Activation of the DnaK-ClpB Complex is Regulated by the Properties of the Bound Substrate

The chaperone ClpB in bacteria is responsible for the reactivation of aggregated proteins in collaboration with the DnaK system. Association of these chaperones at the aggregate surface stimulates ATP hydrolysis, which mediates substrate remodeling. However, a question that remains unanswered is whether the bichaperone complex can be selectively activated by substrates that require remodeling. We find that large aggregates or bulky, native-like substrates activates the complex, whereas a smaller, permanently unfolded protein or extended, short peptides fail to stimulate it. Our data also indicate that ClpB interacts differently with DnaK in the presence of aggregates or small peptides, displaying a higher affinity for aggregate-bound DnaK, and that DnaK-ClpB collaboration requires the coupled ATPase-dependent remodeling activities of both chaperones. Complex stimulation is mediated by residues at the beta subdomain of DnaK substrate binding domain, which become accessible to the disaggregase when the lid is allosterically detached from the beta subdomain. Complex activation also requires an active NBD2 and the integrity of the M domain-ring of ClpB. Disruption of the M-domain ring allows the unproductive stimulation of the DnaK-ClpB complex in solution. The ability of the DnaK-ClpB complex to discriminate different substrate proteins might allow its activation when client proteins require remodeling.A.A. thanks the Basque Government for a Predoctoral Fellowship. The excellent technical assistance of N. Orozco is gratefully acknowledged. We also thank Mathias P. Mayer for the plasmid encoding the DnaK SBD. This work was supported by grants BFU2016-75983 (AEI/FEDER, UE) and IT709-13 (Basque Government)

Hydrothermal CO2 conversion using zinc as reductant: Batch reaction, modeling and parametric analysis of the process

Producción CientíficaHydrothermal CO2 reduction using Zn as reductant was investigated. This process has the advantage of avoiding the use of hydrogen with all its safety and environmental concerns, and allows an easy integration with CO2 capture as NaHCO3. In this work, this reaction was studied in batch reactors at temperatures from 275 to 325 °C. Conversions up to 60% were obtained with 100% selectivity towards formic acid, at reaction times between 10 and 180 min. A mathematical model correlated with data from literature was developed and is able to correctly predict both experimental and literature data with an averaged error of 3.5%. Main variables of the process were analyzed: temperature, Zn/HCO3− ratio, heating rate, Zn particle size, pressure, etc. The optimum reaction conditions found were 300 °C with a rapid heating, and particle sizes of 10 μm. Zn excess dramatically improves the yield, but a lower excess can be compensated at high pressures.Ministerio de Economía, Industria y Competitividad (Project ENE2014-53459-R

Mapping of tecto-lineaments and their influence on sedimentological processes in a GIS environment: a case study of the Iberian trough, Spain

p. 165-174The subsurface sedimentary succession of the Iberian Trough, Spain was examined using geophysical t echniques (analogue seismic profiles) and inverse distance weighted (IDW) interpolation algorithm implemented in a gvGIS open source software. The results showed that the Late Cretaceous succession is divided into two depositional sequences: DS­1 (Late Albian–Middle Turonian) and DS­2 (Late Turonian–Campanian). From the analogical seismic sections, digital data and quantitative isopach maps for DS­1 and DS­2 were obtained. The new isopach maps obtained for the DS­1 sequence showed that the deeper sectors of the basin were located to the northeast and the proximal ones to the southwest. The palaeoshoreline was inferred to be situated in the N 150 direction. Across and parallel to this direction several blocks were delimited by faults, with a direction between 30 N and N 65. The thickness of the sediments in these blocks varied in direction NW–SE, with subsidence and depocentres in hangingwall and uplift in the footwall. These variations may have been related to active synsedimentary faults (e.g., Boñar and Yugueros Faults). In the DS­2 sequence, a lineament separated the smaller thicknesses to the southwest from the larger thicknesses (up to 1400 m) to the northeast. This lineament had an N170 orientation and it indicated the position of the palaeoshoreline. In the isopach map for DS­2 there were two groups of lineaments. The first showed a block structure that was limited by N100–120, they were foundering toward the S and had large thicknesses (depocentres), and rose towards the N, where there were smaller thicknesses. The second group of lineaments had a N 50–65 direction and, in this case, they had a similar interpretation as the one in DS­1. The maps obtained are of great help for geologists and permit better understanding of the geological setting and stratigraphic succession of the Late Cretaceous of the Iberian Trough.S

Unzipping the Secrets of Amyloid Disassembly by the Human Disaggregase

Neurodegenerative diseases (NDs) are increasingly positioned as leading causes of global deaths. The accelerated aging of the population and its strong relationship with neurodegeneration forecast these pathologies as a huge global health problem in the upcoming years. In this scenario, there is an urgent need for understanding the basic molecular mechanisms associated with such diseases. A major molecular hallmark of most NDs is the accumulation of insoluble and toxic protein aggregates, known as amyloids, in extracellular or intracellular deposits. Here, we review the current knowledge on how molecular chaperones, and more specifically a ternary protein complex referred to as the human disaggregase, deals with amyloids. This machinery, composed of the constitutive Hsp70 (Hsc70), the class B J-protein DnaJB1 and the nucleotide exchange factor Apg2 (Hsp110), disassembles amyloids of α-synuclein implicated in Parkinson’s disease as well as of other disease-associated proteins such as tau and huntingtin. We highlight recent studies that have led to the dissection of the mechanism used by this chaperone system to perform its disaggregase activity. We also discuss whether this chaperone-mediated disassembly mechanism could be used to solubilize other amyloidogenic substrates. Finally, we evaluate the implications of the chaperone system in amyloid clearance and associated toxicity, which could be critical for the development of new therapies.This research was funded by MCI/AEI/FEDER, UE (grant PID2019-111068GB-I00) and by the Basque Government (grant IT1201-19). L.V.-C. is the recipient of a predoctoral fellowship from the UPV/EHU and N.O. holds a contract funded by Fundacion Biofisika Bizkaia

Modulation of the chaperone DnaK allosterism by the nucleotide exchange factor GrpE

10 p.-6 fig.Hsp70 chaperones comprise two domains, the nucleotide-binding domain (Hsp70NBD), responsible for structural and functional changes in the chaperone, and the substrate-binding domain (Hsp70SBD), involved in substrate interaction. Substrate binding and release in Hsp70 is controlled by the nucleotide state of DnaKNBD, with ATP inducing the open, substrate-receptive DnaKSBD conformation, whereas ADP forces its closure. DnaK cycles between the two conformations through interaction with two cofactors, the Hsp40 co-chaperones (DnaJ in Escherichia coli) induce the ADP state, and the nucleotide exchange factors (GrpE in E. coli) induce the ATP state. X-ray crystallography showed that the GrpE dimer is a nucleotide exchange factor that works by interaction of one of its monomers with DnaKNBD. DnaKSBD location in this complex is debated; there is evidence that it interacts with the GrpE N-terminal disordered region, far from DnaKNBD. Although we confirmed this interaction using biochemical and biophysical techniques, our EM-based three-dimensional reconstruction of the DnaK-GrpE complex located DnaKSBD near DnaKNBD. This apparent discrepancy between the functional and structural results is explained by our finding that the tail region of the GrpE dimer in the DnaK-GrpE complex bends and its tip contacts DnaKSBD, whereas the DnaKNBD-DnaKSBD linker contacts the GrpE helical region. We suggest that these interactions define a more complex role for GrpE in the control of DnaK function.This work was supported in part by Spanish Ministry of Economy and Innovation Grants BFU2013-44202 (to J. M. V.), SAF2011-22988 (to O. L.), and BFU2013-47059 (to A. M.), Madrid Regional Government Grants S2013/MIT-2807 (to J. M. V.) and S2010/BMD-2316 (to O. L.), and Basque Government Grant IT709-13 (to A. M.).Peer reviewe

Indicaciones Límite de las Fracturas de Húmero con Clavo Endomedular Cerrojado

El tratamiento de las fracturas diafisarias del húmero ha entrado en controversia en los últimos años, como lo refleja la literatura internacional. La problemática aumenta cuando se trata de fracturas diafisarias límites que alcanzan la zona metafisaria superior e inferior. En un intento de mejora terapéutica este grupo de autores ha testado un clavo cerrojado para el húmero diseñado por Seidel. El promedio de seguimiento ha sido de 12 meses con un mínimo de 6 meses. El número de casos evaluados ha sido 6. Siguiendo la cotación de Stewart, 4 de los seis pacientes obtuvieron resultados buenos o excelentes. Todos los pacientes consolidaron sus fracturas en un período de tiempo normal, entre 3 y 5 meses, con una media de 4 meses, 4 de los seis pacientes no se inmovilizaron con yeso en ningún momento. La bondad y sencillez del método hace augurar buenos resultados en otros grupos ampliando sus indicaciones.Treatment of dyaphyseal fractures of the humerus has been the source of considerable controversy in recent years. The problem increases in dimension when one is dealing with limiting diaphyseal fractures that invole the upper and lower metaphyseal zone. In an attempt to improve the therapy of this circunstance, the members of this research team have tested a locking nail for the humerus designed by Seidel. The mean follow-up time has been 12 months, with a minimum of six months. The number of cases evaluated was 6. According to the scale of Stewart, four of the cases obtained good or excellent results. All the patients consolidated their fractures within a normal period of time -between 3 and 5 months-, with a mean of 4 months. Four of the 6 patients wer e not immobilized with paster at any time. The goodness and simplicity of the method are suggestive of promising results in other groups by broadening its indications

Endoscopic treatment (endoscopic balloon dilation/self-expandable metal stent) vs surgical resection for the treatment of de novo stenosis in Crohn's disease (ENDOCIR study): an open-label, multicentre, randomized trial.

Background: Stenosis is one of the most common complications in patients with Crohn's disease (CD). Endoscopic balloon dilation (EBD) is the treatment of choice for a short stenosis adjacent to the anastomosis from previous surgery. Self-expandable metal stents (SEMS) may be a suitable treatment option for longer stenoses. To date, however, there is no scientific evidence as to whether endoscopic (EBD/SEMS) or surgical treatment is the best approach for de novo or primary stenoses that are less than 10 cm in length. Methods/design: Exploratory study as "proof-of-concept", multicentre, open-label, randomized trial of the treatment of de novo stenosis in the CD; endoscopic treatment (EBD/SEMS) vs surgical resection (SR). The type of endoscopic treatment will initially be with EDB; if a therapeutic failure occurs, then a SEMS will be placed. We estimate 2 years of recruitment and 1 year of follow-up for the assessment of quality of life, costs, complications, and clinical recurrence. After the end of the study, patients will be followed up for 3 years to re-evaluate the variables over the long term. Forty patients with de novo stenosis in CD will be recruited from 15 hospitals in Spain and will be randomly assigned to the endoscopic or surgical treatment groups. The primary aim will be the evaluation of the patient quality of life at 1 year follow-up (% of patients with an increase of 30 points in the 32-item Inflammatory Bowel Disease Questionnaire (IBDQ-32). The secondary aim will be evaluation of the clinical recurrence rate, complications, and costs of both treatments at 1-year follow-up. Discussion: The ENDOCIR trial has been designed to determine whether an endoscopic or surgical approach is therapeutically superior in the treatment of de novo stenosis in CD

Buenas prácticas lecheras : guía para la implementación en la producción de leche bovina

Las “Buenas Prácticas Agropecuarias” hacen referencia a una producción sana, segura y amigable con el ambiente, los animales y las personas. Son numerosos los temas que abarca e involucra la producción primaria de leche: las vacas y su manejo, el ambiente donde producen y las personas que cumplen distintas funciones para potenciar la producción lechera independientemente del sistema y escala, impactando directamente en toda la cadena láctea (desde la producción primaria, la industria y la comercialización) corresponsables de transformar la cosecha de la ubre y ofrecerla al consumidor de forma fluida o a través de derivados lácteos. De acuerdo a las tendencias actuales los consumidores tienen interés en adquirir productos no sólo de acuerdo a su calidad sino también a cómo fueron producidos. La calidad entonces es reconocida en el producto en sí y en todo su proceso desde la producción primaria. En respuesta a estas exigencias surge la Red de Buenas Prácticas Agropecuarias (BPA) como resultado de un proceso de intercambio entre las principales entidades públicas y privadas de Argentina, contando actualmente con más de 90 instituciones. Tiene la misión de contribuir al desarrollo sostenible promoviendo las buenas prácticas agropecuarias en diálogo con la comunidad. Dispone de diversas comisiones entre las que se encuentra la de lechería, que aborda y promueve la implementación de las BPA en los tambos. Los integrantes de la Comisión de Lechería de la Red BPA sentimos una gran satisfacción al presentar esta guía de buenas prácticas lecheras destinada a tamberos, profesionales del agro, entusiastas lecheros, operarios y aquellos inquietos, preocupados y ocupados por lograr leche sana. El presente documento contiene 13 capítulos escritos con terminología sencilla, entendible y adecuada para motivar al lector a aplicar o mejorar las BPA en todos los sectores y categorías de animales que involucra el tambo. Esta guía de buenas prácticas es una herramienta que permite el aseguramiento de la calidad de la leche en los tambos e introduce un cambio de paradigma: pasar de sistemas enfocados sólo en la calidad final de la leche a sistemas proactivos basados en el control, el orden y la mejora de procesos, trabajando en la prevención con capacidad de planificación y anticipación, y manteniendo una coherencia hacia las normas internacionales, buscando así la excelencia de su eslabón primario, el tambo.EEA PergaminoFil: Aimar, María Verónica. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Ciencias Agropecuarias; ArgentinaFil: Amalfi, José María. Instituto Nacional de Asociativismo y Economía Social; ArgentinaFil: Campos Carlés, Silvina. Confederación Intercooperativa Agropecuaria - CONINAGRO; ArgentinaFil: Charlón, Verónica. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Estación Experimental Agropecuaria Rafaela; ArgentinaFil: Cristiano, Gabriela. Universidad Nacional del Sur. Departamento de Economía; ArgentinaFil: Delbino, Fernando. Universidad Nacional del Litoral. Facultad de Ciencias Agrarias; ArgentinaFil: Diaz Cano, Muncha. Sociedad Rural Argentina; ArgentinaFil: Estevez Acuña, Rodrigo Rubén. Ministerio de Agricultura y Ganadería de la Provincia de Córdoba. Departamento de Producción Láctea; ArgentinaFil: Gigli, Isabel. Universidad Nacional de La Pampa; ArgentinaFil: Glauber, Claudio Eduardo. Servicio Nacional de Sanidad y Calidad Agroalimentaria (SENASA); ArgentinaFil: Guillermón, José. Provincia de Santiago del Estero. Ministerio de Producción, Recursos Naturales, Forestación y Tierras. Programa Ganadero Provincial (PROCARNE); ArgentinaFil: Ibargoyen, José María. Provincia de Buenos Aires. Ministerio de Desarrollo Agrario. Dirección de Lechería; ArgentinaFil: Iorio, Jesica Daniela. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Agronomía; ArgentinaFil: Jaureguiberry, Horacio Sebastián. Provincia de Entre Ríos. Ministerio de Producción, Turismo y Desarrollo Económico. Dirección General de Producción Animal. Coordinación de Lechería; ArgentinaFil: Jarkowsky, Andrés. Fundación para la Promoción y Desarrollo de la Cadena Láctea Argentina; ArgentinaFil: Lesman, María de los Ángeles. Universidad Nacional del Litoral. Facultad de Ciencias Agrarias; ArgentinaFil: Llano, Agustina. Ministerio de Agricultura, Ganadería y Pesca de la Nación. Dirección Nacional de Lechería; ArgentinaFil: Mazzitelli, José. Cámara Empresaria de Medio Ambiente; ArgentinaFil: Moro, Santiago. Consorcios Regionales de Experimentación Agrícola; ArgentinaFil: Mozeris, Gustavo. Fundación para la Promoción y Desarrollo de la Cadena Láctea Argentina; ArgentinaFIL: Negri Rodriguez, Livia María. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Investigación Tecnología de Alimentos; ArgentinaFil: Olivieri, Daniela Ivana. Provincia de La Pampa. Ministerio de la Producción. Dirección de Ganadería; ArgentinaFil: Osan, Oscar. Universidad Nacional del Litoral. Facultad de Ciencias Agrarias; ArgentinaFil: Pérez, Gabriela Guadalupe. Provincia de Santa Fé. Ministerio de Producción, Ciencia y Tecnología. Dirección Provincial de Producción Lechera y Apícola; ArgentinaFil: Preumayr, Fernando Martín. Proyecto Factor Humano en Tambo; ArgentinaFil: Serrano, Pedro. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Estación Experimental Agropecuaria Pergamino. Agencia de Extensión Rural Coronel Brandsen; ArgentinaFil: Tonero, María Eugenia. Provincia de Santa Fé. Ministerio de Producción, Ciencia y Tecnología. Dirección Provincial de Producción Lechera y Apícola; ArgentinaFil: Trombert, José María. Centro de la Industria Lechera Argentina; ArgentinaFil: Trombert, José María. Colegio de Ingenieros Agrónomos de Santa Fe; ArgentinaFil: Troya, Paula. Fundación de Investigación y Desarrollo Agropecuario; ArgentinaFil: Urruspuru, María Luz. Proyecto Factor Humano en Tambo; ArgentinaFil: Varaldo, Estefanía. Cluster Lechero Regional; Argentin

Dialogyca en el mundo real y virtual

El proyecto “Dialogyca en el mundo real y virtual” se presenta como continuación del anterior “Dialogyca: los diálogos como punto de encuentro filológico entre lenguas y culturas”, realizado durante el curso 2019-2020. La base para ambos reside en el trabajo realizado desde hace más de una década por el Grupo de estudios de Prosa hispánica Bajomedieval y Renacentista (eProMyR) del Instituto Universitario Menéndez Pidal, que ha considerado esencial, desde sus inicios, establecer sinergias entre investigación, docencia y transferencia de conocimiento. Por ello, tanto en el anterior proyecto como en este se agrupa a miembros de la comunidad universitaria de diversas categorías: profesores permanentes, profesores temporales, personal de apoyo a la investigación, investigadores en formación y estudiantes de Grado y de Máster. Todos ellos colaboran en la realización de diferentes actividades (análisis de obras, de ediciones impresas, dramatizaciones, propuestas de creación literaria, etc.) con el objetivo prioritario de establecer una red de trabajo que favorezca el aprendizaje integral de los alumnos más allá del aula, su primer acercamiento a las actividades de un grupo de investigación, así como formación en facetas clave para un posible futuro en el ámbito investigador. El género que da unidad a este proyecto es el diálogo literario, una modalidad literaria que se remonta a la Antigüedad clásica y que ha pervivido hasta nuestros días, con especial éxito en periodos y culturas como la bajomedieval y renacentista, el Siglo de Oro, la Ilustración y desde la Edad de Plata a nuestros días. Por sus características intrínsecas, se muestra especialmente orientado al didactismo, algo que percibieron muchos de los autores que se decantaron por él para expresar sus ideas o teorías sobre los más variados temas. Su versatilidad lo ha hecho idóneo para tratar materias como la aritmética, medicina, física, filosofía…, es decir, a través de estas obras se puede contemplar una perspectiva panorámica sobre la historia de la ciencia y el pensamiento. Por ello, se considera un género apropiado para que el alumno ejercite su capacidad argumentativa al mismo tiempo que se acerca al conocimiento de los fundamentos de culturas y sociedades de distintas épocas, algo indispensable para el desarrollo de una actitud crítica y a la vez respetuosa y abierta. Así, este proyecto se plantea utilizar el género del diálogo como recurso didáctico y objeto de indagación para proporcionar al alumno conocimientos esenciales del ámbito de las Humanidades, en especial, del filológico, pero también de otras disciplinas, a través de acciones dentro y fuera del aula, de forma presencial y a distancia