Spoon: Program Analysis and Transformation in Java

In this research report, we present Spoon, a framework for program transformation and static analysis in Java. More precisely, Spoon is an open and extensible Java compiler, written in pure Java by using Compile-time reflection techniques. We take advantage of the new features added by Java 5, and particularly of annotations and generics. Using annotations within the Spoon framework allows the programmer to extend the Java language without defining new syntactic elements, and in such a way that it is naturally supported by IDEs for Java 5 and greater. Generics, as a priceless complement, allow for the well-typing of Spoon programs that implement the programmers' language extensions. Enforcing typing naturally provides better IDE support (such as static checks, completion, documentation, and navigation), and also allows us to define a pure Java template mechanism, which we use as a tool to define well-typed and straightforward program transformations. In addition to its basic transformation capabilities, Spoon comes with a partial evaluation engine that is used to calculate the control flow of the program and to simplify the results of template-based transformations for correctness, optimization, and readability. In order to demonstrate the usability and usefulness of our framework, we present three applications, which have been chosen to cover most of Spoon's features: a translator from Java 1.4 programs into well-typed Java 5 programs, an efficient template-based AOP extension, and an automatic implementation and validation of the visitor pattern

Macchiato : vers un système de panier unique pour le e-commerce

Journées du GDR GPLNational audienceLe e-commerce est un domaine qui a explosé ces dernières années avec la multiplication des sites de vente en ligne. Cependant, face à cette explosion des sites de e-commerce, l'utilisateur final perd petit à petit ses repères et éprouve les plus grandes difficultés à trouver les meilleures offres pour ses achats. Les sites de comparaison en ligne--tels que Kelkoo1 --ne sont pas toujours fiables car les résultats qu'ils fournissent ne sont pas nécessairement objectifs et ne prennent pas en compte les préférences de l'utilisateur. Dans ce contexte, Macchiato se présente comme une solution de nouvelle génération des sites de e-commerce, basée sur les principes de l'Internet des Objets. En particulier, Macchiato vise à mettre l'utilisateur au cœur du système en lui donnant la capacité de composer des services personnalisés pour mieux répondre à ses besoins. Pour ce faire, dans Macchiato, les services et les produits sont exposés sous la forme de ressources sémantiquement riches et connectées entre elles. Cette richesse sémantique facilite la compréhension des informations échangées entre les services et les utilisateurs tout en renforçant le typage des compositions de services

TTC'2015 Case: Refactoring Java Programs using Spoon

International audienceTTC'2015 is the 8th Transformation Tool Contest for users and developers of transformation tools. In this paper, we present the use of Spoon, an open-source library to transform and analyze Java source code for the code refactoring track of TTC'2015. We use Spoon to implement pull-up-method and create super-class refactorings. The implementation uses an unmodified revision of Spoon and is done in 125 lines

Macchiato : vers un système de panier unique pour le e-commerce

Journées du GDR GPLNational audienceLe e-commerce est un domaine qui a explosé ces dernières années avec la multiplication des sites de vente en ligne. Cependant, face à cette explosion des sites de e-commerce, l'utilisateur final perd petit à petit ses repères et éprouve les plus grandes difficultés à trouver les meilleures offres pour ses achats. Les sites de comparaison en ligne--tels que Kelkoo1 --ne sont pas toujours fiables car les résultats qu'ils fournissent ne sont pas nécessairement objectifs et ne prennent pas en compte les préférences de l'utilisateur. Dans ce contexte, Macchiato se présente comme une solution de nouvelle génération des sites de e-commerce, basée sur les principes de l'Internet des Objets. En particulier, Macchiato vise à mettre l'utilisateur au cœur du système en lui donnant la capacité de composer des services personnalisés pour mieux répondre à ses besoins. Pour ce faire, dans Macchiato, les services et les produits sont exposés sous la forme de ressources sémantiquement riches et connectées entre elles. Cette richesse sémantique facilite la compréhension des informations échangées entre les services et les utilisateurs tout en renforçant le typage des compositions de services

Optimiser et Répartir ses Applications Mobiles avec Macchiato

National audienceMacchiato permet de développer des applications mobiles performantes, adaptables et pouvant être réparties tout en étant économes en ressources. Cette plate-forme est agnostique vis à vis de l'environnement d'exécution. Les applications développées s'exécutent sans modification sur tous les environnements que la plate-forme supporte. Il est possible de distribuer les applications sur les navigateurs Web, sur les navigateurs Web mobiles et sur des serveurs d'applications

Spoon: A Library for Implementing Analyses and Transformations of Java Source Code

update for oadoi on Nov 02 2018International audienceThis paper presents SPOON, a library for the analysis and transformation of Java source code. SPOON enables Java developers to write a large range of domain-specific analyses and transformations in an easy and concise manner. SPOON analyses and transformations are written in plain Java. With SPOON, developers do not need to dive into parsing, to hack a compiler infrastructure, or to master a new formalism

Genetic determinism of spontaneous masculinisation in XX female rainbow trout: new insights using medium throughput genotyping and whole-genome sequencing

International audienceRainbow trout has a male heterogametic (XY) sex determination system controlled by a major sex-determining gene, sdY. Unexpectedly, a few phenotypically masculinised fish are regularly observed in all-female farmed trout stocks. To better understand the genetic determinism underlying spontaneous maleness in XX-rainbow trout, we recorded the phenotypic sex of 20,210 XX-rainbow trout from a French farm population at 10 and 15 months post-hatching. The overall masculinisation rate was 1.45%. We performed two genome-wide association studies (GWAS) on a subsample of 1139 individuals classified as females, intersex or males using either medium-throughput genotyping (31,811 SNPs) or whole-genome sequencing (WGS, 8.7 million SNPs). The genomic heritability of maleness ranged between 0.48 and 0.62 depending on the method and the number of SNPs used for the estimation. At the 31K SNPs level, we detected four QTL on three chromosomes (Omy1, Omy12 and Omy20). Using WGS information, we narrowed down the positions of the two QTL detected on Omy1 to 96 kb and 347 kb respectively, with the second QTL explaining up to 14% of the total genetic variance of maleness. Within this QTL, we detected three putative candidate genes, fgfa8, cyp17a1 and an uncharacterised protein (LOC110527930), which might be involved in spontaneous maleness of XX-female rainbow trout

Les monocytes CD14+/CD 16+ (marqueurs potentiels de précurseurs ostéoclastiques circulants dans le myélome)

Pour les patients atteints de myélome multiple, les lésions ostéolytiques causées par une activation ostéoclastique excessive sont un problème clinique majeur. Les ostéoclastes sont capables de se différencier in vitro à partir de précurseurs monocytaires médullaires mais également à partir de monocytes circulants. Les monocytes sont une entité polymorphe dotée de plasticité et constituée de différentes sous populations contenant les précurseurs ostéoclastiques. Nous avons dans ce travail cherché à mettre en évidence par cytométrie en flux une population de précurseurs ostéoclastiques circulants chez les patients atteints de myélome multiple en étudiant la répartition des sous populations monocytaires CD14+/CD16- et CD14+/CD16+, CD14+/CD5161+ et CD14+/CD115+. Les résultats ont ensuite été corrélés aux paramètres clinico-biologiques et confrontés aux expériences de différenciation cellulaire. L étude a porté sur 20 patients atteints de myélome multiple et sur 35 témoins sains. La population minoritaire CD14+/CD16+ est significativement augmentée chez les patients atteints de myélome alors que les CD14+ totaux et les CD14+/CD16- ne diffèrent pas entre les deux populations. Le ratio entre les CD16+ et les CD16- est significativement augmenté entre les deux populations. Les deux marqueurs utilisés (CD51/61 et CD115) ne permettent pas de mettre en évidence d expression différente entre les deux populations alors que ces marqueurs apparaissent après différenciation cellulaire minime (24h) à partir de monocytes circulants. Cette étude montre que les monocytes CD14+/CD16+ peuvent être un reflet des précurseurs ostéoclastiques circulants au cours du myélome multiple. Les autres marqueurs ne sont pas utilisables dans le myélome pour mettre en évidence ces précurseurs.AMIENS-BU Santé (800212102) / SudocSudocFranceF

TTC'2015 Case: Refactoring Java Programs using Spoon

International audienceTTC'2015 is the 8th Transformation Tool Contest for users and developers of transformation tools. In this paper, we present the use of Spoon, an open-source library to transform and analyze Java source code for the code refactoring track of TTC'2015. We use Spoon to implement pull-up-method and create super-class refactorings. The implementation uses an unmodified revision of Spoon and is done in 125 lines