Rozwój technologii proekologicznych jako motor postępu i rozwoju gospodarczego

W opracowaniu zaprezentowano wybrane obszary i dziedziny z zakresu technologii ekologicznych, korelujących z dążeniami osiągnięcia celów związanych z ochroną środowiska w kontekście europejskim, ze szczególnym uwzględnieniem Niemiec oraz Polski. Dążenie do rozwoju technologii ekologicznych dobrze wpływa na rozwój przedsiębiorczości oraz innowacyjności, oddziaływując jednocześnie korzystnie na wzrost gospodarczy, daje szanse na rozbudowanie działalności MŚP oraz przyczynia się do powstawania miejsc pracy

Rynek pracy w Niemczech w latach 2000–2009. Zmiany form zatrudnienia

Celem opracowania jest przedstawienie sytuacji na niemieckim rynku pracy po roku 2000 przy zastosowaniu analizy danych i przedstawieniu ich graficznie oraz opisu nowych form zatrudnienia. Opracowanie składa się z 2 części, wstępu oraz zakończenia. W części pierwszej przedstawiona została sytuacja na rynku pracy pod kątem wskaźnika zatrudnienia oraz stopy bezrobocia w latach 2000–2009 przy uwzględnieniu przeprowadzonych reform zasiłków dla bezrobotnych (2005 r.). W części drugiej opracowania opisane zostały te nowe formy zatrudnienia (Minijob, niskopłatne stanowiska pracy, praca tymczasowa), które konkurują i wypierają w ostatnich latach zatrudnienie, stałe zapewniając pracodawcom niezbędną elastyczność, szczególnie ważną w dobie kryzysu. Opis tych form zatrudnienia poszerzony został o analizę zagrożenia ubóstwem wśród grup pracowników zatrudnionych na niskopłatnych i tymczasowych stanowiskach pracy. W zakończeniu zebrano najważniejsze wnioski opracowania

Regulatory mechanisms of mammalian replication origins

Tesis Doctoral inédita leída en la Universidad Autónoma de Madrid, Facultad de Ciencias, Departamento de Biología Molecular. Fecha de lectura: 14-12-2017Esta tesis tiene embargado el acceso al texto completo hasta el 14-06-2019In mammalian cells, DNA replication starts from thousands of replication origins whose activation is tightly regulated in the cell division cycle. In this study, we have aimed at better understanding the regulation of origin selection and activation in mouse embryonic stem cells and human cancer cells. In the first part of this dissertation, we set out to investigate the dynamics of origin activation in response to stress conditions that slow down or stall replication forks. This situation promotes the activation of otherwise ‘dormant’ origins, which provide a backup mechanism to complete replication and prevent genomic instability. Using the SNS-Seq technique based on deep-sequencing of short nascent DNA strands, we have mapped the genomic positions of origins in control growth conditions and two experimental settings that trigger the activation of extra origins: (a) exposure to DNA polymerase inhibitor aphidicolin; (b) overexpression of CDC6, a limiting factor for origin licensing and activation in primary murine cells. Using SNS-Seq data we also determined the efficiency of activation of each individual origin in the cell population. Constitutive origins, in contrast to stress-responsive ones, show a strong preference towards open, transcriptionally active chromatin and display higher efficiency. Our results strongly suggest that the main response to stress is mediated by modulating the activity of pre-existing origins rather than the activation of new ones. We have also carried out an unprecedented integration of linear origin maps into 3D chromatin networks that reveals how origins tend to group together in clusters that likely correspond to DNA replication factories. Origin connections are found within the same topologically associated domain (TAD), but also between origins located in different TADs. We report for the first time that the connectivity of an origin is directly proportional to its efficiency of activation. In the second part, we aimed at dissecting a novel mechanism that regulates CDC6 protein stability. Downregulation of CDC7 kinase, known to activate the MCM helicase at replication origins, caused a drop in cellular CDC6 levels. CDC6 was phosphorylated by CDC7 in vitro and became destabilized in vivo when all possible CDC7-dependent phosphorylation sites were mutated. We report a previously unknown role of CDC7 in the regulation of CDC6 stability that is mediated by a combination of direct and indirect mechanisms.This Thesis was supported by a “La Caixa”/CNIO Fellowship from the International PhD Programme and research grants from the Spanish Ministerio de Economía y Competitividad (BFU2013-49153-P and BFU2016-80402-R

3D-GNOME 2.0: a three-dimensional genome modeling engine for predicting structural variation-driven alterations of chromatin spatial structure in the human genome.

Structural variants (SVs) that alter DNA sequence emerge as a driving force involved in the reorganisation of DNA spatial folding, thus affecting gene transcription. In this work, we describe an improved version of our integrated web service for structural modeling of three-dimensional genome (3D-GNOME), which now incorporates all types of SVs to model changes to the reference 3D conformation of chromatin. In 3D-GNOME 2.0, the default reference 3D genome structure is generated using ChIA-PET data from the GM12878 cell line and SVs data are sourced from the population-scale catalogue of SVs identified by the 1000 Genomes Consortium. However, users may also submit their own structural data to set a customized reference genome structure, and/or a custom input list of SVs. 3D-GNOME 2.0 provides novel tools to inspect, visualize and compare 3D models for regions that differ in terms of their linear genomic sequence. Contact diagrams are displayed to compare the reference 3D structure with the one altered by SVs. In our opinion, 3D-GNOME 2.0 is a unique online tool for modeling and analyzing conformational changes to the human genome induced by SVs across populations. It can be freely accessed at https://3dgnome.cent.uw.edu.pl/

Self-perception of body weight status by 13-year-olds with respect to the parents’ body mass index

WSTĘP. Prawidłowa ocena własnej masy ciała jest elementem zapobiegania i kontroli nadwagi i otyłości. Celem pracy była analiza adekwatności oceny własnej masy ciała przez 13-latków w Polsce w zależności od wskaźnika masy ciała (BMI) rodziców. MATERIAŁ I METODY. Analizy wykonano w 561-osobowej grupie 13-latków i ich rodziców. Badana grupa pochodziła z trzeciego etapu badań kohorty ogólnopolskiej reprezentatywnej grupy dzieci urodzonych w 1995 roku. Badanie wykonano metodą sondażu z wykorzystaniem ankiet dla dzieci i rodziców. Pomiary wysokości i masy ciała przeprowadziły pielęgniarki szkolne. W ocenie BMI 13-latków wykorzystano normy referencyjne Światowej Organizacji Zdrowia. Wskaźnik BMI rodziców obliczono na podstawie danych uzyskanych z ankiet. WYNIKI. Stwierdzono istotne statystycznie różnice w adekwatności oceny własnej masy ciała w zależności od płci (p < 0,001). Nieprawidłowo swoją masę ciała oceniło 36% dziewcząt i 38,5% chłopców. Chłopcy mieli tendencję do postrzegania siebie jako &#8222;za szczupłych&#8221;, a dziewczęta &#8212; jako &#8222;za grube&#8221;. Masa ciała obojga rodziców wpływała istotnie statystycznie (p = 0,002 w odniesieniu do matki i p = 0,016 w odniesieniu do ojca) na prawidłowość oceny własnej masy ciała przez dziewczęta. Ponad 2/3 dziewcząt z nadmiarem masy ciała, których rodzice byli otyli lub na granicy otyłości, oceniło swoją masę ciała jako prawidłową. WNIOSKI. Masa ciała rodziców wpływa na prawidłowość oceny masy ciała ich 13-letnich dzieci, zwłaszcza córek. Działania zapobiegawcze i interwencyjne, ukierunkowane na zmniejszenie masy ciała nastolatków, powinny być skierowane do całej rodziny i uwzględniać adekwatność oceny własnej masy ciała przez dzieci.INTRODUCTION. Adequate self-perception of body weight status is the element of prevention and control of overweight and obesity. The purpose of this study was to analyse the self-perception of body weight by 13-year-olds in Poland with respect to the parents&#8217; body mass index (BMI). MATERIAL AND METHODS. Analyses were performed on the sample of 561 adolescent and their parents. Subjects were identified in the third stage of prospective cohort of children born in 1995. This study was conducted with the use of questionnaires for children and parents. Anthropometric measurements of 13-year-olds were done by school nurses. WHO growth standards were used as BMI references. Parents&#8217; BMI was calculated on the basis of data obtained from the questionnaires. RESULTS. Significant gender differences in self-perception of body weight status were found (p < 0.001). The inadequate perception of body weight was demonstrated by 36% girls and 38.5% boys. Boys had a tendency to assess themselves as &#8220;to slim&#8221; and the girls as &#8220;too fat&#8221;. Parental BMI significantly influenced (p = 0.002 for mother and p = 0.016 for father) the accuracy of the perception of body weight by girls. More than 2/3 of overweight girls, whose parents was obese or near to obesity, assessed their weight as a normal. CONCLUSIONS. Parental BMI affected the adequacy of teenagers body weight self-assessment, particularly in relation to daughters. Prevention and interventions aiming to reduce body weight among adolescents should be addressed to the whole family and consider the adequacy of children&#8217;s body weight status self-assessment

Super-resolution visualization of chromatin loop folding in human lymphoblastoid cells using interferometric photoactivated localization microscopy.

The three-dimensional (3D) genome structure plays a fundamental role in gene regulation and cellular functions. Recent studies in 3D genomics inferred the very basic functional chromatin folding structures known as chromatin loops, the long-range chromatin interactions that are mediated by protein factors and dynamically extruded by cohesin. We combined the use of FISH staining of a very short (33 kb) chromatin fragment, interferometric photoactivated localization microscopy (iPALM), and traveling salesman problem-based heuristic loop reconstruction algorithm from an image of the one of the strongest CTCF-mediated chromatin loops in human lymphoblastoid cells. In total, we have generated thirteen good quality images of the target chromatin region with 2-22 nm oligo probe localization precision. We visualized the shape of the single chromatin loops with unprecedented genomic resolution which allowed us to study the structural heterogeneity of chromatin looping. We were able to compare the physical distance maps from all reconstructed image-driven computational models with contact frequencies observed by ChIA-PET and Hi-C genomic-driven methods to examine the concordance between single cell imaging and population based genomic data