An interaction network of mental disorder proteins in neural stem cells

Mental disorders (MDs) such as intellectual disability (ID), autism spectrum disorders (ASD) and schizophrenia have a strong genetic component. Recently, many gene mutations associated with ID, ASD or schizophrenia have been identified by high-throughput sequencing. A substantial fraction of these mutations are in genes encoding transcriptional regulators. Transcriptional regulators associated with different MDs but acting in the same gene regulatory network provide information on the molecular relation between MDs. Physical interaction between transcriptional regulators is a strong predictor for their cooperation in gene regulation. Here, we biochemically purified transcriptional regulators from neural stem cells, identified their interaction partners by mass spectrometry and assembled a protein interaction network containing 206 proteins, including 68 proteins mutated in MD patients and 52 proteins significantly lacking coding variation in humans. Our network shows molecular connections between established MD proteins and provides a discovery tool for novel MD genes. Network proteins preferentially co-localize on the genome and cooperate in disease-relevant gene regulation. Our results suggest that the observed transcriptional regulators associated with ID, ASD or schizophrenia are part of a transcriptional network in neural stem cells. We find that more severe mutations in network proteins are associated with MDs that include lower intelligence quotient (IQ), suggesting that the level of disruption of a shared transcriptional network correlates with cognitive dysfunction

The value of MRI STIR signal intensity on return to play prognosis and reinjury risk estimation in athletes with acute hamstring injuries

Objectives: Previous studies have shown low to moderate evidence for a variety of magnetic resonance imaging (MRI) features as prognostic factors in athletes with hamstring injuries. Short-tau inversion recovery (STIR) signal intensity has not yet been investigated for assessing the prognosis of acute muscle injuries. Our aim was to explore the relationship between MRI STIR signal intensity and time to return to play (RTP) and to investigate the association between MRI STIR and reinjury risk in athletes with acute hamstring injuri

Kjemisk behandling mot Gyrodactylus salaris i Steinkjervassdragene 2006

Årsliste 2007Kjemisk behandling mot Gyrodactylus salaris i Steinkjervassdraget er gjennomført på oppdrag fra Direktoratet for naturforvalting (DN). Tiltakshaver har vært Fylkesmannen (FM) i Sogn og Fjordane. Behandlingen av Steinkjervassdraget høsten 2006 er en del av en totalbehandling som har som hovedmål å utrydde lakseparasitten G. salaris i regionen. Hensikten med behandlingen i august 2006 var å redusere smitten av G. salaris internt i Steinkjervassdragene og eksternt til nærliggende vassdrag i regionen. Dette ble gjort ved å tilsette surt aluminiumsulfat (AlS) i elvevannet og CFT-L (rotenon) i dammer og sig. Behandlingen foregikk i tidsrommet 21.august-2.september 2006. AlS ble dosert ut i hovedelvene og i de største sidevassdragene. I andre små vannkilder i periferien, som for eksempel små sig og mindre avsnørte dammer ble det brukt CFT-Legumin (rotenon). Under behandlingen ble det dosert ut totalt 2 tonn med aluminium og 11 liter CFT-Legumin (0,3 kg rotenon). Lakseunger infisert med G. salaris ble plassert i kar langs elva og eksponert for behandlet elvevann. Ved behandlingens slutt ble alle lakseungene i karene sjekket for G. salaris. Ingen dødelighet ble registrert og det ble heller ikke funnet G. salaris på noen av fiskene i karene.Direktoratet for naturforvaltning

Proteins that bind regulatory regions identified by histone modification chromatin immunoprecipitations and mass spectrometry

The locations of transcriptional enhancers and promoters were recently mapped in many mammalian cell types. Proteins that bind those regulatory regions can determine cell identity but have not been systematically identified. Here we purify native enhancers, promoters or heterochromatin from embryonic stem cells by chromatin immunoprecipitations (ChIP) for characteristic histone modifications and identify associated proteins using mass spectrometry (MS). 239 factors are identified and predicted to bind enhancers or promoters with different levels of activity, or heterochromatin. Published genome-wide data indicate a high accuracy of location prediction by ChIP-MS. A quarter of the identified factors are important for pluripotency and includes Oct4, Esrrb, Klf5, Mycn and Dppa2, factors that drive reprogramming to pluripotent stem cells. We determined the genome-wide binding sites of Dppa2 and find that Dppa2 operates outside the classical pluripotency network. Our ChIP-MS method provides a detailed read-out of the transcriptional landscape representative of the investigated cell type

Kjemisk behandling mot Gyrodactylus salaris i Lærdalselva 2005

Hovedmålet med prosjektet har vært å fjerne lakseparasitten Gyrodactylus salaris fra Lærdalselva med bruk av surt aluminiumsulfat (AlS). Første behandling ble gjennomført våren 2005. Denne behandlingen begrenset seg til hovedelva og de største sidevassdragene, og målet var å redusere smittepresset internt i vassdraget og dermed også smittepresset til nærliggende vassdrag i regionen. Resultatene fra vårbehandlingen viser at G. salaris-infeksjonen ble kraftig redusert, fra en prevalens på 100 % til 2,1 %. Høstbehandlingen i 2005 hadde til hensikt å totalutrydde parasitten fra vassdraget. AlS ble dosert ut fra 18 vannførings-proporsjonale doseringsanlegg langs hovedelva og de største sidevassdragene, samt fra 80 dryppstasjoner langs mindre vannveier, grøfter og dammer. I områder med små grøfter og sig, ble det også brukt noe CFT-Legumin. Etter høstbehandlingen er 434 laksunger fra ulike steder i elva undersøkt uten at G. salaris er påvist. For å øke sannsynligheten for totalutyddelse av parasitten vil det bli gjennomført en ny fullskalabehandling våren 2006. Resultatene så langt viser at Al-metoden er meget velegnet i kampen mot G. salaris i norske laksevassdrag, både mht til totalutryddelse og smittereduksjon. Resultatene viser også at metoden har et forbedringspotensial når det gjelder dosering i forhold til tålegrensen for Al hos fisk. Det ble observert dødelighet på voksen fisk av både sjøørret og laks under begge behandlingene, mens yngel og parr fra begge arter tålte behandlingene godt. Al-doseringene baserer seg på kjente grenseverdier for aluminium på ungfisk av laks og ørret kombinert med hvilke nivåer av Al som skal til for å eliminere G. salaris i løpet av noen dager. At disse Al-nivåene skulle føre til fiskedød på ulike voksenstadier av laks og ørret er nytt for oss og peker på behovet for FoU knyttet til utvikling av ALS-metoden