Stérilisation par plasma à basse pression : mécanismes et effets sur les polymères biomédicaux

Problématique de la stérilisation clinique -- La stérilisation par plasma -- Innocuité des systèmes de stérilisation commerciaux à base de plasma -- Safety of plasma-based sterilization : surface modifications of polymeric medical devices induced by Sterrad® and Plazlyte[TM indice supérieur] processes -- Justification du choix des cathéters d'électrophysiologie -- Plasma-based sterilization : effect on surface and bulk properties, and hydrolytic stability of reprocessed polyurethane electrophysiology catheters -- Mécanisme de destruction des micro-organismes par plasma basse pression -- Effect of gas composition on spore mortality and etching during low-pressure plasma sterilization -- Effet de l'emballage sur l'efficacité du plasma O[indice inférieur 2]CF[indice inférieur 4] -- Sterilization by low-pressure plasma : the role of vacuum-ultraviolet radiation -- Effet du plasma sur les spores et les matériaux polymériques -- Innocuité et mécanisme des sytèmes commerciaux -- Mécanismes de la stérilisation par plasma froid -- Efficacité des UV/VUV -- Axe de développement d'un nouveau stérilisateur par plasma

A Cell Wall Proteome and Targeted Cell Wall Analyses Provide Novel Information on Hemicellulose Metabolism in Flax

International audienceExperimentally-generated (nanoLC-MS/MS) proteomic analyses of four different flax organs/tissues (inner-stem, outer-stem, leaves and roots) enriched in proteins from 3 different sub-compartments (soluble-, membrane-, and cell wall-proteins) was combined with publically available data on flax seed and whole-stem proteins to generate a flax protein database containing 2996 nonredundant total proteins. Subsequent multiple analyses (MapMan, CAZy, WallProtDB and expert curation) of this database were then used to identify a flax cell wall proteome consisting of 456 nonredundant proteins localized in the cell wall and/or associated with cell wall biosynthesis, remodeling and other cell wall related processes. Examination of the proteins present in different flax organs/tissues provided a detailed overview of cell wall metabolism and highlighted the importance of hemicellulose and pectin re-modeling in stem tissues. Phylogenetic analyses of proteins in the cell wall proteome revealed an important paralogy in the class IIIA xyloglucan endo-transglycosy-lase/hydrolase (XTH) family associated with xyloglucan endo-hydrolase activity. Immunolocalisation, FT-IR microspectroscopy, and en-zymatic fingerprinting indicated that flax fiber primary/S1 cell walls contained xyloglucans with typical substituted side chains as well as glucuronoxylans in much lower quantities. These results suggest a likely central role of xyloglucans and endotransglucosylase/hydrolase activity in flax fiber formation and cell wall remodeling processes. Molecular & Cellula

Nouveaux outils pour un protéome ciblé

International audienc

Recherche de protéines utilisant des systèmes d import alternatifs pour leur adressage vers les chloroplastes

L endosymbiose à l origine de l acquisition des plastes par les cellules végétales s est accompagné d un transfert de gènes du génome de l endosymbiote vers le génome nucléaire de l hôte. Cet évènement a conduit à la mise en place de systèmes d adressage et d import des protéines chloroplastiques. De récentes études mettent en lumière l existence de nouvelles voies d adressage des protéines vers les chloroplastes. Dans ce contexte, ce travail de thèse avait pour but l identification d autres protéines empruntant des voies alternatives d adressage chloroplastique. Pour ce faire, deux stratégies ont été retenues. La première était basée sur des méthodologies de capture spécifiques des N-glycoprotéines. La seconde stratégie était basée sur l analyse protéomique des fractions chloroplastiques suivie de la recherche de protéines candidates par analyse in silico. L analyse de la localisation subcellulaire des protéines sélectionnées révèle une localisation chloroplastique pour trois protéines.One important mechanism that participates in the regulation of accumulation of plastid proteins is the protein targeting that allows import of thousands of nuclear encoded proteins to the chloroplast. Recent studies have revealed intriguing arrays of alternative or noncanonical chloroplast import pathways. In this context, the aim of this study was to identify other plastid proteins trafficking through these alternative targeting pathways and to understand the mechanisms that control these pathways. Two complementary approaches have been initiated. The first one was based on specific glycoprotein isolation methods. The second strategy was based on a systematic proteomic analysis, targeted to Arabidopsis subplastidial fractions, and followed by in silico identification of proteins containing noncanonical targeting sequences. Subcellular localization analyses of selected proteins reveal that some of these proteins are targeted to chloroplasts while lacking any classical N-terminal signal.ROUEN-BU Sciences (764512102) / SudocSudocFranceF