Molekulárně genetická studie polygenních onemocnění se zvláštním zaměřením na diabetes mellitus

Mgr. Pavlína Čejková MOLECULAR-GENETIC STUDY OF POLYGENIC DISEASES WITH A SPECIAL FOCUS ON DIABETES MELLITUS Abstract Polygenic diseases with complex mode of inheritance constitute an increasing public health burden. The aim of this study was to contribute to our current knowledge in genetic background of several complex diseases, namely enteropathy-type T-cell lymphoma, type 1 and type 2 diabetes mellitus, systemic lupus erythematosus, rheumatoid arthritis a psoriatic arthritis, in order to better understand the pathogenesis of the diseases with potential diagnostic, prognostic or therapeutic applications. In the ETL, previously detected gain in chromosome band 9q was further narrowed down by microsatellite analysis to 9q34, and gDNA-based quantitative PCR confirmed amplification of both, ABL1 and NOTCH1genes. HLA genotyping of T1D manifested in childhood, adult-onset T1D and LADA showed partially different genetic predispositions. This finding points out a possible role of environmental factors that increases with age, and at least partly different immunogenetic etiology between autoimmune DM manifested in children and in adults. Further, there is some evidence that T1D and LADA diabetes susceptibility may slightly differ as indicated by different frequencies of HLA and NFKBIA gene polymorphisms. This...Mgr. Pavlína Čejková MOLEKULÁRNĚ GENETICKÁ STUDIE POLYGENNÍCH ONEMOCNĚNÍ SE ZVLÁŠTNÍM ZAMĚŘENÍM NA DIABETES MELLITUS Abstrakt Polygenní onemocnění s komplexní dědičností představují vzrůstající zdravotnický problém a zátěž. Cílem této práce bylo přispět ke stávajícím znalostem genetického pozadí některých komplexních chorob, konkrétně T-buněčného lymfomu střeva (ETL), typu 1 a 2 diabetes mellitus (T1D a T2D), systémového lupus erytematosus, revmatoidní artritidy a psoriatické artritidy, díky čemuž by bylo možné lépe porozumět patogenezi těchto onemocnění a zlepšit jejich diagnózu, prognózu i léčbu. U ETL byla doposud známá amplifikace na chromosomu 9q zpřesněna mikrosatelitní analýzou a zúžena na oblast 9q34, kde byla pomocí kvantifikace genomické DNA metodou kvantitativní PCR potvrzena amplifikace obou kandidátních genů, ABL1 a NOTCH1. HLA typizace T1D pacientů manifestujících své onemocnění v dětském a v dospělém věku a pacientů LADA odhalila částečně rozdílné genetické predispozice, což zřejmě svědčí o odlišném působení environmentálních faktorů, jež s věkem narůstá, a alespoň částečně rozdílné imunogenetické etiologii u autoimunitního diabetes mellitus manifestovaného v dětství vs. v dospělosti. Dále, odlišné frekvence genových polymorfismů HLA a NFKBIA genů naznačují, že existují rozdíly ve vnímavosti...Department of Student AffairsStudijní odděleníFaculty of SciencePřírodovědecká fakult

Molecular-genetic Study of Polygenic Diseases with a Special Focus on Diabetes Mellitus

Mgr. Pavlína Čejková MOLECULAR-GENETIC STUDY OF POLYGENIC DISEASES WITH A SPECIAL FOCUS ON DIABETES MELLITUS Abstract Polygenic diseases with complex mode of inheritance constitute an increasing public health burden. The aim of this study was to contribute to our current knowledge in genetic background of several complex diseases, namely enteropathy-type T-cell lymphoma, type 1 and type 2 diabetes mellitus, systemic lupus erythematosus, rheumatoid arthritis a psoriatic arthritis, in order to better understand the pathogenesis of the diseases with potential diagnostic, prognostic or therapeutic applications. In the ETL, previously detected gain in chromosome band 9q was further narrowed down by microsatellite analysis to 9q34, and gDNA-based quantitative PCR confirmed amplification of both, ABL1 and NOTCH1genes. HLA genotyping of T1D manifested in childhood, adult-onset T1D and LADA showed partially different genetic predispositions. This finding points out a possible role of environmental factors that increases with age, and at least partly different immunogenetic etiology between autoimmune DM manifested in children and in adults. Further, there is some evidence that T1D and LADA diabetes susceptibility may slightly differ as indicated by different frequencies of HLA and NFKBIA gene polymorphisms. This..

Molekulárně-genetické studie polygenních nemocí se zaměřením na diabetes mellitus

Cílem předložené práce bylo přispět k pochopení molekulárních základních mechanizmů patogeneze u několika polygenní onemocnění: 1) identifikace (nové) kvantitativní vlastnosti loci u polygenních onemocnění až do současnosti, u kterých nedostatečně prozkoumané genetické komponenty přispívají k onemocnění a etiologii 2) testování podílu předem určených kandidátních genů na patogenezi onemocnění se známými QTLs a najít nové interakce a podtypu genových asociaciThe aim of presented work was to contribute to the understanding of molecular mechanisms underlying pathogenesis of several polygenic disorders by 1) identifying (new) quantitative trait loci in polygenic disease(s) with up to now insufficiently explored genetic component contributing to disease etiology 2) testing the contribution of previously identified candidate genes to pathogenesis of diseases with known QTLs and finding new interactions and subtyping associationsMimofakultní pracoviště3. lékařská fakultaThird Faculty of Medicin

Molecular-Genetic Study of Polygenic Diseases with a Special Focus on Diabetes Mellitus

The aim of presented work was to contribute to the understanding of molecular mechanisms underlying pathogenesis of several polygenic disorders by 1) identifying (new) quantitative trait loci in polygenic disease(s) with up to now insufficiently explored genetic component contributing to disease etiology 2) testing the contribution of previously identified candidate genes to pathogenesis of diseases with known QTLs and finding new interactions and subtyping association