Relação de indicadores biológicos de qualidade de solos com Fusarium spp., Rhizoctonia solani e Trichoderma spp. em uma área sob integração lavoura-pecuária.

O objetivo deste trabalho foi verificar a relação de populações dos patógenos Fusarium solani, Rhizoctonia solani, dos antagonistas Trichoderma spp. e de formas saprófitas de F. oxysporum, com alguns indicadores biológicos de qualidade do solo

Embrapa agrienergy and bioinformatics.

D 156

Levantamento preliminar de plantas apícolas no Herbário IAN.

Com o objetivo de apresentar uma lista das plantas apícolas no estado do Pará, realizou-se no período de abril a junho de 2013 o levantamento de plantas apícolas pertencentes ao acervo do Herbário IAN. De forma preliminar, foram selecionados os registros tombados das espécies consideradas como plantas apícolas pela bibliografia utilizada ou que continham a observação de que foram visitadas por abelhas. Essas exsicatas foram separadas para compor a seção de plantas apícolas do herbário. Posteriormente, esse estudo incluirá plantas coletadas em que forem visualizadas abelhas, indicadas pelos produtores locais como plantas apícolas ou aquelas identificadas por meio de análise palinológica. Foram encontradas 303 espécies de plantas consideradas apícolas, que estão distribuídas em 80 famílias, dentre as quais Leguminosae, Euphorbiaceae, Malvaceae e Convolvulaceae foram as que apresentaram maior riqueza de espécies

Automated information extraction from free-text EEG reports

In this study we have developed a supervised learning to automatically detect with high accuracy EEG reports that describe seizures and epileptiform discharges. We manually labeled 3,277 documents as describing one or more seizures vs no seizures, and as describing epileptiform discharges vs no epileptiform discharges. We then used Naïve Bayes to develop a system able to automatically classify EEG reports into these categories. Our system consisted of normalization techniques, extraction of key sentences, and automated feature selection using cross validation. As candidate features we used key words and special word patterns called elastic word sequences (EWS). Final feature selection was accomplished via sequential backward selection. We used cross validation to predict out of sample performance. Our automated feature selection procedure resulted in a classifier with 38 features for seizure detection, and 23 features for epileptiform discharge detection. The average [95% CI] area under the receiver operating curve was 99.05 [98.79, 99.32]% for detecting reports with seizures, and 96.15 [92.31, 100.00]% for detecting reports with epileptiform discharges. The methodology described herein greatly reduces the manual labor involved in identifying large cohorts of patients for retrospective neurophysiological studies of patients with epilepsy

Transcriptoma de frutos de Coffea arabica L. ao longo do seu desenvolvimento inicial.

Neste trabalho foi realizado o seqüenciamento de RNA em larga escala de 12 bibliotecas de Coffea arabica cv. IAPAR59: folha, flor, frutos ao longo do seu desenvolvimento e frutos tratados com o indutor de metabolismo secundário metiljasmonato. Foram gerados no total 84.798.835 sequências (Illumina, HiSeq2000), que foram montadas em 127.600 contigs com tamanho médio de 1264bp, dos quais 65480 foram considerados como variantes de splicing únicos (unigenes). Neste trabalho, reportamos a montagem de novo do transcriptoma realizada com as sequências destas bibliotecas e os dados preliminares de anotação funcional e categorização. Trata-se do primeiro trabalho de sequenciamento Illumina com frutos de cafeeiro, que pode trazer importantes informações sobre genes candidatos relacionados a produção de compostos-chave envolvidos na qualidade do café e maturação de frutos