Mejoramiento del Sistema de Acueducto en el Distrito de Buenaventura

Este proyecto para el sistema de acueducto de Buenaventura abarcó todos los componentes del sistema, por considerar que en cada uno de ellos hay oportunidades importantes de reducción del agua que se pierde en el sistema, o cuyo uso no es eficiente. Las acciones se circunscribieron a aquellas áreas abastecidas por el sistema, o sea el perímetro urbano y los corregimientos de Córdoba, San Cipriano, Citronela y La Gloria. Este programa se enfocó a optimizar, el recurso hídrico y hacer un uso sostenible del mismo, mediante la identificación y caracterización de aquellos eventos que por su naturaleza producen efectos negativos sobre el medio y por tanto establecer medidas de control y mitigación adecuadas.This project for the Buenaventura aqueduct system covered all the components of the system, considering that in each one of them there are important opportunities to reduce the water that is lost in the system, or whose use is not efficient. The actions were limited to those areas supplied by the system, that is, the urban perimeter and the corregimientos of Córdoba, San Cipriano, Citronela and La Gloria. This program focused on optimizing water resources and making sustainable use of them, through the identification and characterization of those events that by their nature produce negative effects on the environment and therefore establish adequate control and mitigation measures

The glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase gene of Moniliophthoraperniciosa, the causal agent of witches' broom disease of Theobroma cacao

This report describes the cloning, sequence and expression analysis of the glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase (GAPDH) gene of Moniliophthora perniciosa, the most important pathogen of cocoa in Brazil. Southern blot analysis revealed the presence of a single copy of the GAPDH gene in the M. perniciosa genome (MpGAPDH). The complete MpGAPDH coding sequence contained 1,461 bp with eight introns that were conserved in the GAPDH genes of other basidiomycete species. The cis-elements in the promoter region of the MpGAPDH gene were similar to those of other basidiomycetes. Likewise, the MpGAPDH gene encoded a putative 339 amino acid protein that shared significant sequence similarity with other GAPDH proteins in fungi, plants, and metazoans. Phylogenetic analyses clustered the MPGAPDH protein with other homobasidiomycete fungi of the family Tricholomataceae. Expression analysis of the MpGAPDH gene by real-time PCR showed that this gene was more expressed (~1.3X) in the saprotrophic stage of this hemibiotrophic plant pathogen than in the biotrophic stage when grown in cacao extracts

D-MaPs - DNA-microarray projects: Web-based software for multi-platform microarray analysis

The web application D-Maps provides a user-friendly interface to researchers performing studies based on microarrays. The program was developed to manage and process one- or two-color microarray data obtained from several platforms (currently, GeneTAC, ScanArray, CodeLink, NimbleGen and Affymetrix). Despite the availability of many algorithms and many software programs designed to perform microarray analysis on the internet, these usually require sophisticated knowledge of mathematics, statistics and computation. D-maps was developed to overcome the requirement of high performance computers or programming experience. D-Maps performs raw data processing, normalization and statistical analysis, allowing access to the analyzed data in text or graphical format. An original feature presented by D-Maps is GEO (Gene Expression Omnibus) submission format service. The D-MaPs application was already used for analysis of oligonucleotide microarrays and PCR-spotted arrays (one- and two-color, laser and light scanner). In conclusion, D-Maps is a valuable tool for microarray research community, especially in the case of groups without a bioinformatic core

Fitoplancton en el sistema lagunar tropical Carmen Pajonal Machona, Tabasco

Background. Phytoplankton is considered an important indicator of natural and anthropogenic processes that take place in basins and coastal environments. An example of these systems is the formed by the El Car- men, Pajonal and La Machona lagoons, in which there is intense fishing and oyster farming activity, as well as agricultural activities, oil extraction and forestry in their surroundings. Goals.Identifying the phytoplankton species, with emphasis on the potentially harmful and / or toxic ones, their distribution and differences between the samplings, north winds (2015) and rainy (2016), as well as reporting the physicochemical variables was the aimed of this work. Methods. Net samples with a mesh size of 20 μm were taken and physicoche- mical variables were measured with a water quality sonde. 300 organisms were counted and the specific richness, relative abundances and diversity index were calculated. To identify differences between the two seasons sampled the Mann-Whitney U test was performed. In addition, the most important physicochemical variables were identified to explore their relationship with the species through a distance-based redundancy analysis (dbRDA). Results. A total of 86 species were identified, of which ten are new records and 15 are potentially harmful and / or toxic ones. The taxonomic group with the most species in both seasons was Bacillaryophyta (43 Northeast and 22 Rains). Specific richness was significantly different between seasons. In the north winds season, the most abundant species were from the Cyanoprokaryota and Bacillaryophyta groups, while for rainy season they were from the Dinoflagellata. Conclusions. Water temperature and salinity were the physicochemical variables that defined the phyto- plankton composition in the CPM lagoons; the presence of potentially toxic species is an alert for the lagoon system because it reflects a latent situation that could trigger blooms at any time.Antecedentes. El fitoplancton es considerado un indicador importante de los procesos naturales y antro- pogénicos que se desarrollan en las cuencas y en los ambientes costeros. Un ejemplo de estos sistemas es el conformado por las lagunas El Carmen, Pajonal y La Machona (CPM), en las cuales hay una intensa actividad pesquera y de ostricultura, así como actividades agrícolas, extracción petrolera y forestal a sus alrededores. Objetivo. El objetivo fue identificar las especies fitoplanctónicas, con énfasis en las potencial- mente nocivas y/o tóxicas, su distribución y diferencias entre los muestreos, nortes (2015) y lluvias (2016), así como reportar las variables fisicoquímicas. Métodos. Se tomaron muestras de red de 20 μm de abertura de malla y midieron las variables con una sonda de calidad de agua. Se contabilizaron 300 organismos y se obtuvieron la riqueza específica, abundancias relativas e índice de diversidad. Para identificar diferencias entre las dos temporadas muestreadas se realizó la prueba U de Mann-Whitney. Además, se identificaron las variables fisicoquímicas más importantes para explorar su relación con las especies mediante un análisis de redundancia basado en distancias (dbRDA). Resultados. Se identificaron un total de 86 especies de las cuales diez son nuevos registros para el área y 15 son potencialmente tóxicas. El grupo taxonómico con más especies fue el de las Bacillaryophyta (43 nortes y 22 lluvias). La riqueza específica fue significativamente diferente entre temporadas. Las especies más abundantes fueron de los grupos de las Cyanoprokaryota y las Bacillaryophyta para la temporada de nortes, mientras que para la temporada de lluvias fueron del grupo Dinoflagellata. Conclusiones. La temperatura y la salinidad fueron las variables que determinaron la com- posición del fitoplancton en las lagunas CPM; la presencia de especies potencialmente tóxicas es una alerta para el sistema lagunar debido a que refleja una situación latente que podría desencadenar florecimientos en cualquier momento

A genome survey of Moniliophthora perniciosa gives new insights into Witches' Broom Disease of cacao

<p>Abstract</p> <p>Background</p> <p>The basidiomycete fungus <it>Moniliophthora perniciosa </it>is the causal agent of Witches' Broom Disease (WBD) in cacao (<it>Theobroma cacao</it>). It is a hemibiotrophic pathogen that colonizes the apoplast of cacao's meristematic tissues as a biotrophic pathogen, switching to a saprotrophic lifestyle during later stages of infection. <it>M. perniciosa</it>, together with the related species <it>M. roreri</it>, are pathogens of aerial parts of the plant, an uncommon characteristic in the order Agaricales. A genome survey (1.9× coverage) of <it>M. perniciosa </it>was analyzed to evaluate the overall gene content of this phytopathogen.</p> <p>Results</p> <p>Genes encoding proteins involved in retrotransposition, reactive oxygen species (ROS) resistance, drug efflux transport and cell wall degradation were identified. The great number of genes encoding cytochrome P450 monooxygenases (1.15% of gene models) indicates that <it>M. perniciosa </it>has a great potential for detoxification, production of toxins and hormones; which may confer a high adaptive ability to the fungus. We have also discovered new genes encoding putative secreted polypeptides rich in cysteine, as well as genes related to methylotrophy and plant hormone biosynthesis (gibberellin and auxin). Analysis of gene families indicated that <it>M. perniciosa </it>have similar amounts of carboxylesterases and repertoires of plant cell wall degrading enzymes as other hemibiotrophic fungi. In addition, an approach for normalization of gene family data using incomplete genome data was developed and applied in <it>M. perniciosa </it>genome survey.</p> <p>Conclusion</p> <p>This genome survey gives an overview of the <it>M. perniciosa </it>genome, and reveals that a significant portion is involved in stress adaptation and plant necrosis, two necessary characteristics for a hemibiotrophic fungus to fulfill its infection cycle. Our analysis provides new evidence revealing potential adaptive traits that may play major roles in the mechanisms of pathogenicity in the <it>M. perniciosa</it>/cacao pathosystem.</p

Green Criminology Before ‘Green Criminology’: Amnesia and Absences

Although the first published use of the term ‘green criminology’ seems to have been made by Lynch (Green criminology. Aldershot, Hampshire, 1990/2006), elements of the analysis and critique represented by the term were established well before this date. There is much criminological engagement with, and analysis of, environmental crime and harm that occurred prior to 1990 that deserves acknowledgement. In this article, we try to illuminate some of the antecedents of green criminology. Proceeding in this way allows us to learn from ‘absences’, i.e. knowledge that existed but has been forgotten. We conclude by referring to green criminology not as an exclusionary label or barrier but as a symbol that guides and inspires the direction of research

Reparación de las victimas en el posconflicto de cara al acuerdo de paz con las farc.

El propósito de esta investigación fue analizar la politica de reparación de las víctimas en el posconflicto del estado colombiano. La investigación está sustentada en autores como Howland (2015), Salazar y Galvis (2010), Girard (2006), entre otros y se enmarca metodológicamente como una monografía. El estudio se realiza dada la actualidad del acontecer político colombiano, encuadrado en un fin al conflicto armado que por décadas ha sostenido con la FARC. En el desarrollo del estudio se señala que en ese proceso debe observarse la capacidad del estado de brindar verdad y reparaciones a las víctimas por la vía judicial u otro mecanismo idóneo para ello, so pena de sufrir mayores lesiones de no atender al debido resarcimiento de los daños ocasionados. En tal sentido, ese fin del conflicto exige acuerdos claros y precisos buscando la paz, la justicia y la restauración del hilo democrático en tales relaciones, implicando proporcionar mecanismos de reparación a las víctimas en el posconflicto. De allí que una vez desarrollado el estudio, se concluyó que existen deficiencias en el acuerdo realizado, por lo cual se hicieron propuestas de mejora del mismo, basado en políticas públicas coherentes que vayan en beneficio de las víctimas del mismo

Reparación de las victimas en el posconflicto de cara al acuerdo de paz con las farc.

El propósito de esta investigación fue analizar la politica de reparación de las víctimas en el posconflicto del estado colombiano. La investigación está sustentada en autores como Howland (2015), Salazar y Galvis (2010), Girard (2006), entre otros y se enmarca metodológicamente como una monografía. El estudio se realiza dada la actualidad del acontecer político colombiano, encuadrado en un fin al conflicto armado que por décadas ha sostenido con la FARC. En el desarrollo del estudio se señala que en ese proceso debe observarse la capacidad del estado de brindar verdad y reparaciones a las víctimas por la vía judicial u otro mecanismo idóneo para ello, so pena de sufrir mayores lesiones de no atender al debido resarcimiento de los daños ocasionados. En tal sentido, ese fin del conflicto exige acuerdos claros y precisos buscando la paz, la justicia y la restauración del hilo democrático en tales relaciones, implicando proporcionar mecanismos de reparación a las víctimas en el posconflicto. De allí que una vez desarrollado el estudio, se concluyó que existen deficiencias en el acuerdo realizado, por lo cual se hicieron propuestas de mejora del mismo, basado en políticas públicas coherentes que vayan en beneficio de las víctimas del mismo