functional ecology and guiding seed-based restoration and biodiversity conservation in tropical megadiverse ecosystems. There are no copyright restrictions on the data; please cite this paper when using the current data in publications; also the authors would appreciate notification of how the data are used in publications