Biological predictors of survival in limphoma and mechanisms underlying follicular lymphoma transformaion into diffuse large B cell lymphoma (vol I e II)

RESUMO: Os biomarcadores tumorais permitem identificar os doentes com maior risco de recorrência da doença, predizer a resposta tumoral à terapêutica e, finalmente, definir candidatos a novos alvos terapêuticos. Novos biomarcadores são especialmente necessários na abordagem clínica dos linfomas. Actualmente, esses tumores são diagnosticados através de uma combinação de características morfológicas, fenotípicas e moleculares, mas o prognóstico e o planeamento terapêutico estão quase exclusivamente dependentes de características clínicas. Estes factores clínicos são, na maioria dos linfomas, insuficientes numa proporção significativa dos doentes, em particular, aqueles com pior prognóstico. O linfoma folicular (LF) é, globalmente, o segundo subtipo mais comum de linfoma. É tipicamente uma doença indolente com uma sobrevida média entre os 8 e 12 anos, mas é geralmente fatal quando se transforma num linfoma agressivo de alto grau, habitualmente o linfoma difuso de grandes células B (LDGCB). Morfologicamente e funcionalmente, as células do LF recapitulam as células normais do centro germinativo na sua dependência de sobrevivência do microambiente não-tumoral, especialmente das células do sistema imunológico. Biomarcadores preditivos de transformação não existem pelo que um melhor conhecimento da biologia intrínseca de progressão do LF poderá revelar novos candidatos. Nesta tese descrevo duas abordagens distintas para a descoberta de novos biomarcadores. A primeira, o estudo da expressão global de genes ('genomics') obtidos por técnicas de alto rendimento que analisam todo o genoma humano sequenciado, permitindo identificar novas anomalias genéticas que possam representar mecanismos biológicos importantes de transformação. São descritos novos genes e alterações genómicas associados à transformação do LF, sendo especialmente relevantes as relacionadas com os eventos iniciais de transformação em LDGCB. A segunda, baseou-se em várias hipóteses centradas no microambiente do LF, rico em vários tipos de células nãomalignas. Os estudos imunoarquitectural de macrófagos, células T regulatórias e densidade de microvasos efectuado em biopsias de diagnóstico de doentes com LF tratados uniformemente correlacionaram-se significativamente, e independentemente dos critérios clínicos, com a evolução clínica e, mais importante, com o risco de transformação em LDGCB. Nesta tese, foram preferencialmente utilizadas (e optimizadas) técnicas que permitam o uso de amostras fixadas em parafina e formalina (FFPET). Estas são facilmente acessíveis a partir das biopsias de diagnóstico de rotina presentes nos arquivos de todos os departamentos de patologia, facilitando uma transição rápida dos novos marcadores para a prática clínica. Embora o FL fosse o tema principal da tese, os novos achados permitiram estender facilmente hipóteses semelhantes a outros subtipos de linfoma. Assim, são propostos e validados vários biomarcadores promissores e relacionados com o microambiente não tumoral, sobretudo dependentes das células do sistema imunológico, como contribuintes importantes para a biologia dos linfomas. Estes sugerem novas opções para a abordagem clínica destas doenças e, eventualmente, novos alvos terapêuticos.------------- ABSTRACT: Cancer biomarkers provide an opportunity to identify those patients most at risk for disease recurrence, predict which tumours will respond to different therapeutic approaches and ultimately define candidate biomarkers that may serve as targets for personalized therapy. New biomarkers are especially needed in the management of lymphoid cancers. At present, these tumours are diagnosed using a combination of morphologic, phenotypic and molecular features but prognosis and overall survival are mostly dependent on clinical characteristics. In most lymphoma types, these imprecisely assess a significant proportion of patients, in particular, those with very poor outcomes. Follicular lymphoma (FL) is the second most common lymphoma subtype worldwide. It is typically an indolent disease with current median survivals in the range of 8-12 years, but is usually fatal when it transforms into an aggressive high-grade lymphoma, characteristically Diffuse Large B Cell Lymphoma (DLBCL). Morphologically and functionally it recapitulates the normal cells of the germinal center with its survival dependency on non-malignant immune and immunerelated cells. Informative markers of transformation related to the intrinsic biology of FL progression are needed. Within this thesis two separate approaches to biomarker discovery were employed. The first was to study the global expression of genes (‘genomics’) obtained using high-throughput, wholegenome-wide approaches that offered the possibility for discovery of new genetic abnormalities that might represent the important biological mechanisms of transformation. Gene signatures associated with early events of transformation were found. Another approach relied on hypothesis-driven concepts focusing upon the microenvironment, rich in several non-malignant cell types. The immunoarchitectural studies of macrophages, regulatory T cells and microvessel density on diagnostic biopsies of uniformly treated FL patients significantly predicted clinical outcome and, importantly, also informed on the risk of transformation. Techniques that enabled the use of routine formalin fixed paraffin embedded diagnostic specimens from the pathology department archives were preferentially used in this thesis with the goal of fulfilling a rapid bench-to-beside” translation for these new findings. Although FL was the main subject of the thesis the new findings and hypotheses allowed easy transition into other lymphoma types. Several promising biomarkers were proposed and validated including the implication of several non-neoplastic immune cells as important contributors to lymphoma biology, opening new options for better treatment planning and eventually new therapeutic targets and candidate therapeutics

Investigating the role of Sphingosine Kinase 1 pathway in cancer cell-monocyte interactions

Strong evidence suggests that the tumour microenvironment is inflammatory and that activation of the innate immune system plays a role in cancer progression, therefore targeting the multiple interactions of tumour cells with other cell types within the tumour microenvironment may lead to development of new cancer therapies. Sphingosine kinase (SPHK1) is a tumour-associated enzyme whose over-expression has been linked to patient mortality in many types of cancer. Here I investigate whether activation of the SPHK1 pathway, with a known involvement in inflammatory responses, is a signal transduction component of the tumour-monocyte/macrophage cellular interaction and a key element in inflammation-related cancer progression. Using a co-culture model, this study shows that the presence of monocytes increases cancer cell proliferation, an effect abrogated by knockdown of SPHK1 in cancer cells. Both monocytes and cancer cells showed a transient increase in SPHK1 activity and mRNA expression levels together with an increase in MCP-1 and IL-6 secretion. Silencing of SPHK1 in cancer cells abrogated SPHK1 activation in monocytes and pharmacological inhibition of SPHK1 in monocytes cells decreased monocyte induced-SPHK1 expression in cancer cells. Mechanistically, activation of AKT was observed in cancer cells upon co-culture with monocytes, an effect that was abrogated when cancer cells were pre-treated with siRNA for SPHK1. Moreover, the increase of phospho-AKT, ERK1/2 and NF-KB in monocytes by cancer cells was also reduced by RNAi-mediated knockdown of SPHK1 in cancer cells. My data show that STAT1 can bind to SPHK1 promoter or coding region and may be involved in SPHK1 transcriptional regulation in cancer cells upon monocyte stimulation, however its role still remains unclear as it acts as a transcriptional repressor of SPHK1. Monocytes induced cancer cell chemoprotection via a SPHK1-dependent mechanism, and reduced the inhibitory effect of docetaxel on cancer cell proliferation. Accordingly, increased AKT and ERK1/2 phosphorylation in monocytes were also affected by siRNA targeting of SPHK1 in docetaxel treated cancer cells. Altogether I show for the first time that selective inhibition of SPHK1 in tumour cells can affect their interaction with surrounding cells through the modulation of signal transduction pathways (ERK, PI3K, NF-kB) and cytokine exchange (IL-6, MCP-1 and potentially S1P, GM-CSF, GROα, IL-32 and ICAM-1). SPHK1-mediated increase in proliferation and chemoresistance of cancer cells conferred by monocytes renders this enzyme a promising target for future cancer therapies.Open Acces

Inovação Didática no Ensino Superior através do Projeto ROBOT@ESCOLA: escola de robótica

A Robótica é uma área multidisciplinar que tem contribuído significativamente no processo educativo dos jovens nos últimos anos. O modelo pedagógico de aprender fazendo é uma alavanca fundamental para cativar e manter os alunos interessados nas áreas tecnológicas. O projeto ROBOT@ESCOLA – Escola de Robótica, foi desenvolvido com base em componentes básicos para a construção de robôs, plataformas Arduino para programação, bem como dispositivos móveis com sistemas operativos Android, tornando a experimentação de ciência e tecnologia acessível a todos. O projeto foi desenvolvido em parceria com várias instituições de ensino da região da Beira Interior. Desta cooperação resultou uma plataforma robótica (kit) direcionada para a vertente educativa. Este kit de robótica móvel, pode ser utilizado pelos alunos para aprender a lógica dos sistemas programados, interagir com sensores e atuadores, e perceber os fenómenos físicos associados aos diversos tipos de sensores. Além dos aspetos introdutórios, o projeto possibilita explorar vários temas científicos de nível avançado. No artigo é apresentada a prática pedagógica associada à plataforma robótica, que inclui a definição do público-alvo, a metodologia pedagógica, e a avaliação para o caso de estudo apresentado, a unidade curricular de Programação de Computadores. Conclui-se através da experiência adquirida com o projeto que o uso da robótica como recurso de ensino favorece o raciocínio lógico, criatividade e relacionamento interpessoal.Fundação para a Ciência e Tecnologia, Ciência Viva. 122 /ID/2014 -Partilha e Divulgação de Experiências em Inovação Didática no Ensino Superior Português. UID/EMS/50022/2013, through FCT, under LAETA/IDMEC/CSIinfo:eu-repo/semantics/publishedVersio

Contrato de concessão de transportes públicos: definição, monitorização e controlo do cumprimento das obrigações de serviço público

Em 2009 foi publicada legislação europeia, transposta para Portugal em 2015, que define de que modo as autoridades de transporte podem intervir no domínio do transporte público de passageiros, assegurando a livre concorrência, e apenas permitindo o pagamento de compensações financeiras aos operadores de transporte se decorrentes de contrapartidas pela execução de obrigações de serviço público fixadas pela autoridade de transportes. Em Portugal, e até 3 de dezembro de 2019, todas as Autoridades de Transporte terão de lançar concursos públicos com vista à concessão dos serviços de transporte, definindo claramente quais as obrigações de serviço público, modelo de negócio e estabelecendo um modelo de monitorização do contrato e eventuais incentivos / penalizações face à performance dos operadores. O presente Caso Pedagógico debruça-se sobre esta problemática e pretende demonstrar como numa questão aparentemente complexa e exigente, é possível encontrar soluções simples, eficazes e testadas noutros contextos.European legislation published in 2009 (and transposed to Portugal in 2015) regulates how transport authorities can intervene in the field of public passenger transport: ensuring free competition and establishing the payment of financial compensation to transport operators only in return for the performance of public service obligations laid down by the transport authority. In Portugal, by December 3, 2019, all Transport Authorities will have to launch public tenders for the concession of transport services, clearly defining public service obligations, business models and establishing a contract monitoring model and possible incentives / penalties for each operator performance. This Pedagogical Case deals with this problem and aims to demonstrate how this apparently complex and demanding issue can be managed through simple, effective and previously tested solutions

Alternativa para aproveitamento de água pluvial no Campus da ESTG

A água é um recurso essencial para todos os seres vivos, sendo necessário controlar a sua utilização. Tanto nos países que sofrem de escassez desse recurso como noutros países. O aproveitamento de água pluvial é uma medida que permite reduzir o consumo de água potável em utilizações onde não é necessária água com elevada qualidade. Na presente dissertação procedeu-se à realização de um estudo acerca dos sistemas de aproveitamento de água pluvial. Neste estudo dimensionaram-se dois sistemas de aproveitando de água pluvial no campus 2 do Instituto Politécnico de Leiria. O primeiro caso de estudo pretende aproveitar água pluvial para utilização na rega dos jardins do campus, no entanto revelou ser um investimento elevado com um retorno do investimento estimado em 25 anos, sendo que posteriormente é um sistema que trará benefícios ao campus, e permitirá substituir a utilização de água potável por água pluvial. O segundo caso de estudo, tal como no primeiro caso, foi aplicado ao mesmo campus, mas neste caso pretendia-se aproveitar água pluvial para utilização nos autoclismos das instalações sanitárias de um dos edifícios do campus (Edifício D), revelou ser um investimento cujo período de retorno de 9 anos, permitindo a substituição de praticamente metade da água potável utilizada nos autoclismos por água pluvial

Sexualidade depois dos 55 anos: estudo sobre as representações e práticas sexuais em Portugal

Dissertação de mestrado em Comunicação, Arte e CulturaO período revolucionário ocorrido em Portugal a 25 de abril de 1974 simboliza um ponto de viragem entre um passado repressivo e uma nova era de liberdade. A sociedade portuguesa apresenta um retrato distinto após esta data em todos os domínios, nomeadamente no campo da sexualidade. O tema esteve ausente das linhas de investigação durante décadas e a sua discussão pública surgiu sobretudo a partir de 1984, focando-se inicialmente na vertente clínica e nos estereótipos, evoluindo depois para outras abordagens. Neste contexto, importa perceber que alterações ocorreram nas representações e práticas sexuais dos indivíduos de 55 e mais anos, tomando por referência o período imediatamente anterior ao 25 de abril de 1974 e a atualidade. Recorrendo-se a uma amostragem em "bola de neve", realizaram-se entrevistas semiestruturadas a um grupo de 22 portugueses pertencentes ao referido grupo etário, ou seja, indivíduos que eram adolescentes ou jovens adultos aquando da revolução democrática de 1974 e que residem, atualmente, na região Norte e na Grande Lisboa. Os resultados evidenciam representações sobre a sexualidade e práticas sexuais distintas quando os entrevistados se referem ao período pré e pós revolucionário. Depreende--se todavia dos seus discursos que, não obstante o facto de a sexualidade ter saltado para a esfera da discussão pública, consideram a atitude da sociedade atual perante a prática sexual dos adultos com mais de 55 anos, muito castradora e quase condenatória, pelo que mantêm um comportamento de inibição da expressão da sua prática sexual, apesar de a entenderem como perfeitamente natural. Os resultados anteriores sugerem existir, em Portugal, um longo caminho a percorrer na aceitação da prática sexual dos indivíduos com mais de 55 anos, sendo necessário sensibilizar a sociedade, e o próprio Estado, para uma discussão aprofundada do tema e para a implementação de políticas socioeducativas que possibilitem uma natural aceitação desta prática por todos os indivíduos, independentemente do grupo etário a que pertençam.In Portugal the revolutionary period of 25th April 1974 symbolizes a turning point between a repressive past and a new era of liberty. There is a distinct aspect to all areas of Portuguese society after this date, particularly in the field of sexuality. The topic was absent from lines of research for decades and only entered public debate primarily from 1984 onwards, initially focussing on the clinical perspective and on stereotypes, before evolving to include other approaches. In this context, it is necessary to understand what alterations occurred in the sexual representations and practices of individuals of 55 years and over, with reference to the period immediately before the 25 of April 1974 and the present day. Using "snow-ball" sampling, semistructured interviews were carried out with a group of 22 Portuguese individuals belonging to the aforementioned age bracket, i.e. individuals who were adolescents or young adults at the time of the 1974 democratic revolution and who currently reside in the North and Greater Lisbon regions. The results show different representations of sexuality and sexual practices when interviewees refer to the pre- and post- revolutionary period. However, it can be concluded from their dialogues that despite the topic of sexuality having entered the arena of public debate, they consider society's current attitude towards the sexual activity of adults over 55 years of age to be very repressive and almost condemnatory. For this reason they continue to inhibit the expression of their sexual activity, despite understanding it to be perfectly natural. These results suggest that in Portugal there is a long way to go in terms of the acceptance of sexual activity among the over 55's, it being necessary to raise social and administrative (State) awareness of the need for an in-depth discussion of the topic and the implementation of socioeducational policies which will facilitate a natural acceptance of this activity for all individuals, regardless of the age group to which they belong

Technical assessment report on solar thermal energy use in cork industry : António Almeida - Cortiças S.A.

ABSTRACT: Nowadays, current industrial applications seek, whenever possible, to meet thermal needs on sustainable technologies that are economically viable and environmentally friendly. Despite the high potential, a number of challenges still have to be overcame. Those include maximum attainable temperatures, seasonal and daily transience in solar heat supply and its integration in the industrial processes (among others). For that purpose, the implementation of solar thermal energy into industrial applications has been recognised and addressed by IEA Solar Heating & Cooling Programme (established in 1977), in a number of different research studies, including those ones found in Task 33 and Task 49 (IEA, 2015a; IEA, 2015b; and IEA, 2016) supported by the International Energy Agency (IEA) agenda. In this area, a task called Solar Heat for Industrial Processes (SHIP) emerges, which suggested that solar thermal systems have a significant potential in the sector, even though in an early stage of progress. This activity was led primary by the Commonwealth Science and Industrial Research Organization (Fuller, 2011). General motivations to implement solar systems in cork industry include: i) economics, with respect to worldwide increasing gas prices, and ii) environmental, with respect to the carbon-dioxide footprint associated to this specific industrial sector. The main objective of this report is to assess the technical assessment of solar thermal use in the cork industry, more specifically in the António Almeida - Cortiças S.A., located in the north of Portugal. For that purpose, a close collaboration was establish with this industry through several activities namely: i) energetic audit and ii) different actions of monitoring and implementation of the Energy Consumption Rationalization Agreement (ECRA).N/

Imagens utópicas: da cidade à arquitectura

A Utopia é uma idealização de uma sociedade perfeita, como tal esta pode ser uma ferramenta mental que o arquitecto deve utilizar nas suas concepções arquitectónicas, um exercício tanto de brainstorm como de avaliação das concequências das suas criações cobre o espaço e a sociedade. Na criação utópica interessa-nos o impossível, o que teria sido se não houvesse limites, desta forma podemos levar as construções ao limite e ver a reacção da sociedade e da envolvente. Aqui analisaremos as questões que a utopia nos apresenta ao retirarmos os limites naturais nas construções, permitindo a materialização mental de inúmeros mundos imaginários. No entanto, não só a arquitectura faz uso desta ferramenta, outras disciplinas transportam ideias e conceitos através da utopia, criando experiências únicas e favorecendo o producto final. Da mesma forma que a arquitectura pode ser inspirada pela utopía, esta pode também ser moldada por criações de outras disciplinas , criando um ciclo simbiótico entre inspirador e inspirado. A utopia torna-se numa ferramenta ao dispor do arquitecto, que acompanhada pelo desenho e a representação permite materializar ideias que de outra forma nunca seriam partilhadas e discutidas. Esta ferramenta está presente para o arquitecto poder ultrapassar desafios e obstáculos toldados pela normalidade e pelo preconceito, oferecendo-lhe uma maior flexibilidade mental. Este evitar da estagnação permite a criação de locais verdadeiramente únicos e criativos, evitando cidades e sociedades paradas no tempo, que acabam por morrer devido à falta de modernização. A criação utópica torna-se num jogo de acção-reacção, em que o arquitecto tenta prever a transformação da sociedade com a introdução conceitos e ideias estranhos aos ecosistemas a que estamos habituados

Projeto e instalação de sistemas de segurança e de automatização de processos em edifícios : estágio na MKTi - Sistemas de Domótica, Energia e Iluminação, Lda

O ser humano sempre necessitou de segurança e conforto. A procura por estes levou-o a investigar novas soluções que aliem benefícios de bem-estar com a diminuição de esforço. Esta demanda tem sido satisfeita por maquinaria elétrica diversa, formando uma plenitude de sistemas que são alvo de sucessivos progressos e funcionalidades extra que, hoje em dia, permitem agregar vários sistemas num só. Além disto, conseguem aplicar métodos próprios para auxiliar a gestão financeira, sem a qual, seria difícil de concretizar a sua implementação E assim, no contexto doméstico, tornou-se relevante o uso de diversos tipos vigilância e Domótica. Este relatório de estágio tem como objetivo a explanação do estudo e atividades decorridas entre 17 de junho de 2016 e 17 de julho de 2017, na empresa MKTi ̶ Sistemas de Domótica, Energia e Iluminação Lda., no âmbito do Mestrado em Engenharia Eletrotécnica – Área de Especialização em Automação e Comunicações em Sistemas Industriais do Instituto Superior de Engenharia de Coimbra. Aqui são expostos alguns exemplos de trabalhos efetuados. Nomeadamente envolvendo o projeto e instalação de sistemas de videoporteiro, videovigilância, alarme e de Domótica. Em todos estes sistemas são referidas as principais qualidades, finalidades e equipamentos instalados sendo apresentado um conjunto de serviços práticos respeitantes a obras desenvolvidas nessas áreas. É abordado de forma mais aprofundada, um estudo sobre o último tipo de sistema referido, Domótica, pela sua capacidade de interação com os outros sistemas mencionados, pelos diversos desenvolvimentos tecnológicos que têm ocorrido nesta área e, ainda, pela sua relevância nos consumos energéticos e, consequentemente, nas finanças dos utilizadores dos edifícios. Num contexto financeiro, é realizada uma apreciação e comparação de três orçamentos diferentes, a fim de se percecionar os possíveis custos envolvidos em vigilância por vídeo, alarmes e Domótica

Malcata life village – proposta de um modelo de negócio

Alongside the economic and financial difficulties that dominate the international scene, Portugal is no exception, seeing its economy plunged into deep crisis, marked by the high prices of commodities, with negative repercussions in terms of business competitiveness and levels of employability. Given these economic and social vicissitudes, it urges to rediscover new business models in areas strategic for the development of the country, particularly in the poorest regions. Tourism emerges thus as a strategic element in the development of national economy, combined with a variety of products identified under the National Strategic Plan for Tourism. Analyzing the evolution of the global population aging, with special emphasis on European territory, Iberian and national, it matters to know to explore this social phenomenon as a source of opportunities to consider in the design of new business models, associating it with the new consumer trends as manifested by potential customers. It is this sense that the different sections in the field of tourism, which includes the health tourism and wellness, medical tourism, accommodation, tourism and touring business and cultural landscape, the business model proposed identifies a investment solution, taking place in a depressed region of our country - the region of central border area in Malcata, Sabugal province.A par das dificuldades económicas e financeiras que dominam o panorama internacional, Portugal não foge à regra, vendo a sua economia mergulhada numa crise profunda, marcada pelo elevado nível de preços das matérias-primas, com repercussões negativas ao nível da competitividade empresarial e níveis de empregabilidade. Atendendo a estas vicissitudes económicas e sociais, impera redescobrir novos modelos de negócio em área estratégicas para o desenvolvimento do país e em particular das regiões mais desfavorecidas. Surge assim o Turismo como elemento estratégico no desenvolvimento da economia nacional, associado a uma variedade de produtos identificados no âmbito do Plano Estratégico Nacional para o Turismo. Analisando a evolução global do envelhecimento populacional, com especial destaque no território europeu, ibérico e nacional, importa saber explorar este fenómeno social enquanto fonte de oportunidades a ter em conta no design de novos modelos de negócio, associando-o às novas tendências de consumo manifestadas pelos potenciais clientes. É neste sentido, que no domínio das diferentes vertentes do turismo, onde se inclui o turismo de saúde e bem-estar, o turismo médico, o alojamento, o turismo de negócios e touring cultural e paisagístico, que o modelo de negócios proposto identifica uma solução de investimento, a ter lugar numa região deprimida do nosso país – a região da raia central, em Malcata, Concelho do Sabugal