Biodiversity Assessment and Geographical Affinities of Discards in Clam Fisheries in the Atlantic–Mediterranean Transition (Northern Alboran Sea)

This study focused on the assessment and quantification of discards generated by clam fisheries along the northern Alboran Sea (western Mediterranean). Discard samples (n = 278) were collected throughout one year on board nine commercial vessels. A total of 129 species were identified, mostly represented by molluscs (72 spp.), arthropods (20 spp.) and echinoderms (12 spp.). Molluscs dominated in terms of abundance (67.5%) and biomass (94.2%). The superfamily Paguroidea (i.e. hermit crabs), together with undersized target individuals, were the most abundant taxa. The abundance and biomass of discards displayed significant maximum values in winter, which could be partly related to biotic factors including population dynamics of some dominant species. Multivariate analyses indicated the presence of different assemblages related to the targeted bivalve species, reflecting the transition between a fine surface-sands biocoenosis exposed to wave action and a well-sorted fine sands biocoenosis below 5 m depth. Analysis of biogeographical affinities showed that most discarded species (73.2%) have an extensive Atlantic range, whereas 7.1% have a restricted distribution within the Mediterranean. The presence of subtropical species highlights the uniqueness of this area (the Atlantic–Mediterranean transition) in European seas. The usefulness of discard analysis for biodiversity assessment is discussed.Postprin

Characterization of Color Production in Xalla´s Palace Complex, Teotihuacan

A multi-analytical approach was used to characterize color remains from Xalla, a Teotihuacan palace complex (project Teotihuacan, Elite and Government. Excavations in Xalla led by Linda R. Manzanilla). Color samples were obtained from polished lithic instruments and pigment ores. Those samples were analyzed combining microscopic and spectroscopic techniques. Our results coincide with previous studies in Teotihuacan, with the chromatic palette displaying a predominance of iron oxides such as hematite, yellow ochre and natural earths, as well as malachite, celadonite and glauconite. We have enlarged the corpus of raw materials with the characterization of jarosite and bone white and mica as aggregate. The identification of raw materials crossed with functional analysis of polished lithic artefacts suggests a production and application process for the pigmenting materials that were divided in four phases, from the crushing of the raw material to the application and finishing of the painted surfaces

Clonal chromosomal mosaicism and loss of chromosome Y in elderly men increase vulnerability for SARS-CoV-2

The pandemic caused by severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2, COVID-19) had an estimated overall case fatality ratio of 1.38% (pre-vaccination), being 53% higher in males and increasing exponentially with age. Among 9578 individuals diagnosed with COVID-19 in the SCOURGE study, we found 133 cases (1.42%) with detectable clonal mosaicism for chromosome alterations (mCA) and 226 males (5.08%) with acquired loss of chromosome Y (LOY). Individuals with clonal mosaic events (mCA and/or LOY) showed a 54% increase in the risk of COVID-19 lethality. LOY is associated with transcriptomic biomarkers of immune dysfunction, pro-coagulation activity and cardiovascular risk. Interferon-induced genes involved in the initial immune response to SARS-CoV-2 are also down-regulated in LOY. Thus, mCA and LOY underlie at least part of the sex-biased severity and mortality of COVID-19 in aging patients. Given its potential therapeutic and prognostic relevance, evaluation of clonal mosaicism should be implemented as biomarker of COVID-19 severity in elderly people. Among 9578 individuals diagnosed with COVID-19 in the SCOURGE study, individuals with clonal mosaic events (clonal mosaicism for chromosome alterations and/or loss of chromosome Y) showed an increased risk of COVID-19 lethality

La renovación de la palabra en el bicentenario de la Argentina : los colores de la mirada lingüística

El libro reúne trabajos en los que se exponen resultados de investigaciones presentadas por investigadores de Argentina, Chile, Brasil, España, Italia y Alemania en el XII Congreso de la Sociedad Argentina de Lingüística (SAL), Bicentenario: la renovación de la palabra, realizado en Mendoza, Argentina, entre el 6 y el 9 de abril de 2010. Las temáticas abordadas en los 167 capítulos muestran las grandes líneas de investigación que se desarrollan fundamentalmente en nuestro país, pero también en los otros países mencionados arriba, y señalan además las áreas que recién se inician, con poca tradición en nuestro país y que deberían fomentarse. Los trabajos aquí publicados se enmarcan dentro de las siguientes disciplinas y/o campos de investigación: Fonología, Sintaxis, Semántica y Pragmática, Lingüística Cognitiva, Análisis del Discurso, Psicolingüística, Adquisición de la Lengua, Sociolingüística y Dialectología, Didáctica de la lengua, Lingüística Aplicada, Lingüística Computacional, Historia de la Lengua y la Lingüística, Lenguas Aborígenes, Filosofía del Lenguaje, Lexicología y Terminología

Sequencing and de novo assembly of the red cusk-eel (Genypterus chilensis) transcriptome

© 2014 Elsevier B.V. The red cusk-eel (Genypterus chilensis) is an endemic fish species distributed along the coasts of the Eastern South Pacific. Biological studies on this fish are scarce, and genomic information for G. chilensis is practically non-existent. Thus, transcriptome information for this species is an essential resource that will greatly enrich molecular information and benefit future studies of red cusk-eel biology. In this work, we obtained transcriptome information of G. chilensis using the Illumina platform. The RNA sequencing generated 66,307,362 and 59,925,554 paired-end reads from skeletal muscle and liver tissues, respectively. De novo assembly using the CLC Genomic Workbench version 7.0.3 produced 48,480 contigs and created a reference transcriptome with a N50 of 846. bp and average read coverage of 28.3. ×. By sequence similarity search for known proteins, a total of 21,272 (43.9%) contigs were annotated for their function. Out of these annotated contigs, 33.5%

Flat bands, indirect gaps, and unconventional spin-wave behavior induced by a periodic Dzyaloshinskii-Moriya interaction

Periodically patterned metamaterials are known for exhibiting wave properties similar to the ones observed in electronic band structures in crystal lattices. In particular, periodic ferromagnetic materials are characterized by the presence of bands and band gaps in their spin-wave spectrum at tunable GHz frequencies. Recently, the fabrication of magnets hosting Dzyaloshinskii-Moriya interactions has been pursued with high interest since properties, such as the stabilization of chiral spin textures and nonreciprocal spin-wave propagation, emerge from this antisymmetric exchange coupling. In this context, to further engineer the magnon band structure, we propose the implementation of magnonic crystals with periodic Dzyaloshinskii-Moriya interactions, which can be obtained, for instance, via patterning of periodic arrays of heavy metal wires on top of an ultrathin magnetic film. We demonstrate through theoretical calculations and micromagnetic simulations that such systems show an unusual evolution of the standing spin waves around the gaps. We also predict the emergence of indirect gaps and flat bands, effects that depend on the strength of the Dzyaloshinskii-Moriya interaction. Such phenomena, which have been previously observed in different systems, are observed here simultaneously, opening new routes towards engineered metamaterials for spin-wave-based devices

Effects of mechanized dredging targeting Chamelea gallina, striped venus clams, on the associated discards in the northern Alboran Sea (Wester Mediterranean Sea)

Mechanized dredging impact on discards was assessed along the northern Alboran Sea (W Mediterranean Sea). Data from 101 dredging operations were analysed for contrasting spatial and seasonal variability of damage, with the use of a three-level damage scale. 4.5% of discarded individuals displayed intermediate damage, whereas 11.3% displayed severe damage. Echinoderms displayed the highest level of damage (75% of total collected individuals) and Echinocardium cf. mediterraneum was the most susceptible discarded species (85% with severe damage), followed by bivalves (7.3%) and crustaceans (3.3%). The target Chamelea gallina showed a low proportion of damaged individuals, probably due to their thick protective shell, which promotes the survival of discarded undersized target individuals. Spatial differences in damage level on discards were linked to some gear characteristics, to the higher amount of gravels and to longer tow durations, whereas damage was generally higher in cold months and partly related to higher quantities of hard shelled molluscs, in both cases increasing the abrasion and damage to retained organisms. Data suggest that dredges with a lower number of narrower iron teeth and towed for a shorter time could decrease the damage rate in discards of this fishery. A spatial management plan based on the type of grounds would be useful in order to improve efficiency o

Análisis del Descarte de las Pesquerías de Moluscos Bivalvos con Dragas Mecanizadas en el Litoral Mediterráneo de Andalucía

Análisis del descarte de las pesquerías de moluscos bivalvos con dragas mecanizadas en el litoral mediterráneo de Andalucía T. García1, H. Gallardo2, E. León Duarte2, A. Rojas García2, B. Orúe Montaner2, J. Urra1, M. Lozano1, J.M. Serna, A. Garrido3, A.J. Ibañez Yuste3, A. Terrón Sigler3, J. Baro1, J.L. Rueda1 1. Centro Andaluz Superior de Estudios Marinos, Universidad de Cádiz, Polígono Río San Pedro 11510 Puerto Real, Cádiz, España 2. Centro Oceanográfico de Málaga, Instituto Español de Oceanografía, Puerto Pesquero s/n, 29640 Fuengirola, España 3. Agencia de Gestión Agraria y Pesquera de Andalucía, Edificio Administrativo Servicios Centrales, Avda. de Grecia s/n, 41012 Sevilla, España Debido a la ausencia de información para el Mar de Alborán, se ha estudiado la composición y estructura del descarte asociado a la pesquería de Donax trunculus (coquina), Chamelea gallina (chirla) y Callista chione (concha fina) en los caladeros habituales donde opera la flota artesanal con dragas mecanizadas de los puertos de Caleta de Vélez, Fuengirola y La Línea de la Concepción. Se han analizado un total de 143 lances realizados en 45 mareas comerciales durante el periodo comprendido entre febrero y julio de 2013, obteniéndose información referente a la abundancia y la distribución de talla de las especies objetivo y la composición del descarte. Para el análisis del descarte se obtuvo una muestra de cada uno de los lances realizados, clasificando cuantitativa (abundancia, biomasa) y cualitativamente tanto los organismos como el material inerte (bioclastos, guijarros, restos de vegetales y basura) presentes en dicha muestra. Los datos se han tratado de forma univariante para el cálculo de índices ecológicos, y de forma multivariante para conocer las diferencias en los descartes entre especies objetivo y estaciones del año. Tras el análisis de las muestras, se observó que el número medio de especies en los descartes de los embarques dirigidos a la captura de coquina fue mayor (14,8 spp lance-1) que el de chirla (12,4 spp lance-1) o concha fina (7,2 spp lance-1), pero obteniéndose una tasa de descarte mayor para la chirla (23,1%) que para la coquina (10,7%) o la concha fina (14,5%). La fracción descartada está constituida por especies no comerciales y ejemplares de menor talla a la legal de captura. En una pequeña proporción se descartan ejemplares de mayor tamaño debido a daños producidos en el ejercicio de la maniobra de pesca. La fracción de material inerte fue mayor para la coquina (62,9%) que para la chirla (49,9%) o la concha fina (57,1%). El descarte está compuesto por un total de 104 especies, siendo los moluscos el grupo dominante tanto en riqueza específica (51,9%), como en abundancia (70,6%) y en biomasa (68,5%), seguido de los crustáceos decápodos y los equinodermos. Otros grupos que se hallaron en los descartes fueron los peces, los cnidarios, los anélidos, los poliquetos, los nemertinos y los sipuncúlidos, aunque generalmente con valores que no superaron el 1% de la abundancia y la biomasa total. Entre las especies dominantes, en relación a la abundancia, destacan ejemplares por debajo de la talla comercial de coquina y chirla o bivalvos como Mactra stultorum, Glycymeris nummaria, Acanthocardia tuberculata y Tellina spp., equinodermos como Echinocardium cf. mediterraneum, Astropecten irregularis, Ophiura ophiura y Holothuria spp., y decápodos como Liocarcinus vernalis, Atelecyclus undecimdentatus y diferentes especies de pagúridos. El análisis de similitud (ANOSIM) usando datos de abundancia (N) y biomasa (B) mostró que las muestras de descartes presentaban diferencias significativas en relación a la especie objetivo (N: RANOSIM=0,683; B: RANOSIM=0,664; p<0,001) y la estación del año (N: RANOSIM=0,119; p<0,001; B: RANOSIM=0,098; p<0,01), siendo en ambos casos las diferencias más acusadas entre los descartes de coquina y concha fina, y entre las muestras de verano e invierno

Impacto sobre las Comunidades Bentónico-Demersales Generado por las Pesquerías con Dragas Mecanizadas en el Litoral Mediterráneo de Andalucía

Se ha estudiado el impacto que las dragas mecanizadas ocasionan sobre la comunidad bentónica-demersal en la pesquería de Donax trunculus (coquina), Chamelea gallina (chirla) y Callista chione (concha fina). Para ello se han analizado las muestras de descarte de 143 lances, procedentes de 45 mareas comerciales, entre febrero y julio de 2013, en los caladeros habituales donde opera la flota artesanal con dragas mecanizadas de los puertos de Caleta de Vélez, Fuengirola y La Línea de la Concepción. Se ha definido el impacto como el daño que se produce sobre los ejemplares capturados durante las operaciones de pesca y su manipulación, estableciéndose un rango de daño potencial en base a literatura científica consultada: (1) “sin daño”, individuos sin signos de daño físico y con alta probabilidad de supervivencia; (2) “daño intermedio”, individuos que presentan daños en ciertas partes que pueden ser regenerados tras su liberación (ej. Asteroideos u Ofiuroideos sin un brazo, pérdida de apéndices en decápodos, etc.); y (3) “daño severo”, ejemplares con daños que le impiden sobrevivir tras su liberación (ej. peces, rotura de charnela en bivalvos, decápodos con muy pocos apéndices, etc.). Tras el análisis de las muestras, los ejemplares descartados “sin daño” representan el 83,8% del total de individuos del descarte de coquina, el 80,6% del descarte de chirla y el 67,5% del de concha fina. Los individuos descartados con “daño intermedio” son el 6% para coquina y chirla y el 16,9% para concha fina, mientras que los considerados con “daño severo” representan el 10,48% para coquina, el 13,4% para chirla y el 15,5% para concha fina. Las especies más sensibles al impacto de la pesquería son los peces (ej. Lithognathus mormyrus, Ophidion rochei, Raja asterias, Microchirus boscanion), equinodermos con exoesqueleto de tipo frágil o que puedan autotomizarse (ej. Echinocardium cf. mediterraneaum, Holothuria sp., Luidia atlantidea, Ophiura ophiura), organismos vermiformes delicados como son los anélidos poliquetos (ej. Marphysa sp., Nephtys sp.) o sipuncúlidos (Sipunculus nudus), crustáceos decápodos (ej. Derilambrus angulifrons, Liocarcinus vernalis, Atelecyclus undecimdentatus) y moluscos de concha frágil, fundamentalmente bivalvos (ej. Ensis minor, Pharus legumen, Tellina spp., Mactra spp.). Para muchas de las especies descartadas se desconoce su supervivencia tras el descarte en relación al tipo de daño, siendo interesante la realización de estudios experimentales para este tipo de invertebrados y en diferentes estaciones (invierno vs. verano). No obstante, debido a la alta dominancia de los bivalvos con concha resistente, los ejemplares con “daño intermedio” y “daño severo” representan porcentajes bajos con respecto al total. Además, todos los ejemplares descartados son devueltos a la misma zona de captura (mismo tipo de hábitat y comunidad bentónica) en un corto periodo de tiempo (<1 hora), lo cual favorece su posibilidad de supervivencia. Aunque el número de embarcaciones artesanales del litoral mediterráneo andaluz es mayor (~400) al de embarcaciones de arrastre (~130), el impacto directo estimado sobre el medio bentónico seguramente es menor con respecto a la flota de arrastre. Esto es debido a que la flota artesanal cambia de arte a lo largo del año (rastro, trasmallo, etc.) y por tanto no incide en este medio durante todo el año, y está representada por embarcaciones de pequeño tamaño con baja movilidad desde su puerto base, con una mayor dependencia de la meteorología local (paradas debido a fuerte oleaje) y con menores áreas de acción/captura en cada operación de pesca, las cuales se realizan en zonas muy concretas y a muy poca profundidad, favoreciendo la suelta de material descartado en la misma zona de recolección, lo cual incrementa las posibilidades de supervivencia de las especies descartadas