High-Throughput, Large-Scale SNP Genotyping: Bioinformatics Considerations

In order to provide a high-throughput, large-scale genotyping facility at the national level we have developed a set of inter-dependent information systems. A combination of commercial, publicly-available and in-house developed tools links a series of data repositories based both on flat files and relational databases providing an almost complete semi-automated pipeline

¿Hacia donde va la ciencia? Perspectivas estrábicas para un análisis de la tecno-ciencia

Si por algún motivo, algún lector incauto ha comenzado a leer este volumen a partir de aquí, quiero prevenirle de que nos encontramos en la sección Perspectivas de la revista teórica Perspectivas Metodológicas. Hago esta aclaración exceptuando a los amigos, incautos naturalmente por este último motivo y que por ello saben lo que vendrá, puesto que me voy a valer del favor que me hicieran los responsables de la presente edición en incluir esta runfla de frases en la sección mencionada.Lo que sigue, como advierte el título, son “perspectivas estrábicas”, en el pleno sentido oftalmológico del término, tanto por su forma como por su finalidad. Aclaro. Son patológicas en su forma ya que intentan mirar a su objeto -el modo actual de producción de conocimientos- “torciendo la vista”. Es decir, intentando sacar conclusiones en la comparación con otro proceso-objeto. Y son patológicas en su finalidad porque tienen por objetivo intentar “torcer la mirada” del lector hacia lugares no hipnotizados por el éxito de la tecnociencia. En fin, por un lado, desacreditar la ilusión filosófica de que la observación directa de los fenómenos estudiados pueda presentar, a la manera de un espejo, lo real “tal cual es”, y por otro, reivindicar la posibilidad de un conocimiento riguroso válido que no se encuentre atrapado en las redes de un pragmatismo utilitario

L’agro-alimentaire chez les géographes des campagnes en France au xxe siècle

Quelle appropriation du thème de l’agro-alimentaire par les géographes des campagnes en France depuis le début du xxe siècle ? En ne retenant que les industries agro-alimentaires au contact du monde agricole, hors vin, et une sélection d’articles et de thèses considérés comme représentatifs, trois phases s’individualisent. Une seule (années 1960-1990) les érige en tant qu’objet géographique alors que les deux autres les relèguent, soit comme identificateur de l’économie agricole dans un contexte d’agrocentrisme des travaux (fin xixe-années 1950), soit comme acteur d’agrofilières et de bassins de production, dans un contexte de transition agricole cette dernière décennie (années 1970-2000).How have geographers specialised in the French countryside appropriated the agribusiness subject since the early 20th century? Considering only agribusinesses in touch with the agricultural world – excluding wine-growing – and a selection of articles and theses considered as representative, three different phases appear. One only (1960s-1990s) considers them as geographical objects, whereas the other two relegate them either as rural economy identifiers in a context of agri-centered works (late 19th Century-1950s) or as actors in agri-business channels or production areas in a context of agricultural transition in the last decades (1970s-2000s)

El marxismo, una teorética materialista Los métodos y el individualismo metodológico

Como señala Fredric Jameson, basado en las diferentes fases de la dinámica del capital propuesto por Ernest Mandel, las nuevas versiones del marxismo no dejan de corresponder a cada nueva fase del capitalismo. En este sentido, el marxismo analítico intenta revisar los tópicos metodológicos específicos de la teoría marxista, e incluye, al mismo tiempo, un énfasis sobre las conceptualizaciones éticas del joven Marx. En el presente trabajo, nos proponemos la compleja tarea de un análisis crítico de la corriente mencionada, la cual se sustenta en una cierta de individualismo metodológico. En función de ello, aquí trataremos la cuestión de las continuidades entre la filosofía marxista y el materialismo histórico

¿Hacia donde va la ciencia? Perspectivas estrábicas para un análisis de la tecno-ciencia

Si por algún motivo, algún lector incauto ha comenzado a leer este volumen a partir de aquí, quiero prevenirle de que nos encontramos en la sección Perspectivas de la revista teórica Perspectivas Metodológicas. Hago esta aclaración exceptuando a los amigos, incautos naturalmente por este último motivo y que por ello saben lo que vendrá, puesto que me voy a valer del favor que me hicieran los responsables de la presente edición en incluir esta runfla de frases en la sección mencionada.Lo que sigue, como advierte el título, son “perspectivas estrábicas”, en el pleno sentido oftalmológico del término, tanto por su forma como por su finalidad. Aclaro. Son patológicas en su forma ya que intentan mirar a su objeto -el modo actual de producción de conocimientos- “torciendo la vista”. Es decir, intentando sacar conclusiones en la comparación con otro proceso-objeto. Y son patológicas en su finalidad porque tienen por objetivo intentar “torcer la mirada” del lector hacia lugares no hipnotizados por el éxito de la tecnociencia. En fin, por un lado, desacreditar la ilusión filosófica de que la observación directa de los fenómenos estudiados pueda presentar, a la manera de un espejo, lo real “tal cual es”, y por otro, reivindicar la posibilidad de un conocimiento riguroso válido que no se encuentre atrapado en las redes de un pragmatismo utilitario

femtosecond laser ablation

Femtosecond laser ablation was investigated as a solid sampling method for elemental chemical analysis. In comparison to the sampling with longer laser pulses, two aspects could be improved by using ultrashort pulses: elimination of the elemental fractionation from the ablation crater, which is necessary for an accurate quantitative analysis, and better control of the material removal (especially for metals), which increases the spatial resolution of microanalysis. Basic aspects of ultrashort laser ablation were studied using laser induced fluorescence (LIF), laser induced breakdown spectroscopy (LIBS) and laser ablation time of flight mass spectrometry (LA-TOF-MS). The results of the LIF study of plasma expansion fit to the spherical expansion model. The spectroscopic studies of plasma emission and determination of the excitation temperature served to find suitable conditions for quantitative elemental analysis by LIBS. The highly energetic ions (10 keV) that antecede the plume expansion were observed under high vacuum conditions in the TOF spectrometer during ablation of metals and semiconductors. Measurements with additional acceleration indicate high ionisation states.The elimination of the elemental fractionation was demonstrated in LIBS and fs laser ablation inductively coupled plasma mass spectrometry (LA-ICP-MS) experiments on metals, alloys and glass samples. The in-depth profiling of thin layered structures was proposed as the most promissing application of the femtosecond laser ablation in chemical analytics. Rapid analysis of multilayered samples with depth resolution better than 100 nm and lateral resolution of 10-50 µm is feasible. A homogeneous laser beam intensity profile and a high pulse-to-pulse energy stability are the prerequisites for a successful in-depth profiling

PERSONALITY TRAITS AND TREATMENT COMPLIANCE IN PATIENTS WITH TYPE 2 DIABETES MELLITUS

Background: Personality traits, especially types A/B and D, have been linked to negative outcomes in various somatic illnesses. In this study, we aimed to assess the prevalence of personality types and their association with certain aspects of treatment compliance in patients with type 2 diabetes mellitus (T2DM). Subjects and methods: Participants in this study were 91 in- and outpatients suffering from T2DM and 73 healthy control subjects. All the participants filled out standardized self-report measures of personality types A/B (Bortner Rating Scale) and D (Type D Scale; DS-14). In addition, two aspects of treatment compliance were assessed: blood glucose assessment and visits to the primary care physician. Results: We found a higher incidence of personality type B (χ2=4.086, p=0.049) and personality type D (χ2=4.215, p=0.048) in the group of T2DM patients compared to healthy controls. Patients with type D personality were less compliant in terms of the visits to the primary care physician (χ2=4.229, p=0.040), although they were more prevalent among those who were compliant regarding the frequency of blood glucose assessment (χ2=4.022, p=0.045). Conclusion: The current study shows that type B and type D personality are frequent among T2DM patients. Moreover, type D personality could lead to certain aspects of suboptimal health behaviors and, therefore, interfere with disease management in diabetic populations

Drug-eluting balloons in patients with non-ST elevation acute coronary syndrome

AbstractBackgroundWe compared efficacy of bare-metal stent (BMS) and drug-eluting balloon (DEB) combination vs BMS alone, in patients with non-ST elevation acute coronary syndrome treated with percutaneous coronary intervention (PCI).MethodsPatients with non-ST elevation myocardial infarction (NSTEMI) or unstable angina (UA) were randomized to BMS only or BMS+DEB group. Angiographic follow-up was performed after 6 months. The primary endpoints were binary in-stent restenosis (ISR) and late lumen loss (LLL) and the secondary endpoints were target lesion revascularization (TLR), stent thrombosis (ST), and new acute coronary syndrome (ACS).ResultsA total of 85 patients were enrolled, 44 (BMS) and 41 (BMS+DEB). The median age was 67 (36–84) years and 68 (80%) were male. Fifty-two patients (61.2%) had NSTEMI and 33 patients (38.8%) UA. There was no difference in patient demographics, risk factors, and clinical characteristics, except for more smokers in the BMS+DEB group 18/41 (43.9%) vs 9/44 (20.5%). At follow-up, no significant difference in binary ISR was found; p=0.593, but LLL was significantly lower in the BMS+DEB group 0.68 (0.00–2.15) mm vs 0.22 (0.00–2.35) mm; p=0.002. The difference in major adverse cardiac events (MACE) rate combining TLR, ST, and ACS, between the groups was also non-significant, 29.5% (BMS) vs 24.4% (BMS+DEB); p=0.835. One patient had a subacute ST (BMS+DEB) due to clopidogrel resistance.ConclusionPatients treated with BMS+DEB combination for non-ST elevation acute coronary syndrome had significantly less LLL in comparison to patients treated with BMS alone but without an impact on patient clinical outcomes