Automatic Mapping of the Lava Flows at Piton de la Fournaise Volcano, by Combining Thermal Data in Near and Visible Infrared

International audienc

Легенди та перекази кінця ХVI - початку ХVІІ ст. в записах Петра Могили

For the first time in the history of the Ukrainian folkloristics the author researches the records of legends made by sanctifier Petro Mohyla at the beginning of the 17th century mainly in Kyiv suburbs. The author focuses on authenticity of the texts, their links to the traditional legendry and hagiography as well as methods of recording

Genome-Wide Survey for Biologically Functional Pseudogenes

According to current estimates there exist about 20,000 pseudogenes in a mammalian genome. The vast majority of these are disabled and nonfunctional copies of protein-coding genes which, therefore, evolve neutrally. Recent findings that a Makorin1 pseudogene, residing on mouse Chromosome 5, is, indeed, in vivo vital and also evolutionarily preserved, encouraged us to conduct a genome-wide survey for other functional pseudogenes in human, mouse, and chimpanzee. We identify to our knowledge the first examples of conserved pseudogenes common to human and mouse, originating from one duplication predating the human–mouse species split and having evolved as pseudogenes since the species split. Functionality is one possible way to explain the apparently contradictory properties of such pseudogene pairs, i.e., high conservation and ancient origin. The hypothesis of functionality is tested by comparing expression evidence and synteny of the candidates with proper test sets. The tests suggest potential biological function. Our candidate set includes a small set of long-lived pseudogenes whose unknown potential function is retained since before the human–mouse species split, and also a larger group of primate-specific ones found from human–chimpanzee searches. Two processed sequences are notable, their conservation since the human–mouse split being as high as most protein-coding genes; one is derived from the protein Ataxin 7-like 3 (ATX7NL3), and one from the Spinocerebellar ataxia type 1 protein (ATX1). Our approach is comparative and can be applied to any pair of species. It is implemented by a semi-automated pipeline based on cross-species BLAST comparisons and maximum-likelihood phylogeny estimations. To separate pseudogenes from protein-coding genes, we use standard methods, utilizing in-frame disablements, as well as a probabilistic filter based on Ka/Ks ratios

Variabilidade espacial de atributos físicos de um latossolo vermelho-amarelo, sob lavoura cafeeira

O conhecimento da variabilidade dos atributos físicos do solo é importante para o monitoramento da qualidade do solo, pois eles estão diretamente relacionados com a sustentabilidade da produção agrícola. Este estudo teve como objetivos avaliar e identificar as estruturas de dependência espacial, por meio da construção de semivariogramas, num Latossolo Vermelho-Amarelo (LVA), sob lavoura cafeeira; caracterizar as distribuições espaciais dos atributos físicos pela krigagem ordinária; e identificar a camada com maior impedimento físico. O experimento foi conduzido num LVA textura muito argilosa na Fazenda da Empresa de Pesquisa Agropecuária de Minas Gerais, em Patrocínio, MG. A amostragem foi realizada em trincheiras confeccionadas nas intersecções de uma malha retangular de 40 x 150 m, perfazendo um total de 28 pontos, de onde foram coletadas amostras indeformadas em anéis metálicos de 2,54 cm de altura e 6,30 cm de diâmetro, com auxílio do amostrador tipo Uhland. Cada trincheira possuía três degraus de 2,0 x 1,5 m de superfície, nas camadas de 0,00; 0,10; e 0,25 m, onde se coletaram sete amostras indeformadas em cada degrau, dispostas em forma matricial, totalizando 588 amostras. Os atributos físicos do solo apresentaram estrutura de dependência espacial em todas as camadas, exceto a porosidade total. A técnica de krigagem ordinária demonstrou ser alternativa viável para a estimativa de dados em pontos não amostrados na área experimental. A camada de 0,00-0,03 m apresentou maior impedimento físico ao crescimento de raízes, por apresentar maior densidade e menor macroporosidade do solo