Analysis of VEGF-A Regulated Gene Expression in Endothelial Cells to Identify Genes Linked to Angiogenesis

Angiogenesis is important for many physiological processes, diseases, and also regenerative medicine. Therapies that inhibit the vascular endothelial growth factor (VEGF) pathway have been used in the clinic for cancer and macular degeneration. In cancer applications, these treatments suffer from a “tumor escape phenomenon” where alternative pathways are upregulated and angiogenesis continues. The redundancy of angiogenesis regulation indicates the need for additional studies and new drug targets. We aimed to (i) identify novel and missing angiogenesis annotations and (ii) verify their significance to angiogenesis. To achieve these goals, we integrated the human interactome with known angiogenesis-annotated proteins to identify a set of 202 angiogenesis-associated proteins. Across endothelial cell lines, we found that a significant fraction of these proteins had highly perturbed gene expression during angiogenesis. After treatment with VEGF-A, we found increasing expression of HIF-1α, APP, HIV-1 tat interactive protein 2, and MEF2C, while endoglin, liprin β1 and HIF-2α had decreasing expression across three endothelial cell lines. The analysis showed differential regulation of HIF-1α and HIF-2α. The data also provided additional evidence for the role of endothelial cells in Alzheimer's disease

Öar och skär

Öar och skär Innehållsförteckning – Inledaren av Håkan Eklund – Gyllenius i skärgården av Anders Moliis-Mellberg – Aspösund, en olöst gåta av Anders Moliis-Mellberg – Statens öar i öster i ett förändrat liv av Thure Malmberg – Biskopsö Uppgård, ett välbevarat skärgårdshemman av Håkan Eklund – Pörtö Line tar över Söderskär av Thure Malmberg – Fåglarnas Örö av Ari Linna – Fästingen är Finlands farligaste djur av Margaretha Gustavsson – Odensholm, ett stycke kustsvensk historia i Estland av Håkan Eklund – Örö kustfort av Johanna Pakola – En fotovecka på Örö Sofie von Freckell BOKHÖRNAN – Forskarteam om Rilaxslaget av Thure Malmberg – Flykten från Aiboland av Thure Malmberg – En reportagebok som heter duga av Håkan Eklund – Vacker bok om Utöfåglar av Håkan Eklund – Försvarsverket vi ärvde av Håkan Eklund – Äntligen en bok om Jussarö av Håkan Eklund – Martha kockar i Nagu av Nina Söderlund – En bok om fiskelycka av Nina Söderlund – Nordiska skärgårdssamarbetet av Annastina Sarlin – Kolumnen ”Från Karins horisont” av Karin Dahlström – Sista bilden av Håkan Eklun

Molecular Regulation of Angiogenesis

Angiogenesis, de novo formation of blood vessels from the pre-existing vasculature, is crucial in embryo development, and in processes in the adult such as wound healing and ovulation. Angiogenesis is also involved in pathological conditions such as cancer and chronic inflammatory diseases, which are propagated by dysregulated, excess angiogenesis. On the other hand, lack of functional vessels and poor blood flow is a major problem in myocardial and peripheral ischemia. A detailed understanding of the molecular mechanisms underlying angiogenesis is of vital importance for the development of drugs to regulate angiogenesis. The aim of this thesis has been to identify genes involved in regulation of angiogenesis. We have investigated gene expression over time in endothelial cells (ECs), using different in vitro models. We show that the proteoglycan endocan is upregulated in ECs invading a fibrin matrix in response to vascular endothelial growth factor (VEGF)-A. There was increased expression of endocan in renal tumour cells and tumour vessels compared to normal renal tissues, indicating that endocan might have a role in tumour growth and tumour angiogenesis. We also show that vascular endothelial protein tyrosine phosphatase (VE-PTP) is induced in ECs during differentiation into vessel structures in a three dimensional collagen matrix. Silencing of VE-PTP disrupts vessel formation and increases the activity of VEGF receptor-2 (VEGFR-2) and downstream signalling, leading to increased EC proliferation. This presents a possible mechanism for the failure of vessel formation, as EC morphogenesis requires growth arrest of the cells. We also show that VE-PTP and VEGFR-2 are closely associated in resting ECs. VEGF-A stimulation leads to rapid loss of association, coinciding with increased phosphorylation of VEGFR-2. The function of VE-PTP in vivo was investigated using the zebrafish model. We demonstrate specific expression of a zebrafish VE-PTP orthologue (zVE-PTP) in the developing vasculature. Silencing of zVE-PTP leads to defective vessel sprouting and branching, indicating a critical role for zVE-PTP in development of the zebrafish vasculature. In conclusion, this thesis presents gene regulation during endothelial cell morphogenesis and details the expression pattern of endocan and the function of VE-PTP in regulation of VEGFR-2-driven angiogenesis

Följsamhet till hygienrutiner på operationssalen; från uppdukning till såromläggning - operationssjuksköterskors handlande och erfarenheter

Validerat; 20140627 (global_studentproject_submitter

Fortbildning om språk- och kunskapsutvecklande arbetssätt : Perspektiv från elever, gymnasielärare och rektorer

Den här rapporten handlar om en utvärdering av en fortbildningsinsats i språk- och kunskapsutvecklande arbetssätt. Insatsen genomfördes i Uppsala kommun under åren 2020-2022. Att förbättra skolresultat och inkludering för nyanlända och flerspråkiga elever i Uppsala kommuns gymnasieskolor var det övergripande målet med fortbildningsinsats SKUA, som ingick i den av Skolverket finansierade riktade insatsen för nyanlända och flerspråkiga barn och elevers utbildning. Genom analys av fokusgruppsintervjuer ger den här rapporten en inblick i hur fortbildningsinsats SKUA upplevdes av ett urval rektorer och lärare. Fokusgruppsintervjuer med en mindre grupp flerspråkiga elever på de nationella programmen i Uppsala ger insyn i deras upplevelser av undervisning i skolor där en del lärare har gått fortbildningen. Lärare och rektorer uttrycker att de har blivit mer medvetna om vikten av ett fokus på språk i ämnesundervisningen och den viktiga rollen som studiehandledare kan ha i detta. Dock nämns även en del strukturella hinder till en tillfredsställande organisering av studiehandledning på modersmålet och det kollegiala lärandet i skolan. Elever som intervjuats beskriver en undervisning där lärare överlag upplevs ha höga krav på sina elever och ger varierande former och grader av stöttning. Studiehandledning som har fokus på både språk och ämnesinnehåll uppskattas av elever. Rapportens resultat visar på att ett fokus på både språk- och kunskapsutveckling upplevs som angeläget hos alla informanter. Det finns även indikationer om utvecklingsområden som rektorer, lärare, fortbildare och andra beslutsfattare inom gymnasieskolan kan fortsätta arbeta med, bland annat rutiner kring studiehandledning, fortbildningens innehåll och organisation av det kollegiala lärandet.

Fortbildning om språk- och kunskapsutvecklande arbetssätt : Perspektiv från elever, gymnasielärare och rektorer

Den här rapporten handlar om en utvärdering av en fortbildningsinsats i språk- och kunskapsutvecklande arbetssätt. Insatsen genomfördes i Uppsala kommun under åren 2020-2022. Att förbättra skolresultat och inkludering för nyanlända och flerspråkiga elever i Uppsala kommuns gymnasieskolor var det övergripande målet med fortbildningsinsats SKUA, som ingick i den av Skolverket finansierade riktade insatsen för nyanlända och flerspråkiga barn och elevers utbildning. Genom analys av fokusgruppsintervjuer ger den här rapporten en inblick i hur fortbildningsinsats SKUA upplevdes av ett urval rektorer och lärare. Fokusgruppsintervjuer med en mindre grupp flerspråkiga elever på de nationella programmen i Uppsala ger insyn i deras upplevelser av undervisning i skolor där en del lärare har gått fortbildningen. Lärare och rektorer uttrycker att de har blivit mer medvetna om vikten av ett fokus på språk i ämnesundervisningen och den viktiga rollen som studiehandledare kan ha i detta. Dock nämns även en del strukturella hinder till en tillfredsställande organisering av studiehandledning på modersmålet och det kollegiala lärandet i skolan. Elever som intervjuats beskriver en undervisning där lärare överlag upplevs ha höga krav på sina elever och ger varierande former och grader av stöttning. Studiehandledning som har fokus på både språk och ämnesinnehåll uppskattas av elever. Rapportens resultat visar på att ett fokus på både språk- och kunskapsutveckling upplevs som angeläget hos alla informanter. Det finns även indikationer om utvecklingsområden som rektorer, lärare, fortbildare och andra beslutsfattare inom gymnasieskolan kan fortsätta arbeta med, bland annat rutiner kring studiehandledning, fortbildningens innehåll och organisation av det kollegiala lärandet.

Bedömningsstöd för familjehemsplacerade barns umgänge : En utvärdering ur socialarbetares perspektiv

FoU Södertörn och Södertörns högskola har under år 2017, på uppdrag av Socialstyrelsen, utvärderat ett bedömningsstöd för familjehemsplacerade barns umgänge med föräldrar, andra anhöriga och närstående. Bedömningsstödet har utvecklats av FoU Södertörn i samarbete med barn- och familjehemssekreterare från nio Södertörnskommuner. Stödet utgår från erfarenhetskunskap hos personal inom familjehemsvården. Erfarenheter från placerade barn har också funnits med som en grund genom att organisationen Knas hemma har bidragit med erfarenheter från barn. Forskare i socialt arbete och juridik har lämnat synpunkter som har utvecklat bedömningsstödet. Utvärderingen har genomförts genom att barn- och familjehemssekreterare har prövat att använda bedömningsstödet i ärenden som under en period om sex veckor år 2017 var aktuella för nyplacering, övervägande, omprövning eller umgängesbegränsning. Handläggarnas erfarenheter av att använda bedömningsstödet har inhämtats genom en enkätstudie och genom fokusgruppsintervjuer. 76 personer har deltagit i enkätundersökningen. De har svarat på enkäter efter att ha använt bedömningsstödet vid bedömningar av umgänge för totalt 144 barn. Deltagarna kommer från 27 olika kommunala socialtjänstenheter i landet. 26 personer har deltagit i intervjuer. Resultaten visar att barn- och familjehemssekreterarna upplever ett behov av någon form av stöd i arbetet med att bedöma familjehemsplacerade barns umgänge. Bedömningen av umgänge upplevs som en svår fråga och ett viktigt utvecklingsområde. I enkätstudien har deltagarna fått svara på frågan om de upplever att bedömningsstödet har underlättat deras arbete med att göra en bedömning av umgänget i enlighet med barnets bästa. Resultaten visar att tre av fyra svar är att det stämmer mycket bra eller ganska bra. I en lika stor andel svar har bedömningsstödet bidragit till en mer rättssäker handläggning av umgängesfrågan och varit en hjälp för att samla in information på ett systematiskt sätt. I majoriteten av svaren har bedömningsstödet också bidragit till att barnets inställning till umgänge har blivit belyst. Av intervjuer och kommentarer i enkätstudiens fria svar framkommer att handläggarna anser att bedömningsstödet fungerar särskilt bra i nya ärenden, komplexa ärenden samt när ett ärende har ny handläggare. De tar upp att bedömningsstödet skulle behöva komma in tidigare i processen då det inte endast är relevant för familjehemsenheterna utan även för utredningsenheterna inom den sociala barnavården. I intervjuer beskriver deltagare att handläggare vid utredningsenheter och familjehemsenheter kan ha skilda uppfattningar i umgängesfrågan. När ett ärende kommer till familjehemsenheten har redan handläggare vid utredningsenheten gjort en bedömning av umgänget som handläggare vid familjehemsenheten ibland upplever att det av olika skäl är svårt att genomföra. Bedömningsstödet skulle kunna vara till hjälp i de båda enheternas samverkan med att göra en bedömning av vad som är barnets bästa i umgängesfrågan. I drygt 80 procent av svaren i enkätstudien uppges att handläggaren avser att fortsätta använda bedömningsstödet även efter utvärderingsperioden. I mer än 90 procent av svaren skulle handläggaren rekommendera andra professionella att använda bedömningsstödet. Korstabeller visar att arbetserfarenhet har betydelse för deltagarnas svar. De som har kortare erfarenhet av arbete inom familjehemsvården har genomgående upplevt en större nytta av bedömningsstödet medan de som har längre erfarenhet har gjort det i lägre grad. Några handläggare med lång erfarenhet menar att de redan arbetar på ett rättssäkert sätt och att de följer den systematik som bedömningsstödet utgör. Men det finns även handläggare med lång erfarenhet som har upplevt att bedömningsstödet har varit till hjälp, till exempel genom att vara bekräftande i den meningen att de har kunnat stämma av att de inte har missat väsentliga saker som är relevanta för bedömningen. Barn- och familjehemssekreterare beskriver att bedömningsstödet har bidragit till att de har känt sig mer säkra på sin bedömning, vilket har bidragit till att de också har kunnat vara tydligare i samtal med barn och föräldrar samt i samband med rättsliga processer

Transcriptional profiling of human glioblastoma vessels indicates a key role of VEGF-A and TGF beta 2 in vascular abnormalization

Glioblastoma are aggressive astrocytic brain tumours characterized by microvascular proliferation and an abnormal vasculature, giving rise to brain oedema and increased patient morbidity. Here, we have characterized the transcriptome of tumour-associated blood vessels and describe a gene signature clearly associated with pleomorphic, pathologically altered vessels in human glioblastoma (grade IV glioma). We identified 95 genes differentially expressed in glioblastoma vessels, while no significant differences in gene expression were detected between vessels in non-malignant brain and grade II glioma. Differential vascular expression of ANGPT2, CD93, ESM1, ELTD1, FILIP1L and TENC1 in human glioblastoma was validated by immunohistochemistry, using a tissue microarray. Through qPCR analysis of gene induction in primary endothelial cells, we provide evidence that increased VEGF-A and TGF beta 2 signalling in the tumour microenvironment is sufficient to invoke many of the changes in gene expression noted in glioblastoma vessels. Notably, we found an enrichment of Smad target genes within the distinct gene signature of glioblastoma vessels and a significant increase of Smad signalling complexes in the vasculature of human glioblastoma in situ. This indicates a key role of TGF beta signalling in regulating vascular phenotype and suggests that, in addition to VEGF-A, TGF beta 2 may represent a new target for vascular normalization therapy. Copyright (c) 2012 Pathological Society of Great Britain and Ireland. Published by John Wiley & Sons, Ltd