Mapa genético saturado de microssatélite: caminhando para uma cobertura genômica em uma população de milho tropical (Zea mays L.)

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)Dense molecular genetic maps are used for an efficient quantitative trait loci (QTL) mapping and in the marker-assisted selection programs. A dense genetic map was generated with 139 microsatellite markers using 256 F2 plants generated by the crossing of two tropical maize inbred lines (L-02-03D and L-20-01F). This map presented 1,858.61 cM in length, where 10 linkage groups were found spanned, with an average interval of 13.47 cM between adjacent markers. Seventy seven percent of the maize genetic mapping bins were covered, which means an increase of 14% coverage in relation to the previous tropical maize maps. The results provide a more detailed and informative genetic map in a tropical maize population representing the first step to make possible the studies of genetic architecture to identify and map QTL and estimate their effects on the variation of quantitative traits, thus allowing the manipulation and use in tropical maize breeding programs.Mapas genéticos saturados são utilizados para um eficiente mapeamento de caracteres de interesse agronômico (QTL) e nos programas de seleção assistida. Este trabalho gerou um mapa genético saturado utilizando 139 marcadores moleculares do tipo microssatélites em 256 plantas F2 geradas pelo cruzamento de duas linhagens de milho tropical (L-02-03D e L-20-01F). O mapa obtido teve uma extensão total de 1.858,61 cM, ao longo de 10 grupos de ligação, com intervalo médio entre os marcadores de 13,47 cM. Setenta e nove percento dos "bins" do mapa genético de milho foram cobertos, com um acréscimo de 14% de cobertura em relação aos mapas de milho publicados. Os resultados mostram um mapa genético mais detalhado e informativo em uma população de milho tropical representando uma primeira etapa que possibilitará desenvolver estudos da arquitetura genética para a identificação e mapeamento de QTL e a estimativa de seus efeitos sobre a variação de um caráter quantitativo, permitindo assim a sua manipulação e utilização em programas de melhoramento do milho.323499508Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq)Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)CNPq_BrasilFAPESP_Brasi

Mapa genético saturado de microssatélite: caminhando para uma cobertura genômica em uma população de milho tropical (Zea mays L.)

Dense molecular genetic maps are used for an efficient quantitative trait loci (QTL) mapping and in the marker-assisted selection programs. A dense genetic map was generated with 139 microsatellite markers using 256 F2 plants generated by the crossing of two tropical maize inbred lines (L-02-03D and L-20-01F). This map presented 1,858.61 cM in length, where 10 linkage groups were found spanned, with an average interval of 13.47 cM between adjacent markers. Seventy seven percent of the maize genetic mapping bins were covered, which means an increase of 14% coverage in relation to the previous tropical maize maps. The results provide a more detailed and informative genetic map in a tropical maize population representing the first step to make possible the studies of genetic architecture to identify and map QTL and estimate their effects on the variation of quantitative traits, thus allowing the manipulation and use in tropical maize breeding programs.Mapas genéticos saturados são utilizados para um eficiente mapeamento de caracteres de interesse agronômico (QTL) e nos programas de seleção assistida. Este trabalho gerou um mapa genético saturado utilizando 139 marcadores moleculares do tipo microssatélites em 256 plantas F2 geradas pelo cruzamento de duas linhagens de milho tropical (L-02-03D e L-20-01F). O mapa obtido teve uma extensão total de 1.858,61 cM, ao longo de 10 grupos de ligação, com intervalo médio entre os marcadores de 13,47 cM. Setenta e nove percento dos "bins" do mapa genético de milho foram cobertos, com um acréscimo de 14% de cobertura em relação aos mapas de milho publicados. Os resultados mostram um mapa genético mais detalhado e informativo em uma população de milho tropical representando uma primeira etapa que possibilitará desenvolver estudos da arquitetura genética para a identificação e mapeamento de QTL e a estimativa de seus efeitos sobre a variação de um caráter quantitativo, permitindo assim a sua manipulação e utilização em programas de melhoramento do milho.Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq

Microsatellite-dense genetic map: towards genome coverage in a tropical maize (Zea mays L.) population

Dense molecular genetic maps are used for an efficient quantitative trait loci (QTL) mapping and in the marker-assisted selection programs. A dense genetic map was generated with 139 microsatellite markers using 256 F2 plants generated by the crossing of two tropical maize inbred lines (L-02-03D and L-20-01F). This map presented 1,858.61 cM in length, where 10 linkage groups were found spanned, with an average interval of 13.47 cM between adjacent markers. Seventy seven percent of the maize genetic mapping bins were covered, which means an increase of 14% coverage in relation to the previous tropical maize maps. The results provide a more detailed and informative genetic map in a tropical maize population representing the first step to make possible the studies of genetic architecture to identify and map QTL and estimate their effects on the variation of quantitative traits, thus allowing the manipulation and use in tropical maize breeding programs.Mapas genéticos saturados são utilizados para um eficiente mapeamento de caracteres de interesse agronômico (QTL) e nos programas de seleção assistida. Este trabalho gerou um mapa genético saturado utilizando 139 marcadores moleculares do tipo microssatélites em 256 plantas F2 geradas pelo cruzamento de duas linhagens de milho tropical (L-02-03D e L-20-01F). O mapa obtido teve uma extensão total de 1.858,61 cM, ao longo de 10 grupos de ligação, com intervalo médio entre os marcadores de 13,47 cM. Setenta e nove percento dos "bins" do mapa genético de milho foram cobertos, com um acréscimo de 14% de cobertura em relação aos mapas de milho publicados. Os resultados mostram um mapa genético mais detalhado e informativo em uma população de milho tropical representando uma primeira etapa que possibilitará desenvolver estudos da arquitetura genética para a identificação e mapeamento de QTL e a estimativa de seus efeitos sobre a variação de um caráter quantitativo, permitindo assim a sua manipulação e utilização em programas de melhoramento do milho.Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq