Genome of the Avirulent Human-Infective Trypanosome—Trypanosoma rangeli

Background: Trypanosoma rangeli is a hemoflagellate protozoan parasite infecting humans and other wild and domestic mammals across Central and South America. It does not cause human disease, but it can be mistaken for the etiologic agent of Chagas disease, Trypanosoma cruzi. We have sequenced the T. rangeli genome to provide new tools for elucidating the distinct and intriguing biology of this species and the key pathways related to interaction with its arthropod and mammalian hosts.  Methodology/Principal Findings: The T. rangeli haploid genome is ,24 Mb in length, and is the smallest and least repetitive trypanosomatid genome sequenced thus far. This parasite genome has shorter subtelomeric sequences compared to those of T. cruzi and T. brucei; displays intraspecific karyotype variability and lacks minichromosomes. Of the predicted 7,613 protein coding sequences, functional annotations could be determined for 2,415, while 5,043 are hypothetical proteins, some with evidence of protein expression. 7,101 genes (93%) are shared with other trypanosomatids that infect humans. An ortholog of the dcl2 gene involved in the T. brucei RNAi pathway was found in T. rangeli, but the RNAi machinery is non-functional since the other genes in this pathway are pseudogenized. T. rangeli is highly susceptible to oxidative stress, a phenotype that may be explained by a smaller number of anti-oxidant defense enzymes and heatshock proteins.  Conclusions/Significance: Phylogenetic comparison of nuclear and mitochondrial genes indicates that T. rangeli and T. cruzi are equidistant from T. brucei. In addition to revealing new aspects of trypanosome co-evolution within the vertebrate and invertebrate hosts, comparative genomic analysis with pathogenic trypanosomatids provides valuable new information that can be further explored with the aim of developing better diagnostic tools and/or therapeutic targets

Increasing the digestible methionine plus cystine to digestible lysine ratio of finishing pigs fed ractopamine

O experimento foi realizado com o objetivo de determinar a relação metionina mais cistina digestível/lisina digestível (Met+Cis/Lis) em suínos machos castrados suplementados com ractopamina (RAC), selecionados geneticamente para deposição de carne magra na carcaça, na fase de terminação. Foram utilizados 80 suínos machos castrados de alto potencial genético para deposição de carne magra na carcaça, com peso inicial de 84,64±1,28 kg, distribuídos em delineamento experimental de blocos ao acaso composto de cinco tratamentos, oito repetições e dois animais por unidade experimental, durante um período de 28 dias. O peso dos suínos foi adotado como critério na formação dos blocos. Os tratamentos foram constituídos de rações contendo 0,936% de lisina digestível (Lis), suplementadas (5 ppm) com ractopamina (RAC), com os níveis de 54; 58; 62; 66% de metionina + cistina digestível (Met+Cis) em relação à lisina digestível, correspondendo aos seguintes níveis de Met+Cis nas rações, 0,505; 0,543; 0,580; 0,617% e a dieta controle com 0,736% de Lis sem suplementação de ractopamina, com o nível de 62% de Met+Cis em relação à Lis, correspondendo ao nível de Met+Cis na ração de 0,456%. As relações Met+Cis/Lis não influenciaram o consumo de ração (CR), a conversão alimentar (CA) e o ganho de peso diário (GPD) dos suínos que consumiram dietas suplementadas com RAC. O maior índice de rentabilidade foi verificado em suínos suplementados com RAC e relação 0,54 Met+Cis/Lis. Os suínos suplementados com RAC obtiveram peso final de 2,30 kg a mais que os animais não suplementados com RAC, correspondendo a uma melhora de aproximadamente 2%. O GPD dos animais aumentou em 10%, enquanto a CA melhorou em 13% nos suínos suplementados com RAC. A suplementação de RAC não influenciou o CR dos animais. Em animais suplementados com RAC as relações Met+Cis/Lis não influenciaram a espessura de toucinho (ET), a quantidade de carne magra (QCM), o peso da carcaça (PC), a porcentagem de carne magra (PCM) e o rendimento de carcaça (RC). As relações Met+Cis/Lis influenciaram (P<0,01) a concentração de colesterol total no lombo de forma quadrática segundo a equação Y = -227,02+ 967,45X - 835,94X², (R² = 0,99) em que o menor teor de colesterol total foi verificado nos suínos alimentados com dietas na relação 0,66 Met+Cis/Lis, mas as concentrações de colesterol total no músculo Longissimus dorsi (lombo) e no toucinho não foram influenciadas pela suplementação de RAC nas dietas. A suplementação de RAC na dieta melhorou a QCM dos animais em aproximadamente 6% comparado aos suínos não suplementados com RAC. Os terminados suplementados com RAC apresentaram aumento de aproximadamente 4% no PC e 2% no RC quando comparado aos animais que não receberam RAC na ração. A suplementação de RAC não influenciou a ET e nem a PCM dos animais. Conclui-se que a relação 0,54 Met+Cis/Lis, atende as exigências de suínos em terminação de 85 aos 109 kg suplementados com ractopamina para melhor desempenho, características de carcaça e viabilidade econômica. A relação 0,66 Met+Cis/Lis proporciona a menor concentração de colesterol total no lombo e no toucinho de suínos em terminação suplementados com ractopamina.The purpose of this study was to determine the digestible methionine plus cystine to digestible lysine ratio (Met+Cys/Lys) for barrows with high genetic potential for lean gain fed ractopamine (RAC) in finishing phase. Eighty barrows with an average initial body weight of 84.64±1.28 kg were allotted to dietary treatment on the basis of weight in randomized complete block design. Dietary treatments included a basal diet containing RAC (5 ppm) plus DL-Met, resulting in treatment diets containing Met+Cys/Lys of 0.54, 0.58, 0.62, 0.66 and a diet without RAC containing Met+Cys/Lys of 0.62, control (CONT). There were eight replications of barrows with two pigs per replicate during 28 days. Increasing the Met+Cys/Lys had no effects on average daily feed intake (ADFI), feed: gain ratio (F/G) and average daily gain (ADG) of pigs fed RAC. Barrows fed RAC and Met+Cys/Lys of 0.54 had the highest profitability index. The end weight of RAC-treated pigs was 2% higher compared to CONT pigs (by 2.3 kg). The RAC increased ADG by 10% and improved F/G by 13% compared to control pigs, but there were no differences in ADFI. Increasing the Met+Cys/Lys had no effects on fat depth (FD), fat-free lean mass (FFLM), carcass weight (CW), fat-free lean percentage (FFLP) and dressing (DR) for pigs fed RAC. The digestible methionine + cystine of the diet influenced in a quadratic way the cholesterol concentration, Y = -227,1900+ 9,6809X - 0,0837X², (R² = 0,99), being the Met+Cys/Lys of 0.66 for minimum cholesterol concentration, but the RAC had no effects on cholesterol concentration in muscle (Longissimus dorsi) and fat. The RAC increased FFLM by 6%, CW by 4% and DR by 2% compared to control pigs. However, the RAC had no effects on FD and FFLP of barrows. Thus, the optimum Met+Cys/Lys which will achieve maximal growth performance, carcass characteristics and economic return of finishing pigs (from 85 to 109 kg) fed RAC is 0.54. However, to minimize cholesterol concentration in muscle and fat the optimum Met+Cys/Lys is 0.66.Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superio

Effect of nutritional strategies on performance and nutrient excretion of pigs from 30 to 100 kg

Quatro experimentos foram conduzidos, sendo um de desempenho e três de metabolismo com o objetivo de avaliar os efeitos de diferentes estratégias nutricionais sobre os parâmetros de desempenho, características de carcaça, retenção e excreção de nutrientes e rendimento econômico em suínos dos 30 aos 100 kg de peso. Os tratamentos usados foram: dieta controle = dieta com alta proteína bruta sem aminoácidos industriais; dieta baixa PB= dieta com baixa proteína bruta com aminoácidos industriais; dieta fitase = dieta controle com suplementação de fitase; dieta orgânica = dieta controle suplementada com minerais inorgânico-orgânicos e dieta composta = dieta com baixa proteína bruta suplementada com aminoácidos industriais, fitase e minerais inorgânico-orgânicos. No experimento de desempenho foram utilizados 120 suínos, distribuídos em delineamento experimental de blocos ao acaso, com cinco tratamentos, quatro blocos contendo duas repetições por bloco e três animais por unidade experimental, sendo dois machos e uma fêmea. Nos experimentos de metabolismo foram utilizados 20 animais em cada um dos três experimentos (crescimento 1, crescimento 2 e terminação). Os animais foram alojados individualmente, em gaiolas de metabolismo, distribuídos em blocos casualizados, com cinco tratamentos, quatro blocos contendo uma repetição por bloco e um suíno por unidade experimental e a quantidade de ração fornecida a cada animal foi determinada em função do peso metabólico. A partir da quantidade de nutrientes ingerida e da excretada nas fezes e urina determinou-se o balanço de N, P e Ca e a excreção de Cu, Zn e Mn. As dietas avaliadas, baixa PB, fitase, orgânica e composta não alteraram o ganho de peso diário, o consumo de ração médio diário a conversão alimentar e as características de carcaça dos suínos em comparação com os suínos alimentados com a dieta controle. A dieta composta propiciou maior retorno econômico que a dieta controle. Conclui-se que a redução de proteína bruta, a suplementação com fitase e minerais inorgânico-orgânicos podem ser adotadas por não alterar significativamente o desempenho nas fases de crescimento e terminação e as características de carcaças aos 100 kg, enquanto, a dieta composta proporciona maior retorno econômico que a dieta controle em suínos dos 30 aos 100 kg. A redução da proteína bruta da dieta diminui a excreção total de N em suínos dos 30 aos 100 kg. A suplementação de dietas com fitase reduz a excreção total de P em todas as fases avaliadas. A inclusão de minerais inorgânico-orgânicos nas dietas não reduz a excreção de Cu, Zn e Mn em nenhum dos períodos avaliados. A dieta composta reduz a excreção total de N entre 30 e 100 kg, a excreção de Cu, Zn e Mn entre 30 e 50 kg e também diminui a excreção total de P em todas as fases avaliadas.Four experiments were conducted, one about performance and three about metabolism in order to evaluate the effects of different nutritional strategies on performance parameters, carcass characteristics, retention and excretion of nutrients and economic performance in pigs from 30 to 100 kg. The diets were formulated according to the phase, 30-50 kg, 50-70 kg and 70-100 kg. Treatments were: control diet = basal diet without synthetic amino acids; low crude protein diet = diet with low protein by synthetic amino acid supplementation; phytase diet = supplementation with phytase, organic diet = control supplemented with inorganic-organic minerals and combination diet= diet with low protein supplemented with phytase and inorganic-organic minerals. In the performance trial 120 pigs were used distributed in a randomized block design, with five treatments, four blocks containing two replicates per block and three animals per experimental unit, two males and one female. In metabolism experiments were used 20 animals in each experiment (growth phase I, growth phase II and finishingphase). The animals were housed individually in metabolism cages, distributed in a randomized block design with five treatments, four blocks containing one repetition per block, a pig by the experimental unit and the quantity of feed supplied to each animal was determined according to their metabolic weight. According to amount of nutrients ingested and excreted in faeces and urine was possible to find the balance of N, P and Ca and excretion of Cu, Zn and Mn. The diets evaluated, low CP, phytase, organic and combination did not alter the daily weight gain, daily feed intake, feed conversion and carcass traits of pigs compared with pigs fed the control diet. The economic return was greater with diet combination than the control diet. It is concluded that the reduction of crude protein, supplementation with phytase and inorganic-organic minerals can be adopted without changing significantly the performance during the growing-finishing phase and carcass traits at 100 kg, whereas the combination diet provides greater economic return than the control diet in pigs from 30 to 100 kg in weight. The reduction of crude protein diet decreases the excretion of total N in pigs from 30 to 100 kg. Supplementation of diets with phytase reduces the total excretion of P in all phases. The inclusion of inorganic-organic minerals in the diet does not reduce the excretion of Cu, Zn and Mn. The combination diet reduces total N excretion from 30 to 100 kg, the excretion of Cu, Zn and Mn between 30 and 50 kg and also decreases the excretion of total P in all evaluated phases.Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superio

Hidrolisado de mucosa intestinal de suínos em substituição ao plasma sangüíneo em dietas para leitões de 21 a 49 dias

Um experimento foi conduzido para avaliar o efeito da substituição parcial ou total do plasma sangüíneo por hidrolisado de mucosa intestinal de suínos (HI) em dietas para leitões de 21 a 49 dias. Cento e quarenta leitões desmamados aos 21,7 ± 2,9 dias com peso médio de 5,54 ± 0,65 kg foram distribuídos em um delineamento experimental de blocos ao acaso, com cinco tratamentos, sete repetições e quatro animais por unidade experimental. O experimento foi dividido nas fases de 21 a 35 dias e de 36 a 49 dias de idade. Os tratamentos consistiram de uma dieta com plasma e de quatro dietas contendo diferentes níveis dos produtos HI 50 e HI 62 em substituição ao plasma. A substituição parcial ou total do plasma pelos produtos HI 50 e HI 62 não resultou em diferenças no consumo médio diário, no ganho de peso médio diário e na conversão alimentar de leitões nos períodos avaliados. Os pesos absoluto e relativo das vísceras funcionais não foram afetados pelos tratamentos. Não houve efeito das dietas sobre as características de integridade intestinal no duodeno, jejuno e íleo de leitões com 35 dias de idade. Os produtos HI 50 e HI 62 podem substituir total ou parcialmente o plasma em rações para leitões de 21 a 49 dias de idade sem efeitos significativos.A trial was conduced to evaluate the effect partial or total substitution of blood plasma for hydrolyzed of intestinal mucosa of swine (HI) in diets of pigs from 21 to 49 days of age. A total of 140 piglets weaned at 21.7 ± 2.9 days of age with average weight of 5.54 ± 0.65 kg were allotted to a randomized experimental block design, with five treatments, seven replications of four animals per experimental unit. The experiment was divided in the phases from 21 to 35 days and from 36 to 49 days of age. The treatments consisted of a diet with plasma and four diets with different levels of HI 50 and HI 62 products in substitution of plasma. The partial or total plasma substitution for HI 50 and HI 62 products did not result in differences for average daily feed intake, average daily weight gain and feed:gain ratio of piglets in the evaluated periods. The absolute and relative weight of the functional viscera was not affected by treatments. There were not effects of the treatments on the characteristics of intestinal integrity in the duodenum, jejunum and ileum of piglets with 35 days of age. The products HI 50 and HI 62 could substitute total or partially the plasma in diets of pigs from 21 to 49 days of age without significant effects

Digestible tryptophan-to-digestible lysine ratio in diets for laying hens of 42 to 58 weeks of age

SUMMARY To determine the ideal digestible tryptophan-to-digestible lysine ratio in diets for laying hens of 42 to 58 weeks of age, 240 Hy-Line W-36 hens at 42 weeks of age were distributed in a completely randomized design with five treatments, eight replicates and six birds per experimental unit. At 42 weeks of age, the birds were subjected to experimental treatments that consisted of diets with equal amounts of nutrients, except for the digestible tryptophan level. The digestible tryptophan levels in the experimental diets were 0.149, 0.160, 0.171, 0.182 and 0.193%, generating digestible tryptophan-to-digestible lysine ratios of 21.5, 23.1, 24.6, 26.2 and 27.8%. The digestible lysine level in the diets was sub-optimal (0.694%). The same ratios between lysine and the other amino acids were maintained in all experimental diets. The ideal digestible tryptophan-to-digestible lysine ratio was estimated through the studied parameters using analysis of variance and polynomial regression analysis (&#945; = 0.05). The digestible tryptophan-to-digestible lysine ratio in diets quadratically affected egg production, egg mass, feed conversion per egg mass and use efficiency of digestible lysine for egg mass. However, there were no effect (P>0.05) on egg weight, feed conversion per dozen eggs, use efficiency of digestible lysine for number of eggs produced, percentage of egg components and weight gain. The digestible tryptophan-to-digestible lysine ratio estimated for theses parameters ranged from 23.6 to 24.3%. The digestible tryptophan-to-digestible lysine ratio recommended in diets for laying hens of 42 to 58 weeks of age is 24.3%

Avaliação de ácidos orgânicos em dietas para leitões de 21 a 49 dias de idade

Objetivou-se estudar os efeitos da proporção crescente de ácidos orgânicos na dieta sobre o desempenho e a incidência de diarréia em leitões no período de 21 a 49 dias de idade. Os tratamentos foram constituídos de uma dieta basal e três dietas suplementadas com 0,78; 0,84; e 0,90% (21 a 35 dias de idade) e 0,59; 0,63; e 0,66% (36 a 49 dias de idade) de ácidos orgânicos à base de ácido láctico. Avaliaram-se o consumo de ração médio diário (CRMD), o ganho de peso médio diário (GPMD), a conversão alimentar (CA) e o escore fecal dos leitões. O CRMD e o GPMD não variaram entre as proporções de ácidos orgânicos nos períodos avaliados. A CA dos leitões que receberam 0,84% de ácidos orgânicos foi melhor que a daqueles que receberam as dietas basal e com 0,90% de ácido no período de 21 a 35 dias. Os leitões que receberam 0,84% de ácidos apresentaram menor escore fecal em relação aos alimentados com 0,90%. Amostras de sangue foram coletadas para dosar a concentração plasmática de ácido láctico de leitões aos 35 dias. A concentração de ácido láctico dos animais que receberam 0,90% de ácido aumentou em 60,61% em relação à do grupo da dieta basal. Isolaram-se bactérias das fezes dos animais para identificação de microrganismos. As proporções de 0,84 e 0,63% de ácidos orgânicos, respectivamente, nas fases de 21 a 35 e de 36 a 49 dias foram mais eficientes, considerando-se que não foram isoladas as bactérias E. coli a-hemólise e Streptococcus sp. A utilização de 0,84% de ácidos orgânicos na dieta proporcionou melhor conversão alimentar no período de 21 a 35 dias de idade e melhor consistência de fezes e controle de E. coli a-hemólise e Streptococcus sp com a suplementação de 0,84% de ácidos no período de 21 a 35 dias e de 0,63% no período de 36 a 49 dias

Níveis de ácido fólico em dietas contendo ácido fórmico para leitões de 21 a 48 dias de idade

Foi conduzido um experimento com o objetivo de avaliar níveis de ácido fólico em dietas suplementadas com ácido fórmico para leitões de 21 a 48 dias de idade. Foram utilizados 160 leitões de 5,67 ± 0,90 kg, em um delineamento experimental de blocos casualizados, com cinco tratamentos, oito repetições e quatro animais por repetição. Formularam-se duas dietas basais, pré-inicial I (21 a 35 dias) e pré-inicial II (36 a 48 dias), balanceadas para atender às exigências nutricionais dos animais e adicionadas de ácido fórmico em 0,24 e 0,20%, respectivamente. Os tratamentos consistiram de cinco níveis de ácido fólico: 0; 0,30; 0,60; 0,90 e 1,20 mg/kg de ração. O desempenho dos leitões foi avaliado nos períodos de 21 a 35, 36 a 48 e 21 a 48 dias de idade. No 49º dia, os animais submetidos a jejum e oito leitões por tratamento foram destinados à coleta de sangue, para confecção de hemograma e quantificação de folato. Não houve efeito dos níveis de ácido fólico sobre o consumo médio diário de ração (CMDR) em nenhum dos períodos analisados. A adição de ácido fólico melhorou o ganho de peso médio diário de forma quadrática, enquanto a conversão alimentar foi influenciada pelos níveis de ácido fólico apenas no período de 21 a 35 dias. Os valores de hematócrito, hemoglobina e hemácias aumentaram de forma linear conforme os níveis de ácido fólico. Os valores de folato sérico diminuíram com o aumento de ácido fólico na dieta. Dietas com ácido fórmico para leitões de 21 a 48 dias de idade devem ser suplementadas com 0,64 mg de ácido fólico por kg de ração