Reconstructing terrestrial nutrient cycling using stable nitrogen isotopes in wood

Although recent anthropogenic effects on the global nitrogen (N) cycle have been significant, the consequences of increased anthropogenic N on terrestrial ecosystems are unclear. Studies of the impact of increased reactive N on forest ecosystems—impacts on hydrologic and gaseous loss pathways, retention capacity, and even net primary productivity— have been particularly limited by a lack of long-term baseline biogeochemical data. Stable nitrogen isotope analysis (ratio of ¹⁵N to ¹⁴N, termed δ¹⁵N) of wood chronologies offers the potential to address changes in ecosystem N cycling on millennial timescales and across broad geographic regions. Currently, nearly 50 studies have been published utilizing wood δ¹⁵N records; however, there are significant differences in study design and data interpretation. Here, we identify four categories of wood δ¹⁵N studies, summarize the common themes and primary findings of each category, identify gaps in the spatial and temporal scope of current wood δ¹⁵N chronologies, and synthesize methodological frameworks for future research by presenting eight suggestions for common methodological approaches and enhanced integration across studies. Wood δ¹⁵N records have the potential to provide valuable information for interpreting modern biogeochemical cycling. This review serves to advance the utility of this technique for long-term biogeochemical reconstructions

A degenerate primer MOB typing (DPMT) method to classify gamma-proteobacterial plasmids in clinical and environmental settings

Transmissible plasmids are responsible for the spread of genetic determinants, such as antibiotic resistance or virulence traits, causing a large ecological and epidemiological impact. Transmissible plasmids, either conjugative or mobilizable, have in common the presence of a relaxase gene. Relaxases were previously classified in six protein families according to their phylogeny. Degenerate primers hybridizing to coding sequences of conserved amino acid motifs were designed to amplify related relaxase genes from γ-Proteobacterial plasmids. Specificity and sensitivity of a selected set of 19 primer pairs were first tested using a collection of 33 reference relaxases, representing the diversity of γ-Proteobacterial plasmids. The validated set was then applied to the analysis of two plasmid collections obtained from clinical isolates. The relaxase screening method, which we call "Degenerate Primer MOB Typing" or DPMT, detected not only most known Inc/Rep groups, but also a plethora of plasmids not previously assigned to any Inc group or Rep-type

Effect of water stress on Berkane clementine yield and fruits quality: Towards a precision citrus growing

Cette étude consiste à identifier la quantité d’eau d’irrigation optimale pour assurer une meilleure productivité du clémentinier de Berkane en utilisant la méthode d’irrigation déficitaire continue. Trois doses d’irrigation réduites par rapport à un témoin ont été étudiées. Dans le cas du témoin, la quantité d'eau d’irrigation utilisée est estimée à partir de l’évapotranspiration de référence moyenne historique de la région et mise à jour à partir des données climatiques de la saison en cours (stratégie de l’agriculteur). Les trois doses étudiées correspondent à 80%, 60% et 50% de celle utilisée pour le témoin. Les résultats présentés dans cet article sont obtenus à partir d’expérimentations réalisées en plein champs au niveau d’un jeune verger d’agrumes dans la plaine de Triffa (province de Berkane) pendant deux campagnes contrastées en termes de la pluviométrie : une campagne pluvieuse (2017-2018) et une autre au-dessous de la moyenne (2018-2019). Les résultats obtenus montrent que la réduction de la dose de l’irrigation a un effet significatif sur les différentes variables étudiées (rendement par arbre, poids et calibre du fuit, jus produit et taux de sucre). La réduction de 20% de la dose d’irrigation par rapport au témoin n’a pas d’effet significatif sur les variables précitées. Cette étude montre aussi que la sécheresse de la campagne agricole affecte le calibre du fruit malgré la stratégie de l’agrumiculteur qui consiste à augmenter la dose d’irrigation pendant les mois d’avril, mai, juin et juillet. Cette stratégie doit donc être revue pour éviter les pertes dues aux écarts de triage au niveau des stations de conditionnement. Le control continu de l’humidité du sol au niveau de la zone racinaire des arbres et l’exploitation des nouvelles solutions offertes par l’agriculture de précision devraient aider les agrumiculteurs à améliorer leurs stratégies de prise de décision.This study consists on identifying the optimal amount of irrigation water to ensure better productivity of Berkane clementine by using deficit irrigation method. Three degrees of irrigation restriction, compared to a control one, were studied. The amount of irrigation water used in the control treatment is estimated from the historical average reference evapotranspiration of the region, updated from the climate data of the current season (farmer's strategy). The amounts of irrigation water used for the three other treatments correspond to 80%, 60% and 50% of that used for the control. Presented results were obtained from an experimental study carried out on a young citrus orchard in Triffa plain (province of Berkane, Morocco) during two contrasting campaigns in term of annual rainfall: Rainy season (2017-2018) and dry season (2018 -2019). Obtained results showed that the amount of irrigation water has a significant effect on the different studied variables (yield, weight of the fruit, produced juice and total soluble solids). Also, reducing the amount of irrigation water by 20% compared to the control had no significant effect on the above-mentioned variables. Finally, this study showed that drought affects the size of the fruit despite the citrus grower's strategy contesting to increase the amount of irrigation water during the period of April-July. This strategy should therefore be reviewed to avoid losses due to fruits size at the packing stations. Continuous monitoring of soil moisture in the trees root zone and the exploitation of the new solutions offered by smart agriculture should help citrus growers to improve their decision-making strategies

Effet du régime hydrique sur le rendement et la qualité de la clémentine de Berkane: vers une agrumiculture de précision

This study consists on identifying the optimal amount of irrigation water to ensure better productivity of Berkane clementine by using deficit irrigation method. Three degrees of irrigation restriction, compared to a control one, were studied. The amount of irrigation water used in the control treatment is estimated from the historical average reference evapotranspiration of the region, updated from the climate data of the current season (farmer's strategy). The amounts of irrigation water used for the three other treatments correspond to 80%, 60% and 50% of that used for the control. Presented results were obtained from an experimental study carried out on a young citrus orchard in Triffa plain (province of Berkane, Morocco) during two contrasting campaigns in term of annual rainfall: Rainy season (2017-2018) and dry season (2018 -2019). Obtained results showed that the amount of irrigation water has a significant effect on the different studied variables (yield, weight of the fruit, produced juice and total soluble solids). Also, reducing the amount of irrigation water by 20% compared to the control had no significant effect on the above-mentioned variables. Finally, this study showed that drought affects the size of the fruit despite the citrus grower's strategy contesting to increase the amount of irrigation water during the period of April-July. This strategy should therefore be reviewed to avoid losses due to fruits size at the packing stations. Continuous monitoring of soil moisture in the trees root zone and the exploitation of the new solutions offered by smart agriculture should help citrus growers to improve their decision-making strategies.Cette étude consiste à identifier la quantité d’eau d’irrigation optimale pour assurer une meilleure productivité du clémentinier de Berkane en utilisant la méthode d’irrigation déficitaire continue. Trois doses d’irrigation réduites par rapport à un témoin ont été étudiées. Dans le cas du témoin, la quantité d'eau d’irrigation utilisée est estimée à partir de l’évapotranspiration de référence moyenne historique de la région et mise à jour à partir des données climatiques de la saison en cours (stratégie de l’agriculteur). Les trois doses étudiées correspondent à 80%, 60% et 50% de celle utilisée pour le témoin. Les résultats présentés dans cet article sont obtenus à partir d’expérimentations réalisées en plein champs au niveau d’un jeune verger d’agrumes dans la plaine de Triffa (province de Berkane) pendant deux campagnes contrastées en termes de la pluviométrie : une campagne pluvieuse (2017-2018) et une autre au-dessous de la moyenne (2018-2019). Les résultats obtenus montrent que la réduction de la dose de l’irrigation a un effet significatif sur les différentes variables étudiées (rendement par arbre, poids et calibre du fuit, jus produit et taux de sucre). La réduction de 20% de la dose d’irrigation par rapport au témoin n’a pas d’effet significatif sur les variables précitées. Cette étude montre aussi que la sécheresse de la campagne agricole affecte le calibre du fruit malgré la stratégie de l’agrumiculteur qui consiste à augmenter la dose d’irrigation pendant les mois d’avril, mai, juin et juillet. Cette stratégie doit donc être revue pour éviter les pertes dues aux écarts de triage au niveau des stations de conditionnement. Le control continu de l’humidité du sol au niveau de la zone racinaire des arbres et l’exploitation des nouvelles solutions offertes par l’agriculture de précision devraient aider les agrumiculteurs à améliorer leurs stratégies de prise de décision