Substantial reprogramming of the Eutrema salsugineum (Thellungiella salsuginea) transcriptome in response to UV and silver nitrate challenge

BACKGROUND: Cruciferous plants synthesize a large variety of tryptophan-derived phytoalexins in response to pathogen infection, UV irradiation, or high dosages of heavy metals. The major phytoalexins of Eutrema salsugineum (Thellungiella salsuginea), which has recently been established as an extremophile model plant, are probably derivatives of indole glucosinolates, in contrast to Arabidopsis, which synthesizes characteristic camalexin from the glucosinolate precursor indole-3-acetaldoxime. RESULTS: The transcriptional response of E. salsugineum to UV irradiation and AgNO(3) was monitored by RNAseq and microarray analysis. Most transcripts (respectively 70% and 78%) were significantly differentially regulated and a large overlap between the two treatments was observed (54% of total). While core genes of the biosynthesis of aliphatic glucosinolates were repressed, tryptophan and indole glucosinolate biosynthetic genes, as well as defence-related WRKY transcription factors, were consistently upregulated. The putative Eutrema WRKY33 ortholog was functionally tested and shown to complement camalexin deficiency in Atwrky33 mutant. CONCLUSIONS: In E. salsugineum, UV irradiation or heavy metal application resulted in substantial transcriptional reprogramming. Consistently induced genes of indole glucosinolate biosynthesis and modification will serve as candidate genes for the biosynthesis of Eutrema-specific phytoalexins. ELECTRONIC SUPPLEMENTARY MATERIAL: The online version of this article (doi:10.1186/s12870-015-0506-5) contains supplementary material, which is available to authorized users

Investigação de um sistema de alimentação em recém-nascidos prematuros a partir de estimulação gustativa

Objetivo: investigar a existência do sistema de alimentação em recém-nascidos prematuros a partir da estimulação gustativa. Métodos: estudo experimental, analítico, duplo-cego. Participaram 90 recém-nascidos prematuros, de uma maternidade pública de Sergipe. O teste foi filmado, constituindo-se por três momentos de cinco minutos. O primeiro e último momento sem realizar estímulo, o segundo momento com estimulação gustativa, sendo que os recém-nascidos foram divididos em dois grupos (água ou sacarose). Foram estudados os comportamentos específicos sucção de mão direita e esquerda, protrusão de língua e movimentos de sucção nos estados comportamentais sono profundo, sono leve, sonolento, agitado/irritado e choro. Para caracterizar a população foram utilizadas média, desvio-padrão e prevalências. Foi utilizado o teste não paramétrico Mann-Whitney para comparação de médias. O teste de Spearman verificou correlação entre estados comportamentais e comportamentos específicos em cada momento do teste. O valor de p foi significante quando menor que 0,05. Resultados: independente do estímulo administrado, a correlação aumentou em todos os comportamentos específicos. Comparando os grupos separadamente, após a estimulação, observou-se aumento de correlação em sucção de mão direita e protrusão de língua para ambos os grupos. O mesmo aconteceu em sucção, com exceção do estado agitado/irritado. Após a estimulação, houve maior correlação para o comportamento de sucção de mão esquerda no grupo sacarose quando comparado ao grupo água. Os resultados evidenciam que estímulos gustativos podem contribuir na prontidão para alimentação nesta população. Conclusões: evidenciou-se nos recém-nascidos prematuros aumento de correlação para os comportamentos específicos relacionados ao sistema de alimentação, após estimulação oral, o que vislumbra a possibilidade da estimulação gustativa ser utilizada para ativação de um sistema de alimentação em recém-nascidos prematuros. _________________________________________________________________________________________ ABSTRACT: Purpose: to investigate the existence of the alimentation system in premature newborns in response to gustatory stimulation. Methods: experimental, analytical, double-blind study. 90 premature newborns of a public maternity in Sergipe took part in the test which was filmed and divided into three parts of five minutes. In the first and last, there was no stimulus; in the second, the gustatory stimulation was applied and the newborn children were divided into two groups (water or sucrose). We studied the specific behaviors suction right and left hands, tongue protrusion and suction movements in behavioral states deep sleep, light sleep, drowsy, restless / irritable and crying. In the statistical analysis of the population, average, standard deviation and prevalence studies were performed. We used the non-parametric Mann-Whitney test to compare averages. The Spearman test observed correlation between behavioral states at each time of the test. The p value was significant when less than 0.05. Results: independent of the given stimulus, the correlation increased in all specific behaviors. Comparing the groups separately, after stimulation, we observed an increase in correlation in right hand suction and tongue protrusion for both. The same happened in suction, except for the agitated/irritated state. After stimulation, there was a higher correlation to the behavior of left hand suction in the sucrose group when compared to water. The results show that gustatory stimuli may contribute to the readiness to feed this population. Conclusions: it was found in premature newborns an increased in correlation for the specific behaviors related to the alimentation system after oral stimulation, which envisions the possibility of gustatory stimulation be used for activating a alimentation system in premature newborns

HPLC analyses of cultures of <i>Phoma</i> spp.: Differentiation among groups and species through secondary metabolite profiles

The metabolite profiles of 26 isolates of the blackleg fungus (Leptosphaeria maculans (Desm.) Ces. et de Not., asexual stage Phoma lingam (Tode ex Fr.) Desm.), obtained from diverse parts of the world (part of the International Blackleg Crucifer Network collection), were studied utilizing specific culture conditions, HPLC analysis, and a set of chemical markers. This fungus is the causative agent of blackleg disease of brassica oilseeds; a virulent strain of the pathogen has caused significant rapeseed (Brassica napus L., and B. rapa L.) and canola (B. napus L., and B. rapa L.) losses in Canada, and is also considered a serious agricultural problem worldwide. Effective surveys of blackleg epidemics require simple and reliable analytical methodology to differentiate among the diverse groups of isolates. The chemical analysis of phytotoxins and related secondary metabolites is perhaps one of the most discriminating and the least ambiguous methods for differentiation of Phoma blackleg isolates. Following HPLC analyses, the 26 isolates could be placed in three main groups, irrespective of country of origin: isolates producing phomamide and sirodesmins, isolates producing indolyl dioxopiperazines, and isolates producing polyketides. Discussion of the implications of our findings and suggestions for species reclassification are provided. </jats:p

Estimulação sensoriomotora intra e extra-oral em neonatos prematuros: revisão bibliográfica

A prematuridade é um dos fatores mais incidentes no ambiente hospitalar infantil. O trabalho fonoaudiológico realizado em hospitais com foco no recém-nascido prematuro tem conquistado cada vez mais espaço e apresenta como proposta principal a detecção de problemas relacionados à deglutição, proporcionando recurso aos neonatos que fazem uso de via alternativa de alimentação, devido à imaturidade orgânica. O uso de técnicas para maturação do sistema sensório-motor-oral vem sendo explorado a fim de que o recém-nascido pré-termo realize transição, mais segura e em menor tempo, para alimentação plena por via oral. O objetivo deste estudo é realizar revisão sistemática da literatura nacional e internacional a fim de elencar diferentes técnicas e elucidar sobre a eficácia das mesmas, quanto à maturação do sistema sensório-motor-oral em neonatos prematuros que permanecem em ambiente hospitalar. Segundo a literatura, a técnica mais utilizada no Brasil é a sucção não nutritiva com dedo mínimo enluvado ou chupeta ortodôntica. Em outros países, as técnicas mais citadas foram a sucção não nutritiva com chupeta seguida da estimulação do sistema sensório-motor-oral. Tanto as técnicas utilizadas no Brasil quanto no exterior têm refletido positivamente no desenvolvimento das funções orais de neonatos. Levando em conta a necessidade de promoção do aleitamento materno exclusivo, publicações recentes evidenciaram alarmante e preocupante percentual de uso de bicos sintéticos para estimulação em unidades de terapia intensiva neonatal