The Metallophosphoesterase-Domain-Containing Protein 2 (MPPED2) Gene Acts as Tumor Suppressor in Breast Cancer

Background: We have recently reported the downregulation of the Metallophosphoesterase-domain-containing protein 2 (MPPED2) gene and its cognate long non-coding RNA, MPPED2-AS1, in papillary thyroid carcinomas. Functional studies supported a tumor suppressor role of both these genes in thyroid carcinogenesis. We then decided to investigate their role in breast carcinogenesis. Methods: In order to verify MPPED2 expression, 45 human breast carcinoma samples have been investigated by quantitative real-time polymerase chain reaction (qRT-PCR). Then, MPPED2 has been transfected in several human breast carcinoma cell lines, analyzing its role in cell proliferation, migration and invasion. To study the regulation of MPPED2 expression the methylation of its promoter was investigated by targeted bisulfite sequencing. Results: MPPED2 expression was decreased in breast cancer samples, and this was confirmed by the analysis of data available in The Cancer Genome Atlas (TCGA). Interestingly, the hypermethylation of MPPED2 promoter likely accounted for its downregulation in breast cancer. Additionally, MPPED2-AS1 was also found downregulated in breast cancer tissues and, intriguingly, its expression decreased the hypermethylation of the MPPED2 promoter by inhibiting DNA methyltransferase 1 (DNMT1). Furthermore, the restoration of MPPED2 expression reduced cell proliferation, migration and invasion capability of breast carcinoma cell lines. Conclusion: Taken together, these results propose MPPED2 downregulation as a critical event in breast carcinogenesis

ALTERAÇÕES TRANSCRICIONAIS PRECOCEMENTE ENVOLVIDAS NA PROGRESSÃO DE PACIENTES PARA DOENÇA ARTICULAR CRÔNICA PÓS-CHIKUNGUNYA

Introdução/Objetivo: Infecções pelo vírus Chikungunya (CHIKV) podem frequentemente resultar no desenvolvimento de Doença Articular Inflamatória Crônica pós-Chikungunya (pCHIKV-CIJD). Essa condição gera impactos na qualidade de vida dos pacientes e nos gastos com a saúde pública. Neste estudo, visamos identificar mecanismos moleculares precocemente envolvidos na evolução para pCHIKV-CIJD. Método: Pacientes em fase aguda de chikungunya foram incluidos em uma coorte prospectiva e tiveram o seguimento de 90 dias. Aqueles pacientes que permaneceram com sinais clínicos de artrite e exame de imagem alterado foram considerados pCHIKV-CIJD. O RNA foi obtido do sangue total dos pacientes e foi realizado o sequenciamento de RNA total e small RNA. Foram realizadas análises de genes e microRNAs diferencialmente expressos, enriquencimento de vias, análise de módulos de coexpressão e interactoma. Resultados: Comparando os pacientes que evoluíram para pCHIKV-CIJD com aqueles que não evoluíram, nós identificamos assinaturas moleculares precocemente associadas a cronificação nas fases aguda e subaguda da doença. Essas moléculas foram principalmente associadas a alterações na regulação da resposta imune. Dentre elas, o gene LIFR, que codifica para um receptor celular envolvido em um aumento de transcrição de IL-6, encontra-se sub-expresso em pacientes pCHIKV-CIJD. LIFR foi previamente validado como um alvo de miR-98-5p, que encontra-se superexpresso nesses pacientes. Pacientes que evoluíram para doença crônica também apresentaram redução dos níveis de transcritos de importantes mediadores imunológicos como interleucinas e seus receptores, como IL-6 e IL-6R; genes associados ao recrutamento de células imunes e resposta adaptativa, como CCR2; e genes que codificam diferentes subunidades do complexo proteossoma. Além disso, esses pacientes apresentaram redução dos níveis de MMP8, LFT e DDIT4. Esses genes já foram descritos como alterados em outros tipos de artrite como osteoartrite e artrite reumatóide e parecem também ser relevantes para o desenvolvimento de pCHIKV-CIJD. Conclusão: Juntos, nossos achados adicionam conhecimento acerca dos mecanismos moleculares precocemente envolvidos na cronificação e destacam potenciais alvos para novos estudos. Entender esses mecanismos é crucial para o desenvolvimento de terapias efetivas e intervenções para os pacientes acometidos, podendo mitigar os efeitos da doença e reduzir os impactos causados

Shotgun metagenomic sequencing of the first case of monkeypox virus in Brazil, 2022

Monkeypox virus (MPXV), a zoonotic virus endemic to the African continent, has been reported in 33 non-endemic countries since May 2022. We report an almost complete genome of the first confirmed case of MPXV in Brazil. Shotgun metagenomic sequencing was completed in 18 hours, from DNA extraction to consensus sequence generation

Clinical, laboratory and follow-up information of the 169 CHIKF-confirmed volunteers.

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Clinical categorical variables and univariate analysis from CHIKF–confirmed patients at D0 and D21.

Clinical categorical variables and univariate analysis from CHIKF–confirmed patients at D0 and D21.</p

CHIKV Genome Sequencing and phylogenetic analysis.

A. Number of reads of CHIKV sequences per sample. To the left of the dotted line are samples with a number of reads enough to cover CHIKV complete genome. B. The phylogenetic tree was obtained by comparing pCHIKV–CIJD, non–pCHIKV–CIJD, and other publicly available samples from Rio de Janeiro and other states.</p

Shotgun metagenomic sequencing of the first case of monkeypox virus in Brazil, 2022

Monkeypox virus (MPXV), a zoonotic virus endemic to the African continent, has been reported in 33 non-endemic countries since May 2022. We report an almost complete genome of the first confirmed case of MPXV in Brazil. Shotgun metagenomic sequencing was completed in 18 hours, from DNA extraction to consensus sequence generation