An R Package for a General Class of Inverse Gaussian Distributions

The inverse Gaussian distribution is a positively skewed probability model that has received great attention in the last 20 years. Recently, a family that generalizes this model called inverse Gaussian type distributions has been developed. The new R package named ig has been designed to analyze data from inverse Gaussian type distributions. This package contains basic probabilistic functions, lifetime indicators and a random number generator from this model. Also, parameter estimates and diagnostics analysis can be obtained using likelihood methods by means of this package. In addition, goodness-of-fit methods are implemented in order to detect the suitability of the model to the data. The capabilities and features of the ig package are illustrated using simulated and real data sets. Furthermore, some new results related to the inverse Gaussian type distribution are also obtained. Moreover, a simulation study is conducted for evaluating the estimation method implemented in the ig package.

Hallucinated and spoken linguistic patterns as markers of psychiatric disorders

A person with alterations in the brain and cognitive functioning and whose language- and speech-related processes are affected might experience atypical linguistic phenomena. Hallucinated voices, also known as auditory verbal hallucinations, illustrate this: when they manifest, an individual can hear words, phrases or dialogues that can resemble actual human language production in the absence of an actual source of the voice in the outer world. Disorganized speech represents another example: an individual might express her/himself with a discourse whose associations of concepts and use of grammatical elements area typical, sometimes until the point in which the speech is not understandable anymore. Since these linguistic phenomena occur both in individuals with and without need for mental care, a main clinical problem consist in accurately and consistently identifying the patterns that differentiate between pathological and non-pathological hallucinated voices or disorganized speech. In this thesis, a combination of linguistic theory, computational methods, and artificial intelligence was implemented to unveil the linguistic patterns that distinguish between pathological and non-pathological hallucinated voices, as well as those that differentiate the speech of patients with schizophrenia-spectrum disorders from that of control individuals. More broadly, a consensual framework was developed regarding the potential use of this approach across psychiatric disorders and for a series of clinical actions. Lastly, pending obstacles and emerging questions related to this approach were underlined, followed by tentative theoretical venues that might point into solutions and answers about “Hallucinated and spoken linguistic patterns as markers of psychiatric disorders”

Structural biology and characterization of the human R2TP, an HSP90 co-chaperone complex

Tesis Doctoral inédita leída en la Universidad Autónoma de Madrid, Facultad de Ciencias, Departamento de Biología Molecular. Fecha de lectura: 13-07-2017Esta tesis tiene embargado el acceso al texto completo hasta el 13-01-201

Swarm intelligence techniques for optimization and management tasks insensor networks

The main contributions of this thesis are located in the domain of wireless sensor netorks. More in detail, we introduce energyaware algorithms and protocols in the context of the following topics: self-synchronized duty-cycling in networks with energy harvesting capabilities, distributed graph coloring and minimum energy broadcasting with realistic antennas. In the following, we review the research conducted in each case. We propose a self-synchronized duty-cycling mechanism for sensor networks. This mechanism is based on the working and resting phases of natural ant colonies, which show self-synchronized activity phases. The main goal of duty-cycling methods is to save energy by efficiently alternating between different states. In the case at hand, we considered two different states: the sleep state, where communications are not possible and energy consumption is low; and the active state, where communication result in a higher energy consumption. In order to test the model, we conducted an extensive experimentation with synchronous simulations on mobile networks and static networks, and also considering asynchronous networks. Later, we extended this work by assuming a broader point of view and including a comprehensive study of the parameters. In addition, thanks to a collaboration with the Technical University of Braunschweig, we were able to test our algorithm in the real sensor network simulator Shawn (http://shawn.sf.net). The second part of this thesis is devoted to the desynchronization of wireless sensor nodes and its application to the distributed graph coloring problem. In particular, our research is inspired by the calling behavior of Japanese tree frogs, whose males use their calls to attract females. Interestingly, as female frogs are only able to correctly localize the male frogs when their calls are not too close in time, groups of males that are located nearby each other desynchronize their calls. Based on a model of this behavior from the literature, we propose a novel algorithm with applications to the field of sensor networks. More in detail, we analyzed the ability of the algorithm to desynchronize neighboring nodes. Furthermore, we considered extensions of the original model, hereby improving its desynchronization capabilities.To illustrate the potential benefits of desynchronized networks, we then focused on distributed graph coloring. Later, we analyzed the algorithm more extensively and show its performance on a larger set of benchmark instances. The classical minimum energy broadcast (MEB) problem in wireless ad hoc networks, which is well-studied in the scientific literature, considers an antenna model that allows the adjustment of the transmission power to any desired real value from zero up to the maximum transmission power level. However, when specifically considering sensor networks, a look at the currently available hardware shows that this antenna model is not very realistic. In this work we re-formulate the MEB problem for an antenna model that is realistic for sensor networks. In this antenna model transmission power levels are chosen from a finite set of possible ones. A further contribution concerns the adaptation of an ant colony optimization algorithm --currently being the state of the art for the classical MEB problem-- to the more realistic problem version, the so-called minimum energy broadcast problem with realistic antennas (MEBRA). The obtained results show that the advantage of ant colony optimization over classical heuristics even grows when the number of possible transmission power levels decreases. Finally we build a distributed version of the algorithm, which also compares quite favorably against centralized heuristics from the literature.Las principles contribuciones de esta tesis se encuentran en el domino de las redes de sensores inalámbricas. Más en detalle, introducimos algoritmos y protocolos que intentan minimizar el consumo energético para los siguientes problemas: gestión autosincronizada de encendido y apagado de sensores con capacidad para obtener energía del ambiente, coloreado de grafos distribuido y broadcasting de consumo mínimo en entornos con antenas reales. En primer lugar, proponemos un sistema capaz de autosincronizar los ciclos de encendido y apagado de los nodos de una red de sensores. El mecanismo está basado en las fases de trabajo y reposo de las colonias de hormigas tal y como estas pueden observarse en la naturaleza, es decir, con fases de actividad autosincronizadas. El principal objectivo de este tipo de técnicas es ahorrar energía gracias a alternar estados de forma eficiente. En este caso en concreto, consideramos dos estados diferentes: el estado dormido, en el que los nodos no pueden comunicarse y el consumo energético es bajo; y el estado activo, en el que las comunicaciones propician un consumo energético elevado. Con el objetivo de probar el modelo, se ha llevado a cabo una extensa experimentación que incluye tanto simulaciones síncronas en redes móviles y estáticas, como simulaciones en redes asíncronas. Además, este trabajo se extendió asumiendo un punto de vista más amplio e incluyendo un detallado estudio de los parámetros del algoritmo. Finalmente, gracias a la colaboración con la Technical University of Braunschweig, tuvimos la oportunidad de probar el mecanismo en el simulador realista de redes de sensores, Shawn (http://shawn.sf.net). La segunda parte de esta tesis está dedicada a la desincronización de nodos en redes de sensores y a su aplicación al problema del coloreado de grafos de forma distribuida. En particular, nuestra investigación está inspirada por el canto de las ranas de árbol japonesas, cuyos machos utilizan su canto para atraer a las hembras. Resulta interesante que debido a que las hembras solo son capaces de localizar las ranas macho cuando sus cantos no están demasiado cerca en el tiempo, los grupos de machos que se hallan en una misma región desincronizan sus cantos. Basado en un modelo de este comportamiento que se encuentra en la literatura, proponemos un nuevo algoritmo con aplicaciones al campo de las redes de sensores. Más en detalle, analizamos la habilidad del algoritmo para desincronizar nodos vecinos. Además, consideramos extensiones del modelo original, mejorando su capacidad de desincronización. Para ilustrar los potenciales beneficios de las redes desincronizadas, nos centramos en el problema del coloreado de grafos distribuido que tiene relación con diferentes tareas habituales en redes de sensores. El clásico problema del broadcasting de consumo mínimo en redes ad hoc ha sido bien estudiado en la literatura. El problema considera un modelo de antena que permite transmitir a cualquier potencia elegida (hasta un máximo establecido por el dispositivo). Sin embargo, cuando se trabaja de forma específica con redes de sensores, un vistazo al hardware actualmente disponible muestra que este modelo de antena no es demasiado realista. En este trabajo reformulamos el problema para el modelo de antena más habitual en redes de sensores. En este modelo, los niveles de potencia de transmisión se eligen de un conjunto finito de posibilidades. La siguiente contribución consiste en en la adaptación de un algoritmo de optimización por colonias de hormigas a la versión más realista del problema, también conocida como broadcasting de consumo mínimo con antenas realistas. Los resultados obtenidos muestran que la ventaja de este método sobre heurísticas clásicas incluso crece cuando el número de posibles potencias de transmisión decrece. Además, se ha presentado una versión distribuida del algoritmo, que también se compara de forma bastante favorable contra las heurísticas centralizadas conocidas

Perspectivas del gasto en seguridad y defensa frente a cambios en el conflicto armado colombiano

Este documento busca determinar el comportamiento del Gasto en Seguridad y Defensa frente al nuevo escenario estratégico al que se enfrenta el país, teniendo en posibles negociaciones con grupos insurgentes. A partir de un análisis de la relación existente entre el Gasto en Seguridad y Defensa y el Conflicto Interno, se planteó un posible escenario de acuerdo a las condiciones actuales del país y las perspectivas en materia de seguridad, con miras a establecer la dinámica del gasto en el corto y mediano plazo

Evaluación teórica de rccc R-Pirogalo[4]arenos funcionalizados con metales como medio para el almacenamiento de Hidrógeno Molecular ensayos o artículos académicos

In the present study, a theoretical investigation of the potential of various metal-functionalized R-substituted pyrogallol[4]arenes (i.e., M-R-Pyg[4]arene; M = Li+, K+, Na+ and Mg2+; R = methyl and fluoroethyl) as media for molecular hydrogen (H2) storage is reported. Initially, the structural features of the metal-functionalized systems are obtained at the B3LYP/6-311G(d,p) level of theory. Subsequently, the interaction of a H2 molecule with the cations embedded in the cavity of the macrocyclic molecules is described with the B3LYP functional using two basis sets of different flexibility, namely BSA: 6-311G(d,p) for ell atoms, and BSB: 6-311G(d,p) and aug-cc-pVDZ for M-R-Pyg[4]arene and H2, respectively. Notably large BSSE-corrected binding energy values were obtained at the B3LYP/BSB level for the different H2/M-R-Pyg[4]arene complexes spanning the 1.3 – 17.0 kJ/mol range. The resulting values were further refined through two approaches: (i) by employing the functional B97D, which includes a Grimme´s type correction for describing dispersive forces and (ii) by performing MP2 calculations within the frame of the ONIOM approach. Binding energies refined at the MP2 level resulted in an average increment of about ~2.5 kJ/mol when considering all the complexes under investigation. On the other hand, B97D binding energies were found to be overestimated since too large increments (i.e., three- and fourfold with respect to B3LYP values for the case of Li- and Na-functionalized systems, respectively) were observed. For the specific case of the H2/Mg-fluoroethyl-Pyg[4]arene, an adsorption enthalpy (∆H°ads) of -17.6 kJ/mol was estimated by adding the zero point energy and thermal effects computed at 300 K from harmonic vibrational frequencies, obtained at the B3LYP/BSB level. This relatively high adsorption enthalpy suggests that Mg-functionalized R-Pyg[4]arenes can be envisaged as promising systems for molecular hydrogen storage.En el presente estudio se reporta la investigación teórica acerca del potencial de los pirogalol[4]arenos R-sustituidos funcioanlizados con varios metales (M-R-Pyg[4]arenos; M = Li+, K+, Na+ y Mg2+; R = meil y fluoretil) como medio para el almacenamiento de hidrógeno molecular (H2). Como punto de partida, las características estructurales de los sistemas funcionalizados con los metales fueron obtenidos al nivel de teoría B3LYP/6-311G(d,p). Subsecuentemente, la interacción de la molécula de hidrógeno con los cationes integrados en la cavidad de las moléculas macrocíclicas es descrita con el funcional B3LYP usando dos conjuntos base de diferente flexibilidad, BSA: 6-311G(d,p) para todos los átomos, y BSB: 6-311G(d,p) y aug-cc-pVDZ para M-R-Pyg[4]arenos e H2, respectivamente. Los valores obtenidos de las energías de amarre corregidas por el método BSSE usando el nivel de teoría B3LYP/BSB fueron notablemente más altas para los complejos H2/M-R-Pyg[4]areno abarcando el rango entre 1.3 y 17.0 kJ/mol. Estos resultados fueron posteriormente refinados mediante dos aproximaciones: (i) empleando el funcional B97D, el mismo que incluye una corrección de tipo Grimme para la descripción de las fuerzas de dispersión y (ii) realizando cálculos MP2 mediante la utilización del método ONIOM. Las energías de amarre resultantes, usando el nivel MP2, mostraron un incremento de aproximadamente 2.5 kJ/mol al analizar a todos los complejos. Por otra parte, se encontró que las energías de amarre obtenidas usando B97D muestran valores sobrestimados debido a que se evidenciaron incrementos considerablemente grandes (el triple y el cuádruple de os valores obtenidos mediante B3LYP para los casos de los sistemas funcionalizados con Li y Na, respectivamente). Para el caso específico del H2/fluoretil-Pyg[4]areno, la entalpía de adsorción estimada (∆H°ads) fue de -17.6 kJ/mol tmando en cuenta la energía del punto cero (ZPE) y los efectos térmicos calculados a 300 K a partir de las frecuencias armónicas vibracionales obtenidas al nivel de teoría B3LYP/BSB. Esta entalpía de adsorción alta sugiere que los R-Pyg[4]arenos funcioanlizados con Mg pueden ser tomados en cuenta como sistemas prometedores para el almacenamiento de hidrógeno molecular

Las izquierdas en México: una historia de ida y vuelta. Rodríguez, Octavio, Las izquierdas en México, México, Editorial Orfila, 2015

Unknow

Applied genomic in cerebrovascular disease

Cerebrovascular disease involve the alterations caused by pathology process of the sanguineous vessels, affecting one or many brain areas. Cerebrovascular disease is also known like stroke or ictus; it is the third cause of death around the world and is the neurologic pathology with the most prevalence rate. Cerebrovascular disease induces several changes in genetic expression inside the neurovascular unit (glia cells, neurons and ependymal cells); principally, changes in the oxidative stress and calcium inflow into the cells, this could start cellular death and tissue destruction, causing an irreversible injury in brain, losing several functions. The injury causes the activation of signaling pathways to respond to the stress, where many molecules such as proteins and mRNA are involved to act as intermediaries to activate or deactivate stress me- chanisms; these molecules are able to transmit extracellular signals into the nucleus activating early gene expression like proto-oncogenes and several transcription factors to repair the cerebral injury. It is important to know the relation of the changes in genetic expression and proteins to avoid the development of injury and to activate the brain recovery. This knowledge let us diagnose the injury rate and propose therapeutic mechanisms to reduce or avoid the adverse effects on time, before the cellular death start

Instructivo del programa Fismigo

1 archivo PDF (65 páginas) + 1 carpeta comprimida que contiene el programa FISMIGO.El propósito del programa FISMIGO es auxiliar al profesor en sus actividades de asesoría a estudiantes y diseño de tareas con resultados numéricos. El estudiante puede usarlo para verificar sus cálculos numéricos y hacer gráficos y variaciones de parámetros simples. Este programa permite: - Resolver problemas concernientes al equilibrio de una partícula. - Resolver el problema de equilibrio de un cuerpo rígido individual, o de un compuesto que se puede desmembrar en hasta 4 subsistemas. - Resolver problemas numéricos sobre Movimiento Rectilíneo Uniformemente Acelerado. - Resolver problemas numéricos sobre Movimiento de Tiro Parabólico. - Resolver problemas numéricos sobre Cinemática General. Adicionalmente se incluye una "Calculadora Científica", para efectuar muchos de los cálculos numéricos que surgen en los temas listados arriba. Esta herramienta permite: Calcular determinantes; resolver sistemas de ecuaciones lineales; obtener las raíces de una ecuación f(x) = O; resolver triángulos, hacer análisis de regresión lineal y ajuste de polinomios; derivar o integrar una función de una variable; graficar funciones de una variable en coordenadas cartesianas y polares; graficar ecuaciones paramétricas; hacer cálculos de álgebra vectorial , conversión de unidades físicas, etc. La calculadora incluye 48 rutinas matemáticas.2a. edición, 2009