Transcription factors relevant to auxin signalling coordinate broad-spectrum metabolic shifts including sulphur metabolism

A systems approach has previously been used to follow the response behaviour of Arabidopsis thaliana plants upon sulphur limitation. A response network was reconstructed from a time series of transcript and metabolite profiles, integrating complex metabolic and transcript data in order to investigate a potential causal relationship. The resulting scale-free network allowed potential transcriptional regulators of sulphur metabolism to be identified. Here, three sulphur-starvation responsive transcription factors, IAA13, IAA28, and ARF-2 (ARF1-Binding Protein), all of which are related to auxin signalling, were selected for further investigation. IAA28 overexpressing and knock-down lines showed no major morphological changes, whereas IAA13- and ARF1-BP-overexpressing plants grew more slowly than the wild type. Steady-state metabolite levels and expression of pathway-relevant genes were monitored under normal and sulphate-depleted conditions. For all lines, changes in transcript and metabolite levels were observed, yet none of these changes could exclusively be linked to sulphur stress. Instead, up- or down-regulation of the transcription factors caused metabolic changes which in turn affected sulphur metabolism. Auxin-relevant transcription factors are thus part of a complex response pattern to nutrient starvation that serve as coordinators of the metabolic shifts driving sulphur homeostasis rather then as direct effectors of the sulphate assimilation pathway. This study provides the first evidence ever presented that correlates auxin-related transcriptional regulators with primary plant metabolism

Transcriptional profiles of drought-responsive genes in modulating transcription signal transduction, and biochemical pathways in tomato

To unravel the molecular mechanisms of drought responses in tomato, gene expression profiles of two drought-tolerant lines identified from a population of Solanum pennellii introgression lines, and the recurrent parent S. lycopersicum cv. M82, a drought-sensitive cultivar, were investigated under drought stress using tomato microarrays. Around 400 genes identified were responsive to drought stress only in the drought-tolerant lines. These changes in genes expression are most likely caused by the two inserted chromosome segments of S. pennellii, which possibly contain drought-tolerance quantitative trait loci (QTLs). Among these genes are a number of transcription factors and signalling proteins which could be global regulators involved in the tomato responses to drought stress. Genes involved in organism growth and development processes were also specifically regulated by drought stress, including those controlling cell wall structure, wax biosynthesis, and plant height. Moreover, key enzymes in the pathways of gluconeogenesis (fructose-bisphosphate aldolase), purine and pyrimidine nucleotide biosynthesis (adenylate kinase), tryptophan degradation (aldehyde oxidase), starch degradation (β-amylase), methionine biosynthesis (cystathionine β-lyase), and the removal of superoxide radicals (catalase) were also specifically affected by drought stress. These results indicated that tomato plants could adapt to water-deficit conditions through decreasing energy dissipation, increasing ATP energy provision, and reducing oxidative damage. The drought-responsive genes identified in this study could provide further information for understanding the mechanisms of drought tolerance in tomato

Tilintarkastuksen tarpeellisuus ja siihen vaikuttavat tekijät pohjoissuomalaisessa pienyritysaineistossa

Suomen tilintarkastuslakiin on vuoden 2006 aikana tulossa muutoksia, jotka koskettavat todennäköisesti myös pienyrityksiä. Pienyritysten tilintarkastusvelvollisuus saattaa poistua tietyt kokorajat alittavilta yrityksiltä kokonaan, ja maallikkotilintarkastuksesta luopuminen on myös todennäköistä. Tilintarkastuksen yhteiskunnallinen merkitys on nähty tärkeänä pienyritysten kohdalla, joissa tilintarkastuksella on haluttu varmistaa tilinpäätösinformaation laatu. Tämän tutkimuksen tavoitteena on selvittää pienyrityksen tilintarkastuksen tarpeellisuuteen vaikuttavia tekijöitä, jonka lisäksi tarkoituksena on tuoda esiin ajankohtaisia pienyrittäjien näkemyksiä tulossa olevan tilintarkastuslakimuutoksen tiimoilta. Tutkimus kohdistuu 250:een Kainuun, Lapin ja Pohjois-Pohjanmaan alueella sijaitsevaan pienyritykseen, joiden liikevaihto on 0,035 - 2,5 miljoonaa euroa. Tutkimuksen toteutustapa on kvantitatiivinen, internetissä toteutettava kyselytutkimus. Tutkimustulosten mukaan pienyrityksen rakenteellisilla tekijöillä, taloushallinnon osaamisella ja taloudellisella tilanteella on hyvin vähäistä merkitystä tilintarkastuksen tarpeellisuuteen niin yritykselle itsellensä, kuin sen sidosryhmillekin. Ilman näiden taustamuuttujien vaikutusta tilintarkastus koetaan tarpeelliseksi pääasiassa verohallinnolle, pankille sekä muulle rahoittajalle. Tilintarkastus koetaan tarpeettomaksi yhden miehen yrityksissä ja perheyrityksissä. Tilintarkastus koetaan sitä tarpeellisemmaksi, mitä suu-remmasta yrityksestä on kysymys, ja mitä enemmän yrityksellä on hoidettavanaan yhteiskunnallisia velvoitteita. Noin puolet yrityksistä valitsisi tilintarkastuksen suoritettavaksi ilman lakisääteistä velvoitetta. Tilintarkastuksen sidosryhmämerkitys osoittautui kirjallisuudessa esitettyä huomattavasti vähäisemmäksi, sillä tulosten mukaan sidosryhmien pyytämien tilintarkastuskertomusten määrä jäi alhaiseksi. Sidosryhmistä ainoastaan pankin todettiin pyytäneen noin joka toi-selta pienyritykseltä tilintarkastuskertomuksen, verohallinnon ja muun rahoittajan pyytä-essä kertomuksen joka kolmannelta yritykseltä. Tutkimus nosti siten esiin uuden kysy-myksen siitä, mikä on pienyrityksen tilintarkastuskertomuksen todellinen merkitys sidos-ryhmille