Correlation between Biofilm Formation, Multi-Drug Resistance and AlgD Gene among Pseudomonas aeruginosa Clinical Isolates

الخلفية: الزوائف الزنجارية هي عبارة عن بكتريا انتهازية مسببة للامراض التي ترتبط بالإصابة بالعدوى المستمرة التي يصعب استئصالها.الهدف: تهدف هذه الدراسة إلى تحديد قدرة تكوين الغشاء الحيوي في الزوائف الزنجارية وارتباطه بمقاومة المضادات الحيوية وعلاقتها بوجود جين ال  AlgD.المرضى وطريقة العمل: أجريت الدراسة الحالية في مستشفى أزادي التعليمي العام في مدينة كركوك خلال الفترة من أغسطس 2017 حتى مايو 2018 ، تم الحصول على 100 عزلة من الزائفة الزنجارية من 1260 عينة سريرية مختلفة. تم تحديد الحساسية للمضادات الحيوية بواسطة طريقة كيربي باور، تم تحليل تكوين الغشاء الحيوي بطريقة الميكروتايتر بليت ، جين AlgD تم الكشف عنه بواسطة تفاعل البلمرة المتسلسل.النتائج: اقل مقاومة للمضادات الحيوية وجد ضد: ببراسلين/ تازوباكتام (5%) , سيفيبيم (24%), سيفتازيديم (26%), بينما كانت النسبة الاكبر مقاومة ضد: الاموكسيسيلين/ حامض الكلافيولانك (98%) و ترايميثوبريم/ سلفامثوكزازول (97%).وكانت (60%) من هذه العزلات مقاومة للعديد من الأدوية. وجد أن (98%) من العزلات كانت لها قابلية تكوين الغشاء الحيوي. تم الكشف عن وجود جين AlgDبواسطة تفاعل البلمرة المتسلسل حيث وجد أن  (98%) من العزلات حاملة للجين, مع جود هذا الجين AlgD في العزلات المكونة للغشاء الحيوي فقط. الاستنتاجات: كان الإرتباط معنويا بين قابلية تكوين الغشاء الحيوي ومقاومة المضادات الحيوية, ووجد ان هنالك علاقة قوية بين وجود AlgD جين و تكوين الغشاء الحيويBackground: Pseudomonas aeruginosa is an opportunistic pathogenic bacterium that associated with persistent infections that are difficult to eradicate. Objective: This study aims to determine biofilm forming potential of P. aeruginosa and its correlation with antibiotics resistance and presence of AlgD gene. Materilals and Methods: The present study carried out in Azady teaching general hospital in Kirkuk city during the period from August 2017 to May 2018, one hundred isolates of Pseudomonas aeruginosa had been obtained from (1260) different clinical specimens. Antibiotic susceptibility was determined by Kirby-Bauer method, biofilm formation analyzed by Microtiter plate quantitative method, and AlgD gene was determined by polymerase chain reaction (PCR).Results: A lower percentage of antibiotic resistance was against piperacillin/tazobactam (5%), cefepime (24%), and ceftazidime (26%) while, higher resistance percentage was seen against amoxicillin/clavulanic acid (98%) and trimethoprim/sulfamethoxazole (97%), multi-drug resistance (MDR) formed (60%) of total isolates. Biofilm formation found in (98%) of total isolates. AlgD gene detected by PCR technique found in (98%) of total isolates, AlgD gene was found only in biofilm former isolates. Conclusions: Significant correlation found between biofilm formation and antibiotic resistance. Strong correlation observed between presence of AlgD gene and biofilm formation

Frequency of ToxA and ExoS genes in Pseudomonas aeruginosa isolates obtained from different clinical specimens

The present study carried out in Azady teaching general hospital in Kirkuk city during the period from August 2017 to May 2018, to determine the frequency of ToxA gene and ExoS gene in P. aeruginosa isolates. Pseudomonas aeruginosa (100) isolates had been obtained from (1260) different clinical specimens, High prevalence of P. aeruginosa found in isolates obtained from burn swabs. Regarding to genders and ages, P. aeruginosa presented in females (58%) more than males (42%), regarding to age groups, P. aeruginosa presented more frequently (26%) in age group (20-30) followed by children (1-10) years that formed (22%). Molecular detection of virulence genes had been done by using conventional PCR technique, regarding to prevalence of ToxA and ExoS genes, ToxA gene presented (96%), ExoS gene (92%). Regarding to the distribution of genes in clinical specimens, ToxA gene present (100%) in all clinical specimens except in urine samples (90.9%) and low percentage found in sputum (50%). ExoS gene present (100%) in all isolates, while ExoS gene less frequently presented in ear swab isolates ( 83.3%) than other specimens, followed by urine specimens (81.8%), in bronchial washes isolates ExoS gene was absent. This study aims to determine the frequency of ToxA gene and ExoS gene in P. aeruginosa isolates that obtained from different clinical specimens