Human Heme Oxygenase Oxidation of 5- and 15-Phenylhemes

Human heme oxygenase-1 (hHO-1) catalyzes the O2- dependent oxidation of heme to biliverdin, CO, and free iron. Previous work indicated that electrophilic addition of the terminal oxygen of the ferric hydroperoxo complex to the -meso-carbon gives 5-hydroxyheme. Earlier efforts to block this reaction with a 5-methyl substituent failed, as the reaction still gave biliverdin IX . Surprisingly, a 15-methyl substituent caused exclusive cleavage at the -meso- rather than at the normal, unsubstituted -meso-carbon. No CO was formed in these reactions, but the fragment cleaved from the porphyrin eluded identification. We report here that hHO-1 cleaves 5-phenylheme to biliverdin IX and oxidizes 15- phenylheme at the -meso position to give 10-phenylbiliverdin IX . The fragment extruded in the oxidation of 5-phenylheme is benzoic acid, one oxygen of which comes from O2 and the other from water. The 2.29- and 2.11-Å crystal structures of the hHO-1 complexes with 1- and 15-phenylheme, respectively, show clear electron density for both the 5- and 15-phenyl rings in both molecules of the asymmetric unit. The overall structure of 15-phenylheme-hHO-1 is similar to that of heme-hHO-1 except for small changes in distal residues 141–150 and in the proximal Lys18 and Lys22. In the 5-phenylhemehHO-1 structure, the phenyl-substituted heme occupies the same position as heme in the heme-HO-1 complex but the 5-phenyl substituent disrupts the rigid hydrophobic wall of residues Met34, Phe214, and residues 26–42 near the -meso carbon. The results provide independent support for an electrophilic oxidation mechanism and support a role for stereochemical control of the reaction regiospecificity.Fil: Wang, Jingling. University of California; Estados UnidosFil: Niemevz, Fernando. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Farmacia y Bioquímica. Departamento de Química Orgánica; ArgentinaFil: Lad, Latesh. University of California; Estados UnidosFil: Huang, Liusheng. University of California; Estados UnidosFil: Alvarez, Diego Ezequiel. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay; Argentina. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Farmacia y Bioquímica. Departamento de Química Orgánica; ArgentinaFil: Buldain, Graciela Yolanda. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay; Argentina. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Farmacia y Bioquímica. Departamento de Química Orgánica; ArgentinaFil: Poulos, Thomas L.. University of California; Estados UnidosFil: Ortiz de Montellano, Paul R.. University of California; Estados Unido

Open Hardware in Science: The Benefits of Open Electronics

Openly shared low-cost electronic hardware applications, known as open electronics, have sparked a new open-source movement, with much untapped potential to advance scientific research. Initially designed to appeal to electronic hobbyists, open electronics have formed a global “maker” community and are increasingly used in science and industry. In this perspective article, we review the current costs and benefits of open electronics for use in scientific research ranging from the experimental to the theoretical sciences. We discuss how user-made electronic applications can help (I) individual researchers, by increasing the customization, efficiency, and scalability of experiments, while improving data quantity and quality; (II) scientific institutions, by improving access to customizable high-end technologies, sustainability, visibility, and interdisciplinary collaboration potential; and (III) the scientific community, by improving transparency and reproducibility, helping decouple research capacity from funding, increasing innovation, and improving collaboration potential among researchers and the public. We further discuss how current barriers like poor awareness, knowledge access, and time investments can be resolved by increased documentation and collaboration, and provide guidelines for academics to enter this emerging field. We highlight that open electronics are a promising and powerful tool to help scientific research to become more innovative and reproducible and offer a key practical solution to improve democratic access to science

Función resumen perceptual para verificación de integridad en audio forense

In this work we propose a function that allows to calculate a summary code from the parameters of a voice signal. This function is based on ordering of spectral coefficients obtained by means of the application of the Fast Fourier Transform (FFT), using a locally generated reference function (Gaussian random noise). The proposed method is oriented to the verification of integrity in forensic voice signals. The proposed methodology has a perceptual approach, which implies that the resulting code is maintained, even when modifications are made, particularly those that do not affect the sensitive content of the signal, such as re-quantization processes.En este artículos se propone una función que permite calcular un código resumen a partir de los parámetros de una señal de voz. Esta función está basada en el ordenamiento de los coeficientes espectrales en un proceso de imitación entre el espectro de la señal de voz y el espectro de una señal de ruido gaussiano generada localmente. El método de función resumen está orientado a la verificación de integridad forense en señales de voz, con un enfoque perceptual, que implica que la función resumen no cambia si la señal sufre modificaciones que no alteran el contenido (como re-cuantización), pero que si cambia ante modificaciones como recorte y adición de ruido. Se realizaron diversas pruebas para verificar el enfoque perceptual del método resumen propuesto y se compararon los resultados frente a modificaciones utilizando métodos tradicionales

Detección de manipulaciones en evidencia digital con fines forenses

In terms of digital evidence, images of a crime scene play an important role in a legal process; therefore it is essential to guarantee their chain of custody. If the image is tampered with operations such as cropping, duplicity or blurring of objects, there must be a mechanism that identifies the existence of such manipulation. In this paper, a solution to the chain of custody based on a technique known as watermarking is proposed. In order to validate the sensitivity and effectiveness of the proposed system, six classes of manipulations are applied to watermarked images; finding a high sensitivity to small manipulations (e.g 0.25% of the image size), since in all cases the manipulation was identified. With the proposed solution, legal authority can rely on the chain of custody of the digital evidence.En términos de evidencia digital, la imagen de la escena de un crimen es un elemento importante en un proceso legal; razón por la cual es indispensable que se garantice su cadena de custodia. Si la imagen es modificada con operaciones como eliminación, duplicidad o difuminado de objetos, debe existir un mecanismo que identifique la existencia de dicha manipulación. En este proyecto, se propone una solución a la cadena de custodia basada en una técnica conocida como marcado de agua. Con el propósito de validar la sensibilidad y efectividad del sistema propuesto, se aplican seis clases de manipulaciones a imágenes marcadas; encontrando una alta sensibilidad a manipulaciones pequeñas (ej. 0.25% del tamaño de la imagen), dado que en todos los casos fue identificada la manipulación. Con la solución propuesta, la autoridad legal puede confiar en la cadena de custodia de la evidencia digital

Detección de manipulaciones en evidencia digital con fines forenses

En términos de evidencia digital, la imagen de la escena de un crimen es un elemento importante en un proceso legal; razón por la cual es indispensable que se garantice su cadena de custodia. Si la imagen es modificada con operaciones como eliminación, duplicidad o difuminado de objetos, debe existir un mecanismo que identifique la existencia de dicha manipulación. En este proyecto, se propone una solución a la cadena de custodia basada en una técnica conocida como marcado de agua. Con el propósito de validar la sensibilidad y efectividad del sistema propuesto, se aplican seis clases de manipulaciones a imágenes marcadas; encontrando una alta sensibilidad a manipulaciones pequeñas (ej. 0.25% del tamaño de la imagen), dado que en todos los casos fue identificada la manipulación. Con la solución propuesta, la autoridad legal puede confiar en la cadena de custodia de la evidencia digital.

Crustal Architecture at the Collision Zone Between Rivera and North American Plates at the Jalisco Block: Tsujal Project

Processing and analysis of new multichannel seismic records, coincident with wide-angle seismic profiles, acquired in the framework of the TsuJal project allow us to investigate in detail the complex structure of the oceanic domain in the collision zone between Rivera Plate and Block Jalisco at its northern termination. The subducting Rivera Plate, which is overridden by the North American Plate–Jalisco Block, is clearly identified up to 21.5°N (just south of Maria Magdalena Island) as a two clear reflections that we interpret as the interplate and Moho discontinuities. North of the Tres Marias Islands the seismic images display a different tectonic scenario with structures that are consistent with large faulting and rifted margin. A two-dimensional velocity approach for the crustal geometry is achieved using joint refraction/reflection travel time tomography, the uncertainty of the results is assessed by means of Monte Carlo analysis. Our results show an average oceanic crustal thickness of 6–7 km with a moderate increase towards the Jalisco Block, an anomalous thick layers (~3.0 km) displaying a relatively low velocity (~5.5 km/s) underneath Maria Magdalena Rise, and an estimated Moho depth deeper than 15 km in the collision zone between Rivera Plate and Jalisco Block. We have also determined an anomalous crust on the western flank of the Tres Marias Islands, which may be related to the initial phases of continental breakup of the Baja California Peninsula and Mexico mainland. High-resolution bathymetry provides remarkable images of intensive slope instabilities marked by relatively large slides scars of more than 40 km2 extent, and mass-wasting deposits probably triggered by the intense seismicity in the area.Consejo Nacional de Ciencia y Tecnología (CONACYT) –FOMIXJalGobierno de EspañaGobierno del Estado de JaliscoUniversidad Nacional Autonoma de MexicoAgencia Estatal de Investigación (España)Programa Ramón y CajalDepto. de Física de la Tierra y AstrofísicaFac. de Ciencias FísicasTRUEpu

The 2011 October Draconids outburst. I. Orbital elements, meteoroid fluxes and 21P/Giacobini-Zinner delivered mass to Earth

On October 8th, 2011 the Earth crossed the dust trails left by comet 21P/Giacobini-Zinner during its XIX and XX century perihelion approaches with the comet being close to perihelion. The geometric circumstances of that encounter were thus favorable to produce a meteor storm, but the trails were much older than in the 1933 and 1946 historical encounters. As a consequence the 2011 October Draconid display exhibited several activity peaks with Zenithal Hourly Rates of about 400 meteors per hour. In fact, if the display had been not forecasted, it could have passed almost unnoticed as was strongly attenuated for visual observers due to the Moon. This suggests that most meteor storms of a similar nature could have passed historically unnoticed under unfavorable weather and Moon observing conditions. The possibility of obtaining information on the physical properties of cometary meteoroids penetrating the atmosphere under low-geocentric velocity encounter circumstances motivated us to set up a special observing campaign. Added to the Spanish Fireball Network wide-field all-sky and CCD video monitoring, other high-sensitivity 1/2" black and white CCD video cameras were attached to modified medium-field lenses for obtaining high resolution orbital information. The trajectory, radiant, and orbital data of 16 October Draconid meteors observed at multiple stations are presented. The results show that the meteors appeared from a geocentric radiant located at R.A.=263.0+-0.4 deg. and Dec.=+55.3+-0.3 deg. that is in close agreement with the radiant predicted for the 1873-1894 and the 1900 dust trails. The estimated mass of material from 21P/Giacobini-Zinner delivered to Earth during the six-hours outburst was around 950+-150 kg.Comment: Manuscript in press in Monthly Notices of the Royal Astronomical Society, submitted to MNRAS on November 16th, 2012 Accepted for publication in MNRAS on April 28th, 2013 Manuscript Pages: 21 Tables: 8 Figures: 4 Manuscript associated: "The 2011 October Draconids outburst. II. Meteoroid chemical abundances from fireball spectroscopy" by J.M. Madiedo is also in press in the same journa

Variabilidad Fenotípica para tolerancia a salinidad de un panel de asociación de sorgo

PosterLa Argentina es, según FAO UNESCO, el tercer país con mayor superficie de suelos afectados por halomorfismo en el mundo, después de Rusia y Australia. El sorgo constituye un alimento básico de las regiones semiáridas de los países de bajo nivel de desarrollo siendo éste clave para alcanzar el objetivo de la seguridad alimentaria, por ser una especie de alto potencial para suelos marginales.Instituto de Fisiología y Recursos Genéticos VegetalesFil: Bustos, Dolores Angela. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Fisiología y Recursos Genéticos Vegetales; ArgentinaFil: Bustos, Dolores Angela. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Unidad de Estudios Agropecuarios (UDEA); ArgentinaFil: Vieira de Sousa, L. Universidade Federal Rural do Semi Árido (UFERSA); BrasilFil: da Silva, R.R. Universidade Federal Rural do Semi Árido (UFERSA); BrasilFil: Pittaro, Gabriela. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Fisiología y Recursos Genéticos Vegetales; ArgentinaFil: Pittaro, Gabriela. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Unidad de Estudios Agropecuarios (UDEA); ArgentinaFil: Ortiz, Diego. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Estación Experimental Agropecuaria Manfredi; ArgentinaFil: Luna, Dario Fernando. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Fisiología y Recursos Genéticos Vegetales; ArgentinaFil: Luna, Dario Fernando. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Unidad de Estudios Agropecuarios (UDEA); Argentin

Escenario para la transmisión de streaming adaptativo DASH-WebM

Tradicionalmente el videostreaming ha sido soportado por los protocolos RTP y RTSP, de modo que el servidor gestiona una sesión diferente para cada cliente y coordina la entrega de paquetes. Actualmente el estándar de streaming adaptativo DASH ofrece otro enfoque a través de HTTP, de tal forma que el cliente extrae los datos del servidor, sin mantener el estado de la sesión. Así, se tiene como ventajas el pleno uso de la infraestructura de Internet y la adaptación del contenido multimedia al  ancho de banda de la red. A pesar de lo anterior, el proceso de generación y distribución de contenidos multimedia DASH, requiere la ejecución secuencial de tareas de codificación, segmentación,  creación del descriptor MPD y reproducción del contenido DASH. Para el caso de los contenidos multimedia WebM, las anteriores tareas son realizadas separadamente por un conjunto de herramientas libres, por lo que el proceso de generación del contenido DASH no es automático. En este artículo se propone un escenario de transmisión para streaming adaptativo DASH, cuyo principal componente es la herramienta DASHWebMConverter, la cual se encarga de automatizar el proceso de generación de contenidos DASH  WebM. Adicionalmente, se presenta la evaluación del escenario de streaming adaptativo, mediante pruebas de seguimiento de ancho de banda y pruebas de consumo de memoria sobre los principales componentes del escenario