Mammalian autophagy and the plasma membrane.

Autophagy (literally 'self-eating') is an evolutionarily conserved degradation process where cytoplasmic components are engulfed by vesicles called autophagosomes, which are then delivered to lysosomes, where their contents are degraded. Under stress conditions, such as starvation or oxidative stress, autophagy is upregulated in order to degrade macromolecules and restore the nutrient balance. The source of membranes that participate in the initial formation of phagophores is still incompletely understood and many intracellular structures have been shown to act as lipid donors, including the endoplasmic reticulum, Golgi, nucleus, mitochondria and the plasma membrane. Here, we focus on the contributions of the plasma membrane to autophagosome biogenesis governed by ATG16L1 and ATG9A trafficking, and summarize the physiological and pathological implications of this macroautophagy route, from development and stem cell fate to neurodegeneration and cancer

Pillars of Growth in Nebraska’s Non-Metropolitan Economy

Table of Contents About the Authors.......................................................................................................................................1 Executive Summary ....................................................................................................................................2 Chapter 1: Project Scope and Purpose .........................................................................................................9 Chapter 2: Manufacturing ..........................................................................................................................20 Chapter 3: Agriculture ...............................................................................................................................34 Chapter 4: Tourism ...................................................................................................................................47 Chapter 5: Trucking ..................................................................................................................................57 Chapter 6: Professional Services ...............................................................................................................70 Chapter 7: The Information Industry .........................................................................................................83 Chapter 8: Conclusion...............................................................................................................................91 References .........................................................................................................................................10

The complexity of biological control systems: An autophagy case study.

Funder: UK Dementia Research Institute; Id: http://dx.doi.org/10.13039/501100017510Autophagy and YAP1-WWTR1/TAZ signalling are tightly linked in a complex control system of forward and feedback pathways which determine different cellular outcomes in differing cell types at different time-points after perturbations. Here we extend our previous experimental and modelling approaches to consider two possibilities. First, we have performed additional mathematical modelling to explore how the autophagy-YAP1 crosstalk may be controlled by posttranslational modifications of components of the pathways. Second, since analogous contrasting results have also been reported for autophagy as a regulator of other transduction pathways engaged in tumorigenesis (Wnt/β-catenin, TGF-β/Smads, NF-kB or XIAP/cIAPs), we have considered if such discrepancies may be explicable through situations involving competing pathways and feedback loops in different cell types, analogous to the autophagy-YAP/TAZ situation. Since distinct posttranslational modifications dominate those pathways in distinct cells, these need to be understood to enable appropriate cell type-specific therapeutic strategies for cancers and other diseases.We are grateful for funding from the UK Dementia Research Institute (funded by MRC, Alzheimer’s Research UK and the Alzheimer’s Society), a grant of the Romanian Ministry of Research, Innovation and Digitization, CNCS/CCCDI-UEFISCDI, project number PN-III-P1-1.1-PD-2019-0733, within PNCDI-III, and POC/448/1/1/127606 CENEMED project (M.P.)

Endocardita infecțioasă cauzată de Acinetobacter baumannii în cadrul COVID-19

Introducere. Acinetobacter baumanii este un cocobacil gram-negativ, ubiquitar, care rezidă ca floră a pielii și a orofaringelui, care poate supraviețui luni de zile pe suprafețe uscate. Este, în general, considerat agent patogen oportunist și poate provoca o varietate de infecții nosocomiale. Endocardita (EI) provocată de Acinetobacter baumannii este o complicație rară, descrisă la pacienții gravi, imunocompromiși, supuși procedurilor invazive. Cazuri solitare din literatura de specialitate au fost raportate la pacienții cu valve cardiace protezate. Scopul lucrării. Prezentarea cazului clinic de endocardită infecțioasă pe valve native, cauzată de Acinetobacter baumannii, pe fundal de COVID-19 și diabet zaharat de tip 2. Material metode. Pacienta X, 62 ani, internată în secția Pneumologie a SCM ”Sfânta Treime” în august 2020 cu Pneumonie de etiologie mixtă (virală, bacteriană) externată recent dintr-un spital de profil COVID-19, unde timp de 3 a fost tratată, inclusiv în ATI. Colectarea datelor anamnestice, clinico-evolutive, paraclinice și cercetarea revistei literaturii de specialitate. Rezultate. Pacienta la internare prezenta: dispnee la efort minim necesitând oxigenoterapie, tuse muco-purulentă, febră heptică, transpirații abundente, palpitații și xerostomie. Cu 5 ani în urmă a fost diagnosticată cu diabet zaharat tip 2și hipertensiune . Obiectiv: raluri umede buloase mici în regiunile subscapulare bilateral, FCC 96 b/minut, TA 120/40 mmHg hepatomegalie. Pe fundal de tratament antibacterian, inițiat empiric cu vancomicină și gentamicină, febra persista. Datele de laborator relevă caracteristice pentru un sindrom inflamator cu deviere spre stânga, VSH crescut, elevarea proteinei C reactive), dar hiperglicemie, uremie, hipercreatininemie hipertransaminazemie. La hemoculturi a fost decelat Acinetobacter baumannii, sensibil la colicistină ; testul HIV a fost negativ. Radiografia toracelui a evidențiat modificări de tipul ”sticlă mată” , bilateral, subpleural. La ecocardiografia repetată au fost depistate vegetații și regurgitare de gradul III pe valva aortală . În pofida tratamentului intensiv aplicat, evoluția bolii s-a soldat cu deces, cauzat de sindromul insuficienței multiple de organe. Concluzii. Cazul clinic prezentat subliniază severitatea endocarditei nosocomiale produse de Acinetobacter baumannii, dezvoltate pe valve cardiace neprotezate, și importanța fundalului imunocompromis din COVID-19 și diabet zaharat

Endocardita infecțioasă cauzată de Acinetobacter baumannii în cadrul COVID-19

Background. Acinetobacter baumannii infectious endocarditis (EI) is a very rare complication, described in severe patients undergoing invasive procedures. Solitary cases in the literature have been reported in patients with prosthetic heart valves. The objective of the study. Presentation of a clinical case of infectious endocarditis on native valves, caused by Acinetobacter baumannii, on the background of COVID-19 and type 2 diabetes. Material and methods. Patient X, 62 years old, hospitalized in the Pulmonology Department of „St Trinity” MCH in August 2020 with community- acquired pneumonia of mixed etiology (viral, bacterial), recently discharged from a COVID hospital, where she was treated for 3 weeks, including ICU. Anamnestic, clinical, paraclinical data and research of the literature review. Results. On admission, the patient complained: dyspnea at minimal exertion, desaturation, muco-purulent sputum, hectic fever, sweating, and palpitations. She was diagnosed with diabetes and hypertension 5 years ago. Vitals: HR 96, BP 120/40 mmHg and hepatomegaly. Under the empirically initiated antibacterial treatment with vancomycin and gentamicin, the fever persisted. A. baumannii, sensitive to colistin, was detected in blood cultures. Echocardiographically, we detected third-degree regurgitation and vegetations on the aortic valve. Despite the intensive treatment applied, the evolution of the disease resulted in death, caused by the syndrome of multiple organ failure. Conclusions. This clinical case highlights the severity of nosocomial infectious endocarditis, caused by A. baumannii and the importance of the immunocompromised background of COVID-19 and diabetes, similar data being found in the literature.Introducere. Endocardita infecțioasă (EI) prin Acinetobacter baumannii este o complicație rară, descrisă la pacienții gravi, supuși procedurilor invazive. Cazuri solitare din literatura de specialitate au fost raportate la pacienții cu valve cardiace protezate. Scopul lucrării. Prezentarea cazului clinic de endocardită infecțioasă pe valve native, cauzată de Acinetobacter baumannii, pe fundal de COVID-19 și diabet zaharat tip 2. Material și metode. Pacienta X, 62 ani, internată în secția Pneumologie a SCM „Sfânta Treime” în august 2020 cu Pneumonie comunitară de etiologie mixtă (virală, bacteriană), externată recent dintr-un spital de profil COVID, unde timp de 3 săptămâni a fost tratată, inclusiv în ATI. Colectarea datelor anamnestice, clinico-evolutive, paraclinice și cercetarea revistei literaturii de specialitate. Rezultate. Pacienta la internare prezenta: dispnee la efort minim, desaturări, tuse muco-purulentă, febră hectică, transpirații și palpitații. Cu 5 ani în urmă a fost diagnosticată cu DZ și HTA. Obiectiv: FCC 96 b/min., TA 120/40 mmHg și hepatomegalie. Pe fundal de tratament antibacterian inițiat empiric cu vancomicină și gentamicină, febra persista. La hemoculturi a fost decelat A. baumannii, sensibil la colistină. Ecocardiografic am depistat vegetații și regurgitare de gradul III pe valva aortică. În pofida tratamentului intensiv aplicat, evoluția bolii s-a soldat cu deces, cauzat de sindromul insuficienței multiple de organe. Concluzii. Cazul clinic prezentat subliniază severitatea endocarditei infecțioase nosocomiale de etiologie A. baumannii și importanța fundalului imunocompromis din COVID-19 și diabet zaharat, date similare cu literatura de specialitate

INFECTIOUS ENDOCARDITIS CAUSED BY ACINETOBACTER BAUMANNII IN COVID-19

Universitatea de Stat de Medicină şi Farmacie „Nicolae Testemiţanu”, Chişinău, Republica MoldovaIntroducere. Endocardita infecțioasă (EI) prin Acinetobacter baumannii este o complicație rară, descrisă la pacienții gravi, supuși procedurilor invazive. Cazuri solitare din literatura de specialitate au fost raportate la pacienții cu valve cardiace protezate. Scopul lucrării. Prezentarea cazului clinic de endocardită infecțioasă pe valve native, cauzată de Acinetobacter baumannii, pe fundal de COVID-19 și diabet zaharat tip 2. Material și metode. Pacienta X, 62 ani, internată în secția Pneumologie a SCM „Sfânta Treime” în august 2020 cu Pneumonie comunitară de etiologie mixtă (virală, bacteriană), externată recent dintr-un spital de profil COVID, unde timp de 3 săptămâni a fost tratată, inclusiv în ATI. Colectarea datelor anamnestice, clinico-evolutive, paraclinice și cercetarea revistei literaturii de specialitate. Rezultate. Pacienta la internare prezenta: dispnee la efort minim, desaturări, tuse muco-purulentă, febră hectică, transpirații și palpitații. Cu 5 ani în urmă a fost diagnosticată cu DZ și HTA. Obiectiv: FCC 96 b/min., TA 120/40 mmHg și hepatomegalie. Pe fundal de tratament antibacterian inițiat empiric cu vancomicină și gentamicină, febra persista. La hemoculturi a fost decelat A. baumannii, sensibil la colistină. Ecocardiografic am depistat vegetații și regurgitare de gradul III pe valva aortică. În pofida tratamentului intensiv aplicat, evoluția bolii s-a soldat cu deces, cauzat de sindromul insuficienței multiple de organe. Concluzii. Cazul clinic prezentat subliniază severitatea endocarditei infecțioase nosocomiale de etiologie A. baumannii și importanța fundalului imunocompromis din COVID-19 și diabet zaharat, date similare cu literatura de specialitate.Background. Acinetobacter baumannii infectious endocarditis (EI) is a very rare complication, described in severe patients undergoing invasive procedures. Solitary cases in the literature have been reported in patients with prosthetic heart valves. The objective of the study. Presentation of a clinical case of infectious endocarditis on native valves, caused by Acinetobacter baumannii, on the background of COVID-19 and type 2 diabetes. Material and methods. Patient X, 62 years old, hospitalized in the Pulmonology Department of „St Trinity” MCH in August 2020 with community-acquired pneumonia of mixed etiology (viral, bacterial), recently discharged from a COVID hospital, where she was treated for 3 weeks, including ICU. Anamnestic, clinical, paraclinical data and research of the literature review. Results. On admission, the patient complained: dyspnea at minimal exertion, desaturation, muco-purulent sputum, hectic fever, sweating, and palpitations. She was diagnosed with diabetes and hypertension 5 years ago. Vitals: HR 96, BP 120/40 mmHg and hepatomegaly. Under the empirically initiated antibacterial treatment with vancomycin and gentamicin, the fever persisted. A. baumannii, sensitive to colistin, was detected in blood cultures. Echocardiographically, we detected third-degree regurgitation and vegetations on the aortic valve. Despite the intensive treatment applied, the evolution of the disease resulted in death, caused by the syndrome of multiple organ failure. Conclusions. This clinical case highlights the severity of nosocomial infectious endocarditis, caused by A. baumannii and the importance of the immunocompromised background of COVID-19 and diabetes, similar data being found in the literature

α-Catenin levels determine direction of YAP/TAZ response to autophagy perturbation

The factors regulating cellular identity are critical for understanding the transition from health to disease and responses to therapies. Recent literature suggests that autophagy compromise may cause opposite effects in different contexts by either activating or inhibiting YAP/TAZ co-transcriptional regulators of the Hippo pathway via unrelated mechanisms. Here, we confirm that autophagy perturbation in different cell types can cause opposite responses in growth-promoting oncogenic YAP/TAZ transcriptional signalling. These apparently contradictory responses can be resolved by a feedback loop where autophagy negatively regulates the levels of α-catenins, LC3-interacting proteins that inhibit YAP/TAZ, which, in turn, positively regulate autophagy. High basal levels of α-catenins enable autophagy induction to positively regulate YAP/TAZ, while low α-catenins cause YAP/TAZ activation upon autophagy inhibition. These data reveal how feedback loops enable post-transcriptional determination of cell identity and how levels of a single intermediary protein can dictate the direction of response to external or internal perturbations

Findings of the WMT 2017 Biomedical Translation Shared Task

Automatic translation of documents is an important task in many domains, including the biological and clinical domains. The second edition of the Biomedical Translation task in the Conference of Machine Translation focused on the automatic translation of biomedical-related documents between English and various European languages. This year, we addressed ten languages: Czech, German, English, French, Hungarian, Polish, Portuguese, Spanish, Romanian and Swedish. Test sets included both scientific publications (from the Scielo and EDP Sciences databases) and health-related news (from the Cochrane and UK National Health Service web sites). Seven teams participated in the task, submitting a total of 82 runs. Herein we describe the test sets, participating systems and results of both the automatic and manual evaluation of the translations