Molecular bording of recogniton the antigen for T lymphocites

O estudo dos mecanismos de reconhecimento de epitopos por linfocitos T e fundamental para a manipulacao de processos imunologicos, tais como imunizacao protetora contra patogenos e a inducao de tolerancia em doencas auto-imunes. Neste trabalho almejamos identificar epitopos imunodominantes e caracterizar a interface MHC-peptideo-TCR em antigenos de duas doencas endemicas: a Paracoccidioidomicose e doenca de Chagas. Vacinas eficazes sao capazes de induzir uma resposta imune protetora em uma populacao geneticamente distinta. 0 primeiro modelo abordado neste trabalho foi o estudo de epitopos da glicoproteina gp43 de Paracoccidioides brasiliensis, agente causador de uma micose sistemica que atinge toda a America Latina: a Paracoccidioidomicose (PCM). Analisamos a resposta a gp43, capaz de conferir protecao contra o desafio letal em camundongos, em busca de epitopos imunodominantes em humanos. Para tal, utilizamos o algoritmo TEPITOPE para selecionar sequencias que poderiam se ligar a multiplas moleculas HLA-DR e testamos o reconhecimento por celulas T de pacientes tratados e curados de PCM. A real promiscuidade dos cinco peptideos previstos como os mais promiscuos selecionados da sequencia da gp43 foi avaliada por ensaios de ligacao a 9 diferentes moleculas HLA-DR prevalentes na populacao. Os peptideos tambem foram testados em ensaio de proliferacao primaria com PBMC de 29 pacientes PCM e 13 individuos normais. PBMC de 100 por cento dos pacientes reconheceram a gp43 e 72 por cento (21/29) reconheceram pelo menos um peptideo. 0 peptideo gp43(181-195) se ligou a 100 por cento das moleculas de HLA-DR em ensaio de ligacao e foi reconhecido por 48 por cento (14/29) dos pacientes testados, enquanto que os demais peptideos selecionados se ligaram a 22-78 por cento das moleculas HLA-DR testadas foram reconhecidos por 28-41 por cento dos pacientes. A combinacao desses peptideos em um pool aumentou a frequencia de reconhecimento para 75 por cento. Observamos correlacao positiva entre a promiscuidade na previsao pelo TEPITOPE, frequencia de ligacao e o reconhecimento. 0 mimetismo molecular entre o T. cruzi e antigenos do coracao e um dos mecanismos patogenicos hipotetizados para a cardiopatia chagasica cronica, que ocorre em 30 por cento dos cerca de 10 milhoes de individuos infectados pelo parasita em toda a America Latinaa(au)BV UNIFESP: Teses e dissertaçõe

Chromatin proteomics reveals variable histone modifications during the life cycle of Trypanosoma cruzi

Histones are well-conserved proteins that form the basic structure of chromatin in eukaryotes and undergo several post-translational modifications, which are important for the control of transcription, replication, DNA damage repair, and chromosome condensation. In early branched organisms, histones are less conserved and appear to contain alternative sites for modifications, which could reveal evolutionary unique functions of histone modifications in gene expression and other chromatin- based processes. Here, by using high-resolution mass spectrom- etry, we identified and quantified histone post-translational modifications in two life cycle stages of Trypanosoma cruzi, the protozoan parasite that causes Chagas disease. We detected 44 new modifications, namely: 18 acetylations, seven monomethylations, seven dimethylations, seven trimethylations, and four phosphorylations. We found that replicative (epimastigote stage) contains more histone modifications than nonreplicative and infective parasites (trypomastigote stage). Acetylations of lysines at the C-terminus of histone H2A and methylations of lysine 23 of histone H3 were found to be enriched in trypomastigotes. In contrast, phosphorylation in serine 23 of H2B and methylations of lysine 76 of histone H3 predominates in proliferative states. The presence of one or two methylations in the lysine 76 was found in cells undergoing mitosis and cytokinesis, typical of proliferating parasites. Our findings provide new insights into the role of histone modifications related to the control of gene expression and cell-cycle regulation in an early divergent organism.Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)FAPESP: 2012/09403-