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    Cartographie de la surface foliaire du blé à partir de données radiométriques multidatées fourni par une rampe de capteur

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    National audienceConnaître précisément l'indice foliaire du blé au cours de son cycle végétatif permet de répondre à deux buts importants: (i) pouvoir prédire les besoins en azote de la culture en utilisant les mesures aux stades précoces; (ii) utiliser la surface verte des feuilles durant le cycle complet dans le but de faire un diagnostique avec l'aide des cartes de sol et des cartes de rendement.Dans cet objectif, un système de données radiométriques georéférencées installé sur un tracteur a été réalisé. Le système est composé (i) de quatre radiomètres bi-voies (rouge et proche infrarouge), monté sur une rampe d'une longueur de 9 m et mesurant la lumière réfléchie par l'environnement, plus un radiomètre tourné vers le ciel mesurant la lumière incidente, (ii) une interface électronique, et (iii) un ordinateur pour l'acquisition et le stockage des données. Les données géoréférencées étaient enregistrées à trois dates sur un champ de 15 ha où des facteurs agronomiques non uniformes étaient appliqués. Les données étaient utilisées pour cartographier les indices foliaire après floraison. Un modèle linéaire expliquant l'indice foliaire est testé (r2=0.87). Le facteur sol était trouvé comme ayant la plus importante contribution à la variation des données. Globalement l'acquisition et la méthodologie du procédé fournis sont aptes à délivrer des informations spatiales et temporelles sur la culture dans le but de suivre l'état de la végétation après floraison. To know precisely the leaf area index of wheat along the crop cycle allows to answer two important purposes : (i) to be able to predict the crop nitrogen needs by using measurements at early stages; (ii) to use the green leaf area along the whole cycle in order to make diagnosis with the help of soil maps and yield maps.With this aim in view, a georeferenced radiometrical data system, mounted on a tractor has been realized. The system is made up of (i) four twin-channels radiometers (red and near infrared), mounted on a 9m-long boom and measuring the reflected light by the canopy, plus an hemisphere viewing radiometer measuring the incident light, (ii) an electronic interface, and (iii) a computer for data acquisition and storage. Geopositioned data were acquired at 3 dates over a 15 ha field where non uniform agronomical factors were applied. The data were used to cartography the multidate GLAI after anthesis. A linear model explaining the GLAI is tested (r2=0.87). The soil factor was found as having the most important contribution to the data variance. Globally the acquisition and processing methodology prooved its ability to deliver pertinent spatial and temporal information on crop in order to control the post-anthesis vegetation statu

    Cartographie et utilisation de l'indice foliaire du blé à partir de données radiométriques acquises par des capteurs embarqués sur tracteur

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    L'estimation de l'indice foliaire (LAI) du blé sur une parcelle donnée au cours du cycle de développement répond à deux objectifs importants : (i) permettre de prédire les besoins en azote de la culture grâce à des mesures réalisées dès les stades précoces ; (ii) utiliser des mesures de l'indice foliaire vert tout au long du cycle pour établir, en combinaison avec les cartes de sol et de rendement des années précédentes, un diagnostic sur l'état de la culture à partir de l'hétérogénéité intraparcellaire observée. Un système d'acquisition de données radiométriques géoréférencées, embarqué sur tracteur, a été mis au point et il a été testé et validé pour répondre à l'objectif (ii) énoncé ci-dessus. Les données géoréférencées ont été acquises à 3 dates sur un champ de 15 ha où différents traitements agronomiques ont été appliqués. Les données ont été utilisées pour cartographier l'indice foliaire vert (GLAI) à partir de la floraison. Un modèle linéaire a été établi pour expliquer les variations spatio-temporelles du GLAI (R2 = 0,87). Le facteur sol en est le principal facteur explicatif. De façon générale la méthode montre son intérêt pour fournir une information spatiale et temporelle pertinente sur l'état de croissance ou l'état de sénescence de la culture. / To know precisely the leaf area index of wheat along the crop cycle allows to answer two important purposes : (i) to be able to predict the crop nitrogen needs by using measurements from early stages; (ii) to use the green leaf area along the whole cycle in order to establish, by means of previous soil and yield maps, a diagnosis on the state of the crop from the intrafield heterogeneousness observed. With this aim in view, a georeferenced radiometrical data system, mounted on a tractor was finalized. The system is made up of (i) four twin-channels radiometers (red and near infrared), mounted on a 9m-long boom and measuring the reflected light by the canopy, plus an hemisphere viewing radiometer measuring the incident light, (ii) an electronic interface, and (iii) a computer for data acquisition and storage. Geopositioned data were acquired at 3 dates over a 15 ha field where non uniform agronomical factors were applied. The data were used to cartography the multidate GLAI after anthesis. A linear model explaining the GLAI was tested (r2=0.87). The soil factor was found as having the most important contribution to the data variance. Globally the acquisition and processing methodology prooved its ability to deliver pertinent spatial and temporal information on crop in order to control the growth or post-anthesis vegetation status

    Single cell transcriptome analysis of the THY-Tau22 mouse model of Alzheimer's disease reveals sex-dependent dysregulations

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    peer reviewedAlzheimer's disease (AD) progression and pathology show pronounced sex differences, but the factors driving these remain poorly understood. To gain insights into early AD-associated molecular changes and their sex-dependence for tau pathology in the cortex, we performed single-cell RNA-seq in the THY-Tau22 AD mouse model. By examining cell type-specific and cell type-agnostic AD-related gene activity changes and their sex-dimorphism for individual genes, pathways and cellular sub-networks, we identified both statistically significant alterations and interpreted the upstream mechanisms controlling them. Our results confirm several significant sex-dependent alterations in gene activity in the THY-Tau22 model mice compared to controls, with more pronounced alterations in females. Both changes shared across multiple cell types and cell type-specific changes were observed. The differential genes showed significant over-representation of known AD-relevant processes, such as pathways associated with neuronal differentiation, programmed cell death and inflammatory responses. Regulatory network analysis of these genes revealed upstream regulators that modulate many of the downstream targets with sex-dependent changes. Most key regulators have been previously implicated in AD, such as Egr1, Klf4, Chchd2, complement system genes, and myelin-associated glycoproteins. Comparing with similar data from the Tg2576 AD mouse model and human AD patients, we identified multiple genes with consistent, cell type-specific and sex-dependent alterations across all three datasets. These shared changes were particularly evident in the expression of myelin-associated genes such as Mbp and Plp1 in oligodendrocytes. In summary, we observed significant cell type-specific transcriptomic changes in the THY-Tau22 mouse model, with a strong over-representation of known AD-associated genes and processes. These include both sex-neutral and sex-specific patterns, characterized by consistent shifts in upstream master regulators and downstream target genes. Collectively, these findings provide insights into mechanisms influencing sex-specific susceptibility to AD and reveal key regulatory proteins that could be targeted for developing treatments addressing sex-dependent AD pathology.Validating Digital Biomarkers For Better Personalized Treatment Of Parkinson's Disease3. Good health and well-bein

    Agro-éco-Syst'N : Identification de systèmes agroécologiques à hautes performances azotées par le diagnostic avec l'outil Syst'N ®

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    International audienceLe projet Agro-éco-Syst’Nvisait à doter les conseillers agricoles, formateurs et enseignants de méthodes, outils et références leur permettant d’identifier et de concevoir des systèmes de culture à faibles pertes azotées vers l’environnement. A cette fin, une méthode de diagnostic des pertes d’azote vers l’eau (par lixiviation) et vers l’air (par volatilisation), utilisant l’outil Syst’N®, a été élaborée et formalisée. Elle a ensuite été utilisée pour évaluer et expliquer les performances azotées de plusieurs systèmes de culture dans des contextes pédoclimatiques variés.Quinze systèmes de culture ont ainsi été évalués et diagnostiqués. Leur analyse transversale a montré comment différentes combinaisons de pratiques dans un contexte donné conduisent à des performances variables en matière de pertes d’azote. Enfin, 21 cas-types ont été mis à disposition pour outiller les enseignants et conseillers sur le diagnostic des pertes d’azote, ressources mobilisables dans un éventail d’objectifs pédagogiques, de l’évaluation des pertes azotées à la reconception de systèmes de culture. Les systèmes simulés avec Syst’N®sont diffusés viala base de données Pertazote, mise à niveau au cours du proje

    Réseau PRO : Création d'un réseau d'essais au champ et d'un outil de mutualisation des données pour l'étude de la valeur agronomique et des impacts environnementaux des Produits Résiduaires Organiques recyclés enagriculture

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    Ce 49ème volume de la Revue Innovations Agronomiques regroupe l'ensemble de la restitution des projets Casdar, présentés le 3 novembre 2015.The "PRO Network” project (2011-2014) has enabled the creation of a national network of trials investigating the effects of agricultural organic waste products (PRO) applications in very different agropedo-climatic situations and for a range of applied PRO. This network was firstly, to harmonize the methods of study and follow-up effects of PRO applied to the field, and secondly to pool data acquired on a wide range of field trials. Have thus been developed: an inventory of 437 tests of PRO in France, an operational methodological guide of field test on the PRO, a method of referencing of the PRO with a first draft of nomenclature, and an information system shared by PRO network and the PRO SOERE. Collected data led to improve the setting of the tools developed within the RMT fertilization & environment (Tools for environmental diagnosis and management of fertilization and the Organic Statute of the soil). Finally, the critical analysis of pooled data sets resulted in recommendations for future trials.Le projet « Réseau PRO » (2011-2014) a permis la constitution d’un réseau national d’essais étudiant les effets des épandages agricoles de produits résiduaires organiques (PRO) dans des situations agropédo-climatiques très différentes et pour une grande diversité de PRO épandus. Ce réseau visait d’une part, à harmoniser les méthodes d’étude et de suivi des effets des PRO épandus au champ, et d’autre part à mutualiser les données acquises sur une grande diversité d’essais au champ. Ont ainsi été élaborés : un inventaire de 437 essais étudiant les PRO en France, un guide méthodologique opérationnel de conduite d’essai de plein champ sur les PRO, une méthode de référencement des PRO et une première ébauche de nomenclature, et un système d’information commun au Réseau PRO et au SOERE PRO. Par ailleurs, les données recueillies ont permis d’améliorer le paramétrage des outils développés au sein du RMT Fertilisation & Environnement (outils de diagnostic environnemental et de gestion de la fertilisation et du statut organique des sols). Enfin, l’analyse critique des jeux de données mutualisés a donné lieu à des recommandations pour les futurs essais
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