Acquisition et structuration des connaissances en corpus : éléments méthodologiques

Projet DIALOGUECe document présente une expérimentation réalisée dans le domaine de l'agriculture. Les travaux ont été menés dans le cadre du projet ILC sur l'analyse de l'information. L'objectif de cette expérimentation est de montrer comment l'exploitation de modules automatiques de traitement de la langue basés sur la terminologie peuvent être combinés avec des modules de classification pour faire émerger de corpus volumineux de textes, des classes de termes. Ces classes sont interprétables et instancient des modèles abstraits de connaissance du domaine de spécialité que nous avons retrouvés manuellement. Nous avons traité un corpus de 1386 résumés de notices bibliographiques en anglais. La chaîne linguistique opère également sur le français

Early environmental conditions shape personality types in a jumping spider

Individuals of many species across the animal kingdom are found to be less plastic than expected, even in behavioral traits. The existence of consistent behavioral differences between individuals, termed personality differences, is puzzling, since plastic behavior is considered ideal to enable animals to adaptively respond to changes in environmental conditions. In order to elucidate which mechanisms are important for the evolution of personality differences, it is crucial to understand which aspects of the environment are important for the development of personality differences. Here, we tested whether physical or social aspects of the environment during development influence individual differentiation (mean level of behavior) using the jumping spider Marpissa muscosa. Furthermore, we assessed whether those behaviors were repeatable, i.e. whether personalities existed. We applied a split-brood design and raised spider siblings in three different environments: a deprived environment with no enrichment, a socially and a physically enriched environment. We focused on exploratory behavior and repeatedly assessed individual behavior in a novel environment and a novel object test. Results show that the environment during development influenced spiders’ exploratory tendencies: spiders raised in enriched environments tended to be more exploratory. Most investigated behaviors were repeatable (i.e. personalities existed) across all individuals tested, whereas only few behaviors were also repeatable across individuals that had experienced the same environmental condition. Taken together, our results indicate that external stimuli can influence the development of one aspect of personality, the inter-individual variation (mean level of behavior), in a jumping spider. We also found family by environment interactions on behavioral traits potentially suggesting genetic variation in developmental plasticity

Adaptive individual variation in phenological responses to perceived predation levels

The adaptive evolution of timing of breeding (a component of phenology) in response to environmental change requires individual variation in phenotypic plasticity for selection to act upon. A major question is what processes generate this variation. Here we apply multi-year manipulations of perceived predation levels (PPL) in an avian predator-prey system, identifying phenotypic plasticity in phenology as a key component of alternative behavioral strategies with equal fitness payoffs. We show that under low-PPL, faster (versus slower) exploring birds breed late (versus early);the pattern is reversed under high-PPL, with breeding synchrony decreasing in conjunction. Timing of breeding affects reproductive success, yet behavioral types have equal fitness. The existence of alternative behavioral strategies thus explains variation in phenology and plasticity in reproductive behavior, which has implications for evolution in response to anthropogenic change

Boldness is for rookies: prefight boldness and fighting success in a sea anemone

© 2017 The Association for the Study of Animal Behaviour Fighting experience (specifically winning or losing a fight) can significantly alter boldness, a component of resource-holding potential (RHP). Previous studies have shown that both the repeatability of boldness and mean-level boldness can be affected by fighting experience and that these effects are strongest in the recipients of agonistic behaviour. However, whether these postfight changes in boldness impact future contest success and whether subsequent contests further affect boldness remain unknown. Furthermore, little is known about the effects of the specific tactics used within a fight (within-fight experience) and how these might influence future fight performance and boldness. Here, we investigated the relationship between fighting success and boldness (measured as recovery time when startled) across repeated contests in the beadlet sea anemone, Actinia equina, measuring boldness on five occasions before, between and after two contests. We found that boldness (both repeatability and mean-level) was generally robust to the effects of fighting experience, apart from a decrease in the immediate boldness of losers after their second fight. Furthermore, we found that while prefight boldness significantly predicted fighting success and the level of aggression used in an individual's first fight, it did not predict victory or aggression in the second fight. Our findings thus indicate that different traits may be important in determining fighting success in consecutive fights and, moreover, that fighting experience may alter which traits contribute to an individual's RHP

Facteurs influençant la variation comportementales chez l'araignées sauteuses «Eris militaris» (Araneae: Salticidae) dans les vergers de pommiers

Behavioural differences between individuals are often consistent over time (personality traits) and correlated across multiple behavioural contexts (behavioural syndromes). These individual differences are ubiquitous across taxa and have far-reaching implications for ecology and evolution: determining the mechanisms maintaining them is central to behavioural ecology. These individual differences vary along ecological gradients and can be affected by human-induced environmental changes. Agroecosystems vary considerably in their intensity and frequency of human disturbances and are suitable systems to study alteration and modification of behavioural responses by individuals. Many beneficial arthropods, such as spiders, can be negatively affected by different management practices, notably the use of insecticides. In this thesis, I explore the determinants of individual behavioural variation in the context of agroecosystems, using the jumping spider Eris militaris (Araneae: Salticidae) as a model organism. My focus on spiders is motivated by their importance in agroecosystems as generalist predators. In addition, spider personality traits and behavioural syndromes are well described in the literature. I tested whether behavioural syndromes varied between populations with different histories of insecticidal exposure, how consistent behavioural correlations were through ontogeny and how sublethal exposure to insecticides disrupted behavioural consistency and correlations. I found evidence for differing behavioural syndromes between spider populations from insecticide-free and insecticide-treated apple orchards. Individuals with highest activity and voracity had low aggression and boldness in the insecticide-free population while aggressive and voracious individuals behaved less boldly in the insecticide-treated population. These two populations had differing age-structure as more juvenile stages were collected in the insecticide-treated population leading to investigate further the role of development in the generation of behavioural syndromes and consistent behavioural tendencies. When taking development into account, I found that behavioural tendencies were not strongly maintained over the course of ontogeny and only activity showed evidence of heritability and repeatability. I found strong evidence for ontogenic shifts in behavioural syndrome during the transition from subadult to adult stages, mediated by rearing environment and sex. Behavioural correlations were mostly underpinned by within-individual variation indicating high behavioural plasticity through ontogeny. These results confirm that the differences in syndrome structure found between the two apple orchard populations may in part be generated by ontogenic shifts and lower abundance of adult stages in the insecticide-treated population.I performed direct insecticidal exposure tests to determine the effects of sublethal disruption on the consistency and correlation of behavioural traits. Exposure to the organophosphate phosmet at a sublethal dose had a stronger effect on the repeatability of activity than on its average value, indicating that individuals react differently to insecticide exposure. I found strong alterations on the correlations between activity and prey capture that were more pronounced in females. This research provides an opportunity to bridge the gaps between animal personality, agroecology and ecotoxicology by focusing on suites of related traits that affect spider performance in agroecosystems.Les différences comportementales entre individus sont souvent stables au cours du temps (traits de personnalité) et en de multiples contextes (syndromes comportementaux). Ces différences sont communes à de nombreux taxons et ont de profondes implications pour l'écologie et l'évolution. Déterminer les mécanismes maintenant ces variations est un aspect central de l'écologie comportementale. Ces différences varient également le long de gradients écologiques et peuvent être affectées par les changements anthropiques.Les agroécosystèmes varient dans leur intensité et fréquence de perturbations humaines et sont des systèmes adéquats pour l'étude des altérations de la réponse comportementale des individus. De nombreux arthropodes, tels les araignées, sont affectés par les pratiques culturales, notamment par l'utilisation d'insecticides. Au cours de cette thèse, j'examine les facteurs déterminant la réponse comportementales des individus dans les agroécosystèmes à l'aide l'araignée sauteuse Eris militaris (Araneae : Salticidae). Mon intérêt pour les araignées en tant que système d'étude est motivé par leur rôle de prédateur généraliste en agroécosytèmes. De plus, les traits de personnalité et les syndromes comportementaux des araignées sont bien décrits dans la littérature. J'ai testé la présence de variations de syndromes comportementaux entre populations ayant différents niveaux d'exposition aux insecticides, la stabilité de ces corrélations au cours du développement ainsi que les effets d'une exposition sublétale sur la stabilité des traits comportementaux et leurs corrélations.J'ai mis en évidence la présence de syndromes comportementaux différents chez des populations non exposées et exposées aux insecticides en vergers de pommiers. Les individus les plus actifs et voraces ont fait preuve d'une agressivité et témérité réduite chez la population non-exposée tandis que les individus agressifs étaient également voraces dans le verger exposé mais avec une témérité diminuée. Ces deux populations ont montré des différences marquées dans leur structure démographique puisque seuls des stades juvéniles ont été collectés dans le vergers exposé aux insecticides. Ceci m'a conduit à étendre mon investigation au rôle joué par le développement dans la génération des syndromes comportementaux.En prenant en compte le développement, j'ai montré que les tendances comportementales étaient faiblement maintenues et seule l'activité a montré des preuves d'héritabilité et de répétabilité. J'ai également découvert la présence de changement ontogénique de syndromes comportementaux, variant selon l'environnement d'élevage et le sexe lors de la transition du stade subadulte à adulte. Les corrélations comportementales ont été majoritairement influencées par les variations intra-individuelles, suggérant une forte plasticité comportementale au cours du développement. Ces résultats confirment le fait que les différences de structure des syndromes comportementaux entre populations en vergers de pommiers sont en parti dues aux transitions ontogéniques et à une abondance réduite des stades adultes dans la population exposée aux insecticides.J'ai ensuite réalisé une expérience d'exposition directe aux insecticides afin de déterminer les effets d'une perturbation subléthale sur la stabilité des traits comportementaux et leurs corrélations. L'exposition à l'organophosphate phosmet a eu un plus grand effet sur la répétabilité de l'activité que sur sa moyenne, indiquant des réponses variables à l'exposition insecticide d'individus à individus. J'ai également observé une altération plus prononcée des corrélations comportementales entre traits relatifs à l'activité et la capture de proies chez les femelles.Ces recherches permettent de combiner les expertises relatives aux domaines de la personnalité animale, de l'agroécologie et de l'écotoxicologie en se focalisant sur des traits comportementaux affectant la performance des araignées dans les agroécosystèmes

Factors influencing behavioural variation in apple orchard populations of the jumping spider «Eris militaris» (Araneae: Salticidae)

Behavioural differences between individuals are often consistent over time (personality traits) and correlated across multiple behavioural contexts (behavioural syndromes). These individual differences are ubiquitous across taxa and have far-reaching implications for ecology and evolution: determining the mechanisms maintaining them is central to behavioural ecology. These individual differences vary along ecological gradients and can be affected by human-induced environmental changes. Agroecosystems vary considerably in their intensity and frequency of human disturbances and are suitable systems to study alteration and modification of behavioural responses by individuals. Many beneficial arthropods, such as spiders, can be negatively affected by different management practices, notably the use of insecticides. In this thesis, I explore the determinants of individual behavioural variation in the context of agroecosystems, using the jumping spider Eris militaris (Araneae: Salticidae) as a model organism. My focus on spiders is motivated by their importance in agroecosystems as generalist predators. In addition, spider personality traits and behavioural syndromes are well described in the literature. I tested whether behavioural syndromes varied between populations with different histories of insecticidal exposure, how consistent behavioural correlations were through ontogeny and how sublethal exposure to insecticides disrupted behavioural consistency and correlations. I found evidence for differing behavioural syndromes between spider populations from insecticide-free and insecticide-treated apple orchards. Individuals with highest activity and voracity had low aggression and boldness in the insecticide-free population while aggressive and voracious individuals behaved less boldly in the insecticide-treated population. These two populations had differing age-structure as more juvenile stages were collected in the insecticide-treated population leading to investigate further the role of development in the generation of behavioural syndromes and consistent behavioural tendencies. When taking development into account, I found that behavioural tendencies were not strongly maintained over the course of ontogeny and only activity showed evidence of heritability and repeatability. I found strong evidence for ontogenic shifts in behavioural syndrome during the transition from subadult to adult stages, mediated by rearing environment and sex. Behavioural correlations were mostly underpinned by within-individual variation indicating high behavioural plasticity through ontogeny. These results confirm that the differences in syndrome structure found between the two apple orchard populations may in part be generated by ontogenic shifts and lower abundance of adult stages in the insecticide-treated population.I performed direct insecticidal exposure tests to determine the effects of sublethal disruption on the consistency and correlation of behavioural traits. Exposure to the organophosphate phosmet at a sublethal dose had a stronger effect on the repeatability of activity than on its average value, indicating that individuals react differently to insecticide exposure. I found strong alterations on the correlations between activity and prey capture that were more pronounced in females. This research provides an opportunity to bridge the gaps between animal personality, agroecology and ecotoxicology by focusing on suites of related traits that affect spider performance in agroecosystems.Les différences comportementales entre individus sont souvent stables au cours du temps (traits de personnalité) et en de multiples contextes (syndromes comportementaux). Ces différences sont communes à de nombreux taxons et ont de profondes implications pour l'écologie et l'évolution. Déterminer les mécanismes maintenant ces variations est un aspect central de l'écologie comportementale. Ces différences varient également le long de gradients écologiques et peuvent être affectées par les changements anthropiques.Les agroécosystèmes varient dans leur intensité et fréquence de perturbations humaines et sont des systèmes adéquats pour l'étude des altérations de la réponse comportementale des individus. De nombreux arthropodes, tels les araignées, sont affectés par les pratiques culturales, notamment par l'utilisation d'insecticides. Au cours de cette thèse, j'examine les facteurs déterminant la réponse comportementales des individus dans les agroécosystèmes à l'aide l'araignée sauteuse Eris militaris (Araneae : Salticidae). Mon intérêt pour les araignées en tant que système d'étude est motivé par leur rôle de prédateur généraliste en agroécosytèmes. De plus, les traits de personnalité et les syndromes comportementaux des araignées sont bien décrits dans la littérature. J'ai testé la présence de variations de syndromes comportementaux entre populations ayant différents niveaux d'exposition aux insecticides, la stabilité de ces corrélations au cours du développement ainsi que les effets d'une exposition sublétale sur la stabilité des traits comportementaux et leurs corrélations.J'ai mis en évidence la présence de syndromes comportementaux différents chez des populations non exposées et exposées aux insecticides en vergers de pommiers. Les individus les plus actifs et voraces ont fait preuve d'une agressivité et témérité réduite chez la population non-exposée tandis que les individus agressifs étaient également voraces dans le verger exposé mais avec une témérité diminuée. Ces deux populations ont montré des différences marquées dans leur structure démographique puisque seuls des stades juvéniles ont été collectés dans le vergers exposé aux insecticides. Ceci m'a conduit à étendre mon investigation au rôle joué par le développement dans la génération des syndromes comportementaux.En prenant en compte le développement, j'ai montré que les tendances comportementales étaient faiblement maintenues et seule l'activité a montré des preuves d'héritabilité et de répétabilité. J'ai également découvert la présence de changement ontogénique de syndromes comportementaux, variant selon l'environnement d'élevage et le sexe lors de la transition du stade subadulte à adulte. Les corrélations comportementales ont été majoritairement influencées par les variations intra-individuelles, suggérant une forte plasticité comportementale au cours du développement. Ces résultats confirment le fait que les différences de structure des syndromes comportementaux entre populations en vergers de pommiers sont en parti dues aux transitions ontogéniques et à une abondance réduite des stades adultes dans la population exposée aux insecticides.J'ai ensuite réalisé une expérience d'exposition directe aux insecticides afin de déterminer les effets d'une perturbation subléthale sur la stabilité des traits comportementaux et leurs corrélations. L'exposition à l'organophosphate phosmet a eu un plus grand effet sur la répétabilité de l'activité que sur sa moyenne, indiquant des réponses variables à l'exposition insecticide d'individus à individus. J'ai également observé une altération plus prononcée des corrélations comportementales entre traits relatifs à l'activité et la capture de proies chez les femelles.Ces recherches permettent de combiner les expertises relatives aux domaines de la personnalité animale, de l'agroécologie et de l'écotoxicologie en se focalisant sur des traits comportementaux affectant la performance des araignées dans les agroécosystèmes